MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylotenera mobilis JLW8 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012968	GTATTT	2	12	34076	34087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012968	CTGTTG	2	12	108800	108811	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012968	TACATA	2	12	116989	117000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012968	GGTTTG	2	12	210292	210303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012968	CCTGTA	2	12	218178	218189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012968	TGGTTG	2	12	315674	315685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012968	TAAATT	2	12	336649	336660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012968	TGTAGA	2	12	389883	389894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012968	ACATTA	2	12	449619	449630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012968	TTTAGC	2	12	461023	461034	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012968	TTGATG	2	12	461043	461054	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012968	AGTAAC	2	12	465657	465668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012968	ACAGTG	2	12	480324	480335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012968	AGTATG	2	12	595511	595522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012968	AATAAA	2	12	612535	612546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012968	TTATTT	2	12	651231	651242	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012968	GTAAAT	2	12	651399	651410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012968	CCTGTA	2	12	694801	694812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012968	TCCTTT	2	12	704879	704890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012968	TTCAAA	2	12	706847	706858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012968	GGATTG	2	12	742032	742043	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012968	TTTTTA	2	12	796412	796423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012968	TATTTT	2	12	805464	805475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012968	GTTTTA	2	12	827267	827278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012968	GTTTTT	2	12	827554	827565	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012968	TAGAAA	2	12	853371	853382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012968	ACAGTG	2	12	855572	855583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012968	CTATAT	2	12	859014	859025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012968	AATTTA	2	12	863767	863778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012968	CTTTAT	2	12	885791	885802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012968	ATGTGC	2	12	929065	929076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012968	GCTAAC	2	12	1032690	1032701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012968	TTTATT	2	12	1049712	1049723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012968	TGCTTT	2	12	1139586	1139597	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012968	TAGCGC	2	12	1229215	1229226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012968	TCAAAA	2	12	1264173	1264184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012968	TGCGTA	2	12	1266198	1266209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012968	CTAAAG	2	12	1462304	1462315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012968	GGCAAT	2	12	1471666	1471677	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012968	AAGGTC	2	12	1501166	1501177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012968	AAAAAT	2	12	1503468	1503479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012968	CCACTT	2	12	1510982	1510993	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012968	TAAATA	2	12	1516060	1516071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012968	ATGAAA	2	12	1614501	1614512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012968	AATGCT	2	12	1635808	1635819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012968	AAATAT	2	12	1703820	1703831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012968	TAAAAA	2	12	1795232	1795243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012968	AGACTA	2	12	1859107	1859118	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012968	GCTTAA	2	12	1924777	1924788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012968	GCCTAG	2	12	1927321	1927332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012968	TATATT	2	12	2003653	2003664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012968	GAATAC	2	12	2003726	2003737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012968	AAAATA	2	12	2008794	2008805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012968	TAAAAA	2	12	2013895	2013906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012968	CGTTAA	2	12	2032874	2032885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012968	AATATA	2	12	2033781	2033792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012968	AGATAA	2	12	2081174	2081185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012968	GCTAAC	2	12	2086722	2086733	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012968	CAATAT	2	12	2091106	2091117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012968	GCTACG	2	12	2136400	2136411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012968	TAAATA	2	12	2152508	2152519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012968	ACGGCA	2	12	2161483	2161494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012968	CAAACG	2	12	2162055	2162066	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012968	AACGTT	2	12	2163777	2163788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012968	AATTGA	2	12	2195186	2195197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012968	ATATAA	2	12	2207475	2207486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012968	ATATTG	2	12	2276760	2276771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012968	CTACGC	2	12	2321147	2321158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012968	CTAGAC	2	12	2438069	2438080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012968	CTAATT	2	12	2496667	2496678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012968	GTACAA	2	12	2513484	2513495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012968	CTGTTC	2	12	2514429	2514440	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012968	CCATTG	2	12	2514787	2514798	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012968	ACAATC	2	12	2542170	2542181	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.