MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	AAAGCG	2	12	382	393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254778739
2	NC_012973	TTGCAA	2	12	961	972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254778740
3	NC_012973	ATTATA	2	12	1889	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	254778742
4	NC_012973	GCGATA	2	12	3818	3829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778744
5	NC_012973	GCTTGC	2	12	6148	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778745
6	NC_012973	GAAACC	2	12	7596	7607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254778746
7	NC_012973	ATTTGA	2	12	12804	12815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778750
8	NC_012973	AGCTTG	2	12	15840	15851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254778753
9	NC_012973	GATAAA	2	12	22078	22089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254778758
10	NC_012973	GAGTCC	2	12	27784	27795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254778762
11	NC_012973	TATCAA	2	12	29992	30003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778765
12	NC_012973	CTTTTA	2	12	30300	30311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254778765
13	NC_012973	GCGTGG	2	12	32674	32685	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	254778768
14	NC_012973	TTGGAT	2	12	32784	32795	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254778768
15	NC_012973	TAATGA	2	12	32819	32830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778768
16	NC_012973	TTGAAT	2	12	33870	33881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778768
17	NC_012973	TAAGGA	2	12	34169	34180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	254778768
18	NC_012973	TAGGGG	2	12	35685	35696	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	254778771
19	NC_012973	AAAGAA	2	12	37197	37208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778772
20	NC_012973	AAAGAA	2	12	38788	38799	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778774
21	NC_012973	CAAAAT	2	12	41129	41140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254778776
22	NC_012973	GCTTTA	2	12	44201	44212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778779
23	NC_012973	CGCAAA	2	12	44992	45003	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254778779
24	NC_012973	GTTTGA	2	12	48092	48103	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254778781
25	NC_012973	TAAAAA	2	12	51758	51769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254778783
26	NC_012973	CCACGC	2	12	53513	53524	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254778784
27	NC_012973	CTAAAG	2	12	54800	54811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778784
28	NC_012973	AATTTT	2	12	56921	56932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778786
29	NC_012973	AAGAGA	2	12	57541	57552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778787
30	NC_012973	AGAAAA	2	12	57748	57759	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778787
31	NC_012973	TTTTGT	2	12	60709	60720	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	254778788
32	NC_012973	AAAGAG	2	12	60988	60999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778788
33	NC_012973	AGAAAA	2	12	62727	62738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	254778790
34	NC_012973	GAATAC	2	12	63389	63400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778791
35	NC_012973	ACGCCC	2	12	72680	72691	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254778800
36	NC_012973	AAGGGC	2	12	75411	75422	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254778803
37	NC_012973	CGCCCA	2	12	75947	75958	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254778803
38	NC_012973	GCGCAT	2	12	78566	78577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254778804
39	NC_012973	GGCATG	2	12	78869	78880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778804
40	NC_012973	GATATT	2	12	80656	80667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778805
41	NC_012973	AACAGG	2	12	88583	88594	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254778811
42	NC_012973	AAGCAT	2	12	92409	92420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778814
43	NC_012973	ATTAGA	2	12	92708	92719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778814
44	NC_012973	GCTAAA	2	12	94179	94190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778816
45	NC_012973	GATTTT	2	12	94478	94489	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254778817
46	NC_012973	AAACTC	2	12	94595	94606	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254778817
47	NC_012973	TCAAAA	2	12	95946	95957	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254778818
48	NC_012973	GCGGTG	2	12	96638	96649	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	254778819
49	NC_012973	TTAAGG	2	12	98184	98195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778820
50	NC_012973	CAATAT	2	12	99844	99855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778820
51	NC_012973	CGTATT	2	12	105675	105686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778825
52	NC_012973	TGGAGC	2	12	110725	110736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778829
53	NC_012973	TTTTCT	2	12	112226	112237	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	254778830
54	NC_012973	GCAAGC	2	12	112633	112644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778830
55	NC_012973	CGCTCG	2	12	117219	117230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254778835
56	NC_012973	TAGGCA	2	12	119756	119767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778836
57	NC_012973	CTAAAG	2	12	123756	123767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254778838
58	NC_012973	TGAATT	2	12	124290	124301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778838
59	NC_012973	TTTCAA	2	12	124449	124460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778838
60	NC_012973	CTTTGG	2	12	125851	125862	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	254778840
61	NC_012973	AGCAAA	2	12	127794	127805	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254778841
62	NC_012973	AAAAAT	2	12	137088	137099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254778851
63	NC_012973	TAGCGA	2	12	139232	139243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778854
64	NC_012973	ACGATT	2	12	141759	141770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254778856
65	NC_012973	TTAGCG	2	12	142128	142139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254778856
66	NC_012973	TATCGC	2	12	142340	142351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254778856
67	NC_012973	TATCGC	2	12	144048	144059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254778857
68	NC_012973	AGCCTA	2	12	146270	146281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254778859
69	NC_012973	TTCTAT	2	12	147432	147443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254778860
70	NC_012973	CTTGGG	2	12	151082	151093	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254778866
71	NC_012973	TTGGGT	2	12	155860	155871	0 %	50 %	50 %	0 %	254778871
72	NC_012973	GATTTT	2	12	156373	156384	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254778872
73	NC_012973	AATTGA	2	12	156632	156643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778872
74	NC_012973	ACCCTT	2	12	157515	157526	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	254778874
75	NC_012973	GATGGC	2	12	159586	159597	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778876
76	NC_012973	GATGGC	2	12	159694	159705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778876
77	NC_012973	CTTTCT	2	12	159838	159849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778876
78	NC_012973	CCGCTC	2	12	161596	161607	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254778878
79	NC_012973	GCTCTC	2	12	164022	164033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254778880
80	NC_012973	TAGTGG	2	12	165804	165815	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	254778883
81	NC_012973	TTCTAA	2	12	166357	166368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778883
82	NC_012973	ATCGTT	2	12	168468	168479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778885
83	NC_012973	AATTTC	2	12	168819	168830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778886
84	NC_012973	TAAAAT	2	12	170343	170354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778887
85	NC_012973	ATTTTG	2	12	172147	172158	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254778889
86	NC_012973	CGCTTT	2	12	172625	172636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	254778889
87	NC_012973	ACTTAT	2	12	172722	172733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778889
88	NC_012973	GTTTAA	2	12	173409	173420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	254778890
89	NC_012973	CCGCTC	2	12	176436	176447	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254778893
90	NC_012973	AATAAA	2	12	178605	178616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254778895
91	NC_012973	AGGCAT	2	12	180149	180160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778896
92	NC_012973	GCATTT	2	12	181862	181873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778898
93	NC_012973	TCAAAC	2	12	182429	182440	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254778899
94	NC_012973	ATAAAG	2	12	182590	182601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254778899
95	NC_012973	TTAAAG	2	12	185468	185479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254778900
96	NC_012973	GGTATT	2	12	186369	186380	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254778901
97	NC_012973	TCTAAA	2	12	186599	186610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778901
98	NC_012973	TGGGCA	2	12	187668	187679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778902
99	NC_012973	TTCTAA	2	12	188147	188158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778903
100	NC_012973	ATTTTC	2	12	190092	190103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254778903
101	NC_012973	TGGGGC	2	12	197495	197506	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	254778913
102	NC_012973	CTATGG	2	12	197884	197895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254778913
103	NC_012973	AAATCC	2	12	199264	199275	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254778915
104	NC_012973	ATTCTA	2	12	209927	209938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	254778921
105	NC_012973	CATAGC	2	12	211668	211679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254778922
106	NC_012973	GTTTTG	2	12	212173	212184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778922
107	NC_012973	AATGCC	2	12	224630	224641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254778932
108	NC_012973	GGATTG	2	12	226923	226934	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	254778933
109	NC_012973	TGGTTT	2	12	227066	227077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778933
110	NC_012973	GGTGAT	2	12	228884	228895	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	254778934
111	NC_012973	TCAATA	2	12	229305	229316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254778935
112	NC_012973	CACGCC	2	12	229785	229796	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254778935
113	NC_012973	GCTAGG	2	12	232403	232414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254778937
114	NC_012973	TCTTTA	2	12	239027	239038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254778944
115	NC_012973	GTTTTT	2	12	244664	244675	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	254778951
116	NC_012973	TCCCGC	2	12	249994	250005	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254778956
117	NC_012973	TCCCGC	2	12	250807	250818	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254778956
118	NC_012973	TTTAGC	2	12	254032	254043	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254778958
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233	NC_012973	GTAGGT	2	12	477298	477309	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	254779161
234	NC_012973	AAAATC	2	12	477819	477830	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254779162
235	NC_012973	CATATC	2	12	478094	478105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254779162
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341	NC_012973	CTTTTT	2	12	708806	708817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	254779366
342	NC_012973	TCTTTG	2	12	708967	708978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254779366
343	NC_012973	AGCGAT	2	12	711373	711384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254779368
344	NC_012973	TTATTT	2	12	711527	711538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	254779368
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346	NC_012973	GCCCCT	2	12	714519	714530	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254779372
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458	NC_012973	CATAGC	2	12	1041448	1041459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254779629
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