MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	GATC	2	8	365	372	25 %	25 %	25 %	25 %	254003129
2	NC_012970	TGTT	2	8	622	629	0 %	75 %	25 %	0 %	254003129
3	NC_012970	GGAT	2	8	1415	1422	25 %	25 %	50 %	0 %	254003129
4	NC_012970	AACC	2	8	2033	2040	50 %	0 %	0 %	50 %	254003131
5	NC_012970	TAAA	2	8	2190	2197	75 %	25 %	0 %	0 %	254003131
6	NC_012970	AACT	2	8	2564	2571	50 %	25 %	0 %	25 %	254003131
7	NC_012970	TCTT	2	8	3208	3215	0 %	75 %	0 %	25 %	254003132
8	NC_012970	GAAT	2	8	3592	3599	50 %	25 %	25 %	0 %	254003133
9	NC_012970	ATTC	2	8	4524	4531	25 %	50 %	0 %	25 %	254003134
10	NC_012970	ATTG	2	8	4921	4928	25 %	50 %	25 %	0 %	254003134
11	NC_012970	TTGC	2	8	5733	5740	0 %	50 %	25 %	25 %	254003135
12	NC_012970	AAAT	2	8	5981	5988	75 %	25 %	0 %	0 %	254003135
13	NC_012970	ACCA	2	8	6510	6517	50 %	0 %	0 %	50 %	254003136
14	NC_012970	TGCT	2	8	6590	6597	0 %	50 %	25 %	25 %	254003136
15	NC_012970	TCCT	2	8	6891	6898	0 %	50 %	0 %	50 %	254003136
16	NC_012970	TGTT	2	8	7036	7043	0 %	75 %	25 %	0 %	254003136
17	NC_012970	AATG	2	8	7256	7263	50 %	25 %	25 %	0 %	254003137
18	NC_012970	GCTT	2	8	7269	7276	0 %	50 %	25 %	25 %	254003137
19	NC_012970	TGCT	3	12	7428	7439	0 %	50 %	25 %	25 %	254003137
20	NC_012970	TTTA	2	8	7610	7617	25 %	75 %	0 %	0 %	254003137
21	NC_012970	CTGC	2	8	7621	7628	0 %	25 %	25 %	50 %	254003137
22	NC_012970	TTTC	2	8	10777	10784	0 %	75 %	0 %	25 %	254003141
23	NC_012970	TGAT	2	8	10979	10986	25 %	50 %	25 %	0 %	254003141
24	NC_012970	TGAA	2	8	11316	11323	50 %	25 %	25 %	0 %	254003142
25	NC_012970	GCAA	2	8	11771	11778	50 %	0 %	25 %	25 %	254003142
26	NC_012970	ATTC	2	8	12344	12351	25 %	50 %	0 %	25 %	254003143
27	NC_012970	GGGC	2	8	12878	12885	0 %	0 %	75 %	25 %	254003143
28	NC_012970	TTCC	2	8	12965	12972	0 %	50 %	0 %	50 %	254003143
29	NC_012970	GATC	2	8	13562	13569	25 %	25 %	25 %	25 %	254003143
30	NC_012970	ATTC	2	8	13721	13728	25 %	50 %	0 %	25 %	254003143
31	NC_012970	GTTC	2	8	13733	13740	0 %	50 %	25 %	25 %	254003143
32	NC_012970	TTGC	2	8	13871	13878	0 %	50 %	25 %	25 %	254003143
33	NC_012970	GAAG	2	8	14186	14193	50 %	0 %	50 %	0 %	254003143
34	NC_012970	CATT	2	8	14622	14629	25 %	50 %	0 %	25 %	254003143
35	NC_012970	ACAG	2	8	14668	14675	50 %	0 %	25 %	25 %	254003143
36	NC_012970	GCTT	2	8	15399	15406	0 %	50 %	25 %	25 %	254003144
37	NC_012970	TAGA	2	8	15673	15680	50 %	25 %	25 %	0 %	254003145
38	NC_012970	AAAG	2	8	15861	15868	75 %	0 %	25 %	0 %	254003145
39	NC_012970	GAAA	2	8	15915	15922	75 %	0 %	25 %	0 %	254003145
40	NC_012970	CACG	2	8	16753	16760	25 %	0 %	25 %	50 %	254003146
41	NC_012970	TTGT	2	8	17376	17383	0 %	75 %	25 %	0 %	254003146
42	NC_012970	GATC	2	8	17775	17782	25 %	25 %	25 %	25 %	254003147
43	NC_012970	AGGG	2	8	17845	17852	25 %	0 %	75 %	0 %	254003147
44	NC_012970	CGTT	2	8	17960	17967	0 %	50 %	25 %	25 %	254003147
45	NC_012970	TTGG	2	8	18299	18306	0 %	50 %	50 %	0 %	254003148
46	NC_012970	ATAG	2	8	18337	18344	50 %	25 %	25 %	0 %	254003148
47	NC_012970	ACTT	2	8	18847	18854	25 %	50 %	0 %	25 %	254003149
48	NC_012970	TTTC	2	8	19191	19198	0 %	75 %	0 %	25 %	254003149
49	NC_012970	ATGC	2	8	19349	19356	25 %	25 %	25 %	25 %	254003149
50	NC_012970	TTCA	2	8	20909	20916	25 %	50 %	0 %	25 %	254003153
51	NC_012970	AATG	2	8	20996	21003	50 %	25 %	25 %	0 %	254003153
52	NC_012970	CGGA	2	8	21229	21236	25 %	0 %	50 %	25 %	254003154
53	NC_012970	GAAA	2	8	21358	21365	75 %	0 %	25 %	0 %	254003154
54	NC_012970	TCAA	2	8	21367	21374	50 %	25 %	0 %	25 %	254003154
55	NC_012970	GGCA	2	8	21461	21468	25 %	0 %	50 %	25 %	254003154
56	NC_012970	AATG	2	8	22013	22020	50 %	25 %	25 %	0 %	254003154
57	NC_012970	TTTC	2	8	22584	22591	0 %	75 %	0 %	25 %	254003155
58	NC_012970	ACCC	2	8	23105	23112	25 %	0 %	0 %	75 %	254003156
59	NC_012970	ACCT	2	8	24746	24753	25 %	25 %	0 %	50 %	254003160
60	NC_012970	TCAA	2	8	25353	25360	50 %	25 %	0 %	25 %	254003161
61	NC_012970	AGGA	2	8	25559	25566	50 %	0 %	50 %	0 %	254003161
62	NC_012970	ACGC	2	8	25933	25940	25 %	0 %	25 %	50 %	254003161
63	NC_012970	AAGG	2	8	26343	26350	50 %	0 %	50 %	0 %	254003162
64	NC_012970	TACT	2	8	26476	26483	25 %	50 %	0 %	25 %	254003162
65	NC_012970	ATGA	2	8	26792	26799	50 %	25 %	25 %	0 %	254003162
66	NC_012970	TGAA	2	8	27000	27007	50 %	25 %	25 %	0 %	254003162
67	NC_012970	TGCT	2	8	27385	27392	0 %	50 %	25 %	25 %	254003162
68	NC_012970	AGCC	2	8	27616	27623	25 %	0 %	25 %	50 %	254003162
69	NC_012970	GCAC	2	8	27658	27665	25 %	0 %	25 %	50 %	254003162
70	NC_012970	ATTG	2	8	27693	27700	25 %	50 %	25 %	0 %	254003162
71	NC_012970	GGTA	2	8	27942	27949	25 %	25 %	50 %	0 %	254003162
72	NC_012970	TCCA	2	8	28066	28073	25 %	25 %	0 %	50 %	254003163
73	NC_012970	CTTG	2	8	28325	28332	0 %	50 %	25 %	25 %	254003163
74	NC_012970	CCTT	2	8	28810	28817	0 %	50 %	0 %	50 %	254003164
75	NC_012970	GAAT	2	8	29983	29990	50 %	25 %	25 %	0 %	254003164
76	NC_012970	TCCT	2	8	30126	30133	0 %	50 %	0 %	50 %	254003164
77	NC_012970	GCAA	2	8	30172	30179	50 %	0 %	25 %	25 %	254003164
78	NC_012970	TCCG	2	8	30249	30256	0 %	25 %	25 %	50 %	254003164
79	NC_012970	TACC	2	8	30482	30489	25 %	25 %	0 %	50 %	254003165
80	NC_012970	TGCT	2	8	30648	30655	0 %	50 %	25 %	25 %	254003165
81	NC_012970	TCAT	2	8	30760	30767	25 %	50 %	0 %	25 %	254003165
82	NC_012970	CTTG	2	8	30980	30987	0 %	50 %	25 %	25 %	254003165
83	NC_012970	GCGG	2	8	31625	31632	0 %	0 %	75 %	25 %	254003165
84	NC_012970	TGAG	2	8	31681	31688	25 %	25 %	50 %	0 %	254003165
85	NC_012970	CACG	2	8	31700	31707	25 %	0 %	25 %	50 %	254003165
86	NC_012970	CTTC	2	8	31805	31812	0 %	50 %	0 %	50 %	254003165
87	NC_012970	GAAA	2	8	31923	31930	75 %	0 %	25 %	0 %	254003165
88	NC_012970	TTTG	2	8	32193	32200	0 %	75 %	25 %	0 %	254003165
89	NC_012970	TTCG	2	8	33366	33373	0 %	50 %	25 %	25 %	254003166
90	NC_012970	ACGC	2	8	33393	33400	25 %	0 %	25 %	50 %	254003166
91	NC_012970	TTTC	2	8	34049	34056	0 %	75 %	0 %	25 %	254003167
92	NC_012970	GAAG	2	8	34292	34299	50 %	0 %	50 %	0 %	254003167
93	NC_012970	TCCA	2	8	34829	34836	25 %	25 %	0 %	50 %	254003167
94	NC_012970	GCCT	2	8	34992	34999	0 %	25 %	25 %	50 %	254003167
95	NC_012970	GCAG	2	8	35004	35011	25 %	0 %	50 %	25 %	254003167
96	NC_012970	GTAG	2	8	35168	35175	25 %	25 %	50 %	0 %	254003167
97	NC_012970	TTGC	2	8	35955	35962	0 %	50 %	25 %	25 %	254003167
98	NC_012970	CTGT	2	8	36304	36311	0 %	50 %	25 %	25 %	254003169
99	NC_012970	CGAG	2	8	36726	36733	25 %	0 %	50 %	25 %	254003169
100	NC_012970	GCTT	2	8	37002	37009	0 %	50 %	25 %	25 %	254003169
101	NC_012970	CAAT	2	8	37143	37150	50 %	25 %	0 %	25 %	254003169
102	NC_012970	GCCT	2	8	37991	37998	0 %	25 %	25 %	50 %	254003169
103	NC_012970	ATGA	2	8	38066	38073	50 %	25 %	25 %	0 %	254003169
104	NC_012970	AAAT	2	8	38582	38589	75 %	25 %	0 %	0 %	254003169
105	NC_012970	TCCT	2	8	38730	38737	0 %	50 %	0 %	50 %	254003169
106	NC_012970	GCTT	2	8	39378	39385	0 %	50 %	25 %	25 %	254003169
107	NC_012970	TTCA	2	8	39425	39432	25 %	50 %	0 %	25 %	254003169
108	NC_012970	AACC	2	8	39463	39470	50 %	0 %	0 %	50 %	254003169
109	NC_012970	TTCA	2	8	39962	39969	25 %	50 %	0 %	25 %	254003169
110	NC_012970	CATC	2	8	40297	40304	25 %	25 %	0 %	50 %	254003169
111	NC_012970	ACGA	2	8	40460	40467	50 %	0 %	25 %	25 %	254003169
112	NC_012970	CCAT	2	8	40923	40930	25 %	25 %	0 %	50 %	254003169
113	NC_012970	TGGC	2	8	43966	43973	0 %	25 %	50 %	25 %	254003172
114	NC_012970	ATGG	2	8	44023	44030	25 %	25 %	50 %	0 %	254003172
115	NC_012970	TCCA	2	8	44133	44140	25 %	25 %	0 %	50 %	254003172
116	NC_012970	CAAT	2	8	44574	44581	50 %	25 %	0 %	25 %	254003173
117	NC_012970	TGCG	2	8	44660	44667	0 %	25 %	50 %	25 %	254003173
118	NC_012970	GAGC	2	8	45346	45353	25 %	0 %	50 %	25 %	254003174
119	NC_012970	CGTA	2	8	48183	48190	25 %	25 %	25 %	25 %	254003178
120	NC_012970	ATTT	2	8	48273	48280	25 %	75 %	0 %	0 %	254003178
121	NC_012970	TCCG	2	8	48825	48832	0 %	25 %	25 %	50 %	254003180
122	NC_012970	GATT	2	8	49381	49388	25 %	50 %	25 %	0 %	254003180
123	NC_012970	AACG	2	8	49599	49606	50 %	0 %	25 %	25 %	254003180
124	NC_012970	CACT	2	8	50596	50603	25 %	25 %	0 %	50 %	254003181
125	NC_012970	TTGC	2	8	50705	50712	0 %	50 %	25 %	25 %	254003181
126	NC_012970	TTTC	2	8	50767	50774	0 %	75 %	0 %	25 %	254003181
127	NC_012970	AATG	2	8	50942	50949	50 %	25 %	25 %	0 %	254003181
128	NC_012970	ATTG	2	8	51699	51706	25 %	50 %	25 %	0 %	254003182
129	NC_012970	TCAA	2	8	52124	52131	50 %	25 %	0 %	25 %	254003182
130	NC_012970	TTTG	2	8	52350	52357	0 %	75 %	25 %	0 %	254003183
131	NC_012970	TCCA	2	8	52811	52818	25 %	25 %	0 %	50 %	254003184
132	NC_012970	ATTG	2	8	52954	52961	25 %	50 %	25 %	0 %	254003184
133	NC_012970	AACC	2	8	54360	54367	50 %	0 %	0 %	50 %	254003185
134	NC_012970	ACCA	2	8	54591	54598	50 %	0 %	0 %	50 %	254003186
135	NC_012970	CTTT	2	8	54875	54882	0 %	75 %	0 %	25 %	254003186
136	NC_012970	TGAT	2	8	54949	54956	25 %	50 %	25 %	0 %	254003186
137	NC_012970	ACTA	2	8	55248	55255	50 %	25 %	0 %	25 %	254003186
138	NC_012970	TTTC	2	8	55600	55607	0 %	75 %	0 %	25 %	254003187
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.