MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 plasmid pHbal01

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012983	CCCTC	2	10	2333	2342	0 %	20 %	0 %	80 %	254295497
2	NC_012983	GAAAC	2	10	5113	5122	60 %	0 %	20 %	20 %	254295498
3	NC_012983	GCACT	2	10	5141	5150	20 %	20 %	20 %	40 %	254295498
4	NC_012983	GATTT	2	10	6718	6727	20 %	60 %	20 %	0 %	254295500
5	NC_012983	ATTGT	2	10	9878	9887	20 %	60 %	20 %	0 %	254295503
6	NC_012983	TAAAA	2	10	13997	14006	80 %	20 %	0 %	0 %	254295508
7	NC_012983	AGCCA	2	10	14958	14967	40 %	0 %	20 %	40 %	254295508
8	NC_012983	CGCTT	2	10	17843	17852	0 %	40 %	20 %	40 %	254295510
9	NC_012983	ATTTT	2	10	18441	18450	20 %	80 %	0 %	0 %	254295511
10	NC_012983	ACTGA	2	10	19159	19168	40 %	20 %	20 %	20 %	254295511
11	NC_012983	GTTCA	2	10	21396	21405	20 %	40 %	20 %	20 %	254295514
12	NC_012983	CGCTG	2	10	21432	21441	0 %	20 %	40 %	40 %	254295514
13	NC_012983	AAACA	2	10	24056	24065	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012983	CCTTT	2	10	24367	24376	0 %	60 %	0 %	40 %	254295516
15	NC_012983	TGAAC	2	10	24906	24915	40 %	20 %	20 %	20 %	254295517
16	NC_012983	TCCCT	2	10	25187	25196	0 %	40 %	0 %	60 %	254295517
17	NC_012983	GACCG	2	10	27229	27238	20 %	0 %	40 %	40 %	254295519
18	NC_012983	TATTT	2	10	29701	29710	20 %	80 %	0 %	0 %	254295521
19	NC_012983	CAGGA	2	10	29817	29826	40 %	0 %	40 %	20 %	254295521
20	NC_012983	TTGTT	2	10	30325	30334	0 %	80 %	20 %	0 %	254295521
21	NC_012983	GTTTG	2	10	31972	31981	0 %	60 %	40 %	0 %	254295523
22	NC_012983	CGGCG	2	10	33306	33315	0 %	0 %	60 %	40 %	254295525
23	NC_012983	CATTT	2	10	34568	34577	20 %	60 %	0 %	20 %	254295526
24	NC_012983	TCAGG	2	10	35401	35410	20 %	20 %	40 %	20 %	254295527
25	NC_012983	GCGGT	2	10	36993	37002	0 %	20 %	60 %	20 %	254295528
26	NC_012983	GGTTG	2	10	37125	37134	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012983	CATGG	2	10	38054	38063	20 %	20 %	40 %	20 %	254295529
28	NC_012983	GATTG	2	10	38177	38186	20 %	40 %	40 %	0 %	254295529
29	NC_012983	AATAT	2	10	40075	40084	60 %	40 %	0 %	0 %	254295531
30	NC_012983	ATGTG	2	10	40749	40758	20 %	40 %	40 %	0 %	254295531
31	NC_012983	TATAT	2	10	41600	41609	40 %	60 %	0 %	0 %	254295533
32	NC_012983	GCAAT	2	10	42116	42125	40 %	20 %	20 %	20 %	254295533
33	NC_012983	AGGCG	2	10	43865	43874	20 %	0 %	60 %	20 %	254295534
34	NC_012983	GTTGC	2	10	44479	44488	0 %	40 %	40 %	20 %	254295535
35	NC_012983	TTGAT	2	10	44716	44725	20 %	60 %	20 %	0 %	254295535
36	NC_012983	CTTTT	2	10	49636	49645	0 %	80 %	0 %	20 %	254295537
37	NC_012983	ACCAA	2	10	50087	50096	60 %	0 %	0 %	40 %	254295537
38	NC_012983	CGCCA	2	10	50605	50614	20 %	0 %	20 %	60 %	254295537
39	NC_012983	ATTGG	2	10	50851	50860	20 %	40 %	40 %	0 %	254295537
40	NC_012983	TGGGT	2	10	51487	51496	0 %	40 %	60 %	0 %	254295538
41	NC_012983	ATTTC	2	10	51660	51669	20 %	60 %	0 %	20 %	254295538
42	NC_012983	CGGAT	2	10	54025	54034	20 %	20 %	40 %	20 %	254295540
43	NC_012983	TTGGC	2	10	55628	55637	0 %	40 %	40 %	20 %	254295541
44	NC_012983	ACTCA	2	10	57247	57256	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012983	ATACC	2	10	57316	57325	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012983	ACATT	2	10	57472	57481	40 %	40 %	0 %	20 %	254295543
47	NC_012983	TGCGA	2	10	57591	57600	20 %	20 %	40 %	20 %	254295543
48	NC_012983	TTTTG	2	10	61332	61341	0 %	80 %	20 %	0 %	254295544
49	NC_012983	TTGTA	2	10	62067	62076	20 %	60 %	20 %	0 %	254295545
50	NC_012983	ATACG	2	10	66412	66421	40 %	20 %	20 %	20 %	254295550
51	NC_012983	CATTA	2	10	66989	66998	40 %	40 %	0 %	20 %	254295551
52	NC_012983	AATCA	2	10	68393	68402	60 %	20 %	0 %	20 %	254295551
53	NC_012983	CGCAC	2	10	70076	70085	20 %	0 %	20 %	60 %	254295553
54	NC_012983	ATCTC	2	10	72231	72240	20 %	40 %	0 %	40 %	254295555
55	NC_012983	GCTTT	2	10	74301	74310	0 %	60 %	20 %	20 %	254295556
56	NC_012983	TTGAT	2	10	75912	75921	20 %	60 %	20 %	0 %	254295558
57	NC_012983	ATTTG	2	10	76492	76501	20 %	60 %	20 %	0 %	254295558
58	NC_012983	AACCA	2	10	77684	77693	60 %	0 %	0 %	40 %	254295558
59	NC_012983	GTTGG	2	10	79147	79156	0 %	40 %	60 %	0 %	254295559
60	NC_012983	CATTA	2	10	81254	81263	40 %	40 %	0 %	20 %	254295561

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.