MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012960	GTTTG	2	10	13709	13718	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012960	TATGC	2	10	14055	14064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012960	AGTCT	2	10	25509	25518	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012960	CTTTT	2	10	29105	29114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012960	CAAAA	2	10	35755	35764	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012960	GTTTC	2	10	41626	41635	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012960	AAGCT	2	10	70794	70803	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012960	GCTTG	2	10	72528	72537	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012960	TCTCT	2	10	78889	78898	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012960	AGCTG	2	10	81050	81059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012960	TGGCT	2	10	92772	92781	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012960	TGCTT	2	10	92968	92977	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012960	AAATA	2	10	93001	93010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012960	TCGTG	2	10	94422	94431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012960	TGGGC	2	10	94565	94574	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012960	GAGGG	2	10	94946	94955	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012960	AGGAA	2	10	95379	95388	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012960	CTTCT	2	10	98387	98396	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_012960	CCTTT	2	10	98800	98809	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012960	TTTGG	2	10	105274	105283	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012960	TATTT	2	10	116055	116064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012960	CGCGC	2	10	118681	118690	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.