MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 1655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012926	CTATC	2	10	926	935	20 %	40 %	0 %	40 %	253754648
2	NC_012926	AATAA	2	10	1295	1304	80 %	20 %	0 %	0 %	253754648
3	NC_012926	CATAT	2	10	2805	2814	40 %	40 %	0 %	20 %	253754650
4	NC_012926	AAACA	2	10	5719	5728	80 %	0 %	0 %	20 %	253754654
5	NC_012926	TGTCT	2	10	6110	6119	0 %	60 %	20 %	20 %	253754654
6	NC_012926	GAGAT	2	10	6828	6837	40 %	20 %	40 %	0 %	253754655
7	NC_012926	TGAAA	2	10	9965	9974	60 %	20 %	20 %	0 %	253754656
8	NC_012926	CTATT	2	10	11202	11211	20 %	60 %	0 %	20 %	253754659
9	NC_012926	CTTTG	2	10	13431	13440	0 %	60 %	20 %	20 %	253754661
10	NC_012926	AACAG	2	10	13875	13884	60 %	0 %	20 %	20 %	253754662
11	NC_012926	CTTGT	2	10	15031	15040	0 %	60 %	20 %	20 %	253754662
12	NC_012926	ACAAA	2	10	16912	16921	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012926	TCGTG	2	10	18044	18053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012926	GTTAA	2	10	18923	18932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012926	ATTAT	2	10	22858	22867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012926	ATATT	2	10	23407	23416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012926	TTTAT	2	10	24438	24447	20 %	80 %	0 %	0 %	253754665
18	NC_012926	AATGC	2	10	25404	25413	40 %	20 %	20 %	20 %	253754666
19	NC_012926	CTACG	2	10	30758	30767	20 %	20 %	20 %	40 %	253754672
20	NC_012926	GAACG	2	10	33044	33053	40 %	0 %	40 %	20 %	253754673
21	NC_012926	AAACC	2	10	33180	33189	60 %	0 %	0 %	40 %	253754673
22	NC_012926	ATTCT	2	10	34527	34536	20 %	60 %	0 %	20 %	253754673
23	NC_012926	GCCAT	2	10	35002	35011	20 %	20 %	20 %	40 %	253754673
24	NC_012926	AAATG	2	10	36088	36097	60 %	20 %	20 %	0 %	253754674
25	NC_012926	AGCAG	2	10	38719	38728	40 %	0 %	40 %	20 %	253754677
26	NC_012926	CTATT	2	10	38944	38953	20 %	60 %	0 %	20 %	253754677
27	NC_012926	CTATT	2	10	41506	41515	20 %	60 %	0 %	20 %	253754679
28	NC_012926	GAAGC	2	10	42684	42693	40 %	0 %	40 %	20 %	253754680
29	NC_012926	AGCGG	2	10	45790	45799	20 %	0 %	60 %	20 %	253754683
30	NC_012926	TTAGT	2	10	47406	47415	20 %	60 %	20 %	0 %	253754684
31	NC_012926	GAAGT	2	10	48053	48062	40 %	20 %	40 %	0 %	253754685
32	NC_012926	TTATC	2	10	48184	48193	20 %	60 %	0 %	20 %	253754685
33	NC_012926	TAATC	2	10	48292	48301	40 %	40 %	0 %	20 %	253754685
34	NC_012926	TCAAT	2	10	48551	48560	40 %	40 %	0 %	20 %	253754686
35	NC_012926	TTATT	2	10	48804	48813	20 %	80 %	0 %	0 %	253754686
36	NC_012926	GAGAA	2	10	52310	52319	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012926	GCAGA	2	10	53791	53800	40 %	0 %	40 %	20 %	253754691
38	NC_012926	GGGCT	2	10	54262	54271	0 %	20 %	60 %	20 %	253754691
39	NC_012926	TTTTG	2	10	55291	55300	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012926	TGAAT	2	10	55891	55900	40 %	40 %	20 %	0 %	253754693
41	NC_012926	TTAAG	2	10	58306	58315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012926	AGCAG	2	10	60031	60040	40 %	0 %	40 %	20 %	253754697
43	NC_012926	GCCCT	2	10	62853	62862	0 %	20 %	20 %	60 %	253754700
44	NC_012926	GTTTT	2	10	65356	65365	0 %	80 %	20 %	0 %	253754702
45	NC_012926	TTGCT	2	10	65952	65961	0 %	60 %	20 %	20 %	253754703
46	NC_012926	GTATC	2	10	69239	69248	20 %	40 %	20 %	20 %	253754706
47	NC_012926	TGGAT	2	10	71233	71242	20 %	40 %	40 %	0 %	253754710
48	NC_012926	TTATG	2	10	71443	71452	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012926	AAATT	2	10	72334	72343	60 %	40 %	0 %	0 %	253754711
50	NC_012926	TGGCG	2	10	73341	73350	0 %	20 %	60 %	20 %	253754713
51	NC_012926	AAAAC	2	10	73901	73910	80 %	0 %	0 %	20 %	253754714
52	NC_012926	TACAC	2	10	74315	74324	40 %	20 %	0 %	40 %	253754715
53	NC_012926	GAAAA	2	10	75194	75203	80 %	0 %	20 %	0 %	253754716
54	NC_012926	GTCTT	2	10	75482	75491	0 %	60 %	20 %	20 %	253754717
55	NC_012926	TTTGG	2	10	75613	75622	0 %	60 %	40 %	0 %	253754717
56	NC_012926	AAGGA	2	10	78188	78197	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012926	TAAGA	2	10	78946	78955	60 %	20 %	20 %	0 %	253754725
58	NC_012926	AGAAT	2	10	83734	83743	60 %	20 %	20 %	0 %	253754734
59	NC_012926	TAGTC	2	10	84519	84528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012926	GAAAA	2	10	86060	86069	80 %	0 %	20 %	0 %	253754740
61	NC_012926	TGACT	2	10	86455	86464	20 %	40 %	20 %	20 %	253754740
62	NC_012926	TTTTA	2	10	87289	87298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012926	ACAAA	2	10	87713	87722	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012926	TCGTG	2	10	88845	88854	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012926	GTTAA	2	10	89724	89733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012926	TTAAT	2	10	93434	93443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012926	CTTTC	2	10	95293	95302	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_012926	TGCTT	2	10	95957	95966	0 %	60 %	20 %	20 %	253754744
69	NC_012926	CGCTC	2	10	97021	97030	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_012926	TTGTT	2	10	97128	97137	0 %	80 %	20 %	0 %	253754746
71	NC_012926	AATAT	2	10	98570	98579	60 %	40 %	0 %	0 %	253754747
72	NC_012926	TTTCA	2	10	99386	99395	20 %	60 %	0 %	20 %	253754749
73	NC_012926	CTTCG	2	10	99629	99638	0 %	40 %	20 %	40 %	253754749
74	NC_012926	AAAAT	2	10	99763	99772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012926	TTTTG	2	10	99942	99951	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012926	TTTTC	2	10	100550	100559	0 %	80 %	0 %	20 %	253754750
77	NC_012926	TTTGG	2	10	102846	102855	0 %	60 %	40 %	0 %	253754753
78	NC_012926	ATTGC	2	10	103311	103320	20 %	40 %	20 %	20 %	253754753
79	NC_012926	GCTTT	2	10	103542	103551	0 %	60 %	20 %	20 %	253754754
80	NC_012926	AGAAA	2	10	104000	104009	80 %	0 %	20 %	0 %	253754754
81	NC_012926	GACTT	2	10	105579	105588	20 %	40 %	20 %	20 %	253754755
82	NC_012926	CTGGG	2	10	109799	109808	0 %	20 %	60 %	20 %	253754760
83	NC_012926	AAGAA	2	10	114640	114649	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012926	CCGTT	2	10	115683	115692	0 %	40 %	20 %	40 %	253754762
85	NC_012926	GTCTG	2	10	119155	119164	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012926	GGCCT	2	10	119223	119232	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012926	GTCAA	2	10	119320	119329	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012926	GCTTG	2	10	121171	121180	0 %	40 %	40 %	20 %	253754765
89	NC_012926	TGGTT	2	10	121299	121308	0 %	60 %	40 %	0 %	253754765
90	NC_012926	GGTCA	2	10	121598	121607	20 %	20 %	40 %	20 %	253754765
91	NC_012926	AAGGA	2	10	122688	122697	60 %	0 %	40 %	0 %	253754768
92	NC_012926	GGCAA	2	10	123246	123255	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012926	TTGGT	2	10	125634	125643	0 %	60 %	40 %	0 %	253754771
94	NC_012926	GGATG	2	10	125936	125945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012926	CTGGA	2	10	127036	127045	20 %	20 %	40 %	20 %	253754773
96	NC_012926	AGCAG	2	10	127392	127401	40 %	0 %	40 %	20 %	253754773
97	NC_012926	GGCCG	2	10	127573	127582	0 %	0 %	60 %	40 %	253754773
98	NC_012926	AATCA	2	10	128012	128021	60 %	20 %	0 %	20 %	253754774
99	NC_012926	AGGTG	2	10	128700	128709	20 %	20 %	60 %	0 %	253754774
100	NC_012926	CATGA	2	10	129073	129082	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012926	GAAAG	2	10	130387	130396	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012926	ACTTT	2	10	132281	132290	20 %	60 %	0 %	20 %	253754779
103	NC_012926	CTATA	2	10	133305	133314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012926	TAGCG	2	10	135379	135388	20 %	20 %	40 %	20 %	253754783
105	NC_012926	ATCAA	2	10	136540	136549	60 %	20 %	0 %	20 %	253754785
106	NC_012926	GAAGC	2	10	137029	137038	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012926	CGTAT	2	10	137812	137821	20 %	40 %	20 %	20 %	253754786
108	NC_012926	ATCCA	2	10	137903	137912	40 %	20 %	0 %	40 %	253754786
109	NC_012926	CAAGA	2	10	138679	138688	60 %	0 %	20 %	20 %	253754786
110	NC_012926	AAGCT	2	10	139109	139118	40 %	20 %	20 %	20 %	253754786
111	NC_012926	AAGAA	2	10	141369	141378	80 %	0 %	20 %	0 %	253754787
112	NC_012926	GCAGT	2	10	141659	141668	20 %	20 %	40 %	20 %	253754787
113	NC_012926	ATCCA	2	10	141770	141779	40 %	20 %	0 %	40 %	253754787
114	NC_012926	TACGA	2	10	142271	142280	40 %	20 %	20 %	20 %	253754787
115	NC_012926	TTAAG	2	10	142603	142612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012926	GTAAA	2	10	144085	144094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012926	GAAAA	2	10	146063	146072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012926	CTATT	2	10	146089	146098	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012926	GTTTA	2	10	146268	146277	20 %	60 %	20 %	0 %	253754790
120	NC_012926	GCATG	2	10	147790	147799	20 %	20 %	40 %	20 %	253754792
121	NC_012926	AAAAT	2	10	148203	148212	80 %	20 %	0 %	0 %	253754792
122	NC_012926	ATAAA	2	10	148642	148651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012926	GGGTC	2	10	152771	152780	0 %	20 %	60 %	20 %	253754797
124	NC_012926	TTTCA	2	10	153741	153750	20 %	60 %	0 %	20 %	253754798
125	NC_012926	AAAAG	2	10	154334	154343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012926	TGGTC	2	10	156927	156936	0 %	40 %	40 %	20 %	253754801
127	NC_012926	GTCTT	2	10	157882	157891	0 %	60 %	20 %	20 %	253754802
128	NC_012926	TTGGA	2	10	160398	160407	20 %	40 %	40 %	0 %	253754803
129	NC_012926	TCATC	2	10	161271	161280	20 %	40 %	0 %	40 %	253754805
130	NC_012926	CTTGG	2	10	161440	161449	0 %	40 %	40 %	20 %	253754805
131	NC_012926	AATTG	2	10	162100	162109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012926	TTTTC	2	10	162459	162468	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012926	CACCT	2	10	163022	163031	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_012926	TCCAA	2	10	166503	166512	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_012926	CCAGC	2	10	166597	166606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_012926	AGACT	2	10	169948	169957	40 %	20 %	20 %	20 %	253754806
137	NC_012926	CATTG	2	10	174001	174010	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012926	ATACA	2	10	175067	175076	60 %	20 %	0 %	20 %	253754811
139	NC_012926	GGTTT	2	10	177225	177234	0 %	60 %	40 %	0 %	253754812
140	NC_012926	TTATC	2	10	178101	178110	20 %	60 %	0 %	20 %	253754813
141	NC_012926	CAAAT	2	10	180471	180480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012926	TCTGG	2	10	181536	181545	0 %	40 %	40 %	20 %	253754816
143	NC_012926	TTCAA	2	10	182076	182085	40 %	40 %	0 %	20 %	253754816
144	NC_012926	TATAA	2	10	182921	182930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012926	TTGAT	2	10	186263	186272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012926	TGATT	2	10	186911	186920	20 %	60 %	20 %	0 %	253754820
147	NC_012926	GAAGC	2	10	189028	189037	40 %	0 %	40 %	20 %	253754821
148	NC_012926	TATTG	2	10	193524	193533	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012926	GGAAA	2	10	194397	194406	60 %	0 %	40 %	0 %	253754823
150	NC_012926	CTGGT	2	10	194893	194902	0 %	40 %	40 %	20 %	253754824
151	NC_012926	CCAGA	2	10	194946	194955	40 %	0 %	20 %	40 %	253754824
152	NC_012926	AGCAG	2	10	196994	197003	40 %	0 %	40 %	20 %	253754826
153	NC_012926	AAACG	2	10	197955	197964	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_012926	TTTTG	2	10	198526	198535	0 %	80 %	20 %	0 %	253754829
155	NC_012926	GAACA	2	10	198561	198570	60 %	0 %	20 %	20 %	253754829
156	NC_012926	AAAAT	2	10	199379	199388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012926	TTTTA	2	10	199750	199759	20 %	80 %	0 %	0 %	253754830
158	NC_012926	TGAAA	2	10	200915	200924	60 %	20 %	20 %	0 %	253754831
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162	NC_012926	ATGGA	2	10	204466	204475	40 %	20 %	40 %	0 %	253754832
163	NC_012926	AAGTT	2	10	207336	207345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012926	TTTGG	2	10	207583	207592	0 %	60 %	40 %	0 %	253754834
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166	NC_012926	AATGT	2	10	208510	208519	40 %	40 %	20 %	0 %	253754835
167	NC_012926	ATTTT	2	10	210082	210091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012926	AGCAG	2	10	212650	212659	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_012926	GACCA	2	10	215479	215488	40 %	0 %	20 %	40 %	253754838
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171	NC_012926	CCATA	2	10	216690	216699	40 %	20 %	0 %	40 %	253754840
172	NC_012926	ATGAC	2	10	218078	218087	40 %	20 %	20 %	20 %	253754841
173	NC_012926	TTGAT	2	10	218693	218702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012926	ATTTA	2	10	218877	218886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012926	AGCTC	2	10	219706	219715	20 %	20 %	20 %	40 %	253754842
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179	NC_012926	AGCAG	2	10	228706	228715	40 %	0 %	40 %	20 %	253754849
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181	NC_012926	CCTTG	2	10	231096	231105	0 %	40 %	20 %	40 %	253754851
182	NC_012926	ACCAA	2	10	232105	232114	60 %	0 %	0 %	40 %	253754852
183	NC_012926	ATAAA	2	10	233403	233412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012926	TAATG	2	10	234591	234600	40 %	40 %	20 %	0 %	253754854
185	NC_012926	ATTTT	2	10	235854	235863	20 %	80 %	0 %	0 %	253754855
186	NC_012926	TAAAA	2	10	238288	238297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012926	TTGGA	2	10	239095	239104	20 %	40 %	40 %	0 %	253754857
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192	NC_012926	TGAAC	2	10	242738	242747	40 %	20 %	20 %	20 %	253754861
193	NC_012926	AATTT	2	10	243035	243044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012926	GGCTT	2	10	243443	243452	0 %	40 %	40 %	20 %	253754862
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209	NC_012926	AGTTG	2	10	258121	258130	20 %	40 %	40 %	0 %	253754877
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215	NC_012926	TGACC	2	10	266807	266816	20 %	20 %	20 %	40 %	253754883
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218	NC_012926	AAATA	2	10	268740	268749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
219	NC_012926	TAGAA	2	10	271845	271854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
220	NC_012926	AGGCA	2	10	272318	272327	40 %	0 %	40 %	20 %	253754886
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224	NC_012926	GGGTG	2	10	273676	273685	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
225	NC_012926	GGGCT	2	10	273775	273784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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238	NC_012926	CAGGG	2	10	286419	286428	20 %	0 %	60 %	20 %	253754896
239	NC_012926	CCTCT	2	10	286512	286521	0 %	40 %	0 %	60 %	253754896
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241	NC_012926	CTGAC	2	10	288092	288101	20 %	20 %	20 %	40 %	253754897
242	NC_012926	TCTGT	2	10	290510	290519	0 %	60 %	20 %	20 %	253754899
243	NC_012926	ATCAA	2	10	293725	293734	60 %	20 %	0 %	20 %	253754903
244	NC_012926	CACTT	2	10	294314	294323	20 %	40 %	0 %	40 %	253754903
245	NC_012926	GCCTA	2	10	295428	295437	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
246	NC_012926	GAAAG	2	10	295613	295622	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
247	NC_012926	TGACA	2	10	299942	299951	40 %	20 %	20 %	20 %	253754907
248	NC_012926	GACTG	2	10	300060	300069	20 %	20 %	40 %	20 %	253754907
249	NC_012926	TGCCT	2	10	301458	301467	0 %	40 %	20 %	40 %	253754909
250	NC_012926	CATAG	2	10	302502	302511	40 %	20 %	20 %	20 %	253754911
251	NC_012926	CCCAG	2	10	303326	303335	20 %	0 %	20 %	60 %	253754911
252	NC_012926	CTTTT	2	10	304653	304662	0 %	80 %	0 %	20 %	253754912
253	NC_012926	AGCAG	2	10	305884	305893	40 %	0 %	40 %	20 %	253754914
254	NC_012926	TTGGT	2	10	306790	306799	0 %	60 %	40 %	0 %	253754915
255	NC_012926	CAAAT	2	10	307785	307794	60 %	20 %	0 %	20 %	253754917
256	NC_012926	CATTT	2	10	310684	310693	20 %	60 %	0 %	20 %	253754920
257	NC_012926	CAAGG	2	10	311096	311105	40 %	0 %	40 %	20 %	253754921
258	NC_012926	ATGAC	2	10	311523	311532	40 %	20 %	20 %	20 %	253754921
259	NC_012926	AGAGC	2	10	312182	312191	40 %	0 %	40 %	20 %	253754922
260	NC_012926	GATTT	2	10	312511	312520	20 %	60 %	20 %	0 %	253754922
261	NC_012926	TTGGT	2	10	314448	314457	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012926	TTCCT	2	10	314999	315008	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_012926	CAATC	2	10	318951	318960	40 %	20 %	0 %	40 %	253754929
264	NC_012926	GTTTT	2	10	319771	319780	0 %	80 %	20 %	0 %	253754930
265	NC_012926	TAAAA	2	10	320641	320650	80 %	20 %	0 %	0 %	253754930
266	NC_012926	ACAGA	2	10	321211	321220	60 %	0 %	20 %	20 %	253754931
267	NC_012926	CAACA	2	10	325309	325318	60 %	0 %	0 %	40 %	253754933
268	NC_012926	CACGT	2	10	325912	325921	20 %	20 %	20 %	40 %	253754933
269	NC_012926	GTTTT	2	10	326170	326179	0 %	80 %	20 %	0 %	253754933
270	NC_012926	TAGAA	2	10	326890	326899	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_012926	AAACC	2	10	328304	328313	60 %	0 %	0 %	40 %	253754935
272	NC_012926	ACAAA	2	10	328963	328972	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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