MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip02

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012972	TTAA	2	8	202	209	50 %	50 %	0 %	0 %	254028271
2	NC_012972	TACT	2	8	286	293	25 %	50 %	0 %	25 %	254028271
3	NC_012972	TAAA	2	8	377	384	75 %	25 %	0 %	0 %	254028272
4	NC_012972	CATC	2	8	801	808	25 %	25 %	0 %	50 %	254028272
5	NC_012972	ACTT	2	8	940	947	25 %	50 %	0 %	25 %	254028272
6	NC_012972	ATTC	2	8	1027	1034	25 %	50 %	0 %	25 %	254028272
7	NC_012972	AATT	2	8	1261	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	254028273
8	NC_012972	CATT	2	8	1270	1277	25 %	50 %	0 %	25 %	254028273
9	NC_012972	TTTC	2	8	1407	1414	0 %	75 %	0 %	25 %	254028273
10	NC_012972	TGTT	2	8	2536	2543	0 %	75 %	25 %	0 %	254028274
11	NC_012972	CTGT	2	8	2650	2657	0 %	50 %	25 %	25 %	254028274
12	NC_012972	GCCC	2	8	2793	2800	0 %	0 %	25 %	75 %	254028274
13	NC_012972	TAGC	2	8	4172	4179	25 %	25 %	25 %	25 %	254028275
14	NC_012972	ACAG	2	8	4573	4580	50 %	0 %	25 %	25 %	254028275
15	NC_012972	TTTC	2	8	4661	4668	0 %	75 %	0 %	25 %	254028275
16	NC_012972	GTTG	2	8	5049	5056	0 %	50 %	50 %	0 %	254028276
17	NC_012972	CATC	2	8	5145	5152	25 %	25 %	0 %	50 %	254028276
18	NC_012972	GCTG	2	8	5339	5346	0 %	25 %	50 %	25 %	254028276
19	NC_012972	AGCA	2	8	7091	7098	50 %	0 %	25 %	25 %	254028278
20	NC_012972	ATGG	2	8	8440	8447	25 %	25 %	50 %	0 %	254028281
21	NC_012972	GCTT	2	8	8500	8507	0 %	50 %	25 %	25 %	254028281
22	NC_012972	CTGA	2	8	9286	9293	25 %	25 %	25 %	25 %	254028282
23	NC_012972	AGCC	2	8	9366	9373	25 %	0 %	25 %	50 %	254028282
24	NC_012972	AGTG	2	8	9798	9805	25 %	25 %	50 %	0 %	254028283

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.