MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 1014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	TAAAA	2	10	1695	1704	80 %	20 %	0 %	0 %	254778741
2	NC_012973	TTTCT	2	10	8260	8269	0 %	80 %	0 %	20 %	254778746
3	NC_012973	AATTT	2	10	9099	9108	40 %	60 %	0 %	0 %	254778746
4	NC_012973	TTGAA	2	10	11773	11782	40 %	40 %	20 %	0 %	254778749
5	NC_012973	TTTTG	2	10	11789	11798	0 %	80 %	20 %	0 %	254778749
6	NC_012973	TGGTG	2	10	12625	12634	0 %	40 %	60 %	0 %	254778750
7	NC_012973	AAACA	2	10	14418	14427	80 %	0 %	0 %	20 %	254778753
8	NC_012973	GGCTA	2	10	17391	17400	20 %	20 %	40 %	20 %	254778754
9	NC_012973	CAAAA	2	10	18487	18496	80 %	0 %	0 %	20 %	254778755
10	NC_012973	TGAAA	2	10	20831	20840	60 %	20 %	20 %	0 %	254778757
11	NC_012973	CCATG	2	10	23319	23328	20 %	20 %	20 %	40 %	254778760
12	NC_012973	CTCTT	2	10	23349	23358	0 %	60 %	0 %	40 %	254778760
13	NC_012973	CAAGC	2	10	28039	28048	40 %	0 %	20 %	40 %	254778762
14	NC_012973	TTTTA	2	10	28964	28973	20 %	80 %	0 %	0 %	254778763
15	NC_012973	TTTTC	2	10	30556	30565	0 %	80 %	0 %	20 %	254778765
16	NC_012973	TGATT	2	10	31939	31948	20 %	60 %	20 %	0 %	254778766
17	NC_012973	GTGGG	2	10	33832	33841	0 %	20 %	80 %	0 %	254778768
18	NC_012973	AGCCT	2	10	39276	39285	20 %	20 %	20 %	40 %	254778775
19	NC_012973	AAGCC	2	10	40869	40878	40 %	0 %	20 %	40 %	254778776
20	NC_012973	CAAAC	2	10	41510	41519	60 %	0 %	0 %	40 %	254778776
21	NC_012973	AGAAA	2	10	42195	42204	80 %	0 %	20 %	0 %	254778777
22	NC_012973	TACTC	2	10	43048	43057	20 %	40 %	0 %	40 %	254778778
23	NC_012973	TAAAA	2	10	44927	44936	80 %	20 %	0 %	0 %	254778779
24	NC_012973	TCCCA	2	10	45948	45957	20 %	20 %	0 %	60 %	254778780
25	NC_012973	GCTCC	2	10	46269	46278	0 %	20 %	20 %	60 %	254778780
26	NC_012973	TCGCA	2	10	46806	46815	20 %	20 %	20 %	40 %	254778780
27	NC_012973	AGGGC	2	10	47049	47058	20 %	0 %	60 %	20 %	254778780
28	NC_012973	TGATT	2	10	47460	47469	20 %	60 %	20 %	0 %	254778780
29	NC_012973	AGGCT	2	10	48686	48695	20 %	20 %	40 %	20 %	254778782
30	NC_012973	TGCCT	2	10	49061	49070	0 %	40 %	20 %	40 %	254778782
31	NC_012973	TGAAA	2	10	50677	50686	60 %	20 %	20 %	0 %	254778783
32	NC_012973	TCAAA	2	10	50931	50940	60 %	20 %	0 %	20 %	254778783
33	NC_012973	CAGCA	2	10	51878	51887	40 %	0 %	20 %	40 %	254778784
34	NC_012973	TAAAA	2	10	53970	53979	80 %	20 %	0 %	0 %	254778784
35	NC_012973	TCAAA	2	10	54686	54695	60 %	20 %	0 %	20 %	254778784
36	NC_012973	TGGAT	2	10	62118	62127	20 %	40 %	40 %	0 %	254778790
37	NC_012973	TTTCT	2	10	68548	68557	0 %	80 %	0 %	20 %	254778796
38	NC_012973	CTTCT	2	10	68865	68874	0 %	60 %	0 %	40 %	254778796
39	NC_012973	TGCCT	2	10	68942	68951	0 %	40 %	20 %	40 %	254778796
40	NC_012973	TCCAA	2	10	69354	69363	40 %	20 %	0 %	40 %	254778797
41	NC_012973	CAATG	2	10	70189	70198	40 %	20 %	20 %	20 %	254778798
42	NC_012973	TTTTG	2	10	72636	72645	0 %	80 %	20 %	0 %	254778800
43	NC_012973	ACGCC	2	10	72942	72951	20 %	0 %	20 %	60 %	254778800
44	NC_012973	AAAGC	2	10	73708	73717	60 %	0 %	20 %	20 %	254778801
45	NC_012973	ATCTT	2	10	81812	81821	20 %	60 %	0 %	20 %	254778805
46	NC_012973	TGGCT	2	10	82353	82362	0 %	40 %	40 %	20 %	254778805
47	NC_012973	ATGCC	2	10	82762	82771	20 %	20 %	20 %	40 %	254778806
48	NC_012973	TTGAT	2	10	83805	83814	20 %	60 %	20 %	0 %	254778808
49	NC_012973	GGCGT	2	10	85618	85627	0 %	20 %	60 %	20 %	254778810
50	NC_012973	CTTTC	2	10	89263	89272	0 %	60 %	0 %	40 %	254778812
51	NC_012973	TGATT	2	10	92054	92063	20 %	60 %	20 %	0 %	254778814
52	NC_012973	TCTTT	2	10	92263	92272	0 %	80 %	0 %	20 %	254778814
53	NC_012973	ACGAT	2	10	98385	98394	40 %	20 %	20 %	20 %	254778820
54	NC_012973	AATTG	2	10	100227	100236	40 %	40 %	20 %	0 %	254778821
55	NC_012973	TCGTT	2	10	102124	102133	0 %	60 %	20 %	20 %	254778822
56	NC_012973	AAAGC	2	10	108197	108206	60 %	0 %	20 %	20 %	254778827
57	NC_012973	CAAAT	2	10	110746	110755	60 %	20 %	0 %	20 %	254778829
58	NC_012973	CGTTT	2	10	111379	111388	0 %	60 %	20 %	20 %	254778829
59	NC_012973	ACCCT	2	10	112175	112184	20 %	20 %	0 %	60 %	254778830
60	NC_012973	ATGCC	2	10	112307	112316	20 %	20 %	20 %	40 %	254778830
61	NC_012973	TGATT	2	10	114303	114312	20 %	60 %	20 %	0 %	254778832
62	NC_012973	CTAAA	2	10	114773	114782	60 %	20 %	0 %	20 %	254778834
63	NC_012973	GATCG	2	10	118786	118795	20 %	20 %	40 %	20 %	254778836
64	NC_012973	AGCTC	2	10	118805	118814	20 %	20 %	20 %	40 %	254778836
65	NC_012973	AAGCC	2	10	120693	120702	40 %	0 %	20 %	40 %	254778837
66	NC_012973	CGCTG	2	10	123628	123637	0 %	20 %	40 %	40 %	254778838
67	NC_012973	TTTGA	2	10	123775	123784	20 %	60 %	20 %	0 %	254778838
68	NC_012973	CGCTC	2	10	124018	124027	0 %	20 %	20 %	60 %	254778838
69	NC_012973	TGCGT	2	10	127605	127614	0 %	40 %	40 %	20 %	254778841
70	NC_012973	GAAAA	2	10	127766	127775	80 %	0 %	20 %	0 %	254778841
71	NC_012973	GAAAA	2	10	128084	128093	80 %	0 %	20 %	0 %	254778841
72	NC_012973	ATGTT	2	10	131131	131140	20 %	60 %	20 %	0 %	254778847
73	NC_012973	AAAAG	2	10	131543	131552	80 %	0 %	20 %	0 %	254778847
74	NC_012973	AAATC	2	10	133562	133571	60 %	20 %	0 %	20 %	254778848
75	NC_012973	AATGC	2	10	133590	133599	40 %	20 %	20 %	20 %	254778848
76	NC_012973	AAAAT	2	10	135034	135043	80 %	20 %	0 %	0 %	254778849
77	NC_012973	TTTTC	2	10	137596	137605	0 %	80 %	0 %	20 %	254778852
78	NC_012973	GTAAA	2	10	138148	138157	60 %	20 %	20 %	0 %	254778853
79	NC_012973	TTCTT	2	10	139552	139561	0 %	80 %	0 %	20 %	254778854
80	NC_012973	TCTTT	2	10	140046	140055	0 %	80 %	0 %	20 %	254778855
81	NC_012973	TTTTG	2	10	141213	141222	0 %	80 %	20 %	0 %	254778856
82	NC_012973	GCGAT	2	10	142006	142015	20 %	20 %	40 %	20 %	254778856
83	NC_012973	GCTTG	2	10	142262	142271	0 %	40 %	40 %	20 %	254778856
84	NC_012973	GTCCA	2	10	142867	142876	20 %	20 %	20 %	40 %	254778857
85	NC_012973	TTTTG	2	10	142915	142924	0 %	80 %	20 %	0 %	254778857
86	NC_012973	CCAAA	2	10	144755	144764	60 %	0 %	0 %	40 %	254778858
87	NC_012973	ACGCC	2	10	148277	148286	20 %	0 %	20 %	60 %	254778860
88	NC_012973	GCGTT	2	10	150531	150540	0 %	40 %	40 %	20 %	254778865
89	NC_012973	ATTTG	2	10	151507	151516	20 %	60 %	20 %	0 %	254778866
90	NC_012973	AAAAC	2	10	154129	154138	80 %	0 %	0 %	20 %	254778869
91	NC_012973	AGATT	2	10	156029	156038	40 %	40 %	20 %	0 %	254778871
92	NC_012973	AAGCC	2	10	157367	157376	40 %	0 %	20 %	40 %	254778874
93	NC_012973	TAAAA	2	10	158370	158379	80 %	20 %	0 %	0 %	254778875
94	NC_012973	GGCAT	2	10	159167	159176	20 %	20 %	40 %	20 %	254778875
95	NC_012973	ATTTT	2	10	159406	159415	20 %	80 %	0 %	0 %	254778876
96	NC_012973	GGGTG	2	10	159762	159771	0 %	20 %	80 %	0 %	254778876
97	NC_012973	ATTCA	2	10	160904	160913	40 %	40 %	0 %	20 %	254778877
98	NC_012973	ATCTT	2	10	164305	164314	20 %	60 %	0 %	20 %	254778880
99	NC_012973	CCGCA	2	10	172205	172214	20 %	0 %	20 %	60 %	254778889
100	NC_012973	TGGGG	2	10	172914	172923	0 %	20 %	80 %	0 %	254778890
101	NC_012973	ATTTG	2	10	173691	173700	20 %	60 %	20 %	0 %	254778890
102	NC_012973	AAATC	2	10	173930	173939	60 %	20 %	0 %	20 %	254778891
103	NC_012973	AGGTG	2	10	174315	174324	20 %	20 %	60 %	0 %	254778891
104	NC_012973	AAATG	2	10	175222	175231	60 %	20 %	20 %	0 %	254778892
105	NC_012973	TGTAA	2	10	176012	176021	40 %	40 %	20 %	0 %	254778893
106	NC_012973	ATAAA	2	10	177508	177517	80 %	20 %	0 %	0 %	254778894
107	NC_012973	AAAAG	2	10	178658	178667	80 %	0 %	20 %	0 %	254778895
108	NC_012973	TGAAT	2	10	179039	179048	40 %	40 %	20 %	0 %	254778896
109	NC_012973	CCTTA	2	10	182014	182023	20 %	40 %	0 %	40 %	254778898
110	NC_012973	ATTCA	2	10	186166	186175	40 %	40 %	0 %	20 %	254778901
111	NC_012973	AATCC	2	10	186843	186852	40 %	20 %	0 %	40 %	254778901
112	NC_012973	TCATT	2	10	191780	191789	20 %	60 %	0 %	20 %	254778905
113	NC_012973	CTATT	2	10	192669	192678	20 %	60 %	0 %	20 %	254778907
114	NC_012973	TTTTC	2	10	193729	193738	0 %	80 %	0 %	20 %	254778908
115	NC_012973	TATTT	2	10	197480	197489	20 %	80 %	0 %	0 %	254778913
116	NC_012973	TTTCA	2	10	198137	198146	20 %	60 %	0 %	20 %	254778914
117	NC_012973	TGGGG	2	10	205163	205172	0 %	20 %	80 %	0 %	254778918
118	NC_012973	AGCAC	2	10	207240	207249	40 %	0 %	20 %	40 %	254778919
119	NC_012973	ATTCT	2	10	207596	207605	20 %	60 %	0 %	20 %	254778919
120	NC_012973	GCAAA	2	10	210577	210586	60 %	0 %	20 %	20 %	254778921
121	NC_012973	CTAAG	2	10	210942	210951	40 %	20 %	20 %	20 %	254778922
122	NC_012973	TCGGC	2	10	211391	211400	0 %	20 %	40 %	40 %	254778922
123	NC_012973	TAAAA	2	10	212769	212778	80 %	20 %	0 %	0 %	254778923
124	NC_012973	CCACC	2	10	214294	214303	20 %	0 %	0 %	80 %	254778923
125	NC_012973	TTACA	2	10	214481	214490	40 %	40 %	0 %	20 %	254778924
126	NC_012973	GTGGG	2	10	219549	219558	0 %	20 %	80 %	0 %	254778928
127	NC_012973	TGATG	2	10	219739	219748	20 %	40 %	40 %	0 %	254778928
128	NC_012973	GGTTC	2	10	220097	220106	0 %	40 %	40 %	20 %	254778929
129	NC_012973	GATTT	2	10	221050	221059	20 %	60 %	20 %	0 %	254778929
130	NC_012973	TGGGG	2	10	221850	221859	0 %	20 %	80 %	0 %	254778930
131	NC_012973	GATTG	2	10	221969	221978	20 %	40 %	40 %	0 %	254778930
132	NC_012973	TGAAA	2	10	222351	222360	60 %	20 %	20 %	0 %	254778930
133	NC_012973	TGATT	2	10	222901	222910	20 %	60 %	20 %	0 %	254778930
134	NC_012973	GTATT	2	10	223964	223973	20 %	60 %	20 %	0 %	254778931
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