MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 3577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	CAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012985	ACC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012985	GAA	2	6	2150	2155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012985	AAG	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012985	TTG	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012985	TCA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012985	ATT	2	6	9745	9750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012985	ATA	2	6	11014	11019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012985	AAT	2	6	11076	11081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012985	TCT	2	6	11602	11607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012985	TTG	2	6	11796	11801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012985	AAT	2	6	11851	11856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012985	GAT	2	6	11892	11897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012985	AAG	2	6	11921	11926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012985	TAC	2	6	11994	11999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012985	TCG	2	6	12120	12125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012985	ATA	2	6	12190	12195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012985	AGT	2	6	12415	12420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012985	TCT	2	6	12446	12451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012985	TCC	2	6	12567	12572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012985	ATG	2	6	12598	12603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012985	TTA	2	6	12618	12623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012985	ATC	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012985	GAA	2	6	12793	12798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012985	AAT	2	6	15193	15198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012985	AGA	2	6	15262	15267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012985	CAA	2	6	18731	18736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012985	TAA	2	6	19514	19519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012985	ATT	2	6	19539	19544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012985	TCA	2	6	19583	19588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012985	AAT	2	6	19635	19640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012985	CAT	2	6	19674	19679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012985	TAC	2	6	19703	19708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012985	ATT	2	6	19727	19732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012985	TAA	2	6	19740	19745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012985	TAC	2	6	19768	19773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012985	TGA	2	6	19804	19809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012985	TCA	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012985	ATA	2	6	19849	19854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012985	GAA	3	9	29484	29492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012985	CTA	2	6	30734	30739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012985	AAT	3	9	30760	30768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012985	CAA	2	6	31346	31351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012985	AAT	2	6	31652	31657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012985	CCG	2	6	31706	31711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012985	TTA	2	6	31769	31774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012985	AGG	2	6	33027	33032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012985	ATA	2	6	33147	33152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012985	ATG	2	6	33189	33194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012985	ATG	2	6	33215	33220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012985	CAA	2	6	34718	34723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012985	TAA	2	6	34808	34813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012985	TAA	2	6	34955	34960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012985	ATA	2	6	34972	34977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012985	CAG	2	6	35048	35053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012985	CAT	2	6	35060	35065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012985	AAC	2	6	35114	35119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012985	CTT	2	6	35162	35167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012985	ATA	2	6	35176	35181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012985	AAT	2	6	35219	35224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012985	TCA	2	6	35413	35418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012985	CCA	2	6	35425	35430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012985	TAA	2	6	35441	35446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012985	TGA	2	6	35528	35533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012985	AGA	2	6	35657	35662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012985	CAT	2	6	35960	35965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012985	TCA	2	6	36072	36077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012985	ATG	2	6	36100	36105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012985	TCA	2	6	36117	36122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012985	TTA	2	6	37328	37333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012985	TAT	2	6	37421	37426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012985	CTA	2	6	37431	37436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012985	ATA	2	6	37454	37459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012985	TAG	2	6	37499	37504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012985	ATG	2	6	37793	37798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012985	TAA	2	6	37808	37813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012985	AGT	2	6	37844	37849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012985	CTG	2	6	38099	38104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012985	CAT	2	6	38177	38182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012985	TGA	2	6	39047	39052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012985	CTA	2	6	39105	39110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012985	CAA	2	6	39213	39218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012985	AGA	2	6	39262	39267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012985	AAT	2	6	39274	39279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012985	CAA	2	6	39280	39285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012985	ATA	2	6	39312	39317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012985	AGA	2	6	39351	39356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012985	TTC	2	6	39539	39544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012985	AGA	2	6	39568	39573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012985	CTT	2	6	39588	39593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012985	GAT	2	6	39622	39627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012985	TCT	2	6	41286	41291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012985	TTA	2	6	41371	41376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012985	CAA	2	6	41445	41450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012985	GTT	2	6	41452	41457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012985	TAA	2	6	41484	41489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012985	TAG	2	6	41590	41595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012985	TAA	2	6	41973	41978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012985	CCT	2	6	42116	42121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012985	TAA	2	6	42292	42297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012985	ATA	2	6	42342	42347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012985	TTA	2	6	42348	42353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012985	TTA	2	6	42392	42397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012985	TAT	2	6	42449	42454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012985	TAA	2	6	42484	42489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012985	TCT	2	6	42545	42550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012985	AAT	2	6	42587	42592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012985	ATT	2	6	42650	42655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012985	CTC	2	6	42725	42730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012985	CAA	2	6	42736	42741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012985	GAT	2	6	42759	42764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012985	CAT	2	6	42776	42781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012985	CAT	2	6	42871	42876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012985	AAT	2	6	43962	43967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012985	TAA	2	6	44936	44941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012985	TAA	2	6	48052	48057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012985	CAA	2	6	48279	48284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012985	AGA	2	6	48350	48355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012985	TCT	2	6	48379	48384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012985	AAT	2	6	48447	48452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012985	CTA	2	6	48489	48494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012985	TCA	2	6	49321	49326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012985	GAT	2	6	49406	49411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012985	TTC	2	6	50876	50881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012985	ATT	2	6	50939	50944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012985	TAA	2	6	50977	50982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012985	TAT	2	6	51018	51023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012985	ACC	2	6	51136	51141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012985	ACA	2	6	51183	51188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012985	ATT	2	6	51389	51394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012985	ACA	2	6	51469	51474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012985	TAA	2	6	55803	55808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012985	ATT	2	6	55863	55868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012985	TAG	2	6	55898	55903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012985	ATA	2	6	56055	56060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012985	ACA	2	6	56091	56096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012985	AAC	2	6	56393	56398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012985	AGA	2	6	56490	56495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_012985	TAG	2	6	56729	56734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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