MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 plasmid pHbal01

Total Repeats: 947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012983	GAC	2	6	186	191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
2	NC_012983	CAG	2	6	290	295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
3	NC_012983	TCC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254295497
4	NC_012983	AAT	2	6	474	479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295497
5	NC_012983	AAG	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295497
6	NC_012983	ACC	3	9	537	545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295497
7	NC_012983	CAG	2	6	590	595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
8	NC_012983	GGT	2	6	629	634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254295497
9	NC_012983	CGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
10	NC_012983	GAA	2	6	676	681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295497
11	NC_012983	AGC	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
12	NC_012983	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295497
13	NC_012983	CAC	2	6	839	844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295497
14	NC_012983	ATC	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
15	NC_012983	AAC	2	6	960	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254295497
16	NC_012983	GTG	2	6	972	977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254295497
17	NC_012983	ATC	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
18	NC_012983	TTA	2	6	1225	1230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295497
19	NC_012983	CCA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295497
20	NC_012983	CAG	3	9	1361	1369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
21	NC_012983	ATG	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295497
22	NC_012983	TTC	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295497
23	NC_012983	CAT	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
24	NC_012983	TTG	2	6	1676	1681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295497
25	NC_012983	GTT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295497
26	NC_012983	TCA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
27	NC_012983	CAG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
28	NC_012983	TGC	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295497
29	NC_012983	ATC	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
30	NC_012983	TTA	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295497
31	NC_012983	CGC	2	6	2018	2023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254295497
32	NC_012983	AAT	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295497
33	NC_012983	GTT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295497
34	NC_012983	GAA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295497
35	NC_012983	ATC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
36	NC_012983	GAC	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
37	NC_012983	AGC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
38	NC_012983	GTT	2	6	2374	2379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295497
39	NC_012983	GAA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295497
40	NC_012983	TGA	2	6	2506	2511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295497
41	NC_012983	ACG	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295497
42	NC_012983	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295497
43	NC_012983	AAC	2	6	2631	2636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254295497
44	NC_012983	ATC	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
45	NC_012983	TCT	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295497
46	NC_012983	GCT	2	6	2795	2800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295497
47	NC_012983	CTT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295497
48	NC_012983	CTG	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295497
49	NC_012983	GCC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254295497
50	NC_012983	CCA	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295497
51	NC_012983	TGT	2	6	3253	3258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295497
52	NC_012983	TTG	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295497
53	NC_012983	CTT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295497
54	NC_012983	TGA	2	6	3395	3400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295497
55	NC_012983	CCA	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295497
56	NC_012983	CTG	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295497
57	NC_012983	CAC	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295497
58	NC_012983	ATC	2	6	3597	3602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
59	NC_012983	CAT	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
60	NC_012983	CAT	2	6	3656	3661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
61	NC_012983	TCA	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295497
62	NC_012983	AGA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295497
63	NC_012983	CAA	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254295497
64	NC_012983	CCA	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295497
65	NC_012983	TCT	2	6	4156	4161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295498
66	NC_012983	AAG	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295498
67	NC_012983	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295498
68	NC_012983	AAT	2	6	4732	4737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295498
69	NC_012983	TTC	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295498
70	NC_012983	TTG	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295498
71	NC_012983	GCT	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295498
72	NC_012983	ATC	3	9	4974	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295498
73	NC_012983	TCT	2	6	5041	5046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295498
74	NC_012983	ATT	2	6	5431	5436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295499
75	NC_012983	CCA	3	9	5480	5488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295499
76	NC_012983	CTT	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295499
77	NC_012983	TCA	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295499
78	NC_012983	CAA	2	6	5692	5697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254295499
79	NC_012983	GCC	2	6	5723	5728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254295499
80	NC_012983	TTG	2	6	5913	5918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295499
81	NC_012983	TCA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295499
82	NC_012983	TGA	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295499
83	NC_012983	GTT	2	6	6027	6032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295499
84	NC_012983	TCA	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295499
85	NC_012983	AAT	2	6	6133	6138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295499
86	NC_012983	ATG	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295499
87	NC_012983	CAG	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295499
88	NC_012983	GCA	2	6	6363	6368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295499
89	NC_012983	GAC	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295499
90	NC_012983	CAC	2	6	6451	6456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295499
91	NC_012983	ATT	2	6	6505	6510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295500
92	NC_012983	AAT	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295500
93	NC_012983	GTT	2	6	6951	6956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295500
94	NC_012983	CAA	2	6	7384	7389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254295501
95	NC_012983	TTC	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295501
96	NC_012983	TCA	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295501
97	NC_012983	GCT	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295501
98	NC_012983	GCA	2	6	7620	7625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295501
99	NC_012983	ATT	2	6	7631	7636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295501
100	NC_012983	ATG	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295501
101	NC_012983	ATA	2	6	7820	7825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295501
102	NC_012983	TCC	2	6	7901	7906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254295501
103	NC_012983	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295502
104	NC_012983	TCA	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295502
105	NC_012983	TCA	2	6	8206	8211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295502
106	NC_012983	GGC	2	6	8334	8339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254295502
107	NC_012983	TGG	2	6	8427	8432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254295502
108	NC_012983	CAT	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295502
109	NC_012983	AAG	2	6	8514	8519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295502
110	NC_012983	TCA	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295502
111	NC_012983	CCA	2	6	8532	8537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295502
112	NC_012983	ATT	2	6	8846	8851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295502
113	NC_012983	GAT	2	6	9041	9046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295502
114	NC_012983	TCT	2	6	9087	9092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295502
115	NC_012983	TTC	2	6	9274	9279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295503
116	NC_012983	TAT	2	6	9303	9308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295503
117	NC_012983	GCT	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295503
118	NC_012983	CCA	2	6	9394	9399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295503
119	NC_012983	AAT	2	6	9946	9951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295503
120	NC_012983	GCT	2	6	9968	9973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295503
121	NC_012983	CAT	2	6	9981	9986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295503
122	NC_012983	ATC	2	6	9992	9997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295503
123	NC_012983	TCT	2	6	10022	10027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295503
124	NC_012983	GAT	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295504
125	NC_012983	GAA	2	6	10308	10313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295504
126	NC_012983	CTG	2	6	10324	10329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295504
127	NC_012983	AAG	2	6	10675	10680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295504
128	NC_012983	ATC	2	6	10924	10929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295504
129	NC_012983	TAA	2	6	10991	10996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295504
130	NC_012983	GCT	2	6	11119	11124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295504
131	NC_012983	AAG	2	6	11130	11135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295504
132	NC_012983	TCA	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295505
133	NC_012983	TGT	2	6	11297	11302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295505
134	NC_012983	TGA	2	6	11357	11362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295505
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137	NC_012983	GCC	2	6	11616	11621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254295505
138	NC_012983	TGT	2	6	11772	11777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295505
139	NC_012983	TGC	2	6	11778	11783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295505
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143	NC_012983	TGA	2	6	11993	11998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295505
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146	NC_012983	TAA	2	6	12479	12484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295506
147	NC_012983	TAT	2	6	12490	12495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295506
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150	NC_012983	CAA	2	6	12697	12702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254295506
151	NC_012983	CAT	2	6	12743	12748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295506
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157	NC_012983	GCA	2	6	13347	13352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295507
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159	NC_012983	TGA	2	6	13438	13443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295507
160	NC_012983	TGC	2	6	13850	13855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295507
161	NC_012983	TAT	2	6	13879	13884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295507
162	NC_012983	GCT	2	6	13886	13891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295507
163	NC_012983	CAT	2	6	13990	13995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295508
164	NC_012983	CAT	2	6	14065	14070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295508
165	NC_012983	CAT	2	6	14110	14115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295508
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234	NC_012983	ATA	2	6	20311	20316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295513
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237	NC_012983	ATC	2	6	20958	20963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295514
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239	NC_012983	TTC	2	6	21039	21044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295514
240	NC_012983	TAT	2	6	21267	21272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295514
241	NC_012983	AGA	2	6	21456	21461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295514
242	NC_012983	TTC	2	6	21495	21500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295514
243	NC_012983	CTT	2	6	21817	21822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295515
244	NC_012983	GGC	2	6	21827	21832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254295515
245	NC_012983	GGC	2	6	21883	21888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254295515
246	NC_012983	TTG	2	6	21960	21965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295515
247	NC_012983	CAT	2	6	22033	22038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295515
248	NC_012983	ACC	2	6	22062	22067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295515
249	NC_012983	GCG	2	6	22079	22084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254295515
250	NC_012983	AAT	2	6	22219	22224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254295515
251	NC_012983	TCG	2	6	22245	22250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295515
252	NC_012983	ACC	2	6	22310	22315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295515
253	NC_012983	TCA	2	6	22368	22373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295515
254	NC_012983	CCA	2	6	22438	22443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254295515
255	NC_012983	AAG	2	6	22488	22493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295515
256	NC_012983	ATG	2	6	22551	22556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295515
257	NC_012983	CAT	2	6	22639	22644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295515
258	NC_012983	ACG	2	6	22652	22657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254295515
259	NC_012983	GCG	2	6	22843	22848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254295515
260	NC_012983	TCA	2	6	22884	22889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295515
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262	NC_012983	CAA	2	6	24304	24309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254295516
263	NC_012983	TCG	2	6	24402	24407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295516
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265	NC_012983	GCT	2	6	24540	24545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295516
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267	NC_012983	CTG	2	6	24658	24663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295516
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270	NC_012983	TGC	2	6	24772	24777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295516
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284	NC_012983	ATT	2	6	26042	26047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295518
285	NC_012983	TTA	2	6	26149	26154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295518
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287	NC_012983	GAG	2	6	26258	26263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254295518
288	NC_012983	AGA	2	6	26269	26274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254295518
289	NC_012983	CGT	2	6	26393	26398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254295518
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299	NC_012983	GCC	2	6	27419	27424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254295519
300	NC_012983	TAT	2	6	27486	27491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254295519
301	NC_012983	CAT	2	6	27587	27592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254295519
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365	NC_012983	TCT	2	6	33348	33353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254295525
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374	NC_012983	TTG	2	6	34044	34049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254295526
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376	NC_012983	ATG	2	6	34245	34250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254295526
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378	NC_012983	GAG	2	6	34613	34618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254295526
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