MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 1786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012984	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012984	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012984	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012984	AGAA	2	8	9381	9388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012984	ATTG	2	8	9686	9693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012984	GAGT	2	8	13266	13273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012984	TTGG	2	8	17039	17046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012984	TAAA	2	8	17108	17115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012984	TCAG	2	8	22540	22547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012984	TAAG	2	8	22766	22773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012984	AAGG	2	8	30923	30930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012984	ATTA	2	8	33068	33075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012984	GTTT	2	8	33975	33982	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012984	TGAA	2	8	37578	37585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012984	TGAT	2	8	38383	38390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012984	CAGT	2	8	38423	38430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012984	AAAC	2	8	44463	44470	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012984	GTTA	2	8	45126	45133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012984	AACC	2	8	46227	46234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012984	TAAT	2	8	50103	50110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012984	GTAT	2	8	52918	52925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012984	ACTT	2	8	53494	53501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012984	CTAT	2	8	54012	54019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012984	GCTT	2	8	54688	54695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012984	TAAT	2	8	54967	54974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012984	AAAG	2	8	55045	55052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012984	CAAC	2	8	55098	55105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012984	GCTT	2	8	60251	60258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012984	TAAA	2	8	62969	62976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012984	ATCA	2	8	63579	63586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012984	ATCT	2	8	65041	65048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012984	TGGG	2	8	65098	65105	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012984	ATGA	2	8	65329	65336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012984	ATGT	2	8	65409	65416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012984	CTTG	2	8	66324	66331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012984	TGAT	2	8	72949	72956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012984	AAAT	2	8	75202	75209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012984	TTAG	2	8	75288	75295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012984	CAAA	2	8	75372	75379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012984	CAAA	2	8	76361	76368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012984	CAAT	2	8	79904	79911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012984	TAGA	2	8	85686	85693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012984	AATA	2	8	88167	88174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012984	TTAT	2	8	92854	92861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012984	GATT	2	8	94126	94133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012984	CTTA	2	8	95216	95223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012984	GAAC	2	8	95320	95327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012984	ATGG	2	8	95751	95758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012984	CGGT	2	8	97166	97173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012984	CTTG	2	8	97739	97746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012984	AGTG	2	8	98487	98494	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012984	TTTG	2	8	99461	99468	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012984	ACGT	2	8	100408	100415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012984	GGCT	2	8	100947	100954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012984	ATTT	2	8	102734	102741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012984	TAAA	2	8	103166	103173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012984	ATTG	2	8	103201	103208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012984	ATTA	2	8	103235	103242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012984	CAAA	2	8	104220	104227	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012984	TAAT	2	8	115027	115034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012984	AATG	2	8	119697	119704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012984	AATT	2	8	121459	121466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012984	CTGA	2	8	122079	122086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012984	TGTT	2	8	122091	122098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012984	GCGG	2	8	128476	128483	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012984	TATT	2	8	129516	129523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012984	GAGC	2	8	131423	131430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012984	TACT	2	8	131671	131678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012984	TAGT	2	8	132956	132963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012984	TAAT	2	8	135736	135743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012984	TTTG	2	8	136664	136671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012984	CATA	2	8	137273	137280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012984	CAAT	2	8	140326	140333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012984	TTTC	2	8	140517	140524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012984	CAAA	2	8	143359	143366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012984	GAAT	2	8	146553	146560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012984	ATTC	2	8	146978	146985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012984	TTAA	2	8	147032	147039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012984	AAAG	2	8	147956	147963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012984	TAAA	2	8	150111	150118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012984	GTTA	2	8	150143	150150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012984	GAGT	2	8	152016	152023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012984	CAAT	2	8	157004	157011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012984	TTAA	2	8	157099	157106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012984	TAAT	2	8	157112	157119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012984	AGGA	2	8	159520	159527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012984	TAAA	2	8	162272	162279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012984	TTAA	2	8	166119	166126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012984	ATTT	2	8	166198	166205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012984	ATTT	2	8	167653	167660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012984	ATTC	2	8	175648	175655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012984	GCGA	2	8	178686	178693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012984	TAGC	2	8	178895	178902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012984	GTAT	2	8	178938	178945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012984	TCAA	2	8	179020	179027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012984	AACG	2	8	179110	179117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012984	CTAG	2	8	179155	179162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012984	TTAT	2	8	180472	180479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012984	TAAA	2	8	190209	190216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012984	GATT	2	8	191901	191908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012984	CACT	2	8	191948	191955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012984	TCGT	2	8	192096	192103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012984	AAAT	2	8	192181	192188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012984	GTTG	2	8	195129	195136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012984	TGAT	2	8	195171	195178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012984	AATT	2	8	195250	195257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012984	ATTA	2	8	195892	195899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012984	ATAA	2	8	195907	195914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012984	TTTA	2	8	198889	198896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012984	GCCA	2	8	198989	198996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012984	CGCT	2	8	200128	200135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012984	TTAA	2	8	203842	203849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012984	TTAG	2	8	206773	206780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012984	CAGT	2	8	206823	206830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012984	AGCA	2	8	206852	206859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012984	AACG	2	8	207582	207589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012984	TTAG	2	8	209187	209194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012984	ACGT	2	8	209265	209272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012984	GTTA	2	8	210803	210810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012984	GAAT	2	8	210833	210840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012984	TTGA	2	8	210914	210921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012984	AGTT	2	8	212529	212536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012984	TAAT	2	8	213432	213439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012984	ATTA	2	8	213495	213502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012984	ATGA	2	8	218090	218097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012984	CAAT	2	8	218131	218138	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012984	AAGA	2	8	218755	218762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012984	TTGA	2	8	221371	221378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012984	AAAT	2	8	221388	221395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012984	AATT	2	8	221522	221529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012984	CAAA	2	8	221648	221655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012984	TAAA	2	8	223699	223706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012984	AGGA	2	8	228098	228105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012984	GTAG	2	8	233839	233846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012984	GGTA	2	8	233884	233891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012984	AAGT	2	8	233907	233914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012984	AGTT	2	8	236826	236833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012984	AAAG	2	8	239097	239104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012984	GAAT	2	8	242692	242699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012984	ACTA	2	8	242879	242886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012984	TTGG	2	8	245978	245985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012984	CTGG	2	8	246150	246157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012984	TAAT	2	8	250677	250684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012984	TCCC	2	8	253679	253686	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_012984	TAAA	2	8	255666	255673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012984	AGTG	2	8	256582	256589	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012984	GTTT	2	8	259561	259568	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012984	GCAA	2	8	261264	261271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012984	GATG	2	8	265219	265226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012984	CTTA	2	8	265391	265398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_012984	GACA	2	8	267748	267755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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