MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 323

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	CG	3	6	121	126	0 %	0 %	50 %	50 %	254558119
2	NC_012987	GC	3	6	221	226	0 %	0 %	50 %	50 %	254558119
3	NC_012987	GC	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	254558120
4	NC_012987	GC	3	6	652	657	0 %	0 %	50 %	50 %	254558120
5	NC_012987	CG	3	6	1281	1286	0 %	0 %	50 %	50 %	254558121
6	NC_012987	CG	4	8	2516	2523	0 %	0 %	50 %	50 %	254558122
7	NC_012987	GC	3	6	3712	3717	0 %	0 %	50 %	50 %	254558123
8	NC_012987	GC	4	8	5433	5440	0 %	0 %	50 %	50 %	254558124
9	NC_012987	GC	3	6	5443	5448	0 %	0 %	50 %	50 %	254558124
10	NC_012987	TC	3	6	6289	6294	0 %	50 %	0 %	50 %	254558124
11	NC_012987	CG	3	6	7085	7090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012987	CG	3	6	7224	7229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012987	CG	3	6	7406	7411	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
14	NC_012987	GC	3	6	7503	7508	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
15	NC_012987	CG	3	6	8060	8065	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
16	NC_012987	AC	3	6	8329	8334	50 %	0 %	0 %	50 %	254558125
17	NC_012987	CG	3	6	8496	8501	0 %	0 %	50 %	50 %	254558125
18	NC_012987	GC	3	6	8601	8606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012987	AC	3	6	8884	8889	50 %	0 %	0 %	50 %	254558126
20	NC_012987	GC	3	6	8989	8994	0 %	0 %	50 %	50 %	254558126
21	NC_012987	CG	4	8	9052	9059	0 %	0 %	50 %	50 %	254558126
22	NC_012987	GC	3	6	9079	9084	0 %	0 %	50 %	50 %	254558126
23	NC_012987	CG	3	6	9861	9866	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
24	NC_012987	GC	3	6	10048	10053	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
25	NC_012987	CG	5	10	10213	10222	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
26	NC_012987	CG	4	8	10373	10380	0 %	0 %	50 %	50 %	254558127
27	NC_012987	CG	3	6	11035	11040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012987	GT	3	6	11078	11083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012987	CG	3	6	11159	11164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012987	AG	3	6	11862	11867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012987	GC	3	6	11977	11982	0 %	0 %	50 %	50 %	254558128
32	NC_012987	GC	3	6	12208	12213	0 %	0 %	50 %	50 %	254558128
33	NC_012987	CT	4	8	12228	12235	0 %	50 %	0 %	50 %	254558128
34	NC_012987	CG	3	6	12564	12569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012987	GT	3	6	12736	12741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012987	GA	3	6	12938	12943	50 %	0 %	50 %	0 %	254558129
37	NC_012987	AC	3	6	12983	12988	50 %	0 %	0 %	50 %	254558129
38	NC_012987	CG	3	6	13475	13480	0 %	0 %	50 %	50 %	254558129
39	NC_012987	TG	3	6	13895	13900	0 %	50 %	50 %	0 %	254558129
40	NC_012987	GC	3	6	14074	14079	0 %	0 %	50 %	50 %	254558129
41	NC_012987	GC	3	6	14289	14294	0 %	0 %	50 %	50 %	254558129
42	NC_012987	GC	3	6	14634	14639	0 %	0 %	50 %	50 %	254558130
43	NC_012987	AC	3	6	15302	15307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012987	GC	4	8	16083	16090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012987	CG	3	6	16208	16213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012987	CG	3	6	16263	16268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012987	GC	3	6	16317	16322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012987	GC	3	6	16329	16334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012987	CG	3	6	16386	16391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012987	GC	3	6	16759	16764	0 %	0 %	50 %	50 %	254558131
51	NC_012987	GT	3	6	18523	18528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012987	GC	3	6	18908	18913	0 %	0 %	50 %	50 %	254558132
53	NC_012987	GA	3	6	19358	19363	50 %	0 %	50 %	0 %	254558132
54	NC_012987	CG	4	8	19694	19701	0 %	0 %	50 %	50 %	254558132
55	NC_012987	GC	3	6	19790	19795	0 %	0 %	50 %	50 %	254558132
56	NC_012987	AC	3	6	19931	19936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012987	CG	3	6	20215	20220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012987	AG	3	6	20330	20335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012987	CG	3	6	22565	22570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012987	CG	4	8	22982	22989	0 %	0 %	50 %	50 %	254558133
61	NC_012987	CG	3	6	23932	23937	0 %	0 %	50 %	50 %	254558134
62	NC_012987	TG	3	6	24800	24805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012987	AG	3	6	24908	24913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012987	CG	3	6	25377	25382	0 %	0 %	50 %	50 %	254558135
65	NC_012987	GT	3	6	26029	26034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012987	AC	3	6	26127	26132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012987	GA	4	8	26545	26552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012987	AT	3	6	27050	27055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012987	CG	4	8	29420	29427	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
70	NC_012987	GC	4	8	29581	29588	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
71	NC_012987	GC	3	6	29971	29976	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
72	NC_012987	CG	3	6	29980	29985	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
73	NC_012987	GC	3	6	30226	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
74	NC_012987	CG	3	6	30378	30383	0 %	0 %	50 %	50 %	254558137
75	NC_012987	GA	3	6	30599	30604	50 %	0 %	50 %	0 %	254558138
76	NC_012987	AG	3	6	30728	30733	50 %	0 %	50 %	0 %	254558138
77	NC_012987	GC	3	6	31294	31299	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
78	NC_012987	CG	4	8	31501	31508	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
79	NC_012987	CG	3	6	31661	31666	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
80	NC_012987	GC	3	6	31909	31914	0 %	0 %	50 %	50 %	254558138
81	NC_012987	GT	3	6	32522	32527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012987	AC	3	6	33327	33332	50 %	0 %	0 %	50 %	254558139
83	NC_012987	GC	4	8	33570	33577	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
84	NC_012987	GC	3	6	33853	33858	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
85	NC_012987	CG	3	6	33897	33902	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
86	NC_012987	CG	3	6	34153	34158	0 %	0 %	50 %	50 %	254558139
87	NC_012987	GA	3	6	34218	34223	50 %	0 %	50 %	0 %	254558139
88	NC_012987	GA	3	6	34330	34335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012987	CG	3	6	34743	34748	0 %	0 %	50 %	50 %	254558140
90	NC_012987	CT	3	6	35126	35131	0 %	50 %	0 %	50 %	254558140
91	NC_012987	GC	3	6	35871	35876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012987	TA	3	6	36657	36662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012987	GC	4	8	38298	38305	0 %	0 %	50 %	50 %	254558142
94	NC_012987	GA	3	6	38662	38667	50 %	0 %	50 %	0 %	254558142
95	NC_012987	GA	3	6	39975	39980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012987	TC	3	6	40133	40138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012987	TA	4	8	40412	40419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012987	AT	3	6	40616	40621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012987	GC	3	6	40646	40651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012987	CG	3	6	41158	41163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012987	AT	4	8	42044	42051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012987	AT	3	6	42442	42447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012987	AT	3	6	43656	43661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012987	TC	3	6	43939	43944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012987	GT	3	6	44668	44673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012987	TA	3	6	45032	45037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012987	GC	4	8	45906	45913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012987	CG	3	6	46580	46585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012987	CG	3	6	46857	46862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012987	GC	3	6	47357	47362	0 %	0 %	50 %	50 %	254558145
111	NC_012987	TC	3	6	47388	47393	0 %	50 %	0 %	50 %	254558145
112	NC_012987	GT	3	6	47605	47610	0 %	50 %	50 %	0 %	254558145
113	NC_012987	CT	3	6	48852	48857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012987	GC	4	8	49543	49550	0 %	0 %	50 %	50 %	254558146
115	NC_012987	GC	3	6	49838	49843	0 %	0 %	50 %	50 %	254558146
116	NC_012987	TG	3	6	51050	51055	0 %	50 %	50 %	0 %	254558147
117	NC_012987	GC	3	6	52049	52054	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
118	NC_012987	GC	4	8	52120	52127	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
119	NC_012987	GC	3	6	52180	52185	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
120	NC_012987	GC	3	6	52585	52590	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
121	NC_012987	GC	3	6	52723	52728	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
122	NC_012987	CG	3	6	52988	52993	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
123	NC_012987	GC	3	6	53196	53201	0 %	0 %	50 %	50 %	254558148
124	NC_012987	GC	3	6	53855	53860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012987	CT	3	6	54012	54017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012987	CA	3	6	54132	54137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012987	AT	3	6	54376	54381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012987	GC	3	6	55638	55643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012987	GC	3	6	55742	55747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012987	GC	3	6	55846	55851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012987	GC	3	6	55987	55992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012987	CG	3	6	56223	56228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012987	GC	3	6	56925	56930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012987	CT	3	6	57029	57034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012987	AT	4	8	57263	57270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012987	TA	3	6	57294	57299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012987	TA	3	6	57717	57722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012987	GC	3	6	57782	57787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012987	GC	3	6	58043	58048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012987	CT	3	6	58220	58225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012987	TC	3	6	58335	58340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012987	TA	3	6	58577	58582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012987	GC	3	6	59856	59861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012987	GA	3	6	60873	60878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012987	GC	3	6	60993	60998	0 %	0 %	50 %	50 %	254558150
146	NC_012987	TA	4	8	61380	61387	50 %	50 %	0 %	0 %	254558150
147	NC_012987	CG	3	6	61818	61823	0 %	0 %	50 %	50 %	254558150
148	NC_012987	AG	3	6	62143	62148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012987	TC	3	6	62152	62157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012987	CA	3	6	62296	62301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.