MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	TGCAT	2	10	1406	1415	20 %	40 %	20 %	20 %	254780124
2	NC_012985	AGATG	2	10	1781	1790	40 %	20 %	40 %	0 %	254780124
3	NC_012985	TATCA	2	10	2485	2494	40 %	40 %	0 %	20 %	254780125
4	NC_012985	TCGTT	2	10	3027	3036	0 %	60 %	20 %	20 %	254780125
5	NC_012985	GTCCT	2	10	6210	6219	0 %	40 %	20 %	40 %	254780129
6	NC_012985	GATCA	2	10	8841	8850	40 %	20 %	20 %	20 %	254780134
7	NC_012985	TCTTT	2	10	12823	12832	0 %	80 %	0 %	20 %	254780137
8	NC_012985	AAAGA	2	10	13322	13331	80 %	0 %	20 %	0 %	254780137
9	NC_012985	AAAAT	2	10	13771	13780	80 %	20 %	0 %	0 %	254780137
10	NC_012985	GAAAA	2	10	13840	13849	80 %	0 %	20 %	0 %	254780137
11	NC_012985	AAAAT	2	10	15643	15652	80 %	20 %	0 %	0 %	254780138
12	NC_012985	TCATT	2	10	16232	16241	20 %	60 %	0 %	20 %	254780138
13	NC_012985	AAAAC	2	10	16837	16846	80 %	0 %	0 %	20 %	254780139
14	NC_012985	CTAAT	2	10	17022	17031	40 %	40 %	0 %	20 %	254780139
15	NC_012985	CAATA	2	10	18366	18375	60 %	20 %	0 %	20 %	254780140
16	NC_012985	AACAT	2	10	18379	18388	60 %	20 %	0 %	20 %	254780140
17	NC_012985	TATTT	2	10	22495	22504	20 %	80 %	0 %	0 %	254780142
18	NC_012985	AAATC	2	10	25307	25316	60 %	20 %	0 %	20 %	254780143
19	NC_012985	AGGCG	2	10	26343	26352	20 %	0 %	60 %	20 %	254780143
20	NC_012985	AAAGA	2	10	27144	27153	80 %	0 %	20 %	0 %	254780143
21	NC_012985	TCATT	2	10	28502	28511	20 %	60 %	0 %	20 %	254780144
22	NC_012985	GACGA	2	10	29232	29241	40 %	0 %	40 %	20 %	254780145
23	NC_012985	TGGGA	2	10	30539	30548	20 %	20 %	60 %	0 %	254780147
24	NC_012985	AAAAT	2	10	31368	31377	80 %	20 %	0 %	0 %	254780149
25	NC_012985	AAACA	2	10	36454	36463	80 %	0 %	0 %	20 %	254780153
26	NC_012985	CCTTG	2	10	44196	44205	0 %	40 %	20 %	40 %	254780161
27	NC_012985	ATCCC	2	10	47907	47916	20 %	20 %	0 %	60 %	254780164
28	NC_012985	CTTTA	2	10	53312	53321	20 %	60 %	0 %	20 %	254780171
29	NC_012985	CTCTT	2	10	53664	53673	0 %	60 %	0 %	40 %	254780171
30	NC_012985	AACAG	2	10	54066	54075	60 %	0 %	20 %	20 %	254780172
31	NC_012985	TTGAA	2	10	61977	61986	40 %	40 %	20 %	0 %	254780181
32	NC_012985	ATCTC	2	10	63425	63434	20 %	40 %	0 %	40 %	254780182
33	NC_012985	TCCTG	2	10	67103	67112	0 %	40 %	20 %	40 %	254780184
34	NC_012985	TTGAA	2	10	72476	72485	40 %	40 %	20 %	0 %	254780186
35	NC_012985	AAGAA	2	10	73046	73055	80 %	0 %	20 %	0 %	254780187
36	NC_012985	AAAAG	2	10	80187	80196	80 %	0 %	20 %	0 %	254780191
37	NC_012985	ATTTT	2	10	80878	80887	20 %	80 %	0 %	0 %	255764460
38	NC_012985	CATCT	2	10	82077	82086	20 %	40 %	0 %	40 %	254780193
39	NC_012985	GCACC	2	10	82160	82169	20 %	0 %	20 %	60 %	254780193
40	NC_012985	TAGAA	2	10	83214	83223	60 %	20 %	20 %	0 %	254780193
41	NC_012985	CAAGA	2	10	87840	87849	60 %	0 %	20 %	20 %	254780197
42	NC_012985	ACTTC	2	10	91707	91716	20 %	40 %	0 %	40 %	254780201
43	NC_012985	CAAGG	2	10	91774	91783	40 %	0 %	40 %	20 %	254780201
44	NC_012985	AAATC	2	10	92796	92805	60 %	20 %	0 %	20 %	254780202
45	NC_012985	AATCA	2	10	93077	93086	60 %	20 %	0 %	20 %	254780202
46	NC_012985	ATATC	2	10	94847	94856	40 %	40 %	0 %	20 %	254780204
47	NC_012985	TCCAA	2	10	95480	95489	40 %	20 %	0 %	40 %	254780205
48	NC_012985	ATAAA	2	10	95551	95560	80 %	20 %	0 %	0 %	254780205
49	NC_012985	ACAAA	2	10	96849	96858	80 %	0 %	0 %	20 %	254780206
50	NC_012985	GAGAA	2	10	106321	106330	60 %	0 %	40 %	0 %	254780218
51	NC_012985	TAAAA	2	10	106628	106637	80 %	20 %	0 %	0 %	254780219
52	NC_012985	TTCAA	2	10	106702	106711	40 %	40 %	0 %	20 %	254780219
53	NC_012985	ATAAA	2	10	106789	106798	80 %	20 %	0 %	0 %	254780219
54	NC_012985	ATAAA	2	10	106909	106918	80 %	20 %	0 %	0 %	254780219
55	NC_012985	AAATC	2	10	107258	107267	60 %	20 %	0 %	20 %	254780220
56	NC_012985	AAAAC	2	10	107541	107550	80 %	0 %	0 %	20 %	254780221
57	NC_012985	CAATG	2	10	108296	108305	40 %	20 %	20 %	20 %	254780222
58	NC_012985	TACAT	2	10	108452	108461	40 %	40 %	0 %	20 %	254780222
59	NC_012985	AAAAC	2	10	109197	109206	80 %	0 %	0 %	20 %	254780222
60	NC_012985	CTACG	2	10	109644	109653	20 %	20 %	20 %	40 %	254780222
61	NC_012985	TCATT	2	10	113234	113243	20 %	60 %	0 %	20 %	254780225
62	NC_012985	CCATC	2	10	118194	118203	20 %	20 %	0 %	60 %	254780229
63	NC_012985	CAATA	2	10	120186	120195	60 %	20 %	0 %	20 %	254780229
64	NC_012985	CTTTT	2	10	120648	120657	0 %	80 %	0 %	20 %	254780229
65	NC_012985	CTTTT	2	10	122544	122553	0 %	80 %	0 %	20 %	254780229
66	NC_012985	CAATA	2	10	122718	122727	60 %	20 %	0 %	20 %	254780229
67	NC_012985	TCCTC	2	10	125079	125088	0 %	40 %	0 %	60 %	254780231
68	NC_012985	CTTTT	2	10	125872	125881	0 %	80 %	0 %	20 %	254780233
69	NC_012985	TCACA	2	10	130877	130886	40 %	20 %	0 %	40 %	254780238
70	NC_012985	CTTTA	2	10	134292	134301	20 %	60 %	0 %	20 %	254780242
71	NC_012985	CCACT	2	10	135852	135861	20 %	20 %	0 %	60 %	254780246
72	NC_012985	GCATC	2	10	136745	136754	20 %	20 %	20 %	40 %	254780248
73	NC_012985	AAATA	2	10	138831	138840	80 %	20 %	0 %	0 %	254780254
74	NC_012985	CCTTT	2	10	138881	138890	0 %	60 %	0 %	40 %	254780254
75	NC_012985	ACGCA	2	10	147645	147654	40 %	0 %	20 %	40 %	254780266
76	NC_012985	GCATA	2	10	149518	149527	40 %	20 %	20 %	20 %	254780268
77	NC_012985	ACCAT	2	10	150258	150267	40 %	20 %	0 %	40 %	254780268
78	NC_012985	AACAT	2	10	152078	152087	60 %	20 %	0 %	20 %	254780270
79	NC_012985	AGATC	2	10	152186	152195	40 %	20 %	20 %	20 %	254780270
80	NC_012985	ACAAA	2	10	152417	152426	80 %	0 %	0 %	20 %	254780270
81	NC_012985	AGGAG	2	10	157422	157431	40 %	0 %	60 %	0 %	254780273
82	NC_012985	ACTTC	2	10	160322	160331	20 %	40 %	0 %	40 %	254780275
83	NC_012985	ACCGC	2	10	160594	160603	20 %	0 %	20 %	60 %	254780276
84	NC_012985	TTCCA	2	10	163163	163172	20 %	40 %	0 %	40 %	254780277
85	NC_012985	TATTT	2	10	163852	163861	20 %	80 %	0 %	0 %	254780277
86	NC_012985	AATTG	2	10	164215	164224	40 %	40 %	20 %	0 %	254780277
87	NC_012985	ATCCA	2	10	165593	165602	40 %	20 %	0 %	40 %	254780279
88	NC_012985	CTGTA	2	10	167382	167391	20 %	40 %	20 %	20 %	254780280
89	NC_012985	ATCTA	2	10	168528	168537	40 %	40 %	0 %	20 %	254780281
90	NC_012985	AAAAT	2	10	169122	169131	80 %	20 %	0 %	0 %	254780282
91	NC_012985	CTGTT	2	10	169808	169817	0 %	60 %	20 %	20 %	254780282
92	NC_012985	TTCGA	2	10	171400	171409	20 %	40 %	20 %	20 %	254780284
93	NC_012985	CCAAG	2	10	172432	172441	40 %	0 %	20 %	40 %	254780284
94	NC_012985	TCATT	2	10	173327	173336	20 %	60 %	0 %	20 %	254780285
95	NC_012985	TAATA	2	10	174581	174590	60 %	40 %	0 %	0 %	254780285
96	NC_012985	TTTTC	2	10	175001	175010	0 %	80 %	0 %	20 %	254780285
97	NC_012985	AAATA	2	10	175174	175183	80 %	20 %	0 %	0 %	254780286
98	NC_012985	TCATC	2	10	175434	175443	20 %	40 %	0 %	40 %	254780286
99	NC_012985	TATAA	2	10	177260	177269	60 %	40 %	0 %	0 %	254780288
100	NC_012985	CCTTT	2	10	179326	179335	0 %	60 %	0 %	40 %	254780289
101	NC_012985	ATGTT	2	10	180529	180538	20 %	60 %	20 %	0 %	254780290
102	NC_012985	ATCCT	2	10	180664	180673	20 %	40 %	0 %	40 %	254780290
103	NC_012985	AAAAC	2	10	181646	181655	80 %	0 %	0 %	20 %	254780291
104	NC_012985	TATAA	2	10	182918	182927	60 %	40 %	0 %	0 %	254780291
105	NC_012985	CATTA	2	10	182972	182981	40 %	40 %	0 %	20 %	254780291
106	NC_012985	TCCAT	2	10	184601	184610	20 %	40 %	0 %	40 %	254780294
107	NC_012985	TTGAA	2	10	186141	186150	40 %	40 %	20 %	0 %	254780295
108	NC_012985	TATCA	2	10	187226	187235	40 %	40 %	0 %	20 %	254780297
109	NC_012985	GTCTT	2	10	188330	188339	0 %	60 %	20 %	20 %	254780298
110	NC_012985	CAATC	2	10	189853	189862	40 %	20 %	0 %	40 %	254780299
111	NC_012985	GCTAT	2	10	192956	192965	20 %	40 %	20 %	20 %	254780302
112	NC_012985	GAAGG	2	10	194667	194676	40 %	0 %	60 %	0 %	254780305
113	NC_012985	CTCTA	2	10	195692	195701	20 %	40 %	0 %	40 %	254780306
114	NC_012985	GAAAA	2	10	197193	197202	80 %	0 %	20 %	0 %	254780306
115	NC_012985	GATAC	2	10	200182	200191	40 %	20 %	20 %	20 %	254780308
116	NC_012985	ACATT	2	10	210523	210532	40 %	40 %	0 %	20 %	254780317
117	NC_012985	CTTTA	2	10	211687	211696	20 %	60 %	0 %	20 %	254780320
118	NC_012985	GATGG	2	10	215510	215519	20 %	20 %	60 %	0 %	254780322
119	NC_012985	TAAGG	2	10	216877	216886	40 %	20 %	40 %	0 %	254780323
120	NC_012985	CCAAA	2	10	218974	218983	60 %	0 %	0 %	40 %	254780326
121	NC_012985	CAAGC	2	10	219578	219587	40 %	0 %	20 %	40 %	254780326
122	NC_012985	CAACA	2	10	220032	220041	60 %	0 %	0 %	40 %	254780326
123	NC_012985	ACATA	2	10	220871	220880	60 %	20 %	0 %	20 %	254780327
124	NC_012985	ATGAA	2	10	224852	224861	60 %	20 %	20 %	0 %	254780329
125	NC_012985	CATTA	2	10	226151	226160	40 %	40 %	0 %	20 %	254780331
126	NC_012985	ACGAT	2	10	226961	226970	40 %	20 %	20 %	20 %	254780332
127	NC_012985	ATTCT	2	10	227252	227261	20 %	60 %	0 %	20 %	254780332
128	NC_012985	TGGGT	2	10	228128	228137	0 %	40 %	60 %	0 %	254780333
129	NC_012985	TTGGA	2	10	229240	229249	20 %	40 %	40 %	0 %	254780334
130	NC_012985	AGAAA	2	10	229298	229307	80 %	0 %	20 %	0 %	254780334
131	NC_012985	TTAAA	2	10	232364	232373	60 %	40 %	0 %	0 %	254780336
132	NC_012985	TAATG	2	10	233174	233183	40 %	40 %	20 %	0 %	254780337
133	NC_012985	ACCTC	2	10	237146	237155	20 %	20 %	0 %	60 %	254780340
134	NC_012985	ACCAT	2	10	237278	237287	40 %	20 %	0 %	40 %	254780340
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