MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 chromosome

Total Repeats: 2003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012969	TCAGC	2	10	186	195	20 %	20 %	20 %	40 %	253997714
2	NC_012969	GCTAC	2	10	4441	4450	20 %	20 %	20 %	40 %	253997716
3	NC_012969	GGTGC	2	10	9509	9518	0 %	20 %	60 %	20 %	253997722
4	NC_012969	CCAGC	2	10	12190	12199	20 %	0 %	20 %	60 %	253997724
5	NC_012969	TTTAA	2	10	12872	12881	40 %	60 %	0 %	0 %	253997724
6	NC_012969	GCATG	2	10	14027	14036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012969	CAGGG	2	10	14398	14407	20 %	0 %	60 %	20 %	253997726
8	NC_012969	GGCGA	2	10	16649	16658	20 %	0 %	60 %	20 %	253997727
9	NC_012969	GGCAG	2	10	16969	16978	20 %	0 %	60 %	20 %	253997727
10	NC_012969	TGCCG	2	10	19268	19277	0 %	20 %	40 %	40 %	253997727
11	NC_012969	ATTCC	2	10	22163	22172	20 %	40 %	0 %	40 %	253997730
12	NC_012969	CTGGC	2	10	23775	23784	0 %	20 %	40 %	40 %	253997730
13	NC_012969	ATCCA	2	10	23845	23854	40 %	20 %	0 %	40 %	253997730
14	NC_012969	CTGGC	2	10	25627	25636	0 %	20 %	40 %	40 %	253997732
15	NC_012969	GCGCA	2	10	29268	29277	20 %	0 %	40 %	40 %	253997736
16	NC_012969	CAAGG	2	10	30920	30929	40 %	0 %	40 %	20 %	253997739
17	NC_012969	GCGCC	2	10	34319	34328	0 %	0 %	40 %	60 %	253997743
18	NC_012969	TGCCA	2	10	37099	37108	20 %	20 %	20 %	40 %	253997745
19	NC_012969	CCCAG	2	10	40624	40633	20 %	0 %	20 %	60 %	253997749
20	NC_012969	GGCCT	2	10	43187	43196	0 %	20 %	40 %	40 %	253997751
21	NC_012969	GCGCT	2	10	43879	43888	0 %	20 %	40 %	40 %	253997752
22	NC_012969	TGCCG	2	10	44997	45006	0 %	20 %	40 %	40 %	253997752
23	NC_012969	ATCCT	2	10	45278	45287	20 %	40 %	0 %	40 %	253997752
24	NC_012969	TGCCG	2	10	47570	47579	0 %	20 %	40 %	40 %	253997753
25	NC_012969	CAGGC	2	10	48802	48811	20 %	0 %	40 %	40 %	253997755
26	NC_012969	CGCAG	2	10	50728	50737	20 %	0 %	40 %	40 %	253997756
27	NC_012969	CCTGT	2	10	52576	52585	0 %	40 %	20 %	40 %	253997757
28	NC_012969	TGGCC	2	10	53929	53938	0 %	20 %	40 %	40 %	253997759
29	NC_012969	ATCAC	2	10	54856	54865	40 %	20 %	0 %	40 %	253997760
30	NC_012969	GCCTG	2	10	55389	55398	0 %	20 %	40 %	40 %	253997761
31	NC_012969	CTGGG	2	10	56576	56585	0 %	20 %	60 %	20 %	253997762
32	NC_012969	GCCGA	2	10	56606	56615	20 %	0 %	40 %	40 %	253997762
33	NC_012969	TCAGG	2	10	57703	57712	20 %	20 %	40 %	20 %	253997763
34	NC_012969	GCCTG	2	10	62478	62487	0 %	20 %	40 %	40 %	253997768
35	NC_012969	TTTGC	2	10	64251	64260	0 %	60 %	20 %	20 %	253997769
36	NC_012969	GTGGA	2	10	68079	68088	20 %	20 %	60 %	0 %	253997774
37	NC_012969	GGAAT	2	10	71530	71539	40 %	20 %	40 %	0 %	253997778
38	NC_012969	CAGGA	2	10	72525	72534	40 %	0 %	40 %	20 %	253997779
39	NC_012969	TTCGC	2	10	73047	73056	0 %	40 %	20 %	40 %	253997779
40	NC_012969	TCGTG	2	10	76010	76019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012969	GAAGC	2	10	77185	77194	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012969	GGGAG	2	10	77505	77514	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012969	TACTT	2	10	79953	79962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012969	ATTGA	2	10	80273	80282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012969	GCCTT	2	10	80737	80746	0 %	40 %	20 %	40 %	253997781
46	NC_012969	AGCCG	2	10	82788	82797	20 %	0 %	40 %	40 %	253997783
47	NC_012969	AGTGA	2	10	83452	83461	40 %	20 %	40 %	0 %	253997783
48	NC_012969	ACGCG	2	10	90559	90568	20 %	0 %	40 %	40 %	253997789
49	NC_012969	TTTAA	2	10	91696	91705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012969	TCATG	2	10	93477	93486	20 %	40 %	20 %	20 %	253997791
51	NC_012969	CAGTG	2	10	94221	94230	20 %	20 %	40 %	20 %	253997791
52	NC_012969	TGACC	2	10	94986	94995	20 %	20 %	20 %	40 %	253997792
53	NC_012969	CATGC	2	10	97322	97331	20 %	20 %	20 %	40 %	253997793
54	NC_012969	ACGCA	2	10	98198	98207	40 %	0 %	20 %	40 %	253997794
55	NC_012969	CTTAT	2	10	100020	100029	20 %	60 %	0 %	20 %	253997795
56	NC_012969	TGTGG	2	10	104920	104929	0 %	40 %	60 %	0 %	253997800
57	NC_012969	GATGC	2	10	105954	105963	20 %	20 %	40 %	20 %	253997802
58	NC_012969	CTGGA	2	10	109499	109508	20 %	20 %	40 %	20 %	253997805
59	NC_012969	TGCGC	2	10	109876	109885	0 %	20 %	40 %	40 %	253997805
60	NC_012969	GTTTA	2	10	110889	110898	20 %	60 %	20 %	0 %	253997805
61	NC_012969	GTATG	2	10	111887	111896	20 %	40 %	40 %	0 %	253997806
62	NC_012969	TGTGG	2	10	112243	112252	0 %	40 %	60 %	0 %	253997806
63	NC_012969	GATCA	2	10	113438	113447	40 %	20 %	20 %	20 %	253997809
64	NC_012969	GGCCG	2	10	114144	114153	0 %	0 %	60 %	40 %	253997810
65	NC_012969	TGCTG	2	10	115308	115317	0 %	40 %	40 %	20 %	253997811
66	NC_012969	GCCAG	2	10	115542	115551	20 %	0 %	40 %	40 %	253997812
67	NC_012969	GCTGG	2	10	116239	116248	0 %	20 %	60 %	20 %	253997813
68	NC_012969	CGGTA	2	10	117821	117830	20 %	20 %	40 %	20 %	253997814
69	NC_012969	TAAAT	2	10	120370	120379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012969	GTTAA	2	10	120383	120392	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012969	CTTGT	2	10	124412	124421	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012969	CAGCG	2	10	124793	124802	20 %	0 %	40 %	40 %	253997822
73	NC_012969	CTGGC	2	10	126539	126548	0 %	20 %	40 %	40 %	253997823
74	NC_012969	CCCGA	2	10	127564	127573	20 %	0 %	20 %	60 %	253997824
75	NC_012969	CCGGC	2	10	128375	128384	0 %	0 %	40 %	60 %	253997824
76	NC_012969	TGGCT	2	10	128762	128771	0 %	40 %	40 %	20 %	253997824
77	NC_012969	GCCGC	2	10	128790	128799	0 %	0 %	40 %	60 %	253997824
78	NC_012969	CATTT	2	10	129101	129110	20 %	60 %	0 %	20 %	253997825
79	NC_012969	GCATC	2	10	129712	129721	20 %	20 %	20 %	40 %	253997825
80	NC_012969	CTGGC	2	10	131416	131425	0 %	20 %	40 %	40 %	253997826
81	NC_012969	TTGCC	2	10	131613	131622	0 %	40 %	20 %	40 %	253997826
82	NC_012969	TCAGC	2	10	133262	133271	20 %	20 %	20 %	40 %	253997828
83	NC_012969	AGCGC	2	10	135347	135356	20 %	0 %	40 %	40 %	253997829
84	NC_012969	TGCCA	2	10	137309	137318	20 %	20 %	20 %	40 %	253997830
85	NC_012969	GCAGC	2	10	137392	137401	20 %	0 %	40 %	40 %	253997830
86	NC_012969	CTGAT	2	10	139912	139921	20 %	40 %	20 %	20 %	253997831
87	NC_012969	CATGA	2	10	146778	146787	40 %	20 %	20 %	20 %	253997837
88	NC_012969	GGTCA	2	10	147894	147903	20 %	20 %	40 %	20 %	253997839
89	NC_012969	GTACA	2	10	148389	148398	40 %	20 %	20 %	20 %	253997839
90	NC_012969	ATTCA	2	10	151080	151089	40 %	40 %	0 %	20 %	253997842
91	NC_012969	TAAGT	2	10	151164	151173	40 %	40 %	20 %	0 %	253997842
92	NC_012969	AAGGG	2	10	152214	152223	40 %	0 %	60 %	0 %	253997842
93	NC_012969	TTTTG	2	10	152642	152651	0 %	80 %	20 %	0 %	253997843
94	NC_012969	TCCAG	2	10	153035	153044	20 %	20 %	20 %	40 %	253997843
95	NC_012969	GAATC	2	10	157545	157554	40 %	20 %	20 %	20 %	253997846
96	NC_012969	AAACC	2	10	160096	160105	60 %	0 %	0 %	40 %	253997848
97	NC_012969	TGGTG	2	10	161707	161716	0 %	40 %	60 %	0 %	253997849
98	NC_012969	CACGG	2	10	163843	163852	20 %	0 %	40 %	40 %	253997851
99	NC_012969	GGCGT	2	10	164695	164704	0 %	20 %	60 %	20 %	253997852
100	NC_012969	GTCTG	2	10	165484	165493	0 %	40 %	40 %	20 %	253997852
101	NC_012969	GCGCT	2	10	165652	165661	0 %	20 %	40 %	40 %	253997852
102	NC_012969	CAGCC	2	10	167366	167375	20 %	0 %	20 %	60 %	253997854
103	NC_012969	CCCAG	2	10	167702	167711	20 %	0 %	20 %	60 %	253997854
104	NC_012969	GCCAG	2	10	167765	167774	20 %	0 %	40 %	40 %	253997854
105	NC_012969	CGCGC	2	10	170908	170917	0 %	0 %	40 %	60 %	253997858
106	NC_012969	TGGCC	2	10	172666	172675	0 %	20 %	40 %	40 %	253997861
107	NC_012969	TGCCC	2	10	173014	173023	0 %	20 %	20 %	60 %	253997862
108	NC_012969	ACGCC	2	10	174605	174614	20 %	0 %	20 %	60 %	253997863
109	NC_012969	GCCTG	2	10	178798	178807	0 %	20 %	40 %	40 %	253997864
110	NC_012969	GCCCG	2	10	179129	179138	0 %	0 %	40 %	60 %	253997865
111	NC_012969	AAATG	2	10	180254	180263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012969	GGCCG	2	10	181788	181797	0 %	0 %	60 %	40 %	253997867
113	NC_012969	TGAAT	2	10	182133	182142	40 %	40 %	20 %	0 %	253997867
114	NC_012969	CTGTG	2	10	184630	184639	0 %	40 %	40 %	20 %	253997869
115	NC_012969	AGCCT	2	10	189487	189496	20 %	20 %	20 %	40 %	253997876
116	NC_012969	GGCCA	2	10	189820	189829	20 %	0 %	40 %	40 %	253997876
117	NC_012969	GCGGT	2	10	192871	192880	0 %	20 %	60 %	20 %	253997879
118	NC_012969	CAAGC	2	10	193738	193747	40 %	0 %	20 %	40 %	253997879
119	NC_012969	ACCTG	2	10	193826	193835	20 %	20 %	20 %	40 %	253997879
120	NC_012969	GATCA	2	10	194765	194774	40 %	20 %	20 %	20 %	253997880
121	NC_012969	ATTTG	2	10	196264	196273	20 %	60 %	20 %	0 %	253997880
122	NC_012969	CGCGC	2	10	196979	196988	0 %	0 %	40 %	60 %	253997882
123	NC_012969	GAGTG	2	10	199067	199076	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012969	GAGGC	2	10	199286	199295	20 %	0 %	60 %	20 %	253997883
125	NC_012969	GCACG	2	10	200603	200612	20 %	0 %	40 %	40 %	253997885
126	NC_012969	CGGCG	2	10	200726	200735	0 %	0 %	60 %	40 %	253997885
127	NC_012969	GCATG	2	10	200972	200981	20 %	20 %	40 %	20 %	253997885
128	NC_012969	ATCTC	2	10	205147	205156	20 %	40 %	0 %	40 %	253997889
129	NC_012969	CGCCT	2	10	205494	205503	0 %	20 %	20 %	60 %	253997890
130	NC_012969	ATGCC	2	10	205634	205643	20 %	20 %	20 %	40 %	253997890
131	NC_012969	CAAGA	2	10	206386	206395	60 %	0 %	20 %	20 %	253997890
132	NC_012969	CGCAG	2	10	213355	213364	20 %	0 %	40 %	40 %	253997898
133	NC_012969	GCGCT	2	10	213878	213887	0 %	20 %	40 %	40 %	253997899
134	NC_012969	TCCGC	2	10	214009	214018	0 %	20 %	20 %	60 %	253997899
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241	NC_012969	GCAAT	2	10	391346	391355	40 %	20 %	20 %	20 %	253998093
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249	NC_012969	GCCAT	2	10	395920	395929	20 %	20 %	20 %	40 %	253998098
250	NC_012969	GCATG	2	10	399532	399541	20 %	20 %	40 %	20 %	253998100
251	NC_012969	GGCCT	2	10	402915	402924	0 %	20 %	40 %	40 %	253998105
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254	NC_012969	GCGAC	2	10	408685	408694	20 %	0 %	40 %	40 %	253998109
255	NC_012969	GCCAT	2	10	410121	410130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
256	NC_012969	GCGCA	2	10	410771	410780	20 %	0 %	40 %	40 %	253998111
257	NC_012969	GCCAG	2	10	410868	410877	20 %	0 %	40 %	40 %	253998111
258	NC_012969	ACAGG	2	10	411598	411607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_012969	ATTCA	2	10	413452	413461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_012969	GCTTG	2	10	414225	414234	0 %	40 %	40 %	20 %	253998114
261	NC_012969	GCCTG	2	10	415304	415313	0 %	20 %	40 %	40 %	253998115
262	NC_012969	TCGGG	2	10	415576	415585	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
263	NC_012969	TGGCG	2	10	416206	416215	0 %	20 %	60 %	20 %	253998116
264	NC_012969	GCCAC	2	10	417316	417325	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
265	NC_012969	CAATC	2	10	417730	417739	40 %	20 %	0 %	40 %	253998117
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268	NC_012969	GGGCC	2	10	418587	418596	0 %	0 %	60 %	40 %	253998118
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