MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	CT	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012970	TG	3	6	653	658	0 %	50 %	50 %	0 %	254003129
3	NC_012970	TC	3	6	928	933	0 %	50 %	0 %	50 %	254003129
4	NC_012970	TA	4	8	1763	1770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012970	TC	3	6	3268	3273	0 %	50 %	0 %	50 %	254003132
6	NC_012970	TC	3	6	3513	3518	0 %	50 %	0 %	50 %	254003133
7	NC_012970	GA	3	6	3581	3586	50 %	0 %	50 %	0 %	254003133
8	NC_012970	AT	3	6	3801	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012970	CT	3	6	3866	3871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012970	AG	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012970	TC	3	6	4011	4016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012970	AC	3	6	4574	4579	50 %	0 %	0 %	50 %	254003134
13	NC_012970	TA	3	6	5500	5505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012970	AT	3	6	5513	5518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012970	AT	3	6	6279	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	254003136
16	NC_012970	GA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	50 %	0 %	254003137
17	NC_012970	TA	3	6	7849	7854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012970	AT	3	6	8704	8709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012970	TA	3	6	8722	8727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012970	AT	3	6	9414	9419	50 %	50 %	0 %	0 %	254003139
21	NC_012970	AT	3	6	9480	9485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012970	TG	3	6	9885	9890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012970	GT	3	6	9894	9899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012970	TC	3	6	9948	9953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012970	AT	5	10	10764	10773	50 %	50 %	0 %	0 %	254003141
26	NC_012970	TA	3	6	11111	11116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012970	AG	3	6	11581	11586	50 %	0 %	50 %	0 %	254003142
28	NC_012970	TA	3	6	12229	12234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012970	AT	3	6	12376	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	254003143
30	NC_012970	GA	3	6	12849	12854	50 %	0 %	50 %	0 %	254003143
31	NC_012970	CT	3	6	16552	16557	0 %	50 %	0 %	50 %	254003146
32	NC_012970	CT	3	6	17122	17127	0 %	50 %	0 %	50 %	254003146
33	NC_012970	AT	3	6	17180	17185	50 %	50 %	0 %	0 %	254003146
34	NC_012970	TA	3	6	18997	19002	50 %	50 %	0 %	0 %	254003149
35	NC_012970	CA	3	6	19539	19544	50 %	0 %	0 %	50 %	254003149
36	NC_012970	TG	3	6	21609	21614	0 %	50 %	50 %	0 %	254003154
37	NC_012970	CA	3	6	21757	21762	50 %	0 %	0 %	50 %	254003154
38	NC_012970	AG	3	6	21824	21829	50 %	0 %	50 %	0 %	254003154
39	NC_012970	AT	3	6	21854	21859	50 %	50 %	0 %	0 %	254003154
40	NC_012970	AT	3	6	23032	23037	50 %	50 %	0 %	0 %	254003156
41	NC_012970	AT	3	6	25029	25034	50 %	50 %	0 %	0 %	254003161
42	NC_012970	CT	3	6	25544	25549	0 %	50 %	0 %	50 %	254003161
43	NC_012970	AT	3	6	26113	26118	50 %	50 %	0 %	0 %	254003161
44	NC_012970	GT	3	6	26549	26554	0 %	50 %	50 %	0 %	254003162
45	NC_012970	CT	3	6	27391	27396	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
46	NC_012970	CT	4	8	27525	27532	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
47	NC_012970	CT	3	6	27740	27745	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
48	NC_012970	TG	3	6	28874	28879	0 %	50 %	50 %	0 %	254003164
49	NC_012970	CG	3	6	30356	30361	0 %	0 %	50 %	50 %	254003164
50	NC_012970	GC	3	6	30507	30512	0 %	0 %	50 %	50 %	254003165
51	NC_012970	GT	3	6	31248	31253	0 %	50 %	50 %	0 %	254003165
52	NC_012970	AG	3	6	32431	32436	50 %	0 %	50 %	0 %	254003165
53	NC_012970	TA	3	6	32900	32905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012970	TC	3	6	33328	33333	0 %	50 %	0 %	50 %	254003166
55	NC_012970	CT	3	6	34998	35003	0 %	50 %	0 %	50 %	254003167
56	NC_012970	AT	3	6	36336	36341	50 %	50 %	0 %	0 %	254003169
57	NC_012970	AT	3	6	36398	36403	50 %	50 %	0 %	0 %	254003169
58	NC_012970	TC	3	6	36871	36876	0 %	50 %	0 %	50 %	254003169
59	NC_012970	AG	3	6	37751	37756	50 %	0 %	50 %	0 %	254003169
60	NC_012970	AT	3	6	38472	38477	50 %	50 %	0 %	0 %	254003169
61	NC_012970	CT	3	6	43028	43033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012970	TC	4	8	43328	43335	0 %	50 %	0 %	50 %	254003172
63	NC_012970	TG	3	6	44740	44745	0 %	50 %	50 %	0 %	254003173
64	NC_012970	TA	3	6	45108	45113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012970	AT	4	8	45307	45314	50 %	50 %	0 %	0 %	254003174
66	NC_012970	AT	3	6	46230	46235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012970	AT	3	6	47301	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012970	TG	3	6	49857	49862	0 %	50 %	50 %	0 %	254003180
69	NC_012970	AG	3	6	49876	49881	50 %	0 %	50 %	0 %	254003180
70	NC_012970	AT	4	8	50307	50314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012970	TA	3	6	50323	50328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012970	AT	3	6	51207	51212	50 %	50 %	0 %	0 %	254003181
73	NC_012970	TC	3	6	51226	51231	0 %	50 %	0 %	50 %	254003181
74	NC_012970	TC	3	6	51912	51917	0 %	50 %	0 %	50 %	254003182
75	NC_012970	AG	3	6	52087	52092	50 %	0 %	50 %	0 %	254003182
76	NC_012970	AT	3	6	52739	52744	50 %	50 %	0 %	0 %	254003184
77	NC_012970	AC	3	6	54995	55000	50 %	0 %	0 %	50 %	254003186
78	NC_012970	TA	3	6	55478	55483	50 %	50 %	0 %	0 %	254003187
79	NC_012970	AG	3	6	57127	57132	50 %	0 %	50 %	0 %	254003188
80	NC_012970	GA	3	6	57493	57498	50 %	0 %	50 %	0 %	254003188
81	NC_012970	CA	3	6	58363	58368	50 %	0 %	0 %	50 %	254003189
82	NC_012970	TA	3	6	58477	58482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012970	TA	3	6	58490	58495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012970	AT	3	6	58514	58519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012970	AT	3	6	59483	59488	50 %	50 %	0 %	0 %	254003190
86	NC_012970	CT	3	6	59921	59926	0 %	50 %	0 %	50 %	254003190
87	NC_012970	GC	3	6	59973	59978	0 %	0 %	50 %	50 %	254003190
88	NC_012970	GA	3	6	60348	60353	50 %	0 %	50 %	0 %	254003190
89	NC_012970	AT	3	6	61228	61233	50 %	50 %	0 %	0 %	254003191
90	NC_012970	TA	3	6	63114	63119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012970	GA	3	6	64624	64629	50 %	0 %	50 %	0 %	254003196
92	NC_012970	AG	3	6	67096	67101	50 %	0 %	50 %	0 %	254003198
93	NC_012970	AT	3	6	68530	68535	50 %	50 %	0 %	0 %	254003200
94	NC_012970	CT	3	6	68724	68729	0 %	50 %	0 %	50 %	254003200
95	NC_012970	GT	3	6	70027	70032	0 %	50 %	50 %	0 %	254003201
96	NC_012970	GT	3	6	71744	71749	0 %	50 %	50 %	0 %	254003203
97	NC_012970	AC	3	6	72858	72863	50 %	0 %	0 %	50 %	254003205
98	NC_012970	AC	3	6	73852	73857	50 %	0 %	0 %	50 %	254003206
99	NC_012970	AT	3	6	73910	73915	50 %	50 %	0 %	0 %	254003206
100	NC_012970	TG	3	6	74047	74052	0 %	50 %	50 %	0 %	254003206
101	NC_012970	TA	3	6	74362	74367	50 %	50 %	0 %	0 %	254003206

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.