MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 17077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	CCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780122
2	NC_012985	TCT	2	6	266	271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780122
3	NC_012985	GAC	2	6	339	344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780122
4	NC_012985	AGA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780122
5	NC_012985	TTA	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780122
6	NC_012985	CAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012985	GTT	2	6	547	552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780123
8	NC_012985	AGG	2	6	585	590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780123
9	NC_012985	AAG	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780123
10	NC_012985	TGG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780123
11	NC_012985	ACC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012985	ACA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780124
13	NC_012985	TCA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780124
14	NC_012985	TTG	2	6	1162	1167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
15	NC_012985	TTG	2	6	1330	1335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
16	NC_012985	AAC	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780124
17	NC_012985	TGT	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
18	NC_012985	TAT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780124
19	NC_012985	ATG	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780124
20	NC_012985	TGT	2	6	1678	1683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
21	NC_012985	GAA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780124
22	NC_012985	TGA	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780124
23	NC_012985	CAA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780124
24	NC_012985	GAA	2	6	2150	2155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012985	AAG	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012985	CAA	2	6	2317	2322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780125
27	NC_012985	GAG	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780125
28	NC_012985	GAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780125
29	NC_012985	TTG	2	6	2714	2719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780125
30	NC_012985	ACG	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780125
31	NC_012985	TTC	2	6	2877	2882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780125
32	NC_012985	GCA	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780125
33	NC_012985	TAA	2	6	3086	3091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780126
34	NC_012985	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254780126
35	NC_012985	CTT	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780126
36	NC_012985	GAA	2	6	3423	3428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780126
37	NC_012985	TTC	2	6	3595	3600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780126
38	NC_012985	ATG	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780126
39	NC_012985	TCT	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780127
40	NC_012985	AAG	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
41	NC_012985	GAA	2	6	4120	4125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
42	NC_012985	AAG	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
43	NC_012985	TAT	2	6	4434	4439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780127
44	NC_012985	CAT	2	6	4592	4597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
45	NC_012985	GGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780127
46	NC_012985	CAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
47	NC_012985	TTG	3	9	4871	4879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780127
48	NC_012985	ACA	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780127
49	NC_012985	TCA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
50	NC_012985	TTC	2	6	5294	5299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780127
51	NC_012985	AAG	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
52	NC_012985	TGA	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780127
53	NC_012985	TCA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
54	NC_012985	TGG	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780127
55	NC_012985	CTA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
56	NC_012985	ATG	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780127
57	NC_012985	TGA	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780127
58	NC_012985	TTG	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780128
59	NC_012985	ATC	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780128
60	NC_012985	TGG	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780128
61	NC_012985	CAG	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780128
62	NC_012985	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780128
63	NC_012985	ACG	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780128
64	NC_012985	GGA	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780128
65	NC_012985	GAA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780128
66	NC_012985	TAT	2	6	6220	6225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780129
67	NC_012985	ATT	2	6	6365	6370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780129
68	NC_012985	TTG	3	9	6432	6440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780129
69	NC_012985	CAA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780129
70	NC_012985	TCT	2	6	6674	6679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780129
71	NC_012985	AGA	2	6	6726	6731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780129
72	NC_012985	TTG	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012985	TCA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012985	TGA	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780130
75	NC_012985	TAC	2	6	6952	6957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780130
76	NC_012985	GAA	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780130
77	NC_012985	AAG	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780130
78	NC_012985	ATG	2	6	6986	6991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780130
79	NC_012985	TCA	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780130
80	NC_012985	GCC	2	6	7033	7038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254780130
81	NC_012985	TAT	2	6	7041	7046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780130
82	NC_012985	TGT	2	6	7163	7168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780130
83	NC_012985	TGG	2	6	7243	7248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780130
84	NC_012985	AGA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780130
85	NC_012985	GAT	2	6	7269	7274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780130
86	NC_012985	TAT	2	6	7333	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780130
87	NC_012985	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780130
88	NC_012985	ATA	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780131
89	NC_012985	TTC	2	6	7542	7547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780131
90	NC_012985	GAT	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780131
91	NC_012985	CAT	2	6	7655	7660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780131
92	NC_012985	TAT	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780131
93	NC_012985	GAC	2	6	7682	7687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780131
94	NC_012985	TGA	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780131
95	NC_012985	ATC	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780131
96	NC_012985	ACC	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780132
97	NC_012985	GGT	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780132
98	NC_012985	CGA	2	6	7914	7919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780132
99	NC_012985	AAC	2	6	8009	8014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780132
100	NC_012985	TAC	2	6	8031	8036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780132
101	NC_012985	AGA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780132
102	NC_012985	TAA	2	6	8057	8062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780132
103	NC_012985	TCA	2	6	8102	8107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780132
104	NC_012985	CCT	2	6	8166	8171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780132
105	NC_012985	AAT	2	6	8280	8285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780132
106	NC_012985	TCC	2	6	8564	8569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780134
107	NC_012985	TAT	2	6	8610	8615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780134
108	NC_012985	CGT	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780134
109	NC_012985	GAA	2	6	8738	8743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780134
110	NC_012985	ACT	2	6	8748	8753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780134
111	NC_012985	CTT	2	6	8932	8937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780134
112	NC_012985	TGT	2	6	9139	9144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780134
113	NC_012985	ATC	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780134
114	NC_012985	CTT	2	6	9273	9278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780134
115	NC_012985	TAA	2	6	9314	9319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780134
116	NC_012985	TAA	2	6	9389	9394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780134
117	NC_012985	GAT	2	6	9579	9584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780134
118	NC_012985	ATT	2	6	9745	9750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012985	ATA	2	6	9892	9897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780135
120	NC_012985	ATG	2	6	9997	10002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780135
121	NC_012985	TGA	2	6	10277	10282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780135
122	NC_012985	CTG	2	6	10402	10407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780135
123	NC_012985	ATA	2	6	10408	10413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780135
124	NC_012985	CGA	2	6	10547	10552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780135
125	NC_012985	CTA	2	6	10902	10907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780135
126	NC_012985	AGA	2	6	10918	10923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780135
127	NC_012985	TAA	2	6	10938	10943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780135
128	NC_012985	CAC	2	6	10953	10958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780135
129	NC_012985	TAA	2	6	10987	10992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780135
130	NC_012985	ATA	2	6	11014	11019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012985	AAT	2	6	11076	11081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012985	CAT	2	6	11169	11174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780136
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140	NC_012985	TTG	2	6	11796	11801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012985	AAT	2	6	11851	11856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_012985	TCG	2	6	12120	12125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012985	ATA	2	6	12190	12195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_012985	TAT	3	9	18812	18820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780141
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