MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	TG	3	6	653	658	0 %	50 %	50 %	0 %	254003129
2	NC_012970	TC	3	6	928	933	0 %	50 %	0 %	50 %	254003129
3	NC_012970	TC	3	6	3268	3273	0 %	50 %	0 %	50 %	254003132
4	NC_012970	TC	3	6	3513	3518	0 %	50 %	0 %	50 %	254003133
5	NC_012970	GA	3	6	3581	3586	50 %	0 %	50 %	0 %	254003133
6	NC_012970	AC	3	6	4574	4579	50 %	0 %	0 %	50 %	254003134
7	NC_012970	AT	3	6	6279	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	254003136
8	NC_012970	GA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	50 %	0 %	254003137
9	NC_012970	AT	3	6	9414	9419	50 %	50 %	0 %	0 %	254003139
10	NC_012970	AT	5	10	10764	10773	50 %	50 %	0 %	0 %	254003141
11	NC_012970	AG	3	6	11581	11586	50 %	0 %	50 %	0 %	254003142
12	NC_012970	AT	3	6	12376	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	254003143
13	NC_012970	GA	3	6	12849	12854	50 %	0 %	50 %	0 %	254003143
14	NC_012970	CT	3	6	16552	16557	0 %	50 %	0 %	50 %	254003146
15	NC_012970	CT	3	6	17122	17127	0 %	50 %	0 %	50 %	254003146
16	NC_012970	AT	3	6	17180	17185	50 %	50 %	0 %	0 %	254003146
17	NC_012970	TA	3	6	18997	19002	50 %	50 %	0 %	0 %	254003149
18	NC_012970	CA	3	6	19539	19544	50 %	0 %	0 %	50 %	254003149
19	NC_012970	TG	3	6	21609	21614	0 %	50 %	50 %	0 %	254003154
20	NC_012970	CA	3	6	21757	21762	50 %	0 %	0 %	50 %	254003154
21	NC_012970	AG	3	6	21824	21829	50 %	0 %	50 %	0 %	254003154
22	NC_012970	AT	3	6	21854	21859	50 %	50 %	0 %	0 %	254003154
23	NC_012970	AT	3	6	23032	23037	50 %	50 %	0 %	0 %	254003156
24	NC_012970	AT	3	6	25029	25034	50 %	50 %	0 %	0 %	254003161
25	NC_012970	CT	3	6	25544	25549	0 %	50 %	0 %	50 %	254003161
26	NC_012970	AT	3	6	26113	26118	50 %	50 %	0 %	0 %	254003161
27	NC_012970	GT	3	6	26549	26554	0 %	50 %	50 %	0 %	254003162
28	NC_012970	CT	3	6	27391	27396	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
29	NC_012970	CT	4	8	27525	27532	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
30	NC_012970	CT	3	6	27740	27745	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
31	NC_012970	TG	3	6	28874	28879	0 %	50 %	50 %	0 %	254003164
32	NC_012970	CG	3	6	30356	30361	0 %	0 %	50 %	50 %	254003164
33	NC_012970	GC	3	6	30507	30512	0 %	0 %	50 %	50 %	254003165
34	NC_012970	GT	3	6	31248	31253	0 %	50 %	50 %	0 %	254003165
35	NC_012970	AG	3	6	32431	32436	50 %	0 %	50 %	0 %	254003165
36	NC_012970	TC	3	6	33328	33333	0 %	50 %	0 %	50 %	254003166
37	NC_012970	CT	3	6	34998	35003	0 %	50 %	0 %	50 %	254003167
38	NC_012970	AT	3	6	36336	36341	50 %	50 %	0 %	0 %	254003169
39	NC_012970	AT	3	6	36398	36403	50 %	50 %	0 %	0 %	254003169
40	NC_012970	TC	3	6	36871	36876	0 %	50 %	0 %	50 %	254003169
41	NC_012970	AG	3	6	37751	37756	50 %	0 %	50 %	0 %	254003169
42	NC_012970	AT	3	6	38472	38477	50 %	50 %	0 %	0 %	254003169
43	NC_012970	TC	4	8	43328	43335	0 %	50 %	0 %	50 %	254003172
44	NC_012970	TG	3	6	44740	44745	0 %	50 %	50 %	0 %	254003173
45	NC_012970	AT	4	8	45307	45314	50 %	50 %	0 %	0 %	254003174
46	NC_012970	TG	3	6	49857	49862	0 %	50 %	50 %	0 %	254003180
47	NC_012970	AG	3	6	49876	49881	50 %	0 %	50 %	0 %	254003180
48	NC_012970	AT	3	6	51207	51212	50 %	50 %	0 %	0 %	254003181
49	NC_012970	TC	3	6	51226	51231	0 %	50 %	0 %	50 %	254003181
50	NC_012970	TC	3	6	51912	51917	0 %	50 %	0 %	50 %	254003182
51	NC_012970	AG	3	6	52087	52092	50 %	0 %	50 %	0 %	254003182
52	NC_012970	AT	3	6	52739	52744	50 %	50 %	0 %	0 %	254003184
53	NC_012970	AC	3	6	54995	55000	50 %	0 %	0 %	50 %	254003186
54	NC_012970	TA	3	6	55478	55483	50 %	50 %	0 %	0 %	254003187
55	NC_012970	AG	3	6	57127	57132	50 %	0 %	50 %	0 %	254003188
56	NC_012970	GA	3	6	57493	57498	50 %	0 %	50 %	0 %	254003188
57	NC_012970	CA	3	6	58363	58368	50 %	0 %	0 %	50 %	254003189
58	NC_012970	AT	3	6	59483	59488	50 %	50 %	0 %	0 %	254003190
59	NC_012970	CT	3	6	59921	59926	0 %	50 %	0 %	50 %	254003190
60	NC_012970	GC	3	6	59973	59978	0 %	0 %	50 %	50 %	254003190
61	NC_012970	GA	3	6	60348	60353	50 %	0 %	50 %	0 %	254003190
62	NC_012970	AT	3	6	61228	61233	50 %	50 %	0 %	0 %	254003191
63	NC_012970	GA	3	6	64624	64629	50 %	0 %	50 %	0 %	254003196
64	NC_012970	AG	3	6	67096	67101	50 %	0 %	50 %	0 %	254003198
65	NC_012970	AT	3	6	68530	68535	50 %	50 %	0 %	0 %	254003200
66	NC_012970	CT	3	6	68724	68729	0 %	50 %	0 %	50 %	254003200
67	NC_012970	GT	3	6	70027	70032	0 %	50 %	50 %	0 %	254003201
68	NC_012970	GT	3	6	71744	71749	0 %	50 %	50 %	0 %	254003203
69	NC_012970	AC	3	6	72858	72863	50 %	0 %	0 %	50 %	254003205
70	NC_012970	AC	3	6	73852	73857	50 %	0 %	0 %	50 %	254003206
71	NC_012970	AT	3	6	73910	73915	50 %	50 %	0 %	0 %	254003206
72	NC_012970	TG	3	6	74047	74052	0 %	50 %	50 %	0 %	254003206
73	NC_012970	TA	3	6	74362	74367	50 %	50 %	0 %	0 %	254003206

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.