MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	TCCCC	2	10	1975	1984	0 %	20 %	0 %	80 %	254558121
2	NC_012987	CCGAT	2	10	2100	2109	20 %	20 %	20 %	40 %	254558122
3	NC_012987	GCGCA	2	10	4267	4276	20 %	0 %	40 %	40 %	254558123
4	NC_012987	GGTCA	2	10	4489	4498	20 %	20 %	40 %	20 %	254558123
5	NC_012987	CCCTC	2	10	4860	4869	0 %	20 %	0 %	80 %	254558123
6	NC_012987	CGCAC	2	10	5192	5201	20 %	0 %	20 %	60 %	254558123
7	NC_012987	CGCGA	2	10	5479	5488	20 %	0 %	40 %	40 %	254558124
8	NC_012987	CCGTG	2	10	6036	6045	0 %	20 %	40 %	40 %	254558124
9	NC_012987	GCCCG	2	10	6645	6654	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_012987	GACTC	2	10	7255	7264	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_012987	CCCTA	2	10	7872	7881	20 %	20 %	0 %	60 %	254558125
12	NC_012987	CGGCT	2	10	8130	8139	0 %	20 %	40 %	40 %	254558125
13	NC_012987	CGAAC	2	10	8318	8327	40 %	0 %	20 %	40 %	254558125
14	NC_012987	AGGGC	2	10	10159	10168	20 %	0 %	60 %	20 %	254558127
15	NC_012987	AGCCT	2	10	10413	10422	20 %	20 %	20 %	40 %	254558127
16	NC_012987	AGGGC	2	10	10907	10916	20 %	0 %	60 %	20 %	254558127
17	NC_012987	CGGCG	2	10	11559	11568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_012987	GAGGG	2	10	11766	11775	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012987	CGGAC	2	10	13055	13064	20 %	0 %	40 %	40 %	254558129
20	NC_012987	CGGCG	2	10	16914	16923	0 %	0 %	60 %	40 %	254558131
21	NC_012987	CCGCG	2	10	17453	17462	0 %	0 %	40 %	60 %	254558131
22	NC_012987	GCCGC	2	10	17691	17700	0 %	0 %	40 %	60 %	254558131
23	NC_012987	ACGGT	2	10	17741	17750	20 %	20 %	40 %	20 %	254558131
24	NC_012987	GTCCG	2	10	18447	18456	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012987	GCGCC	2	10	19540	19549	0 %	0 %	40 %	60 %	254558132
26	NC_012987	GAACC	2	10	19573	19582	40 %	0 %	20 %	40 %	254558132
27	NC_012987	GCGCC	2	10	20269	20278	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_012987	CTACA	2	10	20960	20969	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012987	TCGCC	2	10	22354	22363	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_012987	CGCGC	2	10	24642	24651	0 %	0 %	40 %	60 %	254558134
31	NC_012987	CGGCA	2	10	24933	24942	20 %	0 %	40 %	40 %	254558135
32	NC_012987	GTGGC	2	10	24965	24974	0 %	20 %	60 %	20 %	254558135
33	NC_012987	ACACC	2	10	25447	25456	40 %	0 %	0 %	60 %	254558135
34	NC_012987	TCACA	2	10	25815	25824	40 %	20 %	0 %	40 %	254558135
35	NC_012987	GCACG	2	10	25842	25851	20 %	0 %	40 %	40 %	254558135
36	NC_012987	CTGCG	2	10	26439	26448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012987	CGGTC	2	10	27935	27944	0 %	20 %	40 %	40 %	254558136
38	NC_012987	CTTCG	2	10	29177	29186	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012987	CGGGC	2	10	30619	30628	0 %	0 %	60 %	40 %	254558138
40	NC_012987	CAGCC	2	10	35697	35706	20 %	0 %	20 %	60 %	254558140
41	NC_012987	GCCGC	2	10	36387	36396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_012987	ACAGT	2	10	36787	36796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012987	CCGGC	2	10	37938	37947	0 %	0 %	40 %	60 %	254558141
44	NC_012987	GCCAT	2	10	38578	38587	20 %	20 %	20 %	40 %	254558142
45	NC_012987	CCGCA	2	10	38591	38600	20 %	0 %	20 %	60 %	254558142
46	NC_012987	CCGGC	2	10	38910	38919	0 %	0 %	40 %	60 %	254558142
47	NC_012987	CATTC	2	10	40973	40982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012987	GTTAA	2	10	41124	41133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012987	CGTAT	2	10	42475	42484	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012987	GATCA	2	10	44927	44936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012987	GTACG	2	10	44978	44987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012987	GCCGC	2	10	46045	46054	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_012987	CCGCT	2	10	46550	46559	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_012987	CCCGA	2	10	47694	47703	20 %	0 %	20 %	60 %	254558145
55	NC_012987	CGGTG	2	10	48500	48509	0 %	20 %	60 %	20 %	254558145
56	NC_012987	GGGCA	2	10	48702	48711	20 %	0 %	60 %	20 %	254558145
57	NC_012987	CGCGG	2	10	49813	49822	0 %	0 %	60 %	40 %	254558146
58	NC_012987	GACGA	2	10	49873	49882	40 %	0 %	40 %	20 %	254558146
59	NC_012987	CGTGT	2	10	53520	53529	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012987	CGGCA	2	10	53808	53817	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_012987	TTGCT	2	10	57092	57101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012987	CGTCG	2	10	60042	60051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_012987	CGATG	2	10	60330	60339	20 %	20 %	40 %	20 %	254558149
64	NC_012987	CCTCC	2	10	61163	61172	0 %	20 %	0 %	80 %	254558150
65	NC_012987	CCCCT	2	10	61302	61311	0 %	20 %	0 %	80 %	254558150
66	NC_012987	CCCTC	2	10	61766	61775	0 %	20 %	0 %	80 %	254558150
67	NC_012987	CGCGC	2	10	61842	61851	0 %	0 %	40 %	60 %	254558150
68	NC_012987	GCGCG	2	10	63709	63718	0 %	0 %	60 %	40 %	254558152
69	NC_012987	CCCGG	2	10	63765	63774	0 %	0 %	40 %	60 %	254558152
70	NC_012987	GGCAG	2	10	64124	64133	20 %	0 %	60 %	20 %	254558152
71	NC_012987	CCGGC	2	10	67986	67995	0 %	0 %	40 %	60 %	254558156
72	NC_012987	GGGGA	2	10	67999	68008	20 %	0 %	80 %	0 %	254558156
73	NC_012987	CGGCG	2	10	71284	71293	0 %	0 %	60 %	40 %	254558160
74	NC_012987	GCCGG	2	10	74308	74317	0 %	0 %	60 %	40 %	254558162
75	NC_012987	CGCGC	2	10	75825	75834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_012987	ATGCC	2	10	76313	76322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_012987	CTCGT	2	10	76892	76901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012987	GTTGC	2	10	78438	78447	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012987	CGCAG	2	10	79073	79082	20 %	0 %	40 %	40 %	254558165
80	NC_012987	TCTGA	2	10	79852	79861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012987	CCCGG	2	10	80186	80195	0 %	0 %	40 %	60 %	254558166
82	NC_012987	CGGCC	2	10	80256	80265	0 %	0 %	40 %	60 %	254558166
83	NC_012987	AGCGT	2	10	82048	82057	20 %	20 %	40 %	20 %	254558167
84	NC_012987	GACGG	2	10	84798	84807	20 %	0 %	60 %	20 %	254558169
85	NC_012987	GCCCG	2	10	85171	85180	0 %	0 %	40 %	60 %	254558170
86	NC_012987	ATCCA	2	10	86269	86278	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012987	CCCCT	2	10	86346	86355	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_012987	ATGGC	2	10	87126	87135	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012987	CGGCT	2	10	87658	87667	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_012987	GGTTC	2	10	89401	89410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012987	GCGCG	2	10	90627	90636	0 %	0 %	60 %	40 %	254558171
92	NC_012987	GCTTT	2	10	92069	92078	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012987	GCGTT	2	10	92364	92373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_012987	TCATA	2	10	94766	94775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012987	GCCGC	2	10	96216	96225	0 %	0 %	40 %	60 %	254558174
96	NC_012987	CAGCC	2	10	96457	96466	20 %	0 %	20 %	60 %	254558174
97	NC_012987	CCGGC	2	10	97012	97021	0 %	0 %	40 %	60 %	254558175
98	NC_012987	CTCCG	2	10	97381	97390	0 %	20 %	20 %	60 %	254558176
99	NC_012987	CGATC	2	10	97485	97494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012987	CCGCG	2	10	98834	98843	0 %	0 %	40 %	60 %	254558179
101	NC_012987	GCCGG	2	10	99157	99166	0 %	0 %	60 %	40 %	254558180
102	NC_012987	TCCGC	2	10	99479	99488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_012987	GTCTG	2	10	101067	101076	0 %	40 %	40 %	20 %	254558184
104	NC_012987	CGAGC	2	10	101601	101610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_012987	GCTGC	2	10	101782	101791	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012987	CGGCG	2	10	102611	102620	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012987	CGGGG	2	10	102682	102691	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012987	CGGCC	2	10	104519	104528	0 %	0 %	40 %	60 %	254558188
109	NC_012987	AGTAA	2	10	104869	104878	60 %	20 %	20 %	0 %	254558189
110	NC_012987	CCCGA	2	10	105129	105138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_012987	CTGGC	2	10	105974	105983	0 %	20 %	40 %	40 %	254558191
112	NC_012987	CGGCC	2	10	106160	106169	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_012987	CTCCC	2	10	106176	106185	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
114	NC_012987	GCGGG	2	10	106901	106910	0 %	0 %	80 %	20 %	254558192
115	NC_012987	GCGCG	2	10	107904	107913	0 %	0 %	60 %	40 %	254558192
116	NC_012987	CCGAG	2	10	108424	108433	20 %	0 %	40 %	40 %	254558192
117	NC_012987	GGGCG	2	10	108916	108925	0 %	0 %	80 %	20 %	254558193
118	NC_012987	GTCGG	2	10	109651	109660	0 %	20 %	60 %	20 %	254558193
119	NC_012987	GCGCG	2	10	110274	110283	0 %	0 %	60 %	40 %	254558193
120	NC_012987	GCGGG	2	10	110562	110571	0 %	0 %	80 %	20 %	254558193
121	NC_012987	TCGAG	2	10	111141	111150	20 %	20 %	40 %	20 %	254558193
122	NC_012987	CCCGG	2	10	114292	114301	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_012987	GGCGT	2	10	115497	115506	0 %	20 %	60 %	20 %	254558195
124	NC_012987	CGTCC	2	10	116496	116505	0 %	20 %	20 %	60 %	254558198
125	NC_012987	CGACC	2	10	116525	116534	20 %	0 %	20 %	60 %	254558198
126	NC_012987	GCTGC	2	10	116714	116723	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_012987	CCGCG	2	10	117167	117176	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_012987	CCGAT	2	10	117246	117255	20 %	20 %	20 %	40 %	254558200
129	NC_012987	CAAGC	2	10	119730	119739	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_012987	GGCCG	2	10	120611	120620	0 %	0 %	60 %	40 %	254558203
131	NC_012987	CGGTT	2	10	120967	120976	0 %	40 %	40 %	20 %	254558203
132	NC_012987	CGTCA	2	10	121215	121224	20 %	20 %	20 %	40 %	254558203
133	NC_012987	CACCT	2	10	122226	122235	20 %	20 %	0 %	60 %	254558203
134	NC_012987	CCTCG	2	10	122696	122705	0 %	20 %	20 %	60 %	254558203
135	NC_012987	TCGGT	2	10	123539	123548	0 %	40 %	40 %	20 %	254558203
136	NC_012987	GCGCA	2	10	127454	127463	20 %	0 %	40 %	40 %	254558208
137	NC_012987	GGCGT	2	10	128280	128289	0 %	20 %	60 %	20 %	254558208
138	NC_012987	GGCGT	2	10	128820	128829	0 %	20 %	60 %	20 %	254558208
139	NC_012987	GCGGT	2	10	128934	128943	0 %	20 %	60 %	20 %	254558208
140	NC_012987	TCGCC	2	10	129187	129196	0 %	20 %	20 %	60 %	254558208
141	NC_012987	GCCCG	2	10	129593	129602	0 %	0 %	40 %	60 %	254558208
142	NC_012987	AGACG	2	10	130599	130608	40 %	0 %	40 %	20 %	254558209
143	NC_012987	GTGGC	2	10	131684	131693	0 %	20 %	60 %	20 %	254558211
144	NC_012987	GTTCG	2	10	133900	133909	0 %	40 %	40 %	20 %	254558213
145	NC_012987	CGGGG	2	10	134472	134481	0 %	0 %	80 %	20 %	254558215
146	NC_012987	TCGTT	2	10	135767	135776	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012987	GATCA	2	10	136066	136075	40 %	20 %	20 %	20 %	254558216
148	NC_012987	CCGGG	2	10	138580	138589	0 %	0 %	60 %	40 %	254558219
149	NC_012987	TCGGC	2	10	140852	140861	0 %	20 %	40 %	40 %	254558222
150	NC_012987	CAGCC	2	10	140918	140927	20 %	0 %	20 %	60 %	254558222
151	NC_012987	CGGCT	2	10	141041	141050	0 %	20 %	40 %	40 %	254558223

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.