MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	ACTATG	2	12	1071	1082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254003129
2	NC_012970	TGTATT	2	12	2264	2275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254003131
3	NC_012970	GAGATT	2	12	2407	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
4	NC_012970	GCTGAA	2	12	4475	4486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254003134
5	NC_012970	TGCTGA	2	12	11839	11850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254003142
6	NC_012970	TGTTCT	2	12	19526	19537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254003149
7	NC_012970	GCGTAA	2	12	23922	23933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254003158
8	NC_012970	TCTCGA	2	12	35216	35227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254003167
9	NC_012970	TCAAAA	2	12	35356	35367	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254003167
10	NC_012970	AAGATC	2	12	40598	40609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254003169
11	NC_012970	TTATCT	2	12	49451	49462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254003180
12	NC_012970	AATACC	2	12	55983	55994	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254003187
13	NC_012970	TTGGCT	2	12	56270	56281	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	254003188
14	NC_012970	ATTCAA	2	12	58399	58410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254003189
15	NC_012970	CCTGCT	2	12	67043	67054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254003198
16	NC_012970	ACATTC	2	12	68414	68425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003200
17	NC_012970	GATAAA	2	12	68602	68613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254003200
18	NC_012970	TGGCTA	2	12	70143	70154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254003201
19	NC_012970	CTGCCG	2	12	71188	71199	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254003202
20	NC_012970	TTCTAG	2	12	74053	74064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254003206
21	NC_012970	TAAGAT	2	12	75504	75515	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254003207

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.