MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	TAAAA	2	10	1695	1704	80 %	20 %	0 %	0 %	254778741
2	NC_012973	GTTTT	2	10	4943	4952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012973	TTTTA	2	10	4991	5000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012973	AAATT	2	10	7154	7163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012973	TTTCT	2	10	8260	8269	0 %	80 %	0 %	20 %	254778746
6	NC_012973	AATTT	2	10	9099	9108	40 %	60 %	0 %	0 %	254778746
7	NC_012973	TTGAA	2	10	11773	11782	40 %	40 %	20 %	0 %	254778749
8	NC_012973	TTTTG	2	10	11789	11798	0 %	80 %	20 %	0 %	254778749
9	NC_012973	TGGTG	2	10	12625	12634	0 %	40 %	60 %	0 %	254778750
10	NC_012973	GCTTT	2	10	13452	13461	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012973	AAACA	2	10	14418	14427	80 %	0 %	0 %	20 %	254778753
12	NC_012973	GGCTA	2	10	17391	17400	20 %	20 %	40 %	20 %	254778754
13	NC_012973	CAAAA	2	10	18487	18496	80 %	0 %	0 %	20 %	254778755
14	NC_012973	TGAAA	2	10	20831	20840	60 %	20 %	20 %	0 %	254778757
15	NC_012973	CCATG	2	10	23319	23328	20 %	20 %	20 %	40 %	254778760
16	NC_012973	CTCTT	2	10	23349	23358	0 %	60 %	0 %	40 %	254778760
17	NC_012973	AGCCT	2	10	25855	25864	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_012973	CAAGC	2	10	28039	28048	40 %	0 %	20 %	40 %	254778762
19	NC_012973	TTTTA	2	10	28964	28973	20 %	80 %	0 %	0 %	254778763
20	NC_012973	TTTTC	2	10	30556	30565	0 %	80 %	0 %	20 %	254778765
21	NC_012973	TGATT	2	10	31939	31948	20 %	60 %	20 %	0 %	254778766
22	NC_012973	GTGGG	2	10	33832	33841	0 %	20 %	80 %	0 %	254778768
23	NC_012973	AGCCT	2	10	39276	39285	20 %	20 %	20 %	40 %	254778775
24	NC_012973	AAGCC	2	10	40869	40878	40 %	0 %	20 %	40 %	254778776
25	NC_012973	CAAAC	2	10	41510	41519	60 %	0 %	0 %	40 %	254778776
26	NC_012973	AGAAA	2	10	42195	42204	80 %	0 %	20 %	0 %	254778777
27	NC_012973	TACTC	2	10	43048	43057	20 %	40 %	0 %	40 %	254778778
28	NC_012973	TAGTA	2	10	44124	44133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012973	TAAAA	2	10	44927	44936	80 %	20 %	0 %	0 %	254778779
30	NC_012973	TCCCA	2	10	45948	45957	20 %	20 %	0 %	60 %	254778780
31	NC_012973	GCTCC	2	10	46269	46278	0 %	20 %	20 %	60 %	254778780
32	NC_012973	TCGCA	2	10	46806	46815	20 %	20 %	20 %	40 %	254778780
33	NC_012973	AGGGC	2	10	47049	47058	20 %	0 %	60 %	20 %	254778780
34	NC_012973	TGATT	2	10	47460	47469	20 %	60 %	20 %	0 %	254778780
35	NC_012973	AGGCT	2	10	48686	48695	20 %	20 %	40 %	20 %	254778782
36	NC_012973	TGCCT	2	10	49061	49070	0 %	40 %	20 %	40 %	254778782
37	NC_012973	TAAAA	2	10	50096	50105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012973	ATCAA	2	10	50127	50136	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012973	TAAAC	2	10	50329	50338	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_012973	TGAAA	2	10	50677	50686	60 %	20 %	20 %	0 %	254778783
41	NC_012973	TCAAA	2	10	50931	50940	60 %	20 %	0 %	20 %	254778783
42	NC_012973	CAGCA	2	10	51878	51887	40 %	0 %	20 %	40 %	254778784
43	NC_012973	TAAAA	2	10	53970	53979	80 %	20 %	0 %	0 %	254778784
44	NC_012973	TCAAA	2	10	54686	54695	60 %	20 %	0 %	20 %	254778784
45	NC_012973	TTAAA	2	10	55709	55718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012973	TGGAT	2	10	62118	62127	20 %	40 %	40 %	0 %	254778790
47	NC_012973	TTTCT	2	10	68548	68557	0 %	80 %	0 %	20 %	254778796
48	NC_012973	CTTCT	2	10	68865	68874	0 %	60 %	0 %	40 %	254778796
49	NC_012973	TGCCT	2	10	68942	68951	0 %	40 %	20 %	40 %	254778796
50	NC_012973	TCCAA	2	10	69354	69363	40 %	20 %	0 %	40 %	254778797
51	NC_012973	CAAAA	2	10	69671	69680	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012973	CAATG	2	10	70189	70198	40 %	20 %	20 %	20 %	254778798
53	NC_012973	TTTTA	2	10	72605	72614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012973	TTTTG	2	10	72636	72645	0 %	80 %	20 %	0 %	254778800
55	NC_012973	ACGCC	2	10	72942	72951	20 %	0 %	20 %	60 %	254778800
56	NC_012973	AAAGC	2	10	73708	73717	60 %	0 %	20 %	20 %	254778801
57	NC_012973	TTTGT	2	10	78117	78126	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012973	TTTTG	2	10	78197	78206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012973	GATTT	2	10	78208	78217	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012973	ATCTT	2	10	81812	81821	20 %	60 %	0 %	20 %	254778805
61	NC_012973	TGGCT	2	10	82353	82362	0 %	40 %	40 %	20 %	254778805
62	NC_012973	ATGCC	2	10	82762	82771	20 %	20 %	20 %	40 %	254778806
63	NC_012973	TTGAT	2	10	83805	83814	20 %	60 %	20 %	0 %	254778808
64	NC_012973	GGCGT	2	10	85618	85627	0 %	20 %	60 %	20 %	254778810
65	NC_012973	ATAAG	2	10	88822	88831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012973	ATTAT	2	10	88879	88888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012973	TTAAA	2	10	88977	88986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012973	CTTTC	2	10	89263	89272	0 %	60 %	0 %	40 %	254778812
69	NC_012973	TGATT	2	10	92054	92063	20 %	60 %	20 %	0 %	254778814
70	NC_012973	TCTTT	2	10	92263	92272	0 %	80 %	0 %	20 %	254778814
71	NC_012973	ACGAT	2	10	98385	98394	40 %	20 %	20 %	20 %	254778820
72	NC_012973	AATTG	2	10	100227	100236	40 %	40 %	20 %	0 %	254778821
73	NC_012973	TCGTT	2	10	102124	102133	0 %	60 %	20 %	20 %	254778822
74	NC_012973	AAAAT	2	10	104718	104727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012973	AAAGC	2	10	108197	108206	60 %	0 %	20 %	20 %	254778827
76	NC_012973	GAATG	2	10	109433	109442	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012973	CAAAT	2	10	110746	110755	60 %	20 %	0 %	20 %	254778829
78	NC_012973	CGTTT	2	10	111379	111388	0 %	60 %	20 %	20 %	254778829
79	NC_012973	ACCCT	2	10	112175	112184	20 %	20 %	0 %	60 %	254778830
80	NC_012973	ATGCC	2	10	112307	112316	20 %	20 %	20 %	40 %	254778830
81	NC_012973	ATTTA	2	10	113696	113705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012973	TGATT	2	10	114303	114312	20 %	60 %	20 %	0 %	254778832
83	NC_012973	CTAAA	2	10	114773	114782	60 %	20 %	0 %	20 %	254778834
84	NC_012973	GATCG	2	10	118786	118795	20 %	20 %	40 %	20 %	254778836
85	NC_012973	AGCTC	2	10	118805	118814	20 %	20 %	20 %	40 %	254778836
86	NC_012973	AAGCC	2	10	120693	120702	40 %	0 %	20 %	40 %	254778837
87	NC_012973	TTGAT	2	10	122538	122547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012973	CGCTG	2	10	123628	123637	0 %	20 %	40 %	40 %	254778838
89	NC_012973	TTTGA	2	10	123775	123784	20 %	60 %	20 %	0 %	254778838
90	NC_012973	CGCTC	2	10	124018	124027	0 %	20 %	20 %	60 %	254778838
91	NC_012973	TGCGT	2	10	127605	127614	0 %	40 %	40 %	20 %	254778841
92	NC_012973	GAAAA	2	10	127766	127775	80 %	0 %	20 %	0 %	254778841
93	NC_012973	GAAAA	2	10	128084	128093	80 %	0 %	20 %	0 %	254778841
94	NC_012973	ATGTT	2	10	131131	131140	20 %	60 %	20 %	0 %	254778847
95	NC_012973	AAAAG	2	10	131543	131552	80 %	0 %	20 %	0 %	254778847
96	NC_012973	AAATC	2	10	133562	133571	60 %	20 %	0 %	20 %	254778848
97	NC_012973	AATGC	2	10	133590	133599	40 %	20 %	20 %	20 %	254778848
98	NC_012973	AAAAT	2	10	135034	135043	80 %	20 %	0 %	0 %	254778849
99	NC_012973	TTTTC	2	10	137596	137605	0 %	80 %	0 %	20 %	254778852
100	NC_012973	GTAAA	2	10	138148	138157	60 %	20 %	20 %	0 %	254778853
101	NC_012973	TTCTT	2	10	139552	139561	0 %	80 %	0 %	20 %	254778854
102	NC_012973	TCTTT	2	10	140046	140055	0 %	80 %	0 %	20 %	254778855
103	NC_012973	TTTTG	2	10	141213	141222	0 %	80 %	20 %	0 %	254778856
104	NC_012973	GCGAT	2	10	142006	142015	20 %	20 %	40 %	20 %	254778856
105	NC_012973	GCTTG	2	10	142262	142271	0 %	40 %	40 %	20 %	254778856
106	NC_012973	GTCCA	2	10	142867	142876	20 %	20 %	20 %	40 %	254778857
107	NC_012973	TTTTG	2	10	142915	142924	0 %	80 %	20 %	0 %	254778857
108	NC_012973	CCAAA	2	10	144755	144764	60 %	0 %	0 %	40 %	254778858
109	NC_012973	ACGCC	2	10	148277	148286	20 %	0 %	20 %	60 %	254778860
110	NC_012973	GCGTT	2	10	150531	150540	0 %	40 %	40 %	20 %	254778865
111	NC_012973	ATTTG	2	10	151507	151516	20 %	60 %	20 %	0 %	254778866
112	NC_012973	CAAAT	2	10	153404	153413	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012973	AAAAC	2	10	154129	154138	80 %	0 %	0 %	20 %	254778869
114	NC_012973	AGATT	2	10	156029	156038	40 %	40 %	20 %	0 %	254778871
115	NC_012973	AAGCC	2	10	157367	157376	40 %	0 %	20 %	40 %	254778874
116	NC_012973	TAAAA	2	10	158370	158379	80 %	20 %	0 %	0 %	254778875
117	NC_012973	GGCAT	2	10	159167	159176	20 %	20 %	40 %	20 %	254778875
118	NC_012973	ATTTT	2	10	159406	159415	20 %	80 %	0 %	0 %	254778876
119	NC_012973	GGGTG	2	10	159762	159771	0 %	20 %	80 %	0 %	254778876
120	NC_012973	AATAA	2	10	160695	160704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012973	ATTCA	2	10	160904	160913	40 %	40 %	0 %	20 %	254778877
122	NC_012973	ATCTT	2	10	164305	164314	20 %	60 %	0 %	20 %	254778880
123	NC_012973	AATAT	2	10	171676	171685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012973	TTTCC	2	10	171728	171737	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_012973	GAATG	2	10	171814	171823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012973	CCGCA	2	10	172205	172214	20 %	0 %	20 %	60 %	254778889
127	NC_012973	TGGGG	2	10	172914	172923	0 %	20 %	80 %	0 %	254778890
128	NC_012973	ATTTG	2	10	173691	173700	20 %	60 %	20 %	0 %	254778890
129	NC_012973	AAATC	2	10	173930	173939	60 %	20 %	0 %	20 %	254778891
130	NC_012973	AGGTG	2	10	174315	174324	20 %	20 %	60 %	0 %	254778891
131	NC_012973	TTTCT	2	10	174498	174507	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012973	AAATC	2	10	174827	174836	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012973	AAATG	2	10	175222	175231	60 %	20 %	20 %	0 %	254778892
134	NC_012973	TGTAA	2	10	176012	176021	40 %	40 %	20 %	0 %	254778893
135	NC_012973	ATAAA	2	10	177508	177517	80 %	20 %	0 %	0 %	254778894
136	NC_012973	TTTAA	2	10	177871	177880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012973	AAAAG	2	10	178658	178667	80 %	0 %	20 %	0 %	254778895
138	NC_012973	TGAAT	2	10	179039	179048	40 %	40 %	20 %	0 %	254778896
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