MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 15790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	CAT	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012973	TGA	3	9	215	223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778739
3	NC_012973	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778739
4	NC_012973	TTC	2	6	450	455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778739
5	NC_012973	ACA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778739
6	NC_012973	AAT	2	6	551	556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778740
7	NC_012973	AAC	2	6	791	796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778740
8	NC_012973	CTT	2	6	894	899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778740
9	NC_012973	TGA	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778740
10	NC_012973	AAC	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778741
11	NC_012973	CCG	4	12	1137	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778741
12	NC_012973	CCA	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254778741
13	NC_012973	GCT	2	6	1306	1311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778741
14	NC_012973	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778741
15	NC_012973	GGC	2	6	1497	1502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254778741
16	NC_012973	GCC	2	6	1541	1546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778741
17	NC_012973	GTT	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778741
18	NC_012973	TAG	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778741
19	NC_012973	CTT	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778741
20	NC_012973	TTC	2	6	1856	1861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778742
21	NC_012973	GTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778742
22	NC_012973	CTT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778742
23	NC_012973	TGG	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778742
24	NC_012973	TCA	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778742
25	NC_012973	TAG	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778742
26	NC_012973	TGA	2	6	2754	2759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778743
27	NC_012973	AGC	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778743
28	NC_012973	GTG	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778743
29	NC_012973	AGA	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778743
30	NC_012973	GTG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778743
31	NC_012973	GCC	2	6	3224	3229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778743
32	NC_012973	GTT	2	6	3670	3675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778744
33	NC_012973	CTA	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778744
34	NC_012973	ATC	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778744
35	NC_012973	ATT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778744
36	NC_012973	GGC	2	6	4071	4076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254778744
37	NC_012973	GGT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012973	TAT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012973	TGG	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012973	TGG	2	6	4389	4394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012973	GTG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012973	ACC	2	6	4536	4541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012973	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012973	AAT	2	6	4711	4716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012973	TTA	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012973	TGT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012973	ATT	2	6	5349	5354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778745
48	NC_012973	TGG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778745
49	NC_012973	TCT	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778745
50	NC_012973	TTG	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
51	NC_012973	TAA	2	6	5718	5723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778745
52	NC_012973	ATT	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778745
53	NC_012973	GTG	2	6	5845	5850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778745
54	NC_012973	GTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
55	NC_012973	CAA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778745
56	NC_012973	TCA	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778745
57	NC_012973	CAG	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778745
58	NC_012973	GTT	2	6	6246	6251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
59	NC_012973	CTT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778745
60	NC_012973	TAG	3	9	6467	6475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778745
61	NC_012973	TAG	7	21	6479	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778745
62	NC_012973	TTA	2	6	6508	6513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778745
63	NC_012973	TGT	2	6	6528	6533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
64	NC_012973	GTT	2	6	6561	6566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
65	NC_012973	TTG	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
66	NC_012973	CGT	2	6	6614	6619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778745
67	NC_012973	GTT	2	6	6663	6668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
68	NC_012973	TTG	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
69	NC_012973	CCG	2	6	6797	6802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778745
70	NC_012973	GCT	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778745
71	NC_012973	GTT	2	6	6942	6947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
72	NC_012973	TAA	2	6	7113	7118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778745
73	NC_012973	GGT	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012973	AGA	2	6	7433	7438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012973	GAT	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012973	CAT	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778746
77	NC_012973	GCC	2	6	7487	7492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778746
78	NC_012973	TCT	2	6	7548	7553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778746
79	NC_012973	AAT	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778746
80	NC_012973	CTT	2	6	7654	7659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778746
81	NC_012973	CAT	2	6	7744	7749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778746
82	NC_012973	ATG	2	6	7797	7802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778746
83	NC_012973	TCA	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778746
84	NC_012973	CCG	2	6	7875	7880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778746
85	NC_012973	CTT	2	6	7894	7899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778746
86	NC_012973	CCG	2	6	7903	7908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778746
87	NC_012973	CAT	2	6	8098	8103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778746
88	NC_012973	GTG	2	6	8130	8135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778746
89	NC_012973	TTC	2	6	8210	8215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778746
90	NC_012973	CCG	2	6	8229	8234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778746
91	NC_012973	CAC	2	6	8330	8335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254778746
92	NC_012973	GAT	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778746
93	NC_012973	CTT	2	6	8584	8589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778746
94	NC_012973	TCT	2	6	8694	8699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778746
95	NC_012973	GCA	2	6	8868	8873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778746
96	NC_012973	CTT	2	6	8893	8898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778746
97	NC_012973	CAT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778746
98	NC_012973	TAA	3	9	9129	9137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012973	TCT	2	6	9250	9255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778747
100	NC_012973	CTT	2	6	9332	9337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778747
101	NC_012973	GAT	3	9	9420	9428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778747
102	NC_012973	TCT	2	6	9448	9453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778747
103	NC_012973	CTA	2	6	9464	9469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778747
104	NC_012973	TTA	2	6	9551	9556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012973	ATT	2	6	9630	9635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012973	CAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012973	TTG	2	6	9891	9896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778748
108	NC_012973	GAA	2	6	9907	9912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778748
109	NC_012973	TTA	2	6	10086	10091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778748
110	NC_012973	AGA	2	6	10101	10106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778748
111	NC_012973	ACC	2	6	10109	10114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254778748
112	NC_012973	AAG	2	6	10142	10147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778748
113	NC_012973	ATT	2	6	10175	10180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778748
114	NC_012973	CAT	2	6	10356	10361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778748
115	NC_012973	GTG	2	6	10390	10395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778748
116	NC_012973	ATG	2	6	10670	10675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778748
117	NC_012973	AGG	2	6	10735	10740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254778748
118	NC_012973	AAC	2	6	10762	10767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778748
119	NC_012973	AGA	2	6	11148	11153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778748
120	NC_012973	TTG	2	6	11161	11166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778748
121	NC_012973	GAC	2	6	11248	11253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778748
122	NC_012973	TTA	3	9	11269	11277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778748
123	NC_012973	TTG	2	6	11326	11331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778748
124	NC_012973	AAG	2	6	11839	11844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778749
125	NC_012973	GGT	2	6	11925	11930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778749
126	NC_012973	TTG	2	6	12016	12021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778749
127	NC_012973	TAA	2	6	12149	12154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778749
128	NC_012973	TGG	3	9	12250	12258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778749
129	NC_012973	GAA	3	9	12267	12275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778749
130	NC_012973	AGA	2	6	12371	12376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778749
131	NC_012973	AGG	2	6	12594	12599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012973	TTA	2	6	12681	12686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778750
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134	NC_012973	GTT	2	6	12765	12770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778750
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