MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	GTGAT	2	10	2952	2961	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012970	AGTTC	2	10	4864	4873	20 %	40 %	20 %	20 %	254003134
3	NC_012970	TGGGG	2	10	5396	5405	0 %	20 %	80 %	0 %	254003134
4	NC_012970	AAAGG	2	10	7009	7018	60 %	0 %	40 %	0 %	254003136
5	NC_012970	TACGT	2	10	7118	7127	20 %	40 %	20 %	20 %	254003137
6	NC_012970	GCTTC	2	10	9583	9592	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012970	GAGCT	2	10	11180	11189	20 %	20 %	40 %	20 %	254003142
8	NC_012970	ATGGC	2	10	11520	11529	20 %	20 %	40 %	20 %	254003142
9	NC_012970	GCGAT	2	10	14346	14355	20 %	20 %	40 %	20 %	254003143
10	NC_012970	GTTCT	2	10	15108	15117	0 %	60 %	20 %	20 %	254003144
11	NC_012970	GCTTC	2	10	18370	18379	0 %	40 %	20 %	40 %	254003148
12	NC_012970	ATGGG	2	10	18829	18838	20 %	20 %	60 %	0 %	254003149
13	NC_012970	AGCTA	2	10	21145	21154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012970	AAGCC	2	10	22495	22504	40 %	0 %	20 %	40 %	254003155
15	NC_012970	GTTTT	2	10	24319	24328	0 %	80 %	20 %	0 %	254003159
16	NC_012970	GAAAT	2	10	25011	25020	60 %	20 %	20 %	0 %	254003161
17	NC_012970	CCCCG	2	10	25996	26005	0 %	0 %	20 %	80 %	254003161
18	NC_012970	TCGCT	2	10	29745	29754	0 %	40 %	20 %	40 %	254003164
19	NC_012970	TGACC	2	10	30434	30443	20 %	20 %	20 %	40 %	254003165
20	NC_012970	TACGC	2	10	31351	31360	20 %	20 %	20 %	40 %	254003165
21	NC_012970	AACCA	2	10	32322	32331	60 %	0 %	0 %	40 %	254003165
22	NC_012970	ACCTC	2	10	33313	33322	20 %	20 %	0 %	60 %	254003166
23	NC_012970	CATTA	2	10	36254	36263	40 %	40 %	0 %	20 %	254003169
24	NC_012970	TTCAT	2	10	37617	37626	20 %	60 %	0 %	20 %	254003169
25	NC_012970	TTCAT	2	10	38454	38463	20 %	60 %	0 %	20 %	254003169
26	NC_012970	TTTCA	2	10	39119	39128	20 %	60 %	0 %	20 %	254003169
27	NC_012970	TCACG	2	10	39619	39628	20 %	20 %	20 %	40 %	254003169
28	NC_012970	TTGCT	2	10	41490	41499	0 %	60 %	20 %	20 %	254003169
29	NC_012970	CTTTT	2	10	45167	45176	0 %	80 %	0 %	20 %	254003174
30	NC_012970	GAAAC	2	10	46150	46159	60 %	0 %	20 %	20 %	254003174
31	NC_012970	ACGCT	2	10	46986	46995	20 %	20 %	20 %	40 %	254003176
32	NC_012970	CTTTC	2	10	48048	48057	0 %	60 %	0 %	40 %	254003178
33	NC_012970	GCAGT	2	10	48122	48131	20 %	20 %	40 %	20 %	254003178
34	NC_012970	ATCAC	2	10	49109	49118	40 %	20 %	0 %	40 %	254003180
35	NC_012970	GGGTG	2	10	51865	51874	0 %	20 %	80 %	0 %	254003182
36	NC_012970	CGAGA	2	10	53024	53033	40 %	0 %	40 %	20 %	254003184
37	NC_012970	GCGAA	2	10	56288	56297	40 %	0 %	40 %	20 %	254003188
38	NC_012970	GATTC	2	10	61760	61769	20 %	40 %	20 %	20 %	254003192
39	NC_012970	TGCCT	2	10	64658	64667	0 %	40 %	20 %	40 %	254003197
40	NC_012970	GCCTG	2	10	65960	65969	0 %	20 %	40 %	40 %	254003197
41	NC_012970	CTGCA	2	10	66489	66498	20 %	20 %	20 %	40 %	254003198
42	NC_012970	TGTGC	2	10	66623	66632	0 %	40 %	40 %	20 %	254003198
43	NC_012970	AAACA	2	10	68333	68342	80 %	0 %	0 %	20 %	254003200
44	NC_012970	TCAAA	2	10	70562	70571	60 %	20 %	0 %	20 %	254003201
45	NC_012970	ATGAA	2	10	70711	70720	60 %	20 %	20 %	0 %	254003202
46	NC_012970	TAATG	2	10	72640	72649	40 %	40 %	20 %	0 %	254003204
47	NC_012970	GCCCT	2	10	73692	73701	0 %	20 %	20 %	60 %	254003205
48	NC_012970	GGCAA	2	10	76671	76680	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.