MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012960	A	6	6	2116	2121	100 %	0 %	0 %	0 %	253795550
2	NC_012960	T	7	7	3282	3288	0 %	100 %	0 %	0 %	253795550
3	NC_012960	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	253795550
4	NC_012960	T	6	6	5546	5551	0 %	100 %	0 %	0 %	253795552
5	NC_012960	G	6	6	5990	5995	0 %	0 %	100 %	0 %	253795552
6	NC_012960	T	6	6	8080	8085	0 %	100 %	0 %	0 %	253795555
7	NC_012960	T	7	7	10279	10285	0 %	100 %	0 %	0 %	253795558
8	NC_012960	C	6	6	10295	10300	0 %	0 %	0 %	100 %	253795558
9	NC_012960	A	7	7	10348	10354	100 %	0 %	0 %	0 %	253795558
10	NC_012960	T	7	7	10374	10380	0 %	100 %	0 %	0 %	253795558
11	NC_012960	T	8	8	10493	10500	0 %	100 %	0 %	0 %	253795558
12	NC_012960	C	8	8	10544	10551	0 %	0 %	0 %	100 %	253795558
13	NC_012960	T	10	10	10560	10569	0 %	100 %	0 %	0 %	253795558
14	NC_012960	T	6	6	10791	10796	0 %	100 %	0 %	0 %	253795558
15	NC_012960	C	7	7	10810	10816	0 %	0 %	0 %	100 %	253795558
16	NC_012960	C	6	6	10871	10876	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_012960	T	6	6	10957	10962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012960	C	6	6	10963	10968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_012960	T	8	8	11070	11077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012960	C	6	6	11085	11090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_012960	T	7	7	11110	11116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012960	T	6	6	11180	11185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012960	T	8	8	11192	11199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012960	T	7	7	11212	11218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012960	T	8	8	11235	11242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012960	C	6	6	11281	11286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_012960	T	6	6	11295	11300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012960	A	6	6	11301	11306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012960	T	6	6	11586	11591	0 %	100 %	0 %	0 %	253795559
30	NC_012960	T	6	6	15280	15285	0 %	100 %	0 %	0 %	253795562
31	NC_012960	T	7	7	15408	15414	0 %	100 %	0 %	0 %	253795562
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33	NC_012960	G	7	7	15686	15692	0 %	0 %	100 %	0 %	253795563
34	NC_012960	T	7	7	19552	19558	0 %	100 %	0 %	0 %	253795566
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36	NC_012960	G	6	6	20243	20248	0 %	0 %	100 %	0 %	253795568
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41	NC_012960	A	6	6	32619	32624	100 %	0 %	0 %	0 %	253795587
42	NC_012960	T	7	7	33056	33062	0 %	100 %	0 %	0 %	253795587
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47	NC_012960	T	7	7	41809	41815	0 %	100 %	0 %	0 %	253795596
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50	NC_012960	T	7	7	41894	41900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.