MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 1793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012960	ACA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795548
2	NC_012960	GCG	2	6	182	187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
3	NC_012960	TGA	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795548
4	NC_012960	GCG	2	6	236	241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
5	NC_012960	GCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
6	NC_012960	GGC	2	6	259	264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
7	NC_012960	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795548
8	NC_012960	GTG	2	6	466	471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795548
9	NC_012960	GCG	3	9	491	499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
10	NC_012960	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
11	NC_012960	CGT	2	6	635	640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
12	NC_012960	TGC	2	6	656	661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
13	NC_012960	TGG	2	6	746	751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795548
14	NC_012960	TGC	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
15	NC_012960	GTC	2	6	1004	1009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
16	NC_012960	GGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795548
17	NC_012960	TTG	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795548
18	NC_012960	GCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795548
19	NC_012960	GCG	2	6	1503	1508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795549
20	NC_012960	GTG	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795549
21	NC_012960	GCT	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795549
22	NC_012960	ATG	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795549
23	NC_012960	TGG	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795549
24	NC_012960	GGC	2	6	1664	1669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795549
25	NC_012960	GCT	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795549
26	NC_012960	CAG	2	6	1842	1847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795549
27	NC_012960	CTG	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795549
28	NC_012960	TGC	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
29	NC_012960	TAG	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
30	NC_012960	ATG	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
31	NC_012960	CGC	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795550
32	NC_012960	AGC	2	6	2245	2250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
33	NC_012960	GGT	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795550
34	NC_012960	CGT	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
35	NC_012960	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
36	NC_012960	GTA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
37	NC_012960	CGG	2	6	2693	2698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
38	NC_012960	GCT	2	6	2740	2745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
39	NC_012960	TGC	2	6	2746	2751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
40	NC_012960	TGT	2	6	2801	2806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795550
41	NC_012960	ACG	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
42	NC_012960	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795550
43	NC_012960	GCG	2	6	3004	3009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
44	NC_012960	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253795550
45	NC_012960	TGC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
46	NC_012960	GCT	2	6	3379	3384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
47	NC_012960	AAG	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795550
48	NC_012960	GGC	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
49	NC_012960	TGA	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
50	NC_012960	GCT	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
51	NC_012960	GAC	3	9	3954	3962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
52	NC_012960	GAC	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
53	NC_012960	TGC	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
54	NC_012960	TGC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
55	NC_012960	TTG	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795550
56	NC_012960	GCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
57	NC_012960	GGC	3	9	4522	4530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
58	NC_012960	TGC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
59	NC_012960	ACG	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
60	NC_012960	CGA	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
61	NC_012960	CTA	2	6	4622	4627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795550
62	NC_012960	CGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795550
63	NC_012960	CAG	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
64	NC_012960	TGA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
65	NC_012960	GCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
66	NC_012960	GTG	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795551
67	NC_012960	TGC	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795551
68	NC_012960	GCG	2	6	5240	5245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795551
69	NC_012960	GCT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795551
70	NC_012960	TGG	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795551
71	NC_012960	GCT	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795551
72	NC_012960	GTT	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795551
73	NC_012960	CAC	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795551
74	NC_012960	CGG	2	6	5567	5572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795552
75	NC_012960	CGG	2	6	5574	5579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795552
76	NC_012960	TGG	2	6	5601	5606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795552
77	NC_012960	GCT	2	6	5650	5655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795552
78	NC_012960	TGC	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795552
79	NC_012960	CTT	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253795552
80	NC_012960	GGC	2	6	5788	5793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795552
81	NC_012960	TAG	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795552
82	NC_012960	GCC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795552
83	NC_012960	TGG	2	6	5913	5918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795552
84	NC_012960	GTG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795552
85	NC_012960	CGT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795552
86	NC_012960	CTG	3	9	6092	6100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795552
87	NC_012960	TGG	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795552
88	NC_012960	GGT	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795552
89	NC_012960	GCT	2	6	6262	6267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795552
90	NC_012960	AGC	2	6	6268	6273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795552
91	NC_012960	GCT	2	6	6450	6455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795553
92	NC_012960	GTG	2	6	6532	6537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795553
93	NC_012960	GCT	3	9	6624	6632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795553
94	NC_012960	GTG	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795553
95	NC_012960	TGC	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795553
96	NC_012960	CGT	2	6	6732	6737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795553
97	NC_012960	TGT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795553
98	NC_012960	GCT	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795553
99	NC_012960	CGT	2	6	6874	6879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795553
100	NC_012960	GCC	2	6	6980	6985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795554
101	NC_012960	GCC	2	6	7070	7075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795554
102	NC_012960	GCT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795554
103	NC_012960	CGT	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795554
104	NC_012960	GCT	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795554
105	NC_012960	TGG	2	6	7453	7458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795554
106	NC_012960	TGC	2	6	7547	7552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795554
107	NC_012960	CAG	2	6	7846	7851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795554
108	NC_012960	TGC	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795554
109	NC_012960	GCT	2	6	7925	7930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795555
110	NC_012960	AGC	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795555
111	NC_012960	CGC	2	6	8088	8093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795555
112	NC_012960	CTA	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795555
113	NC_012960	CTG	2	6	8130	8135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795555
114	NC_012960	TGC	2	6	8217	8222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795555
115	NC_012960	GCG	2	6	8306	8311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795555
116	NC_012960	CTG	2	6	8350	8355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795555
117	NC_012960	GAC	2	6	8407	8412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795555
118	NC_012960	GGC	2	6	8664	8669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795556
119	NC_012960	GCT	2	6	9046	9051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795556
120	NC_012960	GTC	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795556
121	NC_012960	GCA	2	6	9203	9208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795556
122	NC_012960	GCT	2	6	9209	9214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795556
123	NC_012960	CGC	2	6	9226	9231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795556
124	NC_012960	CGT	2	6	9255	9260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795556
125	NC_012960	GCC	2	6	9279	9284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795556
126	NC_012960	GTT	3	9	9290	9298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795556
127	NC_012960	GAC	2	6	9449	9454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795556
128	NC_012960	GGC	2	6	9533	9538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795556
129	NC_012960	TGG	2	6	9554	9559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795557
130	NC_012960	GCT	2	6	9606	9611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795557
131	NC_012960	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795557
132	NC_012960	GCT	2	6	9668	9673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795557
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252	NC_012960	GCG	2	6	21098	21103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795570
253	NC_012960	TCA	2	6	21328	21333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795570
254	NC_012960	CTA	2	6	21405	21410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795570
255	NC_012960	CGC	2	6	21417	21422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795570
256	NC_012960	GTT	2	6	21442	21447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795571
257	NC_012960	TGC	2	6	21569	21574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795571
258	NC_012960	GGC	2	6	21592	21597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795571
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265	NC_012960	TGG	2	6	22293	22298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795572
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281	NC_012960	CGG	2	6	23402	23407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795573
282	NC_012960	GCG	2	6	23443	23448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795573
283	NC_012960	GTA	2	6	23535	23540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795573
284	NC_012960	CGA	2	6	23570	23575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795573
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375	NC_012960	CGC	2	6	30402	30407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795585
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497	NC_012960	ACG	2	6	40578	40583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795595
498	NC_012960	GTG	2	6	40739	40744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795595
499	NC_012960	GAC	2	6	40745	40750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795595
500	NC_012960	GCT	2	6	40793	40798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795595

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