MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 3204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	GATG	2	8	239	246	25 %	25 %	50 %	0 %	254780122
2	NC_012985	TCTT	2	8	559	566	0 %	75 %	0 %	25 %	254780123
3	NC_012985	TTTA	2	8	865	872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012985	AATG	2	8	1497	1504	50 %	25 %	25 %	0 %	254780124
5	NC_012985	AAGC	2	8	1580	1587	50 %	0 %	25 %	25 %	254780124
6	NC_012985	CAAC	2	8	1705	1712	50 %	0 %	0 %	50 %	254780124
7	NC_012985	ACAA	3	12	2061	2072	75 %	0 %	0 %	25 %	254780124
8	NC_012985	CAAG	2	8	2683	2690	50 %	0 %	25 %	25 %	254780125
9	NC_012985	AAAC	2	8	2869	2876	75 %	0 %	0 %	25 %	254780125
10	NC_012985	AATT	2	8	3048	3055	50 %	50 %	0 %	0 %	254780125
11	NC_012985	AACT	2	8	3098	3105	50 %	25 %	0 %	25 %	254780126
12	NC_012985	ACAG	2	8	3400	3407	50 %	0 %	25 %	25 %	254780126
13	NC_012985	GAGG	2	8	3483	3490	25 %	0 %	75 %	0 %	254780126
14	NC_012985	GATT	2	8	4161	4168	25 %	50 %	25 %	0 %	254780127
15	NC_012985	CAGA	2	8	5793	5800	50 %	0 %	25 %	25 %	254780128
16	NC_012985	AGAT	2	8	5891	5898	50 %	25 %	25 %	0 %	254780128
17	NC_012985	AATT	2	8	8182	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	254780132
18	NC_012985	AAAC	2	8	8432	8439	75 %	0 %	0 %	25 %	254780133
19	NC_012985	TTCG	2	8	8899	8906	0 %	50 %	25 %	25 %	254780134
20	NC_012985	GAAA	2	8	9296	9303	75 %	0 %	25 %	0 %	254780134
21	NC_012985	AATT	2	8	9882	9889	50 %	50 %	0 %	0 %	254780135
22	NC_012985	TCTA	2	8	10033	10040	25 %	50 %	0 %	25 %	254780135
23	NC_012985	TTTC	2	8	10044	10051	0 %	75 %	0 %	25 %	254780135
24	NC_012985	ATTG	2	8	10167	10174	25 %	50 %	25 %	0 %	254780135
25	NC_012985	GATT	2	8	10696	10703	25 %	50 %	25 %	0 %	254780135
26	NC_012985	ATAA	2	8	10828	10835	75 %	25 %	0 %	0 %	254780135
27	NC_012985	ATAA	2	8	11054	11061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012985	GCGA	2	8	11572	11579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012985	ATGG	2	8	11663	11670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012985	AGTA	2	8	11693	11700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012985	TCAT	2	8	11712	11719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012985	CAGT	2	8	11752	11759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012985	AGTG	2	8	12079	12086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012985	AGAT	2	8	12517	12524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012985	AATA	2	8	12763	12770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012985	ATAG	2	8	13526	13533	50 %	25 %	25 %	0 %	254780137
37	NC_012985	AACG	2	8	13563	13570	50 %	0 %	25 %	25 %	254780137
38	NC_012985	CAAG	2	8	14504	14511	50 %	0 %	25 %	25 %	254780137
39	NC_012985	TTCC	2	8	14833	14840	0 %	50 %	0 %	50 %	254780137
40	NC_012985	TAAA	2	8	15094	15101	75 %	25 %	0 %	0 %	254780137
41	NC_012985	TAAA	2	8	15533	15540	75 %	25 %	0 %	0 %	254780138
42	NC_012985	ACTA	2	8	16248	16255	50 %	25 %	0 %	25 %	254780138
43	NC_012985	TTCA	2	8	16343	16350	25 %	50 %	0 %	25 %	254780138
44	NC_012985	CAAT	2	8	16495	16502	50 %	25 %	0 %	25 %	254780138
45	NC_012985	TCAC	2	8	17607	17614	25 %	25 %	0 %	50 %	254780140
46	NC_012985	ACAT	2	8	17698	17705	50 %	25 %	0 %	25 %	254780140
47	NC_012985	GAAA	2	8	17758	17765	75 %	0 %	25 %	0 %	254780140
48	NC_012985	ATGG	2	8	18738	18745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012985	ATTG	2	8	19056	19063	25 %	50 %	25 %	0 %	254780141
50	NC_012985	AAAT	2	8	19160	19167	75 %	25 %	0 %	0 %	254780141
51	NC_012985	TTCA	2	8	19291	19298	25 %	50 %	0 %	25 %	254780141
52	NC_012985	ATTG	2	8	19339	19346	25 %	50 %	25 %	0 %	254780141
53	NC_012985	AAAC	2	8	19520	19527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012985	TCTT	2	8	19990	19997	0 %	75 %	0 %	25 %	254780142
55	NC_012985	TGAT	2	8	20390	20397	25 %	50 %	25 %	0 %	254780142
56	NC_012985	CATT	2	8	21566	21573	25 %	50 %	0 %	25 %	254780142
57	NC_012985	TTGA	2	8	21700	21707	25 %	50 %	25 %	0 %	254780142
58	NC_012985	CTTT	2	8	22904	22911	0 %	75 %	0 %	25 %	254780142
59	NC_012985	AAAC	2	8	23950	23957	75 %	0 %	0 %	25 %	254780142
60	NC_012985	CTGA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	25 %	25 %	254780142
61	NC_012985	TTCT	2	8	24172	24179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012985	CGTG	2	8	24243	24250	0 %	25 %	50 %	25 %	254780143
63	NC_012985	CTGA	2	8	25088	25095	25 %	25 %	25 %	25 %	254780143
64	NC_012985	CGTT	2	8	25483	25490	0 %	50 %	25 %	25 %	254780143
65	NC_012985	CACG	2	8	25571	25578	25 %	0 %	25 %	50 %	254780143
66	NC_012985	CGAA	2	8	26106	26113	50 %	0 %	25 %	25 %	254780143
67	NC_012985	AACT	2	8	26594	26601	50 %	25 %	0 %	25 %	254780143
68	NC_012985	GAAC	2	8	26950	26957	50 %	0 %	25 %	25 %	254780143
69	NC_012985	TACA	2	8	27423	27430	50 %	25 %	0 %	25 %	254780143
70	NC_012985	TTTC	2	8	27476	27483	0 %	75 %	0 %	25 %	254780143
71	NC_012985	TTTC	2	8	27510	27517	0 %	75 %	0 %	25 %	254780143
72	NC_012985	ACCA	2	8	27576	27583	50 %	0 %	0 %	50 %	254780143
73	NC_012985	TCTA	2	8	27723	27730	25 %	50 %	0 %	25 %	254780143
74	NC_012985	ATGA	2	8	27738	27745	50 %	25 %	25 %	0 %	254780143
75	NC_012985	TCCA	2	8	27769	27776	25 %	25 %	0 %	50 %	254780143
76	NC_012985	CTTA	2	8	29361	29368	25 %	50 %	0 %	25 %	254780145
77	NC_012985	GAAA	2	8	29734	29741	75 %	0 %	25 %	0 %	254780146
78	NC_012985	ATCT	2	8	29944	29951	25 %	50 %	0 %	25 %	254780146
79	NC_012985	CAAC	2	8	30726	30733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012985	AAAC	2	8	30744	30751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012985	GGAT	2	8	31043	31050	25 %	25 %	50 %	0 %	254780148
82	NC_012985	ATAA	2	8	31880	31887	75 %	25 %	0 %	0 %	254780150
83	NC_012985	TTCT	2	8	32843	32850	0 %	75 %	0 %	25 %	254780150
84	NC_012985	AATA	2	8	32998	33005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012985	ATTT	2	8	33553	33560	25 %	75 %	0 %	0 %	254780151
86	NC_012985	AAAT	2	8	33566	33573	75 %	25 %	0 %	0 %	254780151
87	NC_012985	AGAA	2	8	34087	34094	75 %	0 %	25 %	0 %	254780151
88	NC_012985	CACG	2	8	34126	34133	25 %	0 %	25 %	50 %	254780151
89	NC_012985	ATCA	2	8	34535	34542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012985	TTGA	2	8	34655	34662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012985	CACT	2	8	34862	34869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012985	AGGA	2	8	36558	36565	50 %	0 %	50 %	0 %	254780153
93	NC_012985	TATT	2	8	36567	36574	25 %	75 %	0 %	0 %	254780153
94	NC_012985	CAAA	2	8	36878	36885	75 %	0 %	0 %	25 %	254780153
95	NC_012985	CCAA	2	8	36991	36998	50 %	0 %	0 %	50 %	254780153
96	NC_012985	TTCT	2	8	37158	37165	0 %	75 %	0 %	25 %	254780153
97	NC_012985	CAAG	2	8	37194	37201	50 %	0 %	25 %	25 %	254780153
98	NC_012985	AAGC	2	8	37478	37485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012985	AGAA	2	8	37551	37558	75 %	0 %	25 %	0 %	254780154
100	NC_012985	GCTG	2	8	37593	37600	0 %	25 %	50 %	25 %	254780154
101	NC_012985	AGAA	2	8	37879	37886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012985	ATAA	2	8	37971	37978	75 %	25 %	0 %	0 %	254780155
103	NC_012985	TACA	2	8	37981	37988	50 %	25 %	0 %	25 %	254780155
104	NC_012985	ATAA	2	8	38819	38826	75 %	25 %	0 %	0 %	254780156
105	NC_012985	TTCT	2	8	39079	39086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012985	GTTA	2	8	39328	39335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012985	CGAT	2	8	39856	39863	25 %	25 %	25 %	25 %	254780157
108	NC_012985	ATCG	2	8	40027	40034	25 %	25 %	25 %	25 %	254780157
109	NC_012985	CAAT	2	8	40089	40096	50 %	25 %	0 %	25 %	254780157
110	NC_012985	ACTG	2	8	40141	40148	25 %	25 %	25 %	25 %	254780157
111	NC_012985	AATC	2	8	40448	40455	50 %	25 %	0 %	25 %	254780158
112	NC_012985	TCTT	2	8	41528	41535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012985	TTTA	2	8	42320	42327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012985	ATAA	2	8	42354	42361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012985	TGTA	2	8	42698	42705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012985	AAAG	2	8	43670	43677	75 %	0 %	25 %	0 %	254780160
117	NC_012985	TAGT	2	8	43940	43947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012985	ACAT	2	8	45059	45066	50 %	25 %	0 %	25 %	254780162
119	NC_012985	TGAC	2	8	45398	45405	25 %	25 %	25 %	25 %	254780163
120	NC_012985	TTTC	2	8	45697	45704	0 %	75 %	0 %	25 %	254780163
121	NC_012985	AGCA	2	8	48041	48048	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012985	TGAT	2	8	48175	48182	25 %	50 %	25 %	0 %	254780165
123	NC_012985	CTTC	2	8	48286	48293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012985	TTCA	2	8	49294	49301	25 %	50 %	0 %	25 %	254780166
125	NC_012985	CAAT	2	8	50350	50357	50 %	25 %	0 %	25 %	254780168
126	NC_012985	TCTT	2	8	50397	50404	0 %	75 %	0 %	25 %	254780168
127	NC_012985	AAAT	2	8	50485	50492	75 %	25 %	0 %	0 %	254780168
128	NC_012985	AATA	2	8	50860	50867	75 %	25 %	0 %	0 %	254780168
129	NC_012985	TATT	2	8	51196	51203	25 %	75 %	0 %	0 %	254780169
130	NC_012985	TTTG	2	8	51534	51541	0 %	75 %	25 %	0 %	254780170
131	NC_012985	CAAA	2	8	51787	51794	75 %	0 %	0 %	25 %	254780170
132	NC_012985	AATC	2	8	52451	52458	50 %	25 %	0 %	25 %	254780170
133	NC_012985	TATG	2	8	52510	52517	25 %	50 %	25 %	0 %	254780170
134	NC_012985	TTAC	2	8	52759	52766	25 %	50 %	0 %	25 %	254780171
135	NC_012985	ATTG	2	8	53361	53368	25 %	50 %	25 %	0 %	254780171
136	NC_012985	ATCA	2	8	53784	53791	50 %	25 %	0 %	25 %	254780171
137	NC_012985	TGAT	2	8	53848	53855	25 %	50 %	25 %	0 %	254780171
138	NC_012985	TACG	2	8	53874	53881	25 %	25 %	25 %	25 %	254780172
139	NC_012985	TGCT	2	8	53997	54004	0 %	50 %	25 %	25 %	254780172
140	NC_012985	CATT	2	8	54490	54497	25 %	50 %	0 %	25 %	254780172
141	NC_012985	TAAA	2	8	55089	55096	75 %	25 %	0 %	0 %	254780173
142	NC_012985	GCCT	2	8	56435	56442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012985	ATTT	2	8	56566	56573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012985	TATT	2	8	56699	56706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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