MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 2181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012943	TGCCAC	2	12	4051486	4051497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253800665
2002	NC_012943	GACGGC	2	12	4056158	4056169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253800669
2003	NC_012943	GGCCGC	2	12	4060255	4060266	0 %	0 %	50 %	50 %	253800673
2004	NC_012943	CCGGGT	2	12	4062127	4062138	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800675
2005	NC_012943	TTCGAC	2	12	4062592	4062603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	253800676
2006	NC_012943	GTGCGG	2	12	4066006	4066017	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	253800680
2007	NC_012943	GGCCTC	2	12	4068659	4068670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800684
2008	NC_012943	CGTCGC	2	12	4068853	4068864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800684
2009	NC_012943	GCCACC	2	12	4070061	4070072	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800685
2010	NC_012943	GCGGCC	2	12	4071735	4071746	0 %	0 %	50 %	50 %	253800686
2011	NC_012943	GGCCCG	2	12	4074824	4074835	0 %	0 %	50 %	50 %	253800687
2012	NC_012943	CACCGG	2	12	4077234	4077245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800689
2013	NC_012943	CAGCAC	3	18	4081968	4081985	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800696
2014	NC_012943	GGCAAC	2	12	4083271	4083282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800699
2015	NC_012943	GATCGA	2	12	4085416	4085427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253800701
2016	NC_012943	TGACCA	2	12	4086586	4086597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253800702
2017	NC_012943	CGGTGC	2	12	4088653	4088664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800703
2018	NC_012943	CAGCGC	2	12	4089050	4089061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800704
2019	NC_012943	CAGCAC	2	12	4091318	4091329	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800706
2020	NC_012943	TGGCGG	2	12	4091536	4091547	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	253800706
2021	NC_012943	GGTGAC	2	12	4092216	4092227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800707
2022	NC_012943	CCGGCG	2	12	4092415	4092426	0 %	0 %	50 %	50 %	253800707
2023	NC_012943	CAGCGT	2	12	4092620	4092631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800707
2024	NC_012943	AGACCG	2	12	4095750	4095761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800710
2025	NC_012943	AGGCCG	2	12	4102859	4102870	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253800718
2026	NC_012943	CGCGCT	2	12	4105607	4105618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800723
2027	NC_012943	GAGGCG	2	12	4109588	4109599	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	253800726
2028	NC_012943	TGGCCA	2	12	4109898	4109909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800726
2029	NC_012943	CATGGG	2	12	4110031	4110042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800726
2030	NC_012943	GCAACG	2	12	4110477	4110488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800726
2031	NC_012943	CTCCGC	2	12	4111101	4111112	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	253800726
2032	NC_012943	GGCGCG	2	12	4114880	4114891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253800729
2033	NC_012943	CGACCC	2	12	4115228	4115239	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800729
2034	NC_012943	CATCGA	2	12	4118633	4118644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253800734
2035	NC_012943	CTGCGG	2	12	4122783	4122794	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800737
2036	NC_012943	TGCTCG	2	12	4126499	4126510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253800740
2037	NC_012943	CGTCGA	2	12	4131457	4131468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800746
2038	NC_012943	GTCCGC	2	12	4133011	4133022	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800748
2039	NC_012943	CCGCGC	2	12	4133487	4133498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253800748
2040	NC_012943	CCGCGC	3	18	4133727	4133744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253800748
2041	NC_012943	GCGCCG	2	12	4137962	4137973	0 %	0 %	50 %	50 %	253800753
2042	NC_012943	AGGTGA	2	12	4139430	4139441	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	253800755
2043	NC_012943	CGTCGG	2	12	4139499	4139510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800755
2044	NC_012943	ATGGCC	2	12	4140116	4140127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800755
2045	NC_012943	CGACTT	2	12	4140985	4140996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	253800756
2046	NC_012943	GGATGC	2	12	4141801	4141812	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800756
2047	NC_012943	ACGGCG	2	12	4145215	4145226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253800759
2048	NC_012943	GACGTC	2	12	4147029	4147040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800761
2049	NC_012943	GCTGCG	2	12	4148226	4148237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800763
2050	NC_012943	CGGCTG	2	12	4151274	4151285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800766
2051	NC_012943	ACCGCC	2	12	4156129	4156140	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800769
2052	NC_012943	GCGGCT	2	12	4159124	4159135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800773
2053	NC_012943	CACCGG	2	12	4163169	4163180	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800775
2054	NC_012943	ACGAGC	2	12	4165978	4165989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800776
2055	NC_012943	GTCGGC	2	12	4166336	4166347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800776
2056	NC_012943	GGTACC	2	12	4166627	4166638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800776
2057	NC_012943	CGTCGA	2	12	4168632	4168643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800777
2058	NC_012943	CCGACG	2	12	4170603	4170614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800779
2059	NC_012943	TCGATG	2	12	4172592	4172603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253800781
2060	NC_012943	CCGACG	2	12	4176410	4176421	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800785
2061	NC_012943	GTCGGA	2	12	4180030	4180041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800789
2062	NC_012943	TGGCAA	2	12	4180445	4180456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253800790
2063	NC_012943	TGCCTT	2	12	4185409	4185420	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	253800797
2064	NC_012943	CGCTGG	2	12	4187791	4187802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800801
2065	NC_012943	CAACGC	2	12	4188960	4188971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800803
2066	NC_012943	GCCACC	2	12	4189444	4189455	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800803
2067	NC_012943	GACCGA	2	12	4190643	4190654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800805
2068	NC_012943	GCACCG	2	12	4191057	4191068	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800805
2069	NC_012943	GTGACG	2	12	4191880	4191891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800806
2070	NC_012943	GTGTCA	2	12	4191892	4191903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253800806
2071	NC_012943	AGGCCA	2	12	4192963	4192974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800808
2072	NC_012943	CACCGT	2	12	4194086	4194097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253800809
2073	NC_012943	TCGCCG	2	12	4194103	4194114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800809
2074	NC_012943	GGTGAA	2	12	4194185	4194196	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	253800809
2075	NC_012943	GAGCGG	2	12	4202473	4202484	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	253800817
2076	NC_012943	TCGCCC	2	12	4203191	4203202	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	253800819
2077	NC_012943	ACCGCC	2	12	4203381	4203392	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800820
2078	NC_012943	TCACCG	2	12	4203457	4203468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253800820
2079	NC_012943	CCGGAT	2	12	4203505	4203516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800820
2080	NC_012943	CACGGC	2	12	4214442	4214453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800828
2081	NC_012943	GGCGCT	2	12	4216692	4216703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800831
2082	NC_012943	CGCGGT	2	12	4218799	4218810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800833
2083	NC_012943	GAGGTC	2	12	4221822	4221833	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800836
2084	NC_012943	ACACCG	2	12	4226307	4226318	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800840
2085	NC_012943	CGCGGT	2	12	4228620	4228631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800841
2086	NC_012943	GGTGCT	2	12	4228815	4228826	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253800841
2087	NC_012943	TCGACA	2	12	4230744	4230755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253800842
2088	NC_012943	CCGGGC	2	12	4231223	4231234	0 %	0 %	50 %	50 %	253800842
2089	NC_012943	CGGTGT	2	12	4239460	4239471	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253800845
2090	NC_012943	GGGGCC	2	12	4240762	4240773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253800846
2091	NC_012943	GCGGGC	2	12	4242751	4242762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253800847
2092	NC_012943	TCGCCG	2	12	4244531	4244542	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800848
2093	NC_012943	TGCACC	2	12	4244632	4244643	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253800848
2094	NC_012943	CTCGGC	2	12	4245408	4245419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800848
2095	NC_012943	GCGAGC	2	12	4245611	4245622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253800848
2096	NC_012943	GCCTCG	2	12	4246783	4246794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800848
2097	NC_012943	GGTGCC	2	12	4246812	4246823	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800848
2098	NC_012943	CGTCGC	2	12	4246979	4246990	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800848
2099	NC_012943	CGTCGG	2	12	4247051	4247062	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800848
2100	NC_012943	CCACAC	2	12	4251722	4251733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253800851
2101	NC_012943	CGAAGC	2	12	4251916	4251927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800851
2102	NC_012943	TTGCCG	2	12	4252832	4252843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253800852
2103	NC_012943	CGACGG	2	12	4253425	4253436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253800852
2104	NC_012943	CGCCAG	2	12	4255910	4255921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800854
2105	NC_012943	CCAGCA	2	12	4256680	4256691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800854
2106	NC_012943	CCGACG	2	12	4260693	4260704	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800858
2107	NC_012943	CGCGGC	2	12	4261488	4261499	0 %	0 %	50 %	50 %	253800858
2108	NC_012943	CCGCGG	2	12	4263845	4263856	0 %	0 %	50 %	50 %	253800860
2109	NC_012943	CACCGC	2	12	4267426	4267437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800863
2110	NC_012943	CCAGCA	2	12	4267680	4267691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800863
2111	NC_012943	TTCGCC	2	12	4272686	4272697	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	253800868
2112	NC_012943	GCCATC	2	12	4274714	4274725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253800870
2113	NC_012943	CACGGC	2	12	4275316	4275327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800871
2114	NC_012943	ACGGTA	2	12	4275414	4275425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253800871
2115	NC_012943	ACCAGC	2	12	4277244	4277255	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800871
2116	NC_012943	CGGTCT	2	12	4280284	4280295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253800873
2117	NC_012943	GTCCTG	2	12	4282189	4282200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253800873
2118	NC_012943	TCTGGT	2	12	4288377	4288388	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	253800874
2119	NC_012943	ACCGCG	2	12	4288937	4288948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800875
2120	NC_012943	TTCGCG	2	12	4293108	4293119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253800879
2121	NC_012943	CATGGC	2	12	4293749	4293760	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800880
2122	NC_012943	ACCGAC	2	12	4294152	4294163	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800881
2123	NC_012943	TCGACG	2	12	4294813	4294824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800882
2124	NC_012943	ACGCTG	2	12	4296911	4296922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800883
2125	NC_012943	GCCACC	2	12	4297252	4297263	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800883
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2127	NC_012943	AATCCG	2	12	4300035	4300046	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253800887
2128	NC_012943	CTGGCG	2	12	4301397	4301408	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800889
2129	NC_012943	CAGCGA	2	12	4309538	4309549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800899
2130	NC_012943	CCCGCA	2	12	4311797	4311808	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800902
2131	NC_012943	GCTAAA	2	12	4312943	4312954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253800905
2132	NC_012943	GTCGCC	2	12	4313356	4313367	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800905
2133	NC_012943	GTCGGA	2	12	4314246	4314257	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800905
2134	NC_012943	ATGCAG	2	12	4316046	4316057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253800907
2135	NC_012943	TCAGCG	2	12	4316101	4316112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800907
2136	NC_012943	TGCCGC	2	12	4316221	4316232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800907
2137	NC_012943	ACGGTG	2	12	4317937	4317948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253800909
2138	NC_012943	CGCAGC	2	12	4318375	4318386	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800909
2139	NC_012943	CTCGGC	2	12	4322686	4322697	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800910
2140	NC_012943	GTCGGT	2	12	4329934	4329945	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253800917
2141	NC_012943	AGCCGA	2	12	4330198	4330209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253800917
2142	NC_012943	GACCGG	2	12	4331541	4331552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253800918
2143	NC_012943	ATCGGT	2	12	4333907	4333918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253800920
2144	NC_012943	ACACCG	2	12	4334736	4334747	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253800920
2145	NC_012943	GCGCGG	2	12	4338835	4338846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253800923
2146	NC_012943	AAGCAG	2	12	4339409	4339420	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	253800924
2147	NC_012943	CACCCC	2	12	4340158	4340169	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	253800926
2148	NC_012943	CCTCCG	2	12	4340172	4340183	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	253800926
2149	NC_012943	GTCGTG	2	12	4341621	4341632	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253800926
2150	NC_012943	GTCGCG	2	12	4342862	4342873	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800927
2151	NC_012943	CCGGCG	2	12	4344796	4344807	0 %	0 %	50 %	50 %	253800929
2152	NC_012943	CCAGCG	2	12	4347706	4347717	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800931
2153	NC_012943	CCACCG	2	12	4347781	4347792	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800931
2154	NC_012943	GGCGGG	2	12	4348006	4348017	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	253800931
2155	NC_012943	CGCCGG	2	12	4349830	4349841	0 %	0 %	50 %	50 %	253800932
2156	NC_012943	CCCCGG	2	12	4351454	4351465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253800933
2157	NC_012943	ATTGCC	2	12	4355492	4355503	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	253800936
2158	NC_012943	CGCGGC	2	12	4357072	4357083	0 %	0 %	50 %	50 %	253800936
2159	NC_012943	CCGGCC	2	12	4360197	4360208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253800939
2160	NC_012943	TCGGCG	2	12	4365075	4365086	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800944
2161	NC_012943	CACCGG	2	12	4365509	4365520	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800944
2162	NC_012943	TGGCGT	2	12	4369131	4369142	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253800946
2163	NC_012943	GCAGCC	2	12	4369326	4369337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800946
2164	NC_012943	CGCTAC	2	12	4375514	4375525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253800953
2165	NC_012943	GCCGAC	2	12	4375834	4375845	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800953
2166	NC_012943	ACCCGC	2	12	4377312	4377323	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800953
2167	NC_012943	GCCGTC	2	12	4378075	4378086	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800956
2168	NC_012943	CCGTCG	2	12	4378439	4378450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800956
2169	NC_012943	ACCCCG	2	12	4380511	4380522	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	253800958
2170	NC_012943	CGGTCC	2	12	4380535	4380546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253800958
2171	NC_012943	GGGCCG	2	12	4381132	4381143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253800958
2172	NC_012943	TCGGCA	2	12	4384194	4384205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800960
2173	NC_012943	TCGGCG	2	12	4384962	4384973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253800960
2174	NC_012943	GGCCGC	2	12	4385992	4386003	0 %	0 %	50 %	50 %	253800960
2175	NC_012943	ATCGGC	2	12	4386488	4386499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800960
2176	NC_012943	ACGCCG	2	12	4386908	4386919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253800960
2177	NC_012943	AGTCGA	2	12	4393866	4393877	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253800968
2178	NC_012943	GATCGA	2	12	4394115	4394126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253800968
2179	NC_012943	GTCGGT	2	12	4394372	4394383	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253800968
2180	NC_012943	TTCGCT	2	12	4395196	4395207	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	253800970
2181	NC_012943	CGTCGA	2	12	4395681	4395692	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253800970

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