MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 plasmid pHbal01

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012983	CTTC	2	8	850	857	0 %	50 %	0 %	50 %	254295497
2	NC_012983	TCCA	2	8	1433	1440	25 %	25 %	0 %	50 %	254295497
3	NC_012983	TCTA	2	8	1743	1750	25 %	50 %	0 %	25 %	254295497
4	NC_012983	GTTT	2	8	1878	1885	0 %	75 %	25 %	0 %	254295497
5	NC_012983	TGAA	2	8	2716	2723	50 %	25 %	25 %	0 %	254295497
6	NC_012983	TTCT	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	254295497
7	NC_012983	CTGT	2	8	2852	2859	0 %	50 %	25 %	25 %	254295497
8	NC_012983	CTTT	2	8	2891	2898	0 %	75 %	0 %	25 %	254295497
9	NC_012983	ATGC	2	8	3335	3342	25 %	25 %	25 %	25 %	254295497
10	NC_012983	ATTC	2	8	3494	3501	25 %	50 %	0 %	25 %	254295497
11	NC_012983	TTCA	2	8	3735	3742	25 %	50 %	0 %	25 %	254295497
12	NC_012983	GATT	2	8	4374	4381	25 %	50 %	25 %	0 %	254295498
13	NC_012983	GATT	2	8	4459	4466	25 %	50 %	25 %	0 %	254295498
14	NC_012983	GGAT	2	8	4668	4675	25 %	25 %	50 %	0 %	254295498
15	NC_012983	AGTT	2	8	4758	4765	25 %	50 %	25 %	0 %	254295498
16	NC_012983	TTCG	2	8	4809	4816	0 %	50 %	25 %	25 %	254295498
17	NC_012983	GCAC	2	8	4906	4913	25 %	0 %	25 %	50 %	254295498
18	NC_012983	CCAA	2	8	5552	5559	50 %	0 %	0 %	50 %	254295499
19	NC_012983	GTCA	2	8	5615	5622	25 %	25 %	25 %	25 %	254295499
20	NC_012983	TCAA	2	8	5628	5635	50 %	25 %	0 %	25 %	254295499
21	NC_012983	TTGC	2	8	6475	6482	0 %	50 %	25 %	25 %	254295499
22	NC_012983	CAAT	2	8	6581	6588	50 %	25 %	0 %	25 %	254295500
23	NC_012983	TCTG	2	8	6854	6861	0 %	50 %	25 %	25 %	254295500
24	NC_012983	CACC	2	8	6916	6923	25 %	0 %	0 %	75 %	254295500
25	NC_012983	TTTC	2	8	7011	7018	0 %	75 %	0 %	25 %	254295500
26	NC_012983	GGCA	2	8	7177	7184	25 %	0 %	50 %	25 %	254295501
27	NC_012983	TGTT	2	8	7471	7478	0 %	75 %	25 %	0 %	254295501
28	NC_012983	CCAT	2	8	8679	8686	25 %	25 %	0 %	50 %	254295502
29	NC_012983	TATC	2	8	8746	8753	25 %	50 %	0 %	25 %	254295502
30	NC_012983	CCGC	2	8	8754	8761	0 %	0 %	25 %	75 %	254295502
31	NC_012983	TAGC	2	8	9145	9152	25 %	25 %	25 %	25 %	254295502
32	NC_012983	GCAA	2	8	9377	9384	50 %	0 %	25 %	25 %	254295503
33	NC_012983	TCAA	2	8	9527	9534	50 %	25 %	0 %	25 %	254295503
34	NC_012983	CCAC	2	8	10078	10085	25 %	0 %	0 %	75 %	254295503
35	NC_012983	TTCG	2	8	10500	10507	0 %	50 %	25 %	25 %	254295504
36	NC_012983	AGCC	2	8	10654	10661	25 %	0 %	25 %	50 %	254295504
37	NC_012983	TCAT	2	8	11401	11408	25 %	50 %	0 %	25 %	254295505
38	NC_012983	GAGC	2	8	11711	11718	25 %	0 %	50 %	25 %	254295505
39	NC_012983	ATCT	2	8	12136	12143	25 %	50 %	0 %	25 %	254295505
40	NC_012983	TAAC	2	8	12291	12298	50 %	25 %	0 %	25 %	254295506
41	NC_012983	TTGG	2	8	12631	12638	0 %	50 %	50 %	0 %	254295506
42	NC_012983	GGTT	2	8	12984	12991	0 %	50 %	50 %	0 %	254295506
43	NC_012983	CATA	2	8	13091	13098	50 %	25 %	0 %	25 %	254295506
44	NC_012983	TATT	2	8	13275	13282	25 %	75 %	0 %	0 %	254295507
45	NC_012983	CTTA	2	8	13688	13695	25 %	50 %	0 %	25 %	254295507
46	NC_012983	TTGG	2	8	15049	15056	0 %	50 %	50 %	0 %	254295508
47	NC_012983	AAAT	2	8	15608	15615	75 %	25 %	0 %	0 %	254295508
48	NC_012983	GATG	2	8	17028	17035	25 %	25 %	50 %	0 %	254295510
49	NC_012983	CAGT	2	8	17120	17127	25 %	25 %	25 %	25 %	254295510
50	NC_012983	ATGT	2	8	17488	17495	25 %	50 %	25 %	0 %	254295510
51	NC_012983	CATC	2	8	18155	18162	25 %	25 %	0 %	50 %	254295511
52	NC_012983	CTAT	2	8	18970	18977	25 %	50 %	0 %	25 %	254295511
53	NC_012983	TATC	2	8	18988	18995	25 %	50 %	0 %	25 %	254295511
54	NC_012983	ATTT	2	8	19451	19458	25 %	75 %	0 %	0 %	254295511
55	NC_012983	TGAA	2	8	19589	19596	50 %	25 %	25 %	0 %	254295511
56	NC_012983	TGTT	2	8	20034	20041	0 %	75 %	25 %	0 %	254295512
57	NC_012983	GCCC	2	8	20508	20515	0 %	0 %	25 %	75 %	254295513
58	NC_012983	AATA	2	8	20657	20664	75 %	25 %	0 %	0 %	254295513
59	NC_012983	ACCA	2	8	21507	21514	50 %	0 %	0 %	50 %	254295514
60	NC_012983	TAAA	2	8	21603	21610	75 %	25 %	0 %	0 %	254295514
61	NC_012983	TGGC	2	8	21870	21877	0 %	25 %	50 %	25 %	254295515
62	NC_012983	ACCA	2	8	22144	22151	50 %	0 %	0 %	50 %	254295515
63	NC_012983	CGGC	2	8	22202	22209	0 %	0 %	50 %	50 %	254295515
64	NC_012983	TTGT	2	8	24795	24802	0 %	75 %	25 %	0 %	254295517
65	NC_012983	TGCG	2	8	24854	24861	0 %	25 %	50 %	25 %	254295517
66	NC_012983	GCAA	2	8	27050	27057	50 %	0 %	25 %	25 %	254295518
67	NC_012983	CGAC	2	8	27336	27343	25 %	0 %	25 %	50 %	254295519
68	NC_012983	AATA	2	8	27535	27542	75 %	25 %	0 %	0 %	254295519
69	NC_012983	GAAA	2	8	27785	27792	75 %	0 %	25 %	0 %	254295519
70	NC_012983	TATG	2	8	28966	28973	25 %	50 %	25 %	0 %	254295520
71	NC_012983	AAAC	2	8	29760	29767	75 %	0 %	0 %	25 %	254295521
72	NC_012983	AAAC	2	8	30456	30463	75 %	0 %	0 %	25 %	254295521
73	NC_012983	TGCT	2	8	30598	30605	0 %	50 %	25 %	25 %	254295522
74	NC_012983	ACAG	2	8	30753	30760	50 %	0 %	25 %	25 %	254295522
75	NC_012983	TTGA	2	8	30865	30872	25 %	50 %	25 %	0 %	254295522
76	NC_012983	CAAT	2	8	31150	31157	50 %	25 %	0 %	25 %	254295522
77	NC_012983	GCGT	2	8	31188	31195	0 %	25 %	50 %	25 %	254295522
78	NC_012983	CATT	2	8	31236	31243	25 %	50 %	0 %	25 %	254295522
79	NC_012983	TGTC	2	8	32190	32197	0 %	50 %	25 %	25 %	254295523
80	NC_012983	GCCA	2	8	32582	32589	25 %	0 %	25 %	50 %	254295524
81	NC_012983	GGTT	2	8	32662	32669	0 %	50 %	50 %	0 %	254295524
82	NC_012983	GTGC	2	8	32878	32885	0 %	25 %	50 %	25 %	254295524
83	NC_012983	GATT	2	8	35034	35041	25 %	50 %	25 %	0 %	254295526
84	NC_012983	TTTA	2	8	35932	35939	25 %	75 %	0 %	0 %	254295528
85	NC_012983	TGAG	2	8	36099	36106	25 %	25 %	50 %	0 %	254295528
86	NC_012983	TATG	2	8	36684	36691	25 %	50 %	25 %	0 %	254295528
87	NC_012983	TTGG	2	8	37386	37393	0 %	50 %	50 %	0 %	254295529
88	NC_012983	GACG	2	8	37734	37741	25 %	0 %	50 %	25 %	254295529
89	NC_012983	TTTG	2	8	39114	39121	0 %	75 %	25 %	0 %	254295530
90	NC_012983	GGGC	2	8	40108	40115	0 %	0 %	75 %	25 %	254295531
91	NC_012983	CTTT	2	8	40700	40707	0 %	75 %	0 %	25 %	254295531
92	NC_012983	ATTT	2	8	40820	40827	25 %	75 %	0 %	0 %	254295531
93	NC_012983	GACT	2	8	40830	40837	25 %	25 %	25 %	25 %	254295531
94	NC_012983	GTGG	2	8	41563	41570	0 %	25 %	75 %	0 %	254295533
95	NC_012983	TGGA	2	8	42013	42020	25 %	25 %	50 %	0 %	254295533
96	NC_012983	TCAT	2	8	42235	42242	25 %	50 %	0 %	25 %	254295533
97	NC_012983	ACCA	2	8	43365	43372	50 %	0 %	0 %	50 %	254295534
98	NC_012983	TGGG	2	8	44361	44368	0 %	25 %	75 %	0 %	254295535
99	NC_012983	ATTG	2	8	44905	44912	25 %	50 %	25 %	0 %	254295535
100	NC_012983	GTAG	2	8	45971	45978	25 %	25 %	50 %	0 %	254295536
101	NC_012983	AATG	2	8	45997	46004	50 %	25 %	25 %	0 %	254295536
102	NC_012983	GCGG	2	8	46820	46827	0 %	0 %	75 %	25 %	254295536
103	NC_012983	CAAT	2	8	47165	47172	50 %	25 %	0 %	25 %	254295536
104	NC_012983	AGGT	2	8	47751	47758	25 %	25 %	50 %	0 %	254295536
105	NC_012983	TGGA	2	8	47790	47797	25 %	25 %	50 %	0 %	254295536
106	NC_012983	GGGC	2	8	47915	47922	0 %	0 %	75 %	25 %	254295536
107	NC_012983	GCAG	2	8	47974	47981	25 %	0 %	50 %	25 %	254295536
108	NC_012983	AACA	2	8	48103	48110	75 %	0 %	0 %	25 %	254295537
109	NC_012983	AACA	2	8	49777	49784	75 %	0 %	0 %	25 %	254295537
110	NC_012983	AGCG	2	8	50104	50111	25 %	0 %	50 %	25 %	254295537
111	NC_012983	ATTT	2	8	51122	51129	25 %	75 %	0 %	0 %	254295538
112	NC_012983	TGAT	2	8	51189	51196	25 %	50 %	25 %	0 %	254295538
113	NC_012983	AGAA	2	8	52196	52203	75 %	0 %	25 %	0 %	254295538
114	NC_012983	TCGC	2	8	53447	53454	0 %	25 %	25 %	50 %	254295539
115	NC_012983	ATGT	2	8	54483	54490	25 %	50 %	25 %	0 %	254295540
116	NC_012983	TTGG	2	8	54531	54538	0 %	50 %	50 %	0 %	254295540
117	NC_012983	GTTT	2	8	54754	54761	0 %	75 %	25 %	0 %	254295540
118	NC_012983	TGCT	2	8	54973	54980	0 %	50 %	25 %	25 %	254295540
119	NC_012983	TTCA	2	8	55454	55461	25 %	50 %	0 %	25 %	254295541
120	NC_012983	GCAG	2	8	55810	55817	25 %	0 %	50 %	25 %	254295541
121	NC_012983	CTTT	2	8	56102	56109	0 %	75 %	0 %	25 %	254295541
122	NC_012983	TGAT	2	8	56281	56288	25 %	50 %	25 %	0 %	254295542
123	NC_012983	GACA	2	8	56343	56350	50 %	0 %	25 %	25 %	254295542
124	NC_012983	ACCA	2	8	56676	56683	50 %	0 %	0 %	50 %	254295542
125	NC_012983	GTGG	2	8	57393	57400	0 %	25 %	75 %	0 %	254295543
126	NC_012983	GTTG	2	8	57875	57882	0 %	50 %	50 %	0 %	254295543
127	NC_012983	ATTG	2	8	58020	58027	25 %	50 %	25 %	0 %	254295543
128	NC_012983	ATGA	2	8	58251	58258	50 %	25 %	25 %	0 %	254295543
129	NC_012983	CACG	2	8	58347	58354	25 %	0 %	25 %	50 %	254295543
130	NC_012983	TTGT	2	8	58565	58572	0 %	75 %	25 %	0 %	254295543
131	NC_012983	GTTT	2	8	58727	58734	0 %	75 %	25 %	0 %	254295543
132	NC_012983	CTGT	2	8	59261	59268	0 %	50 %	25 %	25 %	254295544
133	NC_012983	AATG	2	8	60016	60023	50 %	25 %	25 %	0 %	254295544
134	NC_012983	ATCC	2	8	60063	60070	25 %	25 %	0 %	50 %	254295544
135	NC_012983	GAAA	2	8	61144	61151	75 %	0 %	25 %	0 %	254295544
136	NC_012983	TCTA	2	8	62242	62249	25 %	50 %	0 %	25 %	254295545
137	NC_012983	TCAT	2	8	63130	63137	25 %	50 %	0 %	25 %	254295546
138	NC_012983	TGTT	2	8	63368	63375	0 %	75 %	25 %	0 %	254295546
139	NC_012983	GTGA	2	8	63642	63649	25 %	25 %	50 %	0 %	254295547
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141	NC_012983	ATAG	2	8	64287	64294	50 %	25 %	25 %	0 %	254295548
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.