MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	TCA	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
2	NC_012970	TCA	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
3	NC_012970	ACT	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
4	NC_012970	GAT	2	6	600	605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003129
5	NC_012970	GCA	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003129
6	NC_012970	CAT	2	6	723	728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
7	NC_012970	CAG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003129
8	NC_012970	CGG	2	6	1123	1128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003129
9	NC_012970	GAA	2	6	1212	1217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003129
10	NC_012970	AGT	2	6	1225	1230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003129
11	NC_012970	TCT	2	6	1274	1279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003129
12	NC_012970	ACA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003129
13	NC_012970	CTT	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003129
14	NC_012970	AAG	2	6	1458	1463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003129
15	NC_012970	CTG	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003130
16	NC_012970	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003130
17	NC_012970	TCT	2	6	1691	1696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003130
18	NC_012970	TGT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003131
19	NC_012970	TTG	2	6	1949	1954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003131
20	NC_012970	GAT	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
21	NC_012970	TCA	2	6	2100	2105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003131
22	NC_012970	ACT	2	6	2198	2203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003131
23	NC_012970	GTT	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003131
24	NC_012970	TAT	2	6	2281	2286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003131
25	NC_012970	AGG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003131
26	NC_012970	ATG	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
27	NC_012970	GCA	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003131
28	NC_012970	GTA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
29	NC_012970	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003131
30	NC_012970	AGT	2	6	2824	2829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
31	NC_012970	TGC	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003131
32	NC_012970	ACT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003134
33	NC_012970	TAC	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003134
34	NC_012970	TGG	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003134
35	NC_012970	TTG	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003134
36	NC_012970	CGG	2	6	5079	5084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003134
37	NC_012970	GAA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003134
38	NC_012970	GAA	3	9	5179	5187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003134
39	NC_012970	ATC	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003134
40	NC_012970	GCG	2	6	5263	5268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003134
41	NC_012970	CAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003134
42	NC_012970	TGA	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003135
43	NC_012970	TGC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003135
44	NC_012970	AGC	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003136
45	NC_012970	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003136
46	NC_012970	AAT	2	6	6209	6214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003136
47	NC_012970	ATA	2	6	6261	6266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003136
48	NC_012970	ACT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003136
49	NC_012970	TGC	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003136
50	NC_012970	ACT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003136
51	NC_012970	CAC	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003136
52	NC_012970	CCT	2	6	6760	6765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254003136
53	NC_012970	GCA	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003136
54	NC_012970	CTT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003136
55	NC_012970	GAA	2	6	6914	6919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003136
56	NC_012970	CAT	2	6	7207	7212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003137
57	NC_012970	TGC	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003137
58	NC_012970	TGA	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003137
59	NC_012970	GCG	2	6	7323	7328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003137
60	NC_012970	TTG	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003137
61	NC_012970	CAA	2	6	7546	7551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003137
62	NC_012970	TTA	2	6	7575	7580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003137
63	NC_012970	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003137
64	NC_012970	TCT	2	6	7672	7677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003137
65	NC_012970	GCC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003137
66	NC_012970	TTC	2	6	7697	7702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003137
67	NC_012970	CTT	2	6	7988	7993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003138
68	NC_012970	TCA	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003138
69	NC_012970	ATC	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003138
70	NC_012970	GTA	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003138
71	NC_012970	CAG	2	6	8329	8334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003138
72	NC_012970	GCT	2	6	8353	8358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003138
73	NC_012970	CAG	2	6	8482	8487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003138
74	NC_012970	GCC	2	6	8829	8834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003139
75	NC_012970	TCG	2	6	8927	8932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003139
76	NC_012970	CGC	2	6	8951	8956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003139
77	NC_012970	AGG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003139
78	NC_012970	TTG	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003139
79	NC_012970	GCC	2	6	9096	9101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003139
80	NC_012970	CTT	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003139
81	NC_012970	TTC	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003139
82	NC_012970	TGA	2	6	9283	9288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003139
83	NC_012970	TAA	2	6	10412	10417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003140
84	NC_012970	AAG	2	6	10596	10601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003140
85	NC_012970	TCT	2	6	10698	10703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003141
86	NC_012970	GTA	2	6	10748	10753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003141
87	NC_012970	GTC	2	6	10807	10812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003141
88	NC_012970	TAA	2	6	10962	10967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003141
89	NC_012970	AAG	2	6	11024	11029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003141
90	NC_012970	AGA	2	6	11080	11085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003141
91	NC_012970	TGC	2	6	11172	11177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
92	NC_012970	CGA	2	6	11272	11277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003142
93	NC_012970	TCG	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
94	NC_012970	CTG	2	6	11457	11462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
95	NC_012970	ATG	2	6	11610	11615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003142
96	NC_012970	GAA	2	6	11699	11704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003142
97	NC_012970	ATG	2	6	11811	11816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003142
98	NC_012970	GCG	2	6	11886	11891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003142
99	NC_012970	GGT	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003142
100	NC_012970	TAT	2	6	11974	11979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003142
101	NC_012970	GCT	2	6	11981	11986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
102	NC_012970	GAA	2	6	12121	12126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003142
103	NC_012970	ATC	2	6	12283	12288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003143
104	NC_012970	GAC	2	6	12301	12306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
105	NC_012970	ACA	2	6	12333	12338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003143
106	NC_012970	CGG	2	6	12471	12476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003143
107	NC_012970	AGA	2	6	12517	12522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003143
108	NC_012970	GCA	2	6	12590	12595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
109	NC_012970	CAT	2	6	12637	12642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003143
110	NC_012970	GGT	2	6	12817	12822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003143
111	NC_012970	AAT	2	6	13027	13032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003143
112	NC_012970	GGT	2	6	13040	13045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003143
113	NC_012970	CTG	2	6	13281	13286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003143
114	NC_012970	GCA	2	6	13322	13327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
115	NC_012970	CAG	2	6	13452	13457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
116	NC_012970	CAG	2	6	13600	13605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
117	NC_012970	TTG	2	6	13652	13657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003143
118	NC_012970	GCC	2	6	13680	13685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003143
119	NC_012970	GAT	2	6	13763	13768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003143
120	NC_012970	AGA	2	6	13770	13775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003143
121	NC_012970	TCA	2	6	13879	13884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003143
122	NC_012970	GCT	2	6	13903	13908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003143
123	NC_012970	AAG	2	6	13923	13928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003143
124	NC_012970	GAT	2	6	14210	14215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003143
125	NC_012970	TGG	2	6	14268	14273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003143
126	NC_012970	CAT	2	6	14401	14406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003143
127	NC_012970	GCA	2	6	14432	14437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
128	NC_012970	GGA	2	6	14602	14607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003143
129	NC_012970	ATT	3	9	14984	14992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003144
130	NC_012970	TGC	2	6	15306	15311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003144
131	NC_012970	CGC	2	6	15384	15389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003144
132	NC_012970	GGA	2	6	15421	15426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003144
133	NC_012970	GAA	2	6	15436	15441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003144
134	NC_012970	CTG	2	6	15562	15567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003145
135	NC_012970	GCA	2	6	15882	15887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003145
136	NC_012970	CTA	2	6	16004	16009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003145
137	NC_012970	TGT	2	6	16040	16045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003145
138	NC_012970	AAG	2	6	16051	16056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003145
139	NC_012970	GAT	2	6	16070	16075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003145
140	NC_012970	CTG	2	6	16326	16331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003146
141	NC_012970	CCA	2	6	16342	16347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003146
142	NC_012970	TCA	2	6	16428	16433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003146
143	NC_012970	TCT	2	6	16477	16482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003146
144	NC_012970	CTG	2	6	16826	16831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003146
145	NC_012970	TGA	2	6	16834	16839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003146
146	NC_012970	ACG	2	6	16907	16912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003146
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149	NC_012970	TGC	2	6	17257	17262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003146
150	NC_012970	TTA	2	6	17567	17572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003147
151	NC_012970	TGG	2	6	17739	17744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003147
152	NC_012970	TCT	2	6	17783	17788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003147
153	NC_012970	CCG	2	6	17898	17903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003147
154	NC_012970	TGT	2	6	17922	17927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003147
155	NC_012970	GGC	2	6	18026	18031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003148
156	NC_012970	AAG	2	6	18065	18070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003148
157	NC_012970	TCA	2	6	18113	18118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003148
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159	NC_012970	CTT	2	6	18241	18246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003148
160	NC_012970	AAT	2	6	18355	18360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003148
161	NC_012970	CAG	2	6	18625	18630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003148
162	NC_012970	GTT	2	6	18745	18750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003149
163	NC_012970	GGC	2	6	18763	18768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003149
164	NC_012970	CAG	2	6	19114	19119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003149
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166	NC_012970	ATA	2	6	19332	19337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003149
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168	NC_012970	TTC	2	6	19370	19375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003149
169	NC_012970	AAC	2	6	19383	19388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003149
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180	NC_012970	TAG	2	6	20457	20462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003152
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239	NC_012970	TCA	2	6	27187	27192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003162
240	NC_012970	TCG	2	6	27205	27210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003162
241	NC_012970	TGC	2	6	27300	27305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003162
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243	NC_012970	CTG	2	6	27429	27434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003162
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246	NC_012970	ACC	2	6	27535	27540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003162
247	NC_012970	AAT	2	6	27636	27641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003162
248	NC_012970	GCG	2	6	27642	27647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003162
249	NC_012970	AAG	2	6	27819	27824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003162
250	NC_012970	TGG	2	6	27866	27871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003162
251	NC_012970	CAA	2	6	28034	28039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003162
252	NC_012970	TGA	2	6	28040	28045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003162
253	NC_012970	TGC	2	6	28094	28099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003163
254	NC_012970	CTG	2	6	28129	28134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003163
255	NC_012970	TTC	2	6	28143	28148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003163
256	NC_012970	CAC	2	6	28202	28207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003163
257	NC_012970	GCA	2	6	28290	28295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003163
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259	NC_012970	TGT	2	6	28432	28437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003163
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264	NC_012970	ATT	2	6	29028	29033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003164
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272	NC_012970	GCA	2	6	29860	29865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003164
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496	NC_012970	TGG	2	6	50632	50637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003181
497	NC_012970	GAT	2	6	50642	50647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003181
498	NC_012970	TCA	2	6	50718	50723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003181
499	NC_012970	CTG	2	6	50731	50736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003181
500	NC_012970	TGC	2	6	50786	50791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003181

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