MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 chromosome

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012969	GCATG	2	10	14027	14036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012969	TCGTG	2	10	76010	76019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012969	GAAGC	2	10	77185	77194	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012969	GGGAG	2	10	77505	77514	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012969	TACTT	2	10	79953	79962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012969	ATTGA	2	10	80273	80282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012969	TTTAA	2	10	91696	91705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012969	TAAAT	2	10	120370	120379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012969	GTTAA	2	10	120383	120392	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012969	CTTGT	2	10	124412	124421	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012969	AAATG	2	10	180254	180263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012969	GAGTG	2	10	199067	199076	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012969	CGTGG	2	10	221310	221319	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012969	AATTT	2	10	280412	280421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012969	TCTGA	2	10	304860	304869	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012969	TTCTG	2	10	374123	374132	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012969	GCATG	2	10	390832	390841	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012969	CTTGC	2	10	394013	394022	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_012969	GCCAT	2	10	410121	410130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012969	ACAGG	2	10	411598	411607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012969	ATTCA	2	10	413452	413461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012969	TCGGG	2	10	415576	415585	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012969	GCCAC	2	10	417316	417325	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_012969	TTCGC	2	10	418249	418258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012969	GGCAA	2	10	465422	465431	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012969	GCCAC	2	10	494991	495000	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_012969	GAAAA	2	10	499665	499674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012969	GAAAG	2	10	508086	508095	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012969	TTTGT	2	10	538489	538498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012969	ATTGG	2	10	538570	538579	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012969	AAGAA	2	10	551220	551229	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012969	ATAAA	2	10	554448	554457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012969	CCCGT	2	10	560757	560766	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_012969	AATGC	2	10	583721	583730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012969	TTTTA	2	10	627560	627569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012969	CCCTG	2	10	656983	656992	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_012969	TCGTG	2	10	667330	667339	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012969	GAAGC	2	10	668505	668514	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012969	GGGAG	2	10	668825	668834	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012969	TACTT	2	10	671273	671282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012969	GGGGC	2	10	673898	673907	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012969	CCATG	2	10	764337	764346	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012969	TGGCC	2	10	817069	817078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012969	GGCAA	2	10	828142	828151	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012969	CCTGT	2	10	853030	853039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012969	GAAAA	2	10	853189	853198	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012969	CCTGA	2	10	857368	857377	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012969	TTCTA	2	10	865812	865821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012969	ACATA	2	10	874476	874485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012969	GCATT	2	10	888909	888918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012969	TTTCG	2	10	921235	921244	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012969	TTAAA	2	10	936706	936715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012969	CGTGA	2	10	939091	939100	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012969	GCCAG	2	10	990531	990540	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_012969	ACGCG	2	10	990549	990558	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_012969	CGGCA	2	10	1010422	1010431	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012969	AAACC	2	10	1023478	1023487	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_012969	AAAAT	2	10	1051690	1051699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012969	TATGC	2	10	1053264	1053273	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012969	TAGCA	2	10	1053728	1053737	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012969	TCGCT	2	10	1073799	1073808	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_012969	AAGGT	2	10	1097676	1097685	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012969	GACTA	2	10	1098811	1098820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012969	CTTTA	2	10	1101079	1101088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012969	CAGGT	2	10	1103515	1103524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012969	TGGCC	2	10	1103536	1103545	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_012969	GTAGG	2	10	1118676	1118685	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012969	TTAAA	2	10	1152397	1152406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012969	TAGCG	2	10	1239822	1239831	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012969	TAAAA	2	10	1246710	1246719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012969	CTACT	2	10	1268279	1268288	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_012969	ATGTA	2	10	1281556	1281565	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012969	GCTAC	2	10	1282074	1282083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_012969	ACCTG	2	10	1292506	1292515	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_012969	AAGTC	2	10	1349281	1349290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012969	TGCCA	2	10	1349310	1349319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_012969	GTTGT	2	10	1370995	1371004	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012969	GCATG	2	10	1382704	1382713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012969	CATGC	2	10	1427014	1427023	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_012969	CAAAA	2	10	1427150	1427159	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012969	TGGAT	2	10	1428549	1428558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012969	AATGA	2	10	1439795	1439804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012969	TGGAA	2	10	1445858	1445867	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012969	CAAAA	2	10	1447897	1447906	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012969	AAAAG	2	10	1449514	1449523	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012969	AAAAG	2	10	1449665	1449674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012969	CCCCT	2	10	1451936	1451945	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_012969	AAAAG	2	10	1454236	1454245	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012969	CTTTT	2	10	1458071	1458080	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012969	AAGAC	2	10	1460055	1460064	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012969	CACCG	2	10	1461251	1461260	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_012969	CTTCT	2	10	1467768	1467777	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_012969	AAGGA	2	10	1478804	1478813	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012969	ATGCA	2	10	1481952	1481961	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012969	AAACA	2	10	1489739	1489748	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012969	TGAAG	2	10	1526225	1526234	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012969	GAAGG	2	10	1526253	1526262	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012969	GCTGG	2	10	1532927	1532936	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012969	ACAGG	2	10	1581828	1581837	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012969	AATCA	2	10	1585984	1585993	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012969	ATGTC	2	10	1589378	1589387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012969	CAAAC	2	10	1608753	1608762	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_012969	ATAAA	2	10	1625346	1625355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012969	TCACA	2	10	1662125	1662134	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_012969	CACAC	2	10	1674809	1674818	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_012969	AACCA	2	10	1684305	1684314	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012969	TTCTA	2	10	1700876	1700885	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012969	AATCA	2	10	1705490	1705499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012969	CTCTG	2	10	1707441	1707450	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_012969	TACAG	2	10	1714586	1714595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012969	AAAAG	2	10	1740265	1740274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012969	GTCAC	2	10	1756785	1756794	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_012969	CCGGG	2	10	1760078	1760087	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_012969	GGGCT	2	10	1772196	1772205	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012969	GTAGC	2	10	1841240	1841249	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012969	CTTTT	2	10	1844362	1844371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012969	GACTT	2	10	1859836	1859845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012969	CGTTG	2	10	1867026	1867035	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012969	GGGAA	2	10	1868573	1868582	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012969	TCTAG	2	10	1873972	1873981	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012969	GATGT	2	10	1912081	1912090	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012969	TTTAA	2	10	1912595	1912604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012969	GCCCG	2	10	1916882	1916891	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_012969	TAATG	2	10	1930527	1930536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012969	ATCCT	2	10	1933872	1933881	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_012969	CAGCC	2	10	1953892	1953901	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_012969	GGCCA	2	10	1983986	1983995	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_012969	CAAAA	2	10	1995879	1995888	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012969	AGATA	2	10	1999877	1999886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012969	ATTGA	2	10	2025380	2025389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012969	AAATG	2	10	2036589	2036598	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012969	ATAAA	2	10	2052047	2052056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012969	TGGCA	2	10	2054216	2054225	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012969	TCACG	2	10	2059521	2059530	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_012969	ATAAA	2	10	2084487	2084496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012969	GCACC	2	10	2084548	2084557	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_012969	GCCCT	2	10	2088704	2088713	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_012969	CTGGC	2	10	2103635	2103644	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_012969	TGGCT	2	10	2120474	2120483	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_012969	ATACT	2	10	2122561	2122570	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012969	CAACC	2	10	2128080	2128089	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_012969	AAATT	2	10	2144474	2144483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012969	AAAAT	2	10	2157061	2157070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012969	AAAAG	2	10	2175336	2175345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012969	AAAAG	2	10	2176259	2176268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012969	TTTAA	2	10	2187827	2187836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012969	TGAAT	2	10	2197274	2197283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012969	AGTAA	2	10	2204091	2204100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012969	CAGAC	2	10	2207336	2207345	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_012969	TTGCC	2	10	2233612	2233621	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_012969	CATCA	2	10	2233652	2233661	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_012969	GGGAT	2	10	2234122	2234131	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012969	GCCTT	2	10	2235815	2235824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_012969	TGGGC	2	10	2243078	2243087	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
155	NC_012969	CGGCC	2	10	2249676	2249685	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_012969	TAAAG	2	10	2266364	2266373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012969	CCCGC	2	10	2266535	2266544	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
158	NC_012969	TGACC	2	10	2270527	2270536	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_012969	ACCTG	2	10	2282873	2282882	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_012969	TTCAG	2	10	2294178	2294187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_012969	CCCCG	2	10	2325411	2325420	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
162	NC_012969	CAGGC	2	10	2356145	2356154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_012969	TAGCC	2	10	2389484	2389493	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_012969	CAGGC	2	10	2421931	2421940	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
165	NC_012969	CTTTC	2	10	2426526	2426535	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_012969	TTTTA	2	10	2472445	2472454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012969	TTTCG	2	10	2480304	2480313	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_012969	AAAAT	2	10	2486651	2486660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012969	GTCAT	2	10	2487903	2487912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_012969	TAGTC	2	10	2487965	2487974	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_012969	CACGC	2	10	2505186	2505195	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
172	NC_012969	TGATT	2	10	2506407	2506416	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012969	GCTCC	2	10	2506764	2506773	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
174	NC_012969	CCATT	2	10	2512672	2512681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
175	NC_012969	ACCGC	2	10	2515321	2515330	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
176	NC_012969	CGAAT	2	10	2531780	2531789	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_012969	ATAAA	2	10	2538085	2538094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_012969	GATGA	2	10	2542221	2542230	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012969	CTTAA	2	10	2550447	2550456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
180	NC_012969	CATCA	2	10	2563304	2563313	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
181	NC_012969	ACCTT	2	10	2563327	2563336	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
182	NC_012969	CCGCA	2	10	2571681	2571690	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
183	NC_012969	GAAAT	2	10	2577593	2577602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012969	CGCTG	2	10	2577606	2577615	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_012969	GGCCG	2	10	2607195	2607204	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
186	NC_012969	TTGGG	2	10	2618945	2618954	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012969	CTGGC	2	10	2627304	2627313	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_012969	AAACG	2	10	2629850	2629859	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
189	NC_012969	TTCAA	2	10	2631419	2631428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_012969	AGCTG	2	10	2649675	2649684	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
191	NC_012969	AAATG	2	10	2677044	2677053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012969	AAAGC	2	10	2712108	2712117	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
193	NC_012969	CTGCA	2	10	2712637	2712646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_012969	CATGG	2	10	2712822	2712831	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
195	NC_012969	GTCTG	2	10	2753273	2753282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
196	NC_012969	ATTAA	2	10	2770187	2770196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_012969	AGGCC	2	10	2773196	2773205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_012969	GTTTT	2	10	2792854	2792863	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
199	NC_012969	GATGG	2	10	2796676	2796685	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
200	NC_012969	TTCCC	2	10	2799124	2799133	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
201	NC_012969	AAACG	2	10	2827052	2827061	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
202	NC_012969	CACAA	2	10	2835910	2835919	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
203	NC_012969	CAACC	2	10	2836341	2836350	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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206	NC_012969	GCCAC	2	10	2874828	2874837	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
207	NC_012969	ATGAG	2	10	2903425	2903434	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
208	NC_012969	CATCA	2	10	2925178	2925187	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
209	NC_012969	TAGCG	2	10	2956849	2956858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
210	NC_012969	AGATG	2	10	2960183	2960192	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.