MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012960	TC	3	6	11012	11017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012960	TC	4	8	11019	11026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012960	TC	4	8	11037	11044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012960	TC	4	8	11046	11053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012960	TC	3	6	11055	11060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012960	CT	3	6	11079	11084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012960	CT	19	38	11243	11280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012960	GC	3	6	11313	11318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012960	GC	3	6	11371	11376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012960	GC	3	6	13002	13007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012960	TG	3	6	13012	13017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012960	GC	3	6	13056	13061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012960	CG	3	6	13190	13195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012960	CG	3	6	13268	13273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012960	CG	3	6	13719	13724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012960	TG	3	6	25470	25475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012960	CG	3	6	29197	29202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012960	GC	3	6	35432	35437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012960	TG	3	6	35444	35449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012960	GC	4	8	35535	35542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012960	GC	4	8	35608	35615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012960	GC	3	6	35686	35691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012960	TG	3	6	35781	35786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012960	TG	3	6	35842	35847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012960	GC	3	6	36770	36775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012960	GC	3	6	39278	39283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012960	GC	3	6	41969	41974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012960	GC	3	6	41995	42000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012960	GC	5	10	42053	42062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012960	CG	3	6	46486	46491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012960	TG	3	6	46500	46505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012960	GC	3	6	60318	60323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012960	GC	3	6	63538	63543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012960	GC	3	6	72630	72635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012960	CG	3	6	74642	74647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012960	GC	3	6	74742	74747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012960	GC	4	8	82345	82352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012960	GC	3	6	82379	82384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012960	GC	3	6	82427	82432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012960	GC	5	10	82482	82491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012960	GC	3	6	82937	82942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012960	CG	3	6	94152	94157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012960	CT	3	6	94496	94501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012960	AC	3	6	94576	94581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012960	AG	3	6	94601	94606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012960	AC	3	6	94744	94749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012960	GC	3	6	94956	94961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012960	CG	3	6	95002	95007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012960	GC	4	8	95018	95025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012960	GC	3	6	95027	95032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012960	GC	3	6	95441	95446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012960	GT	3	6	95779	95784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012960	GC	3	6	96393	96398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012960	CG	3	6	98165	98170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012960	CT	3	6	98309	98314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012960	CT	3	6	98325	98330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012960	TC	3	6	98398	98403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012960	CT	3	6	98417	98422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012960	TC	3	6	115755	115760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012960	CT	3	6	115768	115773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012960	TC	3	6	115777	115782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012960	TC	3	6	115787	115792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012960	TC	3	6	115811	115816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012960	TC	3	6	115824	115829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012960	TC	3	6	115832	115837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012960	TC	3	6	115855	115860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012960	TC	3	6	115871	115876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012960	TC	9	18	115878	115895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012960	GC	3	6	115950	115955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012960	GC	3	6	123304	123309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012960	GC	4	8	123311	123318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012960	GC	3	6	123433	123438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012960	TC	3	6	123579	123584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012960	GC	3	6	140733	140738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012960	GC	4	8	142935	142942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012960	GC	3	6	142987	142992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.