MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 1984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	254555170
2	NC_012984	ATATT	2	10	2830	2839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012984	TATAA	2	10	3130	3139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012984	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	254555173
5	NC_012984	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	254555174
6	NC_012984	TTAAC	2	10	10055	10064	40 %	40 %	0 %	20 %	254555176
7	NC_012984	CTTGA	2	10	11124	11133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012984	TCGTA	2	10	11484	11493	20 %	40 %	20 %	20 %	254555179
9	NC_012984	GACCA	2	10	11556	11565	40 %	0 %	20 %	40 %	254555179
10	NC_012984	GCTGA	2	10	11772	11781	20 %	20 %	40 %	20 %	254555179
11	NC_012984	ATCGT	2	10	16381	16390	20 %	40 %	20 %	20 %	254555182
12	NC_012984	AAAAC	2	10	18797	18806	80 %	0 %	0 %	20 %	254555184
13	NC_012984	ATCTT	2	10	20719	20728	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012984	TTCAC	2	10	22487	22496	20 %	40 %	0 %	40 %	254555186
15	NC_012984	GGCGT	2	10	27641	27650	0 %	20 %	60 %	20 %	254555190
16	NC_012984	TCAAA	2	10	30110	30119	60 %	20 %	0 %	20 %	254555191
17	NC_012984	TCCGC	2	10	32149	32158	0 %	20 %	20 %	60 %	254555192
18	NC_012984	GTATA	2	10	32795	32804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012984	CGCAC	2	10	33480	33489	20 %	0 %	20 %	60 %	254555193
20	NC_012984	TGATT	2	10	33843	33852	20 %	60 %	20 %	0 %	254555193
21	NC_012984	AAACA	2	10	33927	33936	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012984	TTAGT	2	10	34007	34016	20 %	60 %	20 %	0 %	254555194
23	NC_012984	CCATA	2	10	35703	35712	40 %	20 %	0 %	40 %	254555195
24	NC_012984	GAAAC	2	10	36110	36119	60 %	0 %	20 %	20 %	254555195
25	NC_012984	ACTGG	2	10	36238	36247	20 %	20 %	40 %	20 %	254555195
26	NC_012984	GGTTT	2	10	38492	38501	0 %	60 %	40 %	0 %	254555197
27	NC_012984	CTTTG	2	10	41835	41844	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012984	TCAAG	2	10	44789	44798	40 %	20 %	20 %	20 %	254555206
29	NC_012984	TGGTG	2	10	45251	45260	0 %	40 %	60 %	0 %	254555208
30	NC_012984	AGACT	2	10	45811	45820	40 %	20 %	20 %	20 %	254555209
31	NC_012984	AGTTA	2	10	46061	46070	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012984	TATTT	2	10	49559	49568	20 %	80 %	0 %	0 %	254555213
33	NC_012984	ATTAT	2	10	53830	53839	40 %	60 %	0 %	0 %	254555217
34	NC_012984	TTAAA	2	10	53932	53941	60 %	40 %	0 %	0 %	254555217
35	NC_012984	TGATT	2	10	55340	55349	20 %	60 %	20 %	0 %	254555220
36	NC_012984	TGATT	2	10	56901	56910	20 %	60 %	20 %	0 %	254555221
37	NC_012984	GTATG	2	10	60568	60577	20 %	40 %	40 %	0 %	254555224
38	NC_012984	ATGTC	2	10	60646	60655	20 %	40 %	20 %	20 %	254555224
39	NC_012984	TATTT	2	10	63644	63653	20 %	80 %	0 %	0 %	254555227
40	NC_012984	TGCGG	2	10	67289	67298	0 %	20 %	60 %	20 %	254555231
41	NC_012984	GATTG	2	10	68158	68167	20 %	40 %	40 %	0 %	254555233
42	NC_012984	GCACG	2	10	70683	70692	20 %	0 %	40 %	40 %	254555234
43	NC_012984	TTACA	2	10	72620	72629	40 %	40 %	0 %	20 %	254555235
44	NC_012984	GGCAA	2	10	73433	73442	40 %	0 %	40 %	20 %	254555236
45	NC_012984	GACCT	2	10	74940	74949	20 %	20 %	20 %	40 %	254555238
46	NC_012984	GATCA	2	10	75111	75120	40 %	20 %	20 %	20 %	254555238
47	NC_012984	GCTTG	2	10	80431	80440	0 %	40 %	40 %	20 %	254555244
48	NC_012984	ACTTC	2	10	80559	80568	20 %	40 %	0 %	40 %	254555244
49	NC_012984	AACGG	2	10	80776	80785	40 %	0 %	40 %	20 %	254555245
50	NC_012984	GTTAA	2	10	80809	80818	40 %	40 %	20 %	0 %	254555245
51	NC_012984	GCTTA	2	10	82785	82794	20 %	40 %	20 %	20 %	254555246
52	NC_012984	TTGAC	2	10	83034	83043	20 %	40 %	20 %	20 %	254555246
53	NC_012984	ATGCC	2	10	87559	87568	20 %	20 %	20 %	40 %	254555251
54	NC_012984	TTGAA	2	10	92896	92905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012984	AAAGC	2	10	96272	96281	60 %	0 %	20 %	20 %	254555261
56	NC_012984	GTTAG	2	10	96398	96407	20 %	40 %	40 %	0 %	254555261
57	NC_012984	CTAAG	2	10	96828	96837	40 %	20 %	20 %	20 %	254555261
58	NC_012984	AGGTG	2	10	100189	100198	20 %	20 %	60 %	0 %	254555264
59	NC_012984	TTGAA	2	10	100843	100852	40 %	40 %	20 %	0 %	254555265
60	NC_012984	GGGGC	2	10	103454	103463	0 %	0 %	80 %	20 %	254555267
61	NC_012984	TATGA	2	10	104138	104147	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012984	GCACG	2	10	104703	104712	20 %	0 %	40 %	40 %	254555268
63	NC_012984	TGATT	2	10	110029	110038	20 %	60 %	20 %	0 %	254555274
64	NC_012984	TGGGA	2	10	112715	112724	20 %	20 %	60 %	0 %	254555278
65	NC_012984	TAAGC	2	10	114257	114266	40 %	20 %	20 %	20 %	254555281
66	NC_012984	GATCA	2	10	114304	114313	40 %	20 %	20 %	20 %	254555281
67	NC_012984	TTGAT	2	10	116028	116037	20 %	60 %	20 %	0 %	254555282
68	NC_012984	CACGT	2	10	116209	116218	20 %	20 %	20 %	40 %	254555283
69	NC_012984	GATTT	2	10	116410	116419	20 %	60 %	20 %	0 %	254555283
70	NC_012984	GGCGG	2	10	116457	116466	0 %	0 %	80 %	20 %	254555283
71	NC_012984	CACGG	2	10	116751	116760	20 %	0 %	40 %	40 %	254555283
72	NC_012984	TTCAT	2	10	119408	119417	20 %	60 %	0 %	20 %	254555286
73	NC_012984	GGTTA	2	10	121554	121563	20 %	40 %	40 %	0 %	254555288
74	NC_012984	ATTGA	2	10	122888	122897	40 %	40 %	20 %	0 %	254555289
75	NC_012984	ACCGT	2	10	125057	125066	20 %	20 %	20 %	40 %	254555291
76	NC_012984	AATAA	2	10	125318	125327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012984	TCATT	2	10	127096	127105	20 %	60 %	0 %	20 %	254555292
78	NC_012984	TTCGA	2	10	132218	132227	20 %	40 %	20 %	20 %	254555299
79	NC_012984	ATGTT	2	10	132384	132393	20 %	60 %	20 %	0 %	254555299
80	NC_012984	GGCGT	2	10	134222	134231	0 %	20 %	60 %	20 %	254555301
81	NC_012984	CATGC	2	10	135406	135415	20 %	20 %	20 %	40 %	254555302
82	NC_012984	CAACC	2	10	135669	135678	40 %	0 %	0 %	60 %	254555302
83	NC_012984	ATCAA	2	10	136272	136281	60 %	20 %	0 %	20 %	254555303
84	NC_012984	CTTGG	2	10	136489	136498	0 %	40 %	40 %	20 %	254555303
85	NC_012984	GTTCA	2	10	137440	137449	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012984	TAATC	2	10	142408	142417	40 %	40 %	0 %	20 %	254555308
87	NC_012984	CGGTG	2	10	142613	142622	0 %	20 %	60 %	20 %	254555308
88	NC_012984	TCGAT	2	10	143606	143615	20 %	40 %	20 %	20 %	254555309
89	NC_012984	AAATT	2	10	143897	143906	60 %	40 %	0 %	0 %	254555309
90	NC_012984	GAGGT	2	10	145125	145134	20 %	20 %	60 %	0 %	254555310
91	NC_012984	GTACC	2	10	145690	145699	20 %	20 %	20 %	40 %	254555310
92	NC_012984	GAATT	2	10	146501	146510	40 %	40 %	20 %	0 %	254555311
93	NC_012984	AATTA	2	10	147940	147949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012984	AATCA	2	10	149681	149690	60 %	20 %	0 %	20 %	254555316
95	NC_012984	CGGAG	2	10	150610	150619	20 %	0 %	60 %	20 %	254555317
96	NC_012984	TTGAC	2	10	151866	151875	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012984	TAAAC	2	10	152338	152347	60 %	20 %	0 %	20 %	254555319
98	NC_012984	ATGAA	2	10	154901	154910	60 %	20 %	20 %	0 %	254555321
99	NC_012984	GGAAT	2	10	155411	155420	40 %	20 %	40 %	0 %	254555322
100	NC_012984	ATTAA	2	10	156946	156955	60 %	40 %	0 %	0 %	254555322
101	NC_012984	TGACG	2	10	158172	158181	20 %	20 %	40 %	20 %	254555324
102	NC_012984	TCACC	2	10	159774	159783	20 %	20 %	0 %	60 %	254555326
103	NC_012984	AACTA	2	10	160724	160733	60 %	20 %	0 %	20 %	254555327
104	NC_012984	GCAAA	2	10	160815	160824	60 %	0 %	20 %	20 %	254555327
105	NC_012984	ACCGA	2	10	160998	161007	40 %	0 %	20 %	40 %	254555327
106	NC_012984	TTTTA	2	10	162735	162744	20 %	80 %	0 %	0 %	254555330
107	NC_012984	TATCT	2	10	164668	164677	20 %	60 %	0 %	20 %	254555332
108	NC_012984	CAACG	2	10	166674	166683	40 %	0 %	20 %	40 %	254555333
109	NC_012984	ATTGG	3	15	168172	168186	20 %	40 %	40 %	0 %	254555334
110	NC_012984	AAAAC	2	10	169900	169909	80 %	0 %	0 %	20 %	254555336
111	NC_012984	TCCGG	2	10	169919	169928	0 %	20 %	40 %	40 %	254555336
112	NC_012984	TTAAC	2	10	170536	170545	40 %	40 %	0 %	20 %	254555336
113	NC_012984	GTTGT	2	10	170649	170658	0 %	60 %	40 %	0 %	254555336
114	NC_012984	AGGTC	2	10	171902	171911	20 %	20 %	40 %	20 %	254555337
115	NC_012984	GATCG	2	10	172787	172796	20 %	20 %	40 %	20 %	254555338
116	NC_012984	TTTAA	2	10	184686	184695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012984	AATTG	2	10	184761	184770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012984	ATATA	2	10	184817	184826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012984	TTCGT	2	10	185402	185411	0 %	60 %	20 %	20 %	254555345
120	NC_012984	TCTGG	2	10	185585	185594	0 %	40 %	40 %	20 %	254555345
121	NC_012984	GGTTA	2	10	190026	190035	20 %	40 %	40 %	0 %	254555348
122	NC_012984	ATTAA	2	10	190340	190349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012984	AACTG	2	10	191732	191741	40 %	20 %	20 %	20 %	254555349
124	NC_012984	GGCGT	2	10	199453	199462	0 %	20 %	60 %	20 %	254555353
125	NC_012984	TGTGA	2	10	199552	199561	20 %	40 %	40 %	0 %	254555353
126	NC_012984	TTTGG	2	10	200612	200621	0 %	60 %	40 %	0 %	254555354
127	NC_012984	ATCTG	2	10	202483	202492	20 %	40 %	20 %	20 %	254555355
128	NC_012984	TCAAA	2	10	207650	207659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012984	TATAA	2	10	207786	207795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012984	AACCC	2	10	212973	212982	40 %	0 %	0 %	60 %	254555368
131	NC_012984	TCCAA	2	10	215298	215307	40 %	20 %	0 %	40 %	254555370
132	NC_012984	AGGAC	2	10	215445	215454	40 %	0 %	40 %	20 %	254555370
133	NC_012984	AGTTG	2	10	216182	216191	20 %	40 %	40 %	0 %	254555371
134	NC_012984	TTGTG	2	10	216460	216469	0 %	60 %	40 %	0 %	254555371
135	NC_012984	ACTTG	2	10	218288	218297	20 %	40 %	20 %	20 %	254555373
136	NC_012984	TTTAA	2	10	218745	218754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012984	TACGT	2	10	218785	218794	20 %	40 %	20 %	20 %	254555374
138	NC_012984	AAAAT	2	10	220978	220987	80 %	20 %	0 %	0 %	254555376
139	NC_012984	CTTTG	2	10	223748	223757	0 %	60 %	20 %	20 %	254555380
140	NC_012984	ACCAT	2	10	227002	227011	40 %	20 %	0 %	40 %	254555382
141	NC_012984	ATGCA	2	10	232202	232211	40 %	20 %	20 %	20 %	254555385
142	NC_012984	AAAAT	2	10	235510	235519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012984	GGCGC	2	10	237750	237759	0 %	0 %	60 %	40 %	254555393
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146	NC_012984	GGTCA	2	10	248815	248824	20 %	20 %	40 %	20 %	254555405
147	NC_012984	GTGAC	2	10	249104	249113	20 %	20 %	40 %	20 %	254555405
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149	NC_012984	AGGTT	2	10	250851	250860	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012984	GTGAC	2	10	254595	254604	20 %	20 %	40 %	20 %	254555409
151	NC_012984	ACAAT	2	10	255329	255338	60 %	20 %	0 %	20 %	254555410
152	NC_012984	TGCAA	2	10	258140	258149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_012984	TAAAG	2	10	260963	260972	60 %	20 %	20 %	0 %	254555416
154	NC_012984	AAAAT	2	10	261811	261820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012984	TAAGA	2	10	262805	262814	60 %	20 %	20 %	0 %	254555418
156	NC_012984	TTAAT	2	10	264390	264399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012984	CTGGC	2	10	264803	264812	0 %	20 %	40 %	40 %	254555421
158	NC_012984	CCGTT	2	10	266505	266514	0 %	40 %	20 %	40 %	254555422
159	NC_012984	AACGG	2	10	267528	267537	40 %	0 %	40 %	20 %	254555424
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163	NC_012984	GAATT	2	10	270784	270793	40 %	40 %	20 %	0 %	254555427
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166	NC_012984	TTAAT	2	10	271981	271990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012984	GGCGT	2	10	272312	272321	0 %	20 %	60 %	20 %	254555429
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169	NC_012984	ACAAA	2	10	274620	274629	80 %	0 %	0 %	20 %	254555430
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171	NC_012984	AATAA	2	10	276741	276750	80 %	20 %	0 %	0 %	254555430
172	NC_012984	TTACG	2	10	279311	279320	20 %	40 %	20 %	20 %	254555432
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175	NC_012984	TGATT	2	10	282345	282354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012984	TTGGC	2	10	286609	286618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_012984	ATCAC	2	10	290327	290336	40 %	20 %	0 %	40 %	254555442
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179	NC_012984	GATGT	2	10	293640	293649	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_012984	ATTAA	2	10	295989	295998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012984	TTCGT	2	10	298994	299003	0 %	60 %	20 %	20 %	254555451
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184	NC_012984	GCTAA	2	10	301366	301375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_012984	AGATG	2	10	302312	302321	40 %	20 %	40 %	0 %	254555455
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195	NC_012984	GATTA	2	10	312120	312129	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012984	AACGA	2	10	313149	313158	60 %	0 %	20 %	20 %	254555466
197	NC_012984	TCGAA	2	10	313484	313493	40 %	20 %	20 %	20 %	254555466
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201	NC_012984	AGGAA	2	10	318952	318961	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
202	NC_012984	GACCT	2	10	322072	322081	20 %	20 %	20 %	40 %	254555476
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207	NC_012984	TACAA	2	10	325097	325106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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215	NC_012984	CCACG	2	10	344756	344765	20 %	0 %	20 %	60 %	254555498
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218	NC_012984	TGTCT	2	10	348678	348687	0 %	60 %	20 %	20 %	254555501
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230	NC_012984	AATTA	2	10	364032	364041	60 %	40 %	0 %	0 %	254555513
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233	NC_012984	TCTTT	2	10	371850	371859	0 %	80 %	0 %	20 %	254555519
234	NC_012984	CTGGA	2	10	371891	371900	20 %	20 %	40 %	20 %	254555519
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238	NC_012984	GTAAA	2	10	377800	377809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_012984	CAAAA	2	10	379191	379200	80 %	0 %	0 %	20 %	254555526
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243	NC_012984	TTGGC	2	10	391230	391239	0 %	40 %	40 %	20 %	254555538
244	NC_012984	ATTTT	2	10	392195	392204	20 %	80 %	0 %	0 %	254555539
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247	NC_012984	CCAAG	2	10	394892	394901	40 %	0 %	20 %	40 %	254555542
248	NC_012984	GGAAT	2	10	397086	397095	40 %	20 %	40 %	0 %	254555543
249	NC_012984	TCGGT	2	10	397231	397240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
250	NC_012984	AAATT	2	10	398549	398558	60 %	40 %	0 %	0 %	254555544
251	NC_012984	TGACC	2	10	398688	398697	20 %	20 %	20 %	40 %	254555545
252	NC_012984	TTTAA	2	10	398791	398800	40 %	60 %	0 %	0 %	254555545
253	NC_012984	ACGGA	2	10	399230	399239	40 %	0 %	40 %	20 %	254555545
254	NC_012984	TAAGC	2	10	399499	399508	40 %	20 %	20 %	20 %	254555545
255	NC_012984	CGTTT	2	10	401024	401033	0 %	60 %	20 %	20 %	254555547
256	NC_012984	GATGG	2	10	402600	402609	20 %	20 %	60 %	0 %	254555549
257	NC_012984	ATTGA	2	10	407081	407090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012984	TGGAC	2	10	408353	408362	20 %	20 %	40 %	20 %	254555554
259	NC_012984	TGATT	2	10	409215	409224	20 %	60 %	20 %	0 %	254555555
260	NC_012984	TATGT	2	10	410891	410900	20 %	60 %	20 %	0 %	254555558
261	NC_012984	TTAAA	2	10	412901	412910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012984	TGGGG	2	10	413281	413290	0 %	20 %	80 %	0 %	254555561
263	NC_012984	AATGA	2	10	413654	413663	60 %	20 %	20 %	0 %	254555561
264	NC_012984	TAATT	2	10	415677	415686	40 %	60 %	0 %	0 %	254555563
265	NC_012984	GGATG	2	10	416189	416198	20 %	20 %	60 %	0 %	254555564
266	NC_012984	ACGGG	2	10	417500	417509	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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268	NC_012984	TGGAC	2	10	419813	419822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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