MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli BL21(DE3) chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012971	GAAAAT	2	12	10611	10622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012971	ACGCGT	2	12	78385	78396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012971	AAGGGA	2	12	87136	87147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012971	TCTCCC	2	12	167396	167407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012971	TCACCC	2	12	167447	167458	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012971	GTAGTG	2	12	203223	203234	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012971	GCAGGG	2	12	242665	242676	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012971	TCCGCC	2	12	254023	254034	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012971	TGCGCC	2	12	254488	254499	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012971	TGGAGA	2	12	254903	254914	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012971	TAAGGG	2	12	281897	281908	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012971	TGTGGA	2	12	283044	283055	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012971	TTTTCT	2	12	289735	289746	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012971	CTATTT	2	12	290771	290782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012971	TAAATT	2	12	313670	313681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012971	TTTATT	2	12	313779	313790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012971	AACAAT	2	12	371892	371903	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012971	TATTGA	2	12	375515	375526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012971	TTTTCA	2	12	441524	441535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012971	CAGGCG	2	12	460367	460378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012971	TTATAT	2	12	537280	537291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012971	GATTTT	2	12	540875	540886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012971	CGACAT	2	12	543264	543275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012971	GAAACC	2	12	543625	543636	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012971	TATCAA	2	12	549339	549350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012971	TGCAAA	2	12	573140	573151	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012971	ATCATT	2	12	636906	636917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012971	ATTTTT	2	12	668146	668157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012971	TTGTGT	2	12	753819	753830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012971	TCAATA	2	12	761106	761117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012971	CTGTCA	2	12	767975	767986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012971	AATATT	2	12	804751	804762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012971	CAGAAA	2	12	816982	816993	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012971	AGATAA	2	12	856917	856928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012971	CAGAAG	2	12	876998	877009	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012971	TAACCG	2	12	927588	927599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012971	AAATAA	2	12	959703	959714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012971	CTGGAA	2	12	969266	969277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012971	AAAGAT	2	12	992233	992244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012971	TGTCCA	2	12	1012865	1012876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012971	TAAGGA	2	12	1035133	1035144	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012971	ATAATG	2	12	1036547	1036558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012971	TGTTAA	2	12	1078365	1078376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012971	CAAAAA	2	12	1123790	1123801	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012971	AGCTGA	2	12	1181326	1181337	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012971	TTTTGT	2	12	1207665	1207676	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012971	AGCGAT	2	12	1208066	1208077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012971	CACAGG	2	12	1210017	1210028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012971	ACGCTT	2	12	1228274	1228285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012971	ACTCGA	2	12	1228294	1228305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012971	CAGGCT	2	12	1228426	1228437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012971	CTTATT	2	12	1280217	1280228	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012971	CAAAAG	2	12	1286112	1286123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012971	CGGGGG	2	12	1294331	1294342	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012971	CTGATC	2	12	1296590	1296601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012971	CTATAA	2	12	1343632	1343643	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012971	ATTTAA	2	12	1402171	1402182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012971	AAAAAC	2	12	1511229	1511240	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012971	ACCGTT	2	12	1526106	1526117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012971	TGGTTA	2	12	1534936	1534947	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012971	CAAAAA	2	12	1578421	1578432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012971	TAAATA	2	12	1580221	1580232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012971	AAAAAC	2	12	1590973	1590984	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012971	AGTGCG	2	12	1591001	1591012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012971	CTGTAA	2	12	1597092	1597103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012971	ATACTT	2	12	1686403	1686414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012971	AAAATA	2	12	1700059	1700070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012971	TGTTTT	2	12	1700692	1700703	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012971	AAGACT	2	12	1700952	1700963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012971	GAACAG	2	12	1747876	1747887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012971	TATTAC	2	12	1816288	1816299	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012971	TTTCTT	2	12	1835652	1835663	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012971	ATAACC	2	12	1839596	1839607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012971	ACTGTC	2	12	1883251	1883262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012971	TTAATG	2	12	1924660	1924671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012971	AATTCA	2	12	1931785	1931796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012971	ATTTTT	2	12	1963121	1963132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012971	CTGATA	2	12	1972211	1972222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012971	TCCCCC	2	12	2051593	2051604	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_012971	CACCAA	2	12	2085723	2085734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012971	CCAGCG	2	12	2134451	2134462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012971	TAACTG	2	12	2134650	2134661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012971	TCTTCC	2	12	2158686	2158697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012971	CCACTA	2	12	2239995	2240006	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012971	TTACCC	2	12	2274776	2274787	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012971	TAAATG	2	12	2294153	2294164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012971	TGTCAC	2	12	2307788	2307799	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012971	AGAAAA	2	12	2318068	2318079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012971	TAAAAA	2	12	2350901	2350912	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012971	GTTGAC	2	12	2352027	2352038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012971	CTGATG	2	12	2372890	2372901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012971	GTTATG	2	12	2390731	2390742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012971	CAAGTG	2	12	2403694	2403705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012971	TGCTGG	2	12	2468583	2468594	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012971	GGGGCT	2	12	2469021	2469032	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012971	TCCTTC	2	12	2503768	2503779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012971	CCCGCC	2	12	2530076	2530087	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_012971	TGGACA	2	12	2555363	2555374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012971	AAGAGA	2	12	2562990	2563001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012971	CAGTTT	2	12	2570744	2570755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012971	ATCTTA	2	12	2696809	2696820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012971	GGTTTT	2	12	2750618	2750629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012971	ACAAGA	2	12	2754949	2754960	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012971	CTTTTA	2	12	2760578	2760589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012971	ACTTCA	2	12	2765752	2765763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012971	TTTGTT	2	12	2785575	2785586	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012971	CATTAA	2	12	2822434	2822445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012971	ATCGCG	2	12	2872014	2872025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012971	GTAAGG	2	12	2887707	2887718	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012971	ACTGAG	2	12	2912696	2912707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012971	ACGCAG	2	12	2981691	2981702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012971	TTTTCG	2	12	2988337	2988348	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012971	CACCCC	2	12	3069321	3069332	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
114	NC_012971	AGTTGT	2	12	3077111	3077122	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012971	CTTTTT	2	12	3081788	3081799	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012971	AATGAT	2	12	3082623	3082634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012971	TAACAA	2	12	3119601	3119612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_012971	GTAACC	2	12	3132361	3132372	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012971	AGACAA	2	12	3133981	3133992	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012971	TGCATT	2	12	3143127	3143138	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012971	TTTTAT	2	12	3145023	3145034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012971	ATATAA	2	12	3155791	3155802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012971	AATTTA	2	12	3406705	3406716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012971	AGATGC	2	12	3515725	3515736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012971	ATACCG	2	12	3524955	3524966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012971	TGAAAA	2	12	3530597	3530608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_012971	CATTCT	2	12	3595627	3595638	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.