MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012982	TGCTTG	2	12	4	15	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012982	GCTTCA	2	12	100221	100232	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012982	ATAGAT	2	12	101715	101726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012982	AATGGA	2	12	105119	105130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012982	TGGTCT	2	12	149913	149924	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012982	ATTTCT	2	12	263954	263965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012982	CAATCC	2	12	268757	268768	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012982	TTCAAA	2	12	335837	335848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012982	TTTTGT	2	12	398473	398484	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012982	AGATTT	2	12	486355	486366	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012982	ATGTTT	2	12	532336	532347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012982	TTAATC	2	12	535809	535820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012982	ACAGGG	2	12	583483	583494	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012982	CCTTAA	2	12	586707	586718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012982	GTTTTG	2	12	670600	670611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012982	CTTTTT	2	12	799576	799587	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012982	ATTTTT	2	12	825052	825063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012982	GGATAT	2	12	869147	869158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012982	TTTGTT	2	12	882982	882993	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012982	ATGGAT	2	12	959652	959663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012982	ACGTTT	2	12	982287	982298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012982	TAAACC	2	12	991820	991831	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012982	ATATTT	2	12	1038155	1038166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012982	TTAACG	2	12	1053458	1053469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012982	ATTAAA	2	12	1126177	1126188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012982	GAGGTG	2	12	1134772	1134783	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012982	GAATAG	2	12	1139671	1139682	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012982	TATGCT	2	12	1158654	1158665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012982	AAATGT	2	12	1194665	1194676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012982	TGTTTA	2	12	1216551	1216562	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012982	TTGTTT	2	12	1263295	1263306	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012982	ATAAAA	2	12	1266046	1266057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012982	TAGAAT	2	12	1285009	1285020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012982	ATGTAT	2	12	1304171	1304182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012982	TAAAGG	2	12	1353292	1353303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012982	TGCATG	2	12	1404209	1404220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012982	TAGCAT	2	12	1437800	1437811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012982	TTTCGA	2	12	1501669	1501680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012982	GCCAAT	2	12	1533055	1533066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012982	ATGAGA	2	12	1543425	1543436	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012982	ATAATG	2	12	1545692	1545703	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012982	TAATAT	2	12	1577009	1577020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012982	TGGAAC	2	12	1606913	1606924	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012982	TGAAGA	2	12	1622961	1622972	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012982	TATTTT	2	12	1672143	1672154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012982	TTGATA	2	12	1731972	1731983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012982	GTTCTG	2	12	1755518	1755529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012982	ATGATT	2	12	1882946	1882957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012982	AACGAA	2	12	1917474	1917485	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012982	AAAATA	2	12	1953221	1953232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012982	CATTTT	2	12	1991577	1991588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012982	ATTCTG	2	12	2121778	2121789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012982	AAATAG	2	12	2123094	2123105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012982	ACATAA	2	12	2188815	2188826	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012982	TATTTT	2	12	2196259	2196270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012982	TCGCAC	2	12	2236896	2236907	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012982	TTTGAT	2	12	2249082	2249093	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012982	AAATTC	2	12	2349440	2349451	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012982	AAACTT	2	12	2350334	2350345	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012982	TGATAT	2	12	2379652	2379663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012982	CTATTG	2	12	2409327	2409338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012982	CAAAAG	2	12	2420322	2420333	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012982	AAAAGA	2	12	2424573	2424584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012982	ACCCTT	2	12	2441638	2441649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012982	ACCAAA	2	12	2445380	2445391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012982	GTTTTA	2	12	2447329	2447340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012982	CTTTTT	2	12	2573925	2573936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012982	ATTCAA	2	12	2577273	2577284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012982	TTCACT	2	12	2665523	2665534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012982	ATAATG	2	12	2751272	2751283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012982	TAACAC	2	12	2775218	2775229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012982	TATTTT	2	12	2812172	2812183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012982	CAAAAA	2	12	2814175	2814186	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012982	TAATCA	2	12	2892412	2892423	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012982	GCACCA	2	12	2895498	2895509	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012982	AGAATG	2	12	2924393	2924404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012982	CTTCTG	2	12	3006946	3006957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012982	TTTTAA	2	12	3089017	3089028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012982	ATTTTT	2	12	3092192	3092203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012982	TCATTC	2	12	3108282	3108293	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012982	TGCTTT	2	12	3180087	3180098	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012982	AACCCC	2	12	3206029	3206040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012982	TCAATT	2	12	3206248	3206259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012982	CCTCTT	2	12	3213705	3213716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012982	GGATAT	2	12	3217990	3218001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012982	TTCAAA	2	12	3292628	3292639	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012982	CCTAAG	2	12	3427914	3427925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.