MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 chromosome

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012969	GATAGG	2	12	73082	73093	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012969	TGCATT	2	12	86605	86616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012969	GATAGC	2	12	89171	89182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012969	AAAAAT	2	12	91682	91693	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012969	TCATGC	2	12	118537	118548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012969	CAAAAG	2	12	183309	183320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012969	GAAAAA	2	12	188119	188130	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012969	ATCTTT	2	12	209862	209873	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012969	GGCCAG	2	12	244427	244438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012969	GGCCCA	2	12	259114	259125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012969	ATCAAA	2	12	365692	365703	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012969	CAAAAA	2	12	365708	365719	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012969	AGCTTG	2	12	504802	504813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012969	GCCTGC	2	12	560834	560845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012969	AATCCG	2	12	628756	628767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012969	GCCCCA	2	12	761804	761815	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012969	GTACTG	2	12	842326	842337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012969	CTTTTT	2	12	995000	995011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012969	TAAGGG	2	12	1218462	1218473	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012969	AAAAAG	2	12	1426721	1426732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012969	CAAGCG	2	12	1441742	1441753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012969	ACGATG	2	12	1465578	1465589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012969	GGCTGT	2	12	1477851	1477862	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012969	GTTAAA	2	12	1484836	1484847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012969	CTGCCT	2	12	1580403	1580414	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012969	CAGCAA	2	12	1580686	1580697	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012969	AGTGGC	2	12	1621587	1621598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012969	GCTTTT	2	12	1632097	1632108	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012969	GGGCTG	2	12	1687969	1687980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012969	CTGAGC	2	12	1748296	1748307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012969	TCCTTT	2	12	1788803	1788814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012969	AAGAAC	2	12	1798973	1798984	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012969	ATCATT	2	12	1804120	1804131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012969	GTTTTT	2	12	1824647	1824658	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012969	AAGGCA	2	12	1916484	1916495	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012969	CAACTT	2	12	1919231	1919242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012969	TCATGA	2	12	2021482	2021493	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012969	TGGTAT	2	12	2103172	2103183	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012969	AAAATT	2	12	2147592	2147603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012969	ATAAAT	2	12	2150286	2150297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012969	ACTTAA	2	12	2150316	2150327	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012969	AAAATA	2	12	2151374	2151385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012969	AAAGCA	2	12	2176450	2176461	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012969	TAGGTG	2	12	2176590	2176601	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012969	TATATC	2	12	2183803	2183814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012969	TTTGTT	2	12	2184731	2184742	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012969	TTTGTT	2	12	2187212	2187223	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012969	CTTTAT	2	12	2207240	2207251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012969	ATACAC	2	12	2233711	2233722	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012969	TATGCA	2	12	2241046	2241057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012969	AATATA	2	12	2277882	2277893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012969	CCTGCA	2	12	2325236	2325247	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012969	AAGGCC	2	12	2389379	2389390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012969	GCTCAA	2	12	2515783	2515794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012969	GGCAAG	2	12	2571815	2571826	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012969	TTAAAA	2	12	2571860	2571871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012969	AAAGGC	2	12	2712784	2712795	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012969	TGCTTA	2	12	2896128	2896139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.