MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	ACTATA	2	12	9615	9626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012973	AAACAC	2	12	18172	18183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012973	TTTCTT	2	12	22802	22813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012973	GACTTA	2	12	44134	44145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012973	GGCTAG	2	12	49244	49255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012973	GTGGAT	2	12	58446	58457	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012973	AGCCAA	2	12	58521	58532	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012973	CCAACA	2	12	60371	60382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012973	AGCGGG	2	12	64888	64899	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012973	AGGATA	2	12	76777	76788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012973	AGCGTG	2	12	77001	77012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012973	CAACGA	2	12	77350	77361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012973	TACAAA	2	12	91002	91013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012973	AAAAAT	2	12	91205	91216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012973	GATAAC	2	12	109321	109332	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012973	TTCTAT	2	12	122094	122105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012973	GTTCTA	2	12	122383	122394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012973	GTTCTA	2	12	122446	122457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012973	GTTTTA	2	12	128804	128815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012973	TTGTTT	2	12	150420	150431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012973	TAAAAA	2	12	164680	164691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012973	CACGCT	2	12	183262	183273	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012973	CTGTAT	2	12	201196	201207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012973	AATTTT	2	12	201916	201927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012973	AATTTT	2	12	209439	209450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012973	CAAAAA	2	12	209474	209485	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012973	TAATTA	2	12	216676	216687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012973	ACTTTA	2	12	216726	216737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012973	CAAAAC	2	12	221495	221506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012973	CCCTAA	2	12	224425	224436	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012973	CAAAAA	2	12	229191	229202	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012973	ATTTTA	2	12	246124	246135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012973	CAAAAT	2	12	328374	328385	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012973	CTTGCG	2	12	329292	329303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012973	TGGCTA	2	12	337229	337240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012973	AAAAGC	2	12	339322	339333	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012973	AAAATA	2	12	428047	428058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012973	AAAATA	2	12	435833	435844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012973	CTTTTT	2	12	438931	438942	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012973	GGGTTT	2	12	441850	441861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012973	TAAAAA	2	12	442058	442069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012973	AGAACA	2	12	468706	468717	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012973	AAAAAT	2	12	473832	473843	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012973	AAAACA	2	12	498310	498321	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012973	TAAAGA	2	12	501996	502007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012973	TAAAAA	2	12	502101	502112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012973	ATTATA	2	12	533677	533688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012973	ACAGGC	2	12	537488	537499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012973	CCATCC	2	12	557131	557142	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012973	AAGCCG	2	12	603292	603303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012973	AATGAA	2	12	613756	613767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012973	CTTATT	2	12	633090	633101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012973	TACCAT	2	12	633287	633298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012973	ATTTTA	2	12	643949	643960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012973	AGCGCA	2	12	654356	654367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012973	CAAAAA	2	12	677259	677270	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012973	ACCAAA	2	12	677294	677305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012973	GATTTT	2	12	682608	682619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012973	TCTCAA	2	12	726491	726502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012973	TTTGAT	2	12	772911	772922	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012973	TTAAAA	2	12	783116	783127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012973	TTTAGC	2	12	809334	809345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012973	TAAACT	2	12	816169	816180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012973	TAAAAT	2	12	816220	816231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012973	TTTAAG	2	12	823715	823726	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012973	TTTTCT	2	12	826953	826964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012973	TTCATC	2	12	827986	827997	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012973	TTGCTT	2	12	828273	828284	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012973	GAATTA	2	12	830488	830499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012973	TTGTTT	2	12	836668	836679	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012973	TCTTTA	2	12	836840	836851	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012973	AATATC	2	12	852976	852987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012973	TTGTGT	2	12	854078	854089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012973	AACTTA	2	12	876916	876927	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012973	ATTATA	2	12	893288	893299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012973	TTTTTG	2	12	893493	893504	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012973	ATTGAA	2	12	900789	900800	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012973	AAATTA	2	12	919587	919598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012973	ACATAT	2	12	942874	942885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012973	TTAAAA	2	12	942897	942908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012973	TTTTTC	2	12	947636	947647	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012973	CAATAA	2	12	947753	947764	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012973	TATGGG	2	12	949141	949152	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012973	ACGCTT	2	12	966715	966726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012973	CAAGAG	2	12	969463	969474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012973	ATCAAA	2	12	971233	971244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012973	AATTCT	2	12	971561	971572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012973	CTAGCC	2	12	972327	972338	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012973	CCTTAT	2	12	975261	975272	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012973	ACTTAG	10	60	983998	984057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012973	CTTTAA	2	12	984617	984628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012973	AGTTAG	2	12	993773	993784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012973	TTTGAT	2	12	994078	994089	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012973	ATTTTA	2	12	1078935	1078946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012973	AATATC	2	12	1084519	1084530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012973	TTGTGT	2	12	1085621	1085632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012973	AAAAAT	2	12	1149220	1149231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012973	AAATCA	2	12	1155357	1155368	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012973	ATCCTT	2	12	1164364	1164375	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012973	TTGTAT	2	12	1166785	1166796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012973	ACTTAA	2	12	1185050	1185061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012973	TCATTT	2	12	1207366	1207377	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012973	AAACTT	2	12	1207390	1207401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012973	TGTTAT	2	12	1216889	1216900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012973	TTCCAT	2	12	1223990	1224001	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012973	ATTTTT	2	12	1239061	1239072	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012973	TAAGCC	2	12	1257104	1257115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012973	ATAAAA	2	12	1268076	1268087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012973	CAAAGC	2	12	1271250	1271261	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012973	AATTAC	2	12	1301998	1302009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012973	TGGCTT	2	12	1314542	1314553	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_012973	TGGCTT	2	12	1323760	1323771	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012973	AGTTTT	2	12	1358656	1358667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012973	CTTTAA	2	12	1360889	1360900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012973	TTTTCT	2	12	1371417	1371428	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012973	TGTTTA	2	12	1371571	1371582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012973	TTTGAT	2	12	1371686	1371697	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012973	TAAAGA	2	12	1372651	1372662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012973	GTTTTA	2	12	1379444	1379455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012973	AAAAAT	2	12	1381092	1381103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012973	TAAAAA	2	12	1381298	1381309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012973	CTAAGT	4	24	1391111	1391134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012973	GTTTTT	2	12	1393505	1393516	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012973	ATAATC	2	12	1426572	1426583	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012973	AAATCA	2	12	1426836	1426847	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012973	TATCTT	2	12	1473313	1473324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_012973	ATTAAA	2	12	1481883	1481894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012973	AGAAAA	2	12	1516928	1516939	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012973	TGATTT	2	12	1517567	1517578	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012973	AAAGAT	2	12	1571683	1571694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.