MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 28052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012926	AAC	2	6	9	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012926	TAC	2	6	265	270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754648
3	NC_012926	AAG	2	6	277	282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754648
4	NC_012926	CTC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754648
5	NC_012926	AAT	2	6	398	403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754648
6	NC_012926	ATT	2	6	463	468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754648
7	NC_012926	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754648
8	NC_012926	TCA	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754648
9	NC_012926	TGA	2	6	664	669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754648
10	NC_012926	TAA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754648
11	NC_012926	CAA	2	6	693	698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754648
12	NC_012926	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754648
13	NC_012926	GAA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754648
14	NC_012926	TGC	2	6	1039	1044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754648
15	NC_012926	CTC	2	6	1310	1315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754648
16	NC_012926	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754648
17	NC_012926	TCA	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012926	ACT	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012926	ATA	2	6	1505	1510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012926	TAA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
21	NC_012926	TTA	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754649
22	NC_012926	AAG	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754649
23	NC_012926	GTC	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754649
24	NC_012926	TGA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754649
25	NC_012926	TGT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754649
26	NC_012926	GAT	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754649
27	NC_012926	TCT	2	6	2196	2201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754649
28	NC_012926	AAT	2	6	2207	2212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
29	NC_012926	TTA	2	6	2255	2260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754649
30	NC_012926	AAC	2	6	2308	2313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754649
31	NC_012926	TCT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754649
32	NC_012926	TAA	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
33	NC_012926	TGT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754649
34	NC_012926	TCT	2	6	2579	2584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754649
35	NC_012926	AAT	2	6	2609	2614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
36	NC_012926	ATA	2	6	2663	2668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012926	CTG	2	6	2797	2802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754650
38	NC_012926	AGT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754650
39	NC_012926	TTA	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
40	NC_012926	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
41	NC_012926	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754650
42	NC_012926	TGG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754650
43	NC_012926	TTA	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
44	NC_012926	TCT	2	6	3495	3500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754650
45	NC_012926	ATT	3	9	3554	3562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
46	NC_012926	AGG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754650
47	NC_012926	TCA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754651
48	NC_012926	TAA	2	6	3719	3724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754651
49	NC_012926	ATG	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754651
50	NC_012926	ACT	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012926	GAG	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012926	TGG	2	6	4169	4174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754652
53	NC_012926	AAC	2	6	4175	4180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754652
54	NC_012926	GAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754652
55	NC_012926	TGT	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754652
56	NC_012926	ATT	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754652
57	NC_012926	ATT	2	6	4301	4306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754652
58	NC_012926	CAG	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
59	NC_012926	TCG	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754653
60	NC_012926	TCA	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754653
61	NC_012926	CAA	2	6	4828	4833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754653
62	NC_012926	AGA	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
63	NC_012926	GAA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
64	NC_012926	TGA	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754653
65	NC_012926	GCA	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
66	NC_012926	GTG	3	9	5117	5125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754653
67	NC_012926	GAA	3	9	5141	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
68	NC_012926	CGA	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
69	NC_012926	CAG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
70	NC_012926	AGG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754653
71	NC_012926	CTC	2	6	5322	5327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754653
72	NC_012926	GAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754653
73	NC_012926	AAG	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
74	NC_012926	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
75	NC_012926	CAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754653
76	NC_012926	TTC	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012926	GTT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012926	GAT	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012926	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754654
80	NC_012926	TTA	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754654
81	NC_012926	TAG	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754654
82	NC_012926	GAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754654
83	NC_012926	TGG	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754654
84	NC_012926	GAA	2	6	6195	6200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754654
85	NC_012926	GAT	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754654
86	NC_012926	TTA	3	9	6317	6325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754655
87	NC_012926	ATG	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
88	NC_012926	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754655
89	NC_012926	GAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
90	NC_012926	AGA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754655
91	NC_012926	TAG	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
92	NC_012926	TTG	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754655
93	NC_012926	GAT	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
94	NC_012926	TTG	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754655
95	NC_012926	GAT	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
96	NC_012926	CTT	2	6	7291	7296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754655
97	NC_012926	CCA	2	6	7378	7383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754655
98	NC_012926	GTT	2	6	7436	7441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754655
99	NC_012926	GCA	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754655
100	NC_012926	TAG	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
101	NC_012926	TCA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754655
102	NC_012926	TGT	2	6	7720	7725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754655
103	NC_012926	ATT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754655
104	NC_012926	TCT	2	6	7855	7860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754655
105	NC_012926	TAA	2	6	7900	7905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754655
106	NC_012926	GGA	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754655
107	NC_012926	GAT	2	6	7970	7975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
108	NC_012926	TGA	3	9	8029	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
109	NC_012926	ACT	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754655
110	NC_012926	TGA	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
111	NC_012926	TAG	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
112	NC_012926	ATG	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
113	NC_012926	TGT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754655
114	NC_012926	CTA	2	6	8781	8786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754655
115	NC_012926	CAA	2	6	8877	8882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754655
116	NC_012926	GTG	2	6	9132	9137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754655
117	NC_012926	TGC	2	6	9154	9159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754655
118	NC_012926	AGA	2	6	9255	9260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754655
119	NC_012926	AAG	2	6	9390	9395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754655
120	NC_012926	GTA	2	6	9428	9433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
121	NC_012926	GAC	2	6	9501	9506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754655
122	NC_012926	TGT	2	6	9631	9636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754655
123	NC_012926	AAT	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012926	TAA	2	6	9938	9943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754656
125	NC_012926	ACT	2	6	9944	9949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754656
126	NC_012926	GAA	2	6	10044	10049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754656
127	NC_012926	AAT	2	6	10069	10074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754657
128	NC_012926	CAA	2	6	10126	10131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754657
129	NC_012926	TTG	2	6	10199	10204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754657
130	NC_012926	CAG	3	9	10222	10230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754657
131	NC_012926	GAA	2	6	10264	10269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754657
132	NC_012926	GCA	2	6	10330	10335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754657
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498	NC_012926	CTT	2	6	36272	36277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754674
499	NC_012926	AAG	2	6	36294	36299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754674
500	NC_012926	ATT	2	6	36413	36418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754674

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