MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	AAAAAG	2	12	37348	37359	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012985	TATTTT	2	12	47985	47996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012985	CGATAC	2	12	62216	62227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012985	ATATTT	2	12	71400	71411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012985	AAAGAT	2	12	76016	76027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012985	CTTTAT	3	18	180435	180452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012985	GTAGGA	2	12	194226	194237	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012985	CCTTTT	2	12	212299	212310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012985	GACAAT	2	12	212313	212324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012985	ATTAAT	2	12	217591	217602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012985	ATCTTT	2	12	259489	259500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012985	TCTTTT	2	12	277975	277986	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012985	ATTAAC	2	12	287631	287642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012985	CTATTT	2	12	338736	338747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012985	AATAGA	2	12	344947	344958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012985	ATTTAT	2	12	359079	359090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012985	TAAAAT	2	12	360423	360434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012985	TTTAAT	4	24	360544	360567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012985	TGTACA	2	12	365338	365349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012985	TATAAA	2	12	370343	370354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012985	TGATTT	2	12	423791	423802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012985	CTAGTA	2	12	431845	431856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012985	CGCAAG	2	12	431857	431868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012985	ATTTTT	2	12	433348	433359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012985	ATAAAT	2	12	438579	438590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012985	TTTATT	3	18	444509	444526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012985	TGCCTT	2	12	460213	460224	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012985	GGTGAC	2	12	460417	460428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012985	ATTGTT	2	12	461516	461527	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012985	ATTGTT	2	12	476182	476193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012985	TCTTTT	2	12	477028	477039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012985	GCTTGC	2	12	500248	500259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012985	TATAAT	2	12	508220	508231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012985	GGAATC	2	12	508266	508277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012985	CTTTTT	2	12	517485	517496	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012985	GCGGTA	2	12	534723	534734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012985	TAATAT	2	12	535447	535458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012985	ATGTTA	2	12	537573	537584	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012985	ACATGT	2	12	589159	589170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012985	ATCAAT	2	12	589843	589854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012985	GTTTTT	2	12	603293	603304	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012985	ATTTTT	2	12	610703	610714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012985	TCAGGT	2	12	652339	652350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012985	ATTTTT	2	12	692662	692673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012985	GCAAGT	2	12	694220	694231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012985	TTCAAA	2	12	710837	710848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012985	TTTTCA	2	12	711123	711134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012985	GGAAAG	2	12	728775	728786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012985	TATTTG	2	12	728875	728886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012985	TTTATA	2	12	745979	745990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012985	TTAAAA	2	12	755858	755869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012985	TAGGTA	2	12	794824	794835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012985	TGCACA	2	12	795117	795128	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012985	ATAGAA	2	12	801219	801230	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012985	AATAAA	2	12	803444	803455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012985	ACGATT	2	12	803654	803665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012985	TTAAAA	2	12	820652	820663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012985	GGTATG	2	12	842101	842112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012985	GGTTAT	2	12	845867	845878	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012985	ATCAAT	2	12	864823	864834	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012985	TCAATA	2	12	870445	870456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012985	ATCTTA	2	12	891087	891098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012985	ATTTAT	2	12	901437	901448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012985	TGCTAT	2	12	911450	911461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012985	ATTCCA	2	12	919723	919734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012985	TAAATG	2	12	923969	923980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012985	ATTAAA	2	12	927826	927837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012985	TGATTT	2	12	946836	946847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012985	AGAATA	2	12	957438	957449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012985	AATAAA	2	12	968316	968327	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012985	CGATTG	2	12	972607	972618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012985	ATTTTA	2	12	974197	974208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012985	CTATTT	2	12	985731	985742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012985	GTTGAA	2	12	995486	995497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012985	ATATTT	2	12	1028749	1028760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012985	GTATAC	2	12	1081982	1081993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012985	AAAAAT	2	12	1083635	1083646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012985	TTATAA	2	12	1086640	1086651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012985	TAAAAA	2	12	1086728	1086739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012985	TCCTTT	2	12	1109253	1109264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012985	CACATG	2	12	1111654	1111665	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012985	TAAATA	2	12	1131813	1131824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012985	CTAATA	2	12	1152627	1152638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012985	ATTTGT	2	12	1159103	1159114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012985	ATACAT	2	12	1171375	1171386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012985	TCAATA	2	12	1185975	1185986	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012985	AGTAAA	2	12	1219755	1219766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.