MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	CGAG	2	8	46	53	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012987	CCGA	2	8	614	621	25 %	0 %	25 %	50 %	254558120
3	NC_012987	CCTC	2	8	665	672	0 %	25 %	0 %	75 %	254558120
4	NC_012987	GGCC	2	8	1172	1179	0 %	0 %	50 %	50 %	254558121
5	NC_012987	CGAG	2	8	1199	1206	25 %	0 %	50 %	25 %	254558121
6	NC_012987	CCAC	2	8	1348	1355	25 %	0 %	0 %	75 %	254558121
7	NC_012987	CCGG	2	8	1669	1676	0 %	0 %	50 %	50 %	254558121
8	NC_012987	TACC	2	8	1679	1686	25 %	25 %	0 %	50 %	254558121
9	NC_012987	TCGA	2	8	2396	2403	25 %	25 %	25 %	25 %	254558122
10	NC_012987	CCGG	2	8	2448	2455	0 %	0 %	50 %	50 %	254558122
11	NC_012987	CGCC	2	8	2706	2713	0 %	0 %	25 %	75 %	254558122
12	NC_012987	TCGC	2	8	2744	2751	0 %	25 %	25 %	50 %	254558122
13	NC_012987	CGGC	2	8	2850	2857	0 %	0 %	50 %	50 %	254558122
14	NC_012987	CCGG	2	8	3641	3648	0 %	0 %	50 %	50 %	254558123
15	NC_012987	ACGA	2	8	3826	3833	50 %	0 %	25 %	25 %	254558123
16	NC_012987	GATC	2	8	3855	3862	25 %	25 %	25 %	25 %	254558123
17	NC_012987	GTCA	2	8	4018	4025	25 %	25 %	25 %	25 %	254558123
18	NC_012987	GGCT	2	8	4099	4106	0 %	25 %	50 %	25 %	254558123
19	NC_012987	GCGA	2	8	4345	4352	25 %	0 %	50 %	25 %	254558123
20	NC_012987	TCGC	2	8	4388	4395	0 %	25 %	25 %	50 %	254558123
21	NC_012987	GCCC	2	8	4788	4795	0 %	0 %	25 %	75 %	254558123
22	NC_012987	CGGC	2	8	5141	5148	0 %	0 %	50 %	50 %	254558123
23	NC_012987	GCCT	2	8	5641	5648	0 %	25 %	25 %	50 %	254558124
24	NC_012987	GACC	2	8	5697	5704	25 %	0 %	25 %	50 %	254558124
25	NC_012987	CGGG	2	8	5730	5737	0 %	0 %	75 %	25 %	254558124
26	NC_012987	CATC	2	8	6709	6716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012987	TCCA	2	8	7358	7365	25 %	25 %	0 %	50 %	254558125
28	NC_012987	GATC	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	254558125
29	NC_012987	GCGT	2	8	7713	7720	0 %	25 %	50 %	25 %	254558125
30	NC_012987	CGAT	2	8	7804	7811	25 %	25 %	25 %	25 %	254558125
31	NC_012987	ATCC	2	8	8187	8194	25 %	25 %	0 %	50 %	254558125
32	NC_012987	TTCG	2	8	8851	8858	0 %	50 %	25 %	25 %	254558126
33	NC_012987	TGAC	2	8	9009	9016	25 %	25 %	25 %	25 %	254558126
34	NC_012987	CGGG	2	8	9107	9114	0 %	0 %	75 %	25 %	254558126
35	NC_012987	GATC	2	8	9115	9122	25 %	25 %	25 %	25 %	254558126
36	NC_012987	GCTT	2	8	10039	10046	0 %	50 %	25 %	25 %	254558127
37	NC_012987	CAGG	2	8	10328	10335	25 %	0 %	50 %	25 %	254558127
38	NC_012987	CCGG	2	8	11329	11336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012987	GCGG	2	8	11457	11464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012987	CCGC	2	8	11551	11558	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_012987	GGCG	2	8	12047	12054	0 %	0 %	75 %	25 %	254558128
42	NC_012987	GCCG	2	8	12166	12173	0 %	0 %	50 %	50 %	254558128
43	NC_012987	GCCG	2	8	12192	12199	0 %	0 %	50 %	50 %	254558128
44	NC_012987	CCGG	2	8	12421	12428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012987	GCGG	2	8	12788	12795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012987	CCCG	2	8	13212	13219	0 %	0 %	25 %	75 %	254558129
47	NC_012987	TCGG	2	8	14653	14660	0 %	25 %	50 %	25 %	254558130
48	NC_012987	CCCG	2	8	15882	15889	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_012987	GGCT	2	8	16767	16774	0 %	25 %	50 %	25 %	254558131
50	NC_012987	ACCG	2	8	17983	17990	25 %	0 %	25 %	50 %	254558131
51	NC_012987	CGGG	2	8	18292	18299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012987	CAGG	2	8	18895	18902	25 %	0 %	50 %	25 %	254558132
53	NC_012987	CAGC	2	8	18945	18952	25 %	0 %	25 %	50 %	254558132
54	NC_012987	CGGC	2	8	19422	19429	0 %	0 %	50 %	50 %	254558132
55	NC_012987	TCCG	2	8	19702	19709	0 %	25 %	25 %	50 %	254558132
56	NC_012987	CCTG	2	8	20535	20542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012987	GCGG	2	8	20548	20555	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012987	CGCA	2	8	20597	20604	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012987	CGCA	2	8	20674	20681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012987	TCGG	2	8	21738	21745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012987	CTCG	2	8	22187	22194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012987	GACG	2	8	22576	22583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012987	CGGC	2	8	23265	23272	0 %	0 %	50 %	50 %	254558134
64	NC_012987	CTCG	2	8	23278	23285	0 %	25 %	25 %	50 %	254558134
65	NC_012987	CGAT	2	8	23835	23842	25 %	25 %	25 %	25 %	254558134
66	NC_012987	GCCG	2	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	254558134
67	NC_012987	GCGG	2	8	24053	24060	0 %	0 %	75 %	25 %	254558134
68	NC_012987	CAGC	2	8	26620	26627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012987	GTGA	2	8	27649	27656	25 %	25 %	50 %	0 %	254558136
70	NC_012987	ATCG	2	8	27901	27908	25 %	25 %	25 %	25 %	254558136
71	NC_012987	GACT	2	8	28182	28189	25 %	25 %	25 %	25 %	254558136
72	NC_012987	TCGA	2	8	28407	28414	25 %	25 %	25 %	25 %	254558136
73	NC_012987	TGCT	2	8	29036	29043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012987	ACCA	2	8	29557	29564	50 %	0 %	0 %	50 %	254558137
75	NC_012987	AAGG	2	8	30061	30068	50 %	0 %	50 %	0 %	254558137
76	NC_012987	GACG	2	8	30417	30424	25 %	0 %	50 %	25 %	254558137
77	NC_012987	CGTC	2	8	30713	30720	0 %	25 %	25 %	50 %	254558138
78	NC_012987	CGGG	2	8	30807	30814	0 %	0 %	75 %	25 %	254558138
79	NC_012987	TTGG	2	8	32199	32206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012987	GCCA	2	8	32616	32623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012987	GCTG	2	8	32759	32766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012987	CGCC	2	8	32909	32916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_012987	GGCC	2	8	33241	33248	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
84	NC_012987	GGCA	2	8	33253	33260	25 %	0 %	50 %	25 %	254558139
85	NC_012987	ACCT	2	8	33530	33537	25 %	25 %	0 %	50 %	254558139
86	NC_012987	CCTC	2	8	33540	33547	0 %	25 %	0 %	75 %	254558139
87	NC_012987	TCGC	2	8	33548	33555	0 %	25 %	25 %	50 %	254558139
88	NC_012987	GCCA	2	8	33875	33882	25 %	0 %	25 %	50 %	254558139
89	NC_012987	CGAG	2	8	34553	34560	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012987	CGGT	2	8	34592	34599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012987	GGCG	2	8	34617	34624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012987	ACGT	2	8	34912	34919	25 %	25 %	25 %	25 %	254558140
93	NC_012987	GTCA	2	8	35101	35108	25 %	25 %	25 %	25 %	254558140
94	NC_012987	TCGT	2	8	35233	35240	0 %	50 %	25 %	25 %	254558140
95	NC_012987	AGCG	2	8	35260	35267	25 %	0 %	50 %	25 %	254558140
96	NC_012987	ACGA	2	8	35632	35639	50 %	0 %	25 %	25 %	254558140
97	NC_012987	GACC	2	8	35679	35686	25 %	0 %	25 %	50 %	254558140
98	NC_012987	TGGA	2	8	35757	35764	25 %	25 %	50 %	0 %	254558140
99	NC_012987	CGCC	2	8	35768	35775	0 %	0 %	25 %	75 %	254558140
100	NC_012987	TGCA	2	8	36956	36963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012987	CGAC	2	8	37472	37479	25 %	0 %	25 %	50 %	254558141
102	NC_012987	GGCG	2	8	37825	37832	0 %	0 %	75 %	25 %	254558141
103	NC_012987	CGAC	2	8	38452	38459	25 %	0 %	25 %	50 %	254558142
104	NC_012987	GCGA	2	8	38656	38663	25 %	0 %	50 %	25 %	254558142
105	NC_012987	ACCG	2	8	38771	38778	25 %	0 %	25 %	50 %	254558142
106	NC_012987	GGCG	2	8	39755	39762	0 %	0 %	75 %	25 %	254558143
107	NC_012987	GCCT	2	8	39804	39811	0 %	25 %	25 %	50 %	254558143
108	NC_012987	ATAC	2	8	39989	39996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012987	AAAT	2	8	40351	40358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012987	CATC	2	8	40712	40719	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012987	ATGA	2	8	40941	40948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012987	TGAT	2	8	41204	41211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012987	TGGA	2	8	41366	41373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012987	CTTT	2	8	41680	41687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012987	TTAT	2	8	41939	41946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012987	CGAA	2	8	43233	43240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012987	TTGG	2	8	43280	43287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012987	TGGA	2	8	43749	43756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012987	GCTC	2	8	43860	43867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012987	TCGC	2	8	44136	44143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012987	CGAG	2	8	44211	44218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012987	CGAA	2	8	44504	44511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012987	TACA	2	8	44530	44537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012987	TCGA	2	8	45225	45232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012987	TTTC	2	8	45463	45470	0 %	75 %	0 %	25 %	254558144
126	NC_012987	CCTC	2	8	46068	46075	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_012987	GGCG	2	8	46468	46475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012987	GCCG	2	8	46693	46700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012987	GCCG	2	8	46880	46887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012987	CACT	2	8	47954	47961	25 %	25 %	0 %	50 %	254558145
131	NC_012987	AGCG	2	8	48344	48351	25 %	0 %	50 %	25 %	254558145
132	NC_012987	GGGC	2	8	49057	49064	0 %	0 %	75 %	25 %	254558146
133	NC_012987	CGGC	2	8	49316	49323	0 %	0 %	50 %	50 %	254558146
134	NC_012987	GGAC	2	8	49448	49455	25 %	0 %	50 %	25 %	254558146
135	NC_012987	CGTC	2	8	49736	49743	0 %	25 %	25 %	50 %	254558146
136	NC_012987	ACCG	2	8	49902	49909	25 %	0 %	25 %	50 %	254558146
137	NC_012987	GCCT	2	8	50184	50191	0 %	25 %	25 %	50 %	254558146
138	NC_012987	ACCA	2	8	50296	50303	50 %	0 %	0 %	50 %	254558146
139	NC_012987	CCAA	2	8	50315	50322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012987	TGGA	2	8	50890	50897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012987	GCCC	2	8	51189	51196	0 %	0 %	25 %	75 %	254558147
142	NC_012987	GGCG	2	8	51246	51253	0 %	0 %	75 %	25 %	254558147
143	NC_012987	GCCG	2	8	51276	51283	0 %	0 %	50 %	50 %	254558147
144	NC_012987	GGCG	2	8	52863	52870	0 %	0 %	75 %	25 %	254558148
145	NC_012987	TGTC	2	8	53500	53507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012987	CGGC	2	8	53718	53725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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283	NC_012987	CGGG	2	8	102292	102299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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286	NC_012987	GCAG	2	8	103852	103859	25 %	0 %	50 %	25 %	254558188
287	NC_012987	CGCC	2	8	103996	104003	0 %	0 %	25 %	75 %	254558188
288	NC_012987	CCGG	2	8	104112	104119	0 %	0 %	50 %	50 %	254558188
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.