MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 3572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012982	TAT	2	6	8545	8550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012982	TGA	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012982	GTT	2	6	8641	8646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012982	GGA	2	6	10516	10521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012982	GTA	2	6	10548	10553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012982	AGG	2	6	10557	10562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012982	GTT	2	6	10589	10594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012982	CGA	2	6	11660	11665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012982	CAA	2	6	11682	11687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012982	CCA	2	6	12917	12922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012982	GAG	2	6	13005	13010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012982	ATT	2	6	14549	14554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012982	AAT	2	6	14584	14589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012982	GAA	2	6	14599	14604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012982	GAG	2	6	14660	14665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012982	GCG	2	6	18257	18262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012982	TGA	2	6	18354	18359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012982	AAT	2	6	19904	19909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012982	TAC	2	6	23506	23511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012982	CTT	2	6	24146	24151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012982	CAC	2	6	24275	24280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012982	CGG	2	6	24297	24302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012982	GAA	2	6	25151	25156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012982	ATA	2	6	26104	26109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012982	TTA	2	6	26147	26152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012982	CAG	2	6	34141	34146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012982	GGA	2	6	34182	34187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012982	GGC	2	6	34598	34603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012982	GTA	2	6	37259	37264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012982	CTT	2	6	40064	40069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012982	TAA	2	6	40070	40075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012982	CAG	2	6	40105	40110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012982	CAG	2	6	40922	40927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012982	AAT	2	6	40934	40939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012982	GAA	2	6	41180	41185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012982	ATT	2	6	41215	41220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012982	ATA	2	6	44948	44953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012982	AGT	2	6	44977	44982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012982	CTT	2	6	46373	46378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012982	AGA	2	6	47377	47382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012982	AAT	2	6	49136	49141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012982	GCA	2	6	49171	49176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012982	TAA	2	6	49177	49182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012982	GAA	2	6	53381	53386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012982	TTA	2	6	53483	53488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012982	AAT	2	6	54022	54027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012982	CGC	2	6	55405	55410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_012982	TTC	2	6	55436	55441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012982	GCC	2	6	56256	56261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012982	GTT	2	6	56972	56977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012982	AGC	2	6	56990	56995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012982	ATT	2	6	57016	57021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012982	TAT	2	6	57033	57038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012982	TGT	2	6	58551	58556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012982	TGA	2	6	60993	60998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012982	GCC	2	6	63443	63448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012982	CTG	2	6	64793	64798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012982	TGT	2	6	66232	66237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012982	ATA	2	6	67612	67617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012982	TTC	2	6	70772	70777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012982	CAT	2	6	72574	72579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012982	ATA	2	6	73804	73809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012982	AGG	2	6	73850	73855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012982	GAT	2	6	75162	75167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012982	TGA	2	6	77954	77959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012982	CAA	2	6	78043	78048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012982	AGA	2	6	78089	78094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012982	CAG	2	6	78645	78650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012982	GGC	2	6	78751	78756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012982	CTC	2	6	78821	78826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012982	GCG	2	6	78842	78847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012982	TTA	2	6	78890	78895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012982	CGG	2	6	78979	78984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012982	TTC	2	6	78990	78995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012982	CCG	2	6	79006	79011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012982	ATT	2	6	79101	79106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012982	CAT	2	6	80907	80912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012982	AAT	2	6	81555	81560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012982	GTC	2	6	81610	81615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012982	GAT	2	6	83220	83225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012982	TCG	2	6	83237	83242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012982	TAA	2	6	83271	83276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012982	GAT	2	6	83284	83289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012982	TAA	2	6	83296	83301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012982	GTT	2	6	83472	83477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012982	CTT	2	6	83542	83547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012982	CAA	2	6	88854	88859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012982	AGA	2	6	88943	88948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012982	GTA	2	6	94622	94627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012982	TCA	2	6	94643	94648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012982	TTG	2	6	96075	96080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012982	GAT	2	6	96117	96122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012982	ATC	2	6	99884	99889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012982	TGA	3	9	99896	99904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012982	TGA	2	6	99923	99928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012982	TAT	2	6	99964	99969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012982	ATC	3	9	99992	100000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012982	TCA	2	6	100035	100040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012982	TCT	2	6	100098	100103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012982	GCC	2	6	100130	100135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012982	TCT	2	6	100164	100169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012982	TGG	2	6	101756	101761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012982	TAT	2	6	101828	101833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012982	TGG	2	6	102269	102274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012982	ATA	2	6	103764	103769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012982	GAA	2	6	104704	104709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012982	TTC	2	6	104747	104752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012982	TTG	2	6	105162	105167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012982	AGA	2	6	105168	105173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012982	AAT	2	6	109149	109154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012982	CGC	2	6	109171	109176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_012982	TTA	2	6	113952	113957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012982	TGT	2	6	113967	113972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012982	AAG	2	6	113999	114004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012982	AAT	2	6	114041	114046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012982	TGA	2	6	114719	114724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012982	CTA	2	6	115404	115409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012982	AAG	2	6	115446	115451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012982	TCT	2	6	116902	116907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012982	TGT	2	6	119413	119418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012982	TGA	2	6	120478	120483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012982	ATG	2	6	120510	120515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012982	TGC	2	6	120536	120541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012982	GGC	2	6	121579	121584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012982	GCC	2	6	121595	121600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012982	TAT	2	6	121604	121609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012982	TCC	2	6	123949	123954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_012982	TAT	2	6	123983	123988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012982	GAT	2	6	128349	128354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012982	ATA	2	6	129373	129378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012982	TTA	2	6	129504	129509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012982	GTT	2	6	134001	134006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012982	TGA	2	6	136335	136340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012982	ATT	2	6	136402	136407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012982	ATT	2	6	136427	136432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012982	TTG	2	6	136521	136526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012982	GCC	2	6	139887	139892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012982	GAA	3	9	139933	139941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012982	TGT	2	6	142796	142801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_012982	AAT	2	6	144970	144975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012982	AAT	2	6	147773	147778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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