MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 1880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	254555170
2	NC_012984	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	254555172
3	NC_012984	GT	3	6	6511	6516	0 %	50 %	50 %	0 %	254555174
4	NC_012984	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	254555175
5	NC_012984	AT	3	6	11468	11473	50 %	50 %	0 %	0 %	254555179
6	NC_012984	GC	3	6	13880	13885	0 %	0 %	50 %	50 %	254555181
7	NC_012984	TG	3	6	14500	14505	0 %	50 %	50 %	0 %	254555181
8	NC_012984	GT	3	6	15928	15933	0 %	50 %	50 %	0 %	254555182
9	NC_012984	TA	3	6	17977	17982	50 %	50 %	0 %	0 %	254555183
10	NC_012984	CG	3	6	19503	19508	0 %	0 %	50 %	50 %	254555185
11	NC_012984	GC	3	6	19581	19586	0 %	0 %	50 %	50 %	254555185
12	NC_012984	GT	3	6	20294	20299	0 %	50 %	50 %	0 %	254555185
13	NC_012984	CT	3	6	21532	21537	0 %	50 %	0 %	50 %	254555186
14	NC_012984	AT	3	6	22116	22121	50 %	50 %	0 %	0 %	254555186
15	NC_012984	CG	3	6	23279	23284	0 %	0 %	50 %	50 %	254555187
16	NC_012984	GC	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	254555187
17	NC_012984	AT	3	6	25096	25101	50 %	50 %	0 %	0 %	254555188
18	NC_012984	CG	3	6	27147	27152	0 %	0 %	50 %	50 %	254555190
19	NC_012984	CG	3	6	28079	28084	0 %	0 %	50 %	50 %	254555190
20	NC_012984	TG	3	6	29081	29086	0 %	50 %	50 %	0 %	254555191
21	NC_012984	CG	3	6	33783	33788	0 %	0 %	50 %	50 %	254555193
22	NC_012984	CA	3	6	34950	34955	50 %	0 %	0 %	50 %	254555195
23	NC_012984	GA	3	6	35093	35098	50 %	0 %	50 %	0 %	254555195
24	NC_012984	GC	3	6	35116	35121	0 %	0 %	50 %	50 %	254555195
25	NC_012984	GC	3	6	36185	36190	0 %	0 %	50 %	50 %	254555195
26	NC_012984	GT	3	6	38243	38248	0 %	50 %	50 %	0 %	254555196
27	NC_012984	GT	4	8	39503	39510	0 %	50 %	50 %	0 %	254555199
28	NC_012984	TG	3	6	40134	40139	0 %	50 %	50 %	0 %	254555199
29	NC_012984	TA	3	6	40726	40731	50 %	50 %	0 %	0 %	254555200
30	NC_012984	AT	3	6	40811	40816	50 %	50 %	0 %	0 %	254555200
31	NC_012984	TA	3	6	41111	41116	50 %	50 %	0 %	0 %	254555200
32	NC_012984	GT	3	6	41230	41235	0 %	50 %	50 %	0 %	254555200
33	NC_012984	AC	3	6	42713	42718	50 %	0 %	0 %	50 %	254555204
34	NC_012984	GA	3	6	42938	42943	50 %	0 %	50 %	0 %	254555204
35	NC_012984	AC	3	6	45523	45528	50 %	0 %	0 %	50 %	254555209
36	NC_012984	TG	3	6	46997	47002	0 %	50 %	50 %	0 %	254555210
37	NC_012984	CG	3	6	47538	47543	0 %	0 %	50 %	50 %	254555210
38	NC_012984	GC	3	6	48211	48216	0 %	0 %	50 %	50 %	254555211
39	NC_012984	TG	3	6	50313	50318	0 %	50 %	50 %	0 %	254555214
40	NC_012984	AC	3	6	51931	51936	50 %	0 %	0 %	50 %	254555215
41	NC_012984	TA	3	6	56381	56386	50 %	50 %	0 %	0 %	254555221
42	NC_012984	CA	3	6	56747	56752	50 %	0 %	0 %	50 %	254555221
43	NC_012984	TG	3	6	57022	57027	0 %	50 %	50 %	0 %	254555221
44	NC_012984	GT	3	6	58926	58931	0 %	50 %	50 %	0 %	254555222
45	NC_012984	GC	3	6	59256	59261	0 %	0 %	50 %	50 %	254555223
46	NC_012984	AC	3	6	60526	60531	50 %	0 %	0 %	50 %	254555224
47	NC_012984	GT	3	6	60708	60713	0 %	50 %	50 %	0 %	254555224
48	NC_012984	GC	3	6	63428	63433	0 %	0 %	50 %	50 %	254555226
49	NC_012984	AT	4	8	63636	63643	50 %	50 %	0 %	0 %	254555227
50	NC_012984	TA	3	6	64603	64608	50 %	50 %	0 %	0 %	254555228
51	NC_012984	TG	3	6	69540	69545	0 %	50 %	50 %	0 %	254555234
52	NC_012984	GC	3	6	70261	70266	0 %	0 %	50 %	50 %	254555234
53	NC_012984	AT	3	6	71025	71030	50 %	50 %	0 %	0 %	254555234
54	NC_012984	CA	3	6	72004	72009	50 %	0 %	0 %	50 %	254555235
55	NC_012984	TA	3	6	72210	72215	50 %	50 %	0 %	0 %	254555235
56	NC_012984	CA	3	6	73107	73112	50 %	0 %	0 %	50 %	254555236
57	NC_012984	GT	3	6	74286	74291	0 %	50 %	50 %	0 %	254555237
58	NC_012984	TG	3	6	74980	74985	0 %	50 %	50 %	0 %	254555238
59	NC_012984	AC	3	6	77118	77123	50 %	0 %	0 %	50 %	254555240
60	NC_012984	TG	3	6	79052	79057	0 %	50 %	50 %	0 %	254555242
61	NC_012984	TA	3	6	83178	83183	50 %	50 %	0 %	0 %	254555246
62	NC_012984	CA	3	6	86026	86031	50 %	0 %	0 %	50 %	254555249
63	NC_012984	GC	3	6	86665	86670	0 %	0 %	50 %	50 %	254555250
64	NC_012984	GA	3	6	87022	87027	50 %	0 %	50 %	0 %	254555250
65	NC_012984	TG	3	6	89562	89567	0 %	50 %	50 %	0 %	254555253
66	NC_012984	GC	3	6	89839	89844	0 %	0 %	50 %	50 %	254555253
67	NC_012984	AC	3	6	90140	90145	50 %	0 %	0 %	50 %	254555253
68	NC_012984	GC	3	6	90626	90631	0 %	0 %	50 %	50 %	254555253
69	NC_012984	CA	3	6	91290	91295	50 %	0 %	0 %	50 %	254555254
70	NC_012984	CG	3	6	93461	93466	0 %	0 %	50 %	50 %	254555258
71	NC_012984	CG	3	6	94426	94431	0 %	0 %	50 %	50 %	254555259
72	NC_012984	GC	3	6	102339	102344	0 %	0 %	50 %	50 %	254555266
73	NC_012984	TG	3	6	102641	102646	0 %	50 %	50 %	0 %	254555266
74	NC_012984	CA	3	6	104564	104569	50 %	0 %	0 %	50 %	254555268
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79	NC_012984	GT	3	6	119235	119240	0 %	50 %	50 %	0 %	254555286
80	NC_012984	TG	3	6	119598	119603	0 %	50 %	50 %	0 %	254555286
81	NC_012984	CG	3	6	120829	120834	0 %	0 %	50 %	50 %	254555287
82	NC_012984	AT	3	6	122488	122493	50 %	50 %	0 %	0 %	254555289
83	NC_012984	GC	3	6	124564	124569	0 %	0 %	50 %	50 %	254555291
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85	NC_012984	TG	3	6	126340	126345	0 %	50 %	50 %	0 %	254555292
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90	NC_012984	TG	3	6	136069	136074	0 %	50 %	50 %	0 %	254555303
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94	NC_012984	GC	3	6	144266	144271	0 %	0 %	50 %	50 %	254555310
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100	NC_012984	GA	3	6	152568	152573	50 %	0 %	50 %	0 %	254555319
101	NC_012984	TG	3	6	152619	152624	0 %	50 %	50 %	0 %	254555319
102	NC_012984	GC	3	6	152771	152776	0 %	0 %	50 %	50 %	254555319
103	NC_012984	CG	3	6	153269	153274	0 %	0 %	50 %	50 %	254555320
104	NC_012984	GC	3	6	154931	154936	0 %	0 %	50 %	50 %	254555321
105	NC_012984	CA	3	6	156500	156505	50 %	0 %	0 %	50 %	254555322
106	NC_012984	TA	3	6	159966	159971	50 %	50 %	0 %	0 %	254555326
107	NC_012984	GC	3	6	162393	162398	0 %	0 %	50 %	50 %	254555330
108	NC_012984	GA	3	6	163507	163512	50 %	0 %	50 %	0 %	254555331
109	NC_012984	AT	3	6	164428	164433	50 %	50 %	0 %	0 %	254555332
110	NC_012984	GC	3	6	169027	169032	0 %	0 %	50 %	50 %	254555335
111	NC_012984	CA	3	6	170092	170097	50 %	0 %	0 %	50 %	254555336
112	NC_012984	AC	3	6	171217	171222	50 %	0 %	0 %	50 %	254555337
113	NC_012984	CA	3	6	174162	174167	50 %	0 %	0 %	50 %	254555339
114	NC_012984	AC	3	6	174620	174625	50 %	0 %	0 %	50 %	254555339
115	NC_012984	GC	3	6	174808	174813	0 %	0 %	50 %	50 %	254555339
116	NC_012984	GC	3	6	175891	175896	0 %	0 %	50 %	50 %	254555340
117	NC_012984	GT	3	6	177487	177492	0 %	50 %	50 %	0 %	254555340
118	NC_012984	TA	3	6	179484	179489	50 %	50 %	0 %	0 %	254555341
119	NC_012984	GT	3	6	181229	181234	0 %	50 %	50 %	0 %	254555343
120	NC_012984	GT	3	6	182304	182309	0 %	50 %	50 %	0 %	254555343
121	NC_012984	TA	3	6	183755	183760	50 %	50 %	0 %	0 %	254555344
122	NC_012984	CG	3	6	185799	185804	0 %	0 %	50 %	50 %	254555345
123	NC_012984	CG	3	6	187149	187154	0 %	0 %	50 %	50 %	254555346
124	NC_012984	AC	3	6	187883	187888	50 %	0 %	0 %	50 %	254555347
125	NC_012984	GC	3	6	189234	189239	0 %	0 %	50 %	50 %	254555348
126	NC_012984	AT	3	6	192308	192313	50 %	50 %	0 %	0 %	254555350
127	NC_012984	AT	3	6	197436	197441	50 %	50 %	0 %	0 %	254555352
128	NC_012984	AT	3	6	203701	203706	50 %	50 %	0 %	0 %	254555355
129	NC_012984	GC	3	6	204616	204621	0 %	0 %	50 %	50 %	254555357
130	NC_012984	TG	3	6	204626	204631	0 %	50 %	50 %	0 %	254555357
131	NC_012984	GT	3	6	204861	204866	0 %	50 %	50 %	0 %	254555357
132	NC_012984	GC	3	6	205310	205315	0 %	0 %	50 %	50 %	254555357
133	NC_012984	CG	4	8	211640	211647	0 %	0 %	50 %	50 %	254555364
134	NC_012984	CT	3	6	212210	212215	0 %	50 %	0 %	50 %	254555365
135	NC_012984	GC	3	6	217060	217065	0 %	0 %	50 %	50 %	254555371
136	NC_012984	CG	3	6	220111	220116	0 %	0 %	50 %	50 %	254555375
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138	NC_012984	TG	3	6	223373	223378	0 %	50 %	50 %	0 %	254555379
139	NC_012984	GA	3	6	225825	225830	50 %	0 %	50 %	0 %	254555381
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