MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 6310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012926	ACTT	2	8	651	658	25 %	50 %	0 %	25 %	253754648
2	NC_012926	ACGT	2	8	957	964	25 %	25 %	25 %	25 %	253754648
3	NC_012926	ACAA	2	8	1066	1073	75 %	0 %	0 %	25 %	253754648
4	NC_012926	GACA	2	8	1222	1229	50 %	0 %	25 %	25 %	253754648
5	NC_012926	ATGC	2	8	1283	1290	25 %	25 %	25 %	25 %	253754648
6	NC_012926	ACAA	2	8	1954	1961	75 %	0 %	0 %	25 %	253754649
7	NC_012926	TACC	2	8	2266	2273	25 %	25 %	0 %	50 %	253754649
8	NC_012926	ACCG	2	8	2279	2286	25 %	0 %	25 %	50 %	253754649
9	NC_012926	ACTT	2	8	2519	2526	25 %	50 %	0 %	25 %	253754649
10	NC_012926	GTCC	2	8	2585	2592	0 %	25 %	25 %	50 %	253754649
11	NC_012926	AAAG	2	8	2823	2830	75 %	0 %	25 %	0 %	253754650
12	NC_012926	GAAG	2	8	3407	3414	50 %	0 %	50 %	0 %	253754650
13	NC_012926	GTAT	2	8	3622	3629	25 %	50 %	25 %	0 %	253754650
14	NC_012926	AATG	2	8	4188	4195	50 %	25 %	25 %	0 %	253754652
15	NC_012926	AAAT	2	8	4657	4664	75 %	25 %	0 %	0 %	253754653
16	NC_012926	CTTG	2	8	5245	5252	0 %	50 %	25 %	25 %	253754653
17	NC_012926	TTGG	2	8	5624	5631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012926	GATT	2	8	5677	5684	25 %	50 %	25 %	0 %	253754654
19	NC_012926	ATGA	2	8	5868	5875	50 %	25 %	25 %	0 %	253754654
20	NC_012926	ATCA	2	8	6275	6282	50 %	25 %	0 %	25 %	253754655
21	NC_012926	AATC	2	8	6299	6306	50 %	25 %	0 %	25 %	253754655
22	NC_012926	GTTT	2	8	6505	6512	0 %	75 %	25 %	0 %	253754655
23	NC_012926	TCAA	2	8	6532	6539	50 %	25 %	0 %	25 %	253754655
24	NC_012926	CTTA	2	8	7005	7012	25 %	50 %	0 %	25 %	253754655
25	NC_012926	GATG	2	8	7588	7595	25 %	25 %	50 %	0 %	253754655
26	NC_012926	GCAA	2	8	8220	8227	50 %	0 %	25 %	25 %	253754655
27	NC_012926	TCAG	2	8	9160	9167	25 %	25 %	25 %	25 %	253754655
28	NC_012926	ATTG	2	8	9397	9404	25 %	50 %	25 %	0 %	253754655
29	NC_012926	CTTG	2	8	9439	9446	0 %	50 %	25 %	25 %	253754655
30	NC_012926	AAGG	2	8	9718	9725	50 %	0 %	50 %	0 %	253754655
31	NC_012926	GAAG	2	8	9839	9846	50 %	0 %	50 %	0 %	253754656
32	NC_012926	TCTT	2	8	10169	10176	0 %	75 %	0 %	25 %	253754657
33	NC_012926	TGCC	2	8	10184	10191	0 %	25 %	25 %	50 %	253754657
34	NC_012926	CTAT	2	8	10648	10655	25 %	50 %	0 %	25 %	253754659
35	NC_012926	AGTG	2	8	11511	11518	25 %	25 %	50 %	0 %	253754659
36	NC_012926	AGAT	2	8	11819	11826	50 %	25 %	25 %	0 %	253754660
37	NC_012926	GAAG	2	8	12134	12141	50 %	0 %	50 %	0 %	253754660
38	NC_012926	GATT	2	8	12202	12209	25 %	50 %	25 %	0 %	253754660
39	NC_012926	GGCG	2	8	12213	12220	0 %	0 %	75 %	25 %	253754660
40	NC_012926	AGGC	2	8	12864	12871	25 %	0 %	50 %	25 %	253754660
41	NC_012926	TAAA	2	8	12898	12905	75 %	25 %	0 %	0 %	253754660
42	NC_012926	CTTG	2	8	14361	14368	0 %	50 %	25 %	25 %	253754662
43	NC_012926	TGTT	2	8	14435	14442	0 %	75 %	25 %	0 %	253754662
44	NC_012926	GTTC	2	8	14461	14468	0 %	50 %	25 %	25 %	253754662
45	NC_012926	GTCG	2	8	14530	14537	0 %	25 %	50 %	25 %	253754662
46	NC_012926	CAAC	2	8	14589	14596	50 %	0 %	0 %	50 %	253754662
47	NC_012926	ATGG	2	8	14608	14615	25 %	25 %	50 %	0 %	253754662
48	NC_012926	CAAC	2	8	14651	14658	50 %	0 %	0 %	50 %	253754662
49	NC_012926	TTGG	2	8	14716	14723	0 %	50 %	50 %	0 %	253754662
50	NC_012926	AAGA	2	8	14956	14963	75 %	0 %	25 %	0 %	253754662
51	NC_012926	ACAA	2	8	15339	15346	75 %	0 %	0 %	25 %	253754662
52	NC_012926	TTAT	2	8	15774	15781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012926	ATTA	2	8	16357	16364	50 %	50 %	0 %	0 %	253754663
54	NC_012926	GTGA	2	8	17377	17384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012926	AGCG	2	8	17548	17555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012926	AGCC	2	8	18430	18437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012926	GTAA	2	8	19009	19016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012926	TCAC	2	8	19066	19073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012926	GCGA	2	8	19165	19172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012926	ATTC	2	8	20031	20038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012926	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012926	TAGG	2	8	21043	21050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012926	AATC	2	8	22189	22196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012926	GCGT	2	8	23100	23107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012926	TTTG	2	8	23629	23636	0 %	75 %	25 %	0 %	253754664
66	NC_012926	CAAA	2	8	24386	24393	75 %	0 %	0 %	25 %	253754664
67	NC_012926	GGTC	2	8	24484	24491	0 %	25 %	50 %	25 %	253754665
68	NC_012926	AACA	2	8	24893	24900	75 %	0 %	0 %	25 %	253754665
69	NC_012926	TCTA	2	8	25037	25044	25 %	50 %	0 %	25 %	253754666
70	NC_012926	ATCA	2	8	25376	25383	50 %	25 %	0 %	25 %	253754666
71	NC_012926	TTTG	2	8	26288	26295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012926	ATTG	2	8	26804	26811	25 %	50 %	25 %	0 %	253754667
73	NC_012926	TTGA	2	8	27015	27022	25 %	50 %	25 %	0 %	253754667
74	NC_012926	TGAT	2	8	27028	27035	25 %	50 %	25 %	0 %	253754667
75	NC_012926	TTTG	2	8	27293	27300	0 %	75 %	25 %	0 %	253754667
76	NC_012926	ATTT	2	8	27355	27362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012926	TGCC	2	8	27765	27772	0 %	25 %	25 %	50 %	253754668
78	NC_012926	GCGG	2	8	28282	28289	0 %	0 %	75 %	25 %	253754668
79	NC_012926	GAAA	2	8	28437	28444	75 %	0 %	25 %	0 %	253754668
80	NC_012926	TGGG	2	8	29376	29383	0 %	25 %	75 %	0 %	253754670
81	NC_012926	TCAA	2	8	29415	29422	50 %	25 %	0 %	25 %	253754670
82	NC_012926	CGTG	2	8	29842	29849	0 %	25 %	50 %	25 %	253754670
83	NC_012926	TCAA	2	8	30095	30102	50 %	25 %	0 %	25 %	253754670
84	NC_012926	AACC	2	8	30144	30151	50 %	0 %	0 %	50 %	253754670
85	NC_012926	CTTG	2	8	30202	30209	0 %	50 %	25 %	25 %	253754670
86	NC_012926	AATT	2	8	30385	30392	50 %	50 %	0 %	0 %	253754671
87	NC_012926	TTTA	2	8	30567	30574	25 %	75 %	0 %	0 %	253754671
88	NC_012926	AAGA	2	8	30828	30835	75 %	0 %	25 %	0 %	253754672
89	NC_012926	TGAA	2	8	30895	30902	50 %	25 %	25 %	0 %	253754672
90	NC_012926	TTCA	2	8	32022	32029	25 %	50 %	0 %	25 %	253754673
91	NC_012926	TACT	2	8	32087	32094	25 %	50 %	0 %	25 %	253754673
92	NC_012926	GTCC	2	8	33096	33103	0 %	25 %	25 %	50 %	253754673
93	NC_012926	TTCC	2	8	33233	33240	0 %	50 %	0 %	50 %	253754673
94	NC_012926	GCAG	2	8	33683	33690	25 %	0 %	50 %	25 %	253754673
95	NC_012926	TACC	2	8	33900	33907	25 %	25 %	0 %	50 %	253754673
96	NC_012926	CCAA	2	8	34765	34772	50 %	0 %	0 %	50 %	253754673
97	NC_012926	GACG	2	8	34892	34899	25 %	0 %	50 %	25 %	253754673
98	NC_012926	AAGA	2	8	35103	35110	75 %	0 %	25 %	0 %	253754673
99	NC_012926	AAAT	2	8	35151	35158	75 %	25 %	0 %	0 %	253754673
100	NC_012926	TGGT	2	8	36024	36031	0 %	50 %	50 %	0 %	253754674
101	NC_012926	CAAC	2	8	36137	36144	50 %	0 %	0 %	50 %	253754674
102	NC_012926	ACCT	2	8	36434	36441	25 %	25 %	0 %	50 %	253754674
103	NC_012926	AGCC	2	8	37009	37016	25 %	0 %	25 %	50 %	253754675
104	NC_012926	GATT	2	8	37072	37079	25 %	50 %	25 %	0 %	253754675
105	NC_012926	CTGG	2	8	37131	37138	0 %	25 %	50 %	25 %	253754675
106	NC_012926	GGCT	2	8	38136	38143	0 %	25 %	50 %	25 %	253754676
107	NC_012926	GTCC	2	8	38628	38635	0 %	25 %	25 %	50 %	253754677
108	NC_012926	CAAG	2	8	38821	38828	50 %	0 %	25 %	25 %	253754677
109	NC_012926	GCAG	2	8	39094	39101	25 %	0 %	50 %	25 %	253754677
110	NC_012926	AACC	2	8	39556	39563	50 %	0 %	0 %	50 %	253754677
111	NC_012926	CGTC	2	8	39570	39577	0 %	25 %	25 %	50 %	253754677
112	NC_012926	CAAA	2	8	40242	40249	75 %	0 %	0 %	25 %	253754678
113	NC_012926	GACC	2	8	40746	40753	25 %	0 %	25 %	50 %	253754678
114	NC_012926	AAAG	2	8	41308	41315	75 %	0 %	25 %	0 %	253754679
115	NC_012926	GCGG	2	8	41402	41409	0 %	0 %	75 %	25 %	253754679
116	NC_012926	TGCC	2	8	42331	42338	0 %	25 %	25 %	50 %	253754680
117	NC_012926	TGAA	2	8	42457	42464	50 %	25 %	25 %	0 %	253754680
118	NC_012926	ATAC	2	8	43219	43226	50 %	25 %	0 %	25 %	253754681
119	NC_012926	AAAG	2	8	43238	43245	75 %	0 %	25 %	0 %	253754681
120	NC_012926	TGAC	2	8	43544	43551	25 %	25 %	25 %	25 %	253754681
121	NC_012926	AATA	2	8	43613	43620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012926	TAAA	2	8	43646	43653	75 %	25 %	0 %	0 %	253754682
123	NC_012926	TTAT	2	8	44336	44343	25 %	75 %	0 %	0 %	253754682
124	NC_012926	GAAG	2	8	44592	44599	50 %	0 %	50 %	0 %	253754682
125	NC_012926	GAAG	2	8	44760	44767	50 %	0 %	50 %	0 %	253754682
126	NC_012926	TTGG	2	8	44935	44942	0 %	50 %	50 %	0 %	253754683
127	NC_012926	CGAC	2	8	45150	45157	25 %	0 %	25 %	50 %	253754683
128	NC_012926	TTGA	2	8	45950	45957	25 %	50 %	25 %	0 %	253754683
129	NC_012926	TCAG	2	8	46077	46084	25 %	25 %	25 %	25 %	253754683
130	NC_012926	AATA	2	8	46213	46220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012926	CTCC	2	8	46239	46246	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_012926	TTCG	2	8	46340	46347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012926	AAGC	2	8	46462	46469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012926	AAAC	2	8	46664	46671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012926	ATCA	2	8	46734	46741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012926	CTAT	2	8	47537	47544	25 %	50 %	0 %	25 %	253754684
137	NC_012926	TCAA	2	8	47558	47565	50 %	25 %	0 %	25 %	253754684
138	NC_012926	GCTT	2	8	47872	47879	0 %	50 %	25 %	25 %	253754685
139	NC_012926	CCTA	2	8	47958	47965	25 %	25 %	0 %	50 %	253754685
140	NC_012926	GCTA	2	8	48226	48233	25 %	25 %	25 %	25 %	253754685
141	NC_012926	AAGA	2	8	48829	48836	75 %	0 %	25 %	0 %	253754686
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143	NC_012926	TGAT	2	8	49089	49096	25 %	50 %	25 %	0 %	253754687
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