MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis P1/7

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012925	ACAAA	2	10	16914	16923	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012925	TCGTG	2	10	18046	18055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012925	GTTAA	2	10	18925	18934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012925	ATTAT	2	10	22860	22869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012925	ATATT	2	10	23409	23418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012925	GAGAA	2	10	52312	52321	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012925	TTTTG	2	10	55293	55302	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012925	TTAAG	2	10	58302	58311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012925	TTATG	2	10	71439	71448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012925	AAGGA	2	10	78185	78194	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012925	TAGTC	2	10	84516	84525	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012925	TTTTA	2	10	87286	87295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012925	ACAAA	2	10	87711	87720	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012925	TCGTG	2	10	88843	88852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012925	GTTAA	2	10	89722	89731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012925	TTAAT	2	10	93432	93441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012925	CTTTC	2	10	95291	95300	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_012925	CGCTC	2	10	97053	97062	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012925	AAAAT	2	10	99795	99804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012925	TTTTG	2	10	99974	99983	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012925	AAGAA	2	10	114672	114681	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012925	GTCTG	2	10	119187	119196	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012925	GGCCT	2	10	119255	119264	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012925	GTCAA	2	10	119352	119361	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012925	GGATG	2	10	125968	125977	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012925	CATGA	2	10	129108	129117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012925	GAAAG	2	10	130547	130556	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012925	CTATA	2	10	133465	133474	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012925	GAAGC	2	10	137189	137198	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012925	TTAAG	2	10	142763	142772	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012925	GTAAA	2	10	144245	144254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012925	GAAAA	2	10	146223	146232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012925	CTATT	2	10	146249	146258	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012925	ATAAA	2	10	148802	148811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012925	AAAAG	2	10	154550	154559	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012925	AATTG	2	10	162316	162325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012925	TTTTC	2	10	162675	162684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012925	CACCT	2	10	163238	163247	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_012925	CATTG	2	10	172077	172086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_012925	CAAAT	2	10	178547	178556	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012925	TATAA	2	10	180997	181006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012925	TTGAT	2	10	184135	184144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012925	TATTG	2	10	191396	191405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012925	AAACG	2	10	195827	195836	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012925	AAAAT	2	10	197251	197260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012925	AAGTT	2	10	205208	205217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012925	ATTTT	2	10	207954	207963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012925	AGCAG	2	10	210522	210531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012925	TTGAT	2	10	216565	216574	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012925	ATTTA	2	10	216749	216758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012925	ATAAA	2	10	231329	231338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012925	TAAAA	2	10	236214	236223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012925	AATTT	2	10	240961	240970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012925	GGAAT	2	10	242211	242220	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012925	TCCTT	2	10	252455	252464	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_012925	TCTGC	2	10	255704	255713	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012925	TTTAG	2	10	260762	260771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012925	GTAAA	2	10	264004	264013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012925	TTTTA	2	10	265478	265487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012925	CAAAA	2	10	266898	266907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012925	AAATA	2	10	266945	266954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012925	TAGAA	2	10	270050	270059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012925	TTAAA	2	10	271629	271638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012925	GCCTA	2	10	293457	293466	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_012925	GAAAG	2	10	293642	293651	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012925	TTGGT	2	10	312477	312486	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012925	TTCCT	2	10	313028	313037	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_012925	TAGAA	2	10	324919	324928	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012925	ACAAA	2	10	326992	327001	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012925	TCGTG	2	10	328124	328133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012925	GTTAA	2	10	329003	329012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012925	TTTTC	2	10	332345	332354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012925	GTTTT	2	10	335650	335659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012925	ATTTT	2	10	335923	335932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012925	ATAGT	2	10	340450	340459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012925	CATTA	2	10	352948	352957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012925	TTGAT	2	10	354729	354738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012925	AACAT	2	10	373008	373017	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012925	TATTT	2	10	380078	380087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012925	TTCAG	2	10	388012	388021	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012925	ATCTT	2	10	393417	393426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012925	TTGGG	2	10	403101	403110	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012925	ACAAA	2	10	421033	421042	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012925	TCGTG	2	10	422165	422174	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012925	GTTAA	2	10	423044	423053	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012925	TTGAG	2	10	427331	427340	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012925	AGAAA	2	10	430316	430325	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012925	TGAAA	2	10	437066	437075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012925	GATTT	2	10	437144	437153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012925	CTGTT	2	10	449694	449703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012925	GAGTA	2	10	451690	451699	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012925	TTAAA	2	10	453941	453950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012925	CCTGG	2	10	462164	462173	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_012925	AAGGA	2	10	464282	464291	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012925	AGAAA	2	10	470780	470789	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012925	AAAGT	2	10	479813	479822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012925	TAGAA	2	10	485301	485310	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012925	TTATT	2	10	485417	485426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012925	TATAC	2	10	485481	485490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012925	TTGAT	2	10	485724	485733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012925	GTAAT	2	10	486164	486173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012925	TTGGT	2	10	486410	486419	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012925	ATATT	2	10	486443	486452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012925	ATTAT	2	10	493609	493618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012925	ATAAA	2	10	500151	500160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012925	ATAGG	2	10	503419	503428	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012925	AGTAT	2	10	506098	506107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012925	ATAAA	2	10	513845	513854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012925	ATATG	2	10	521233	521242	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012925	TCTTA	2	10	524234	524243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012925	CGTAT	2	10	534029	534038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012925	TAGAC	2	10	536486	536495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012925	TAGAC	2	10	536564	536573	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012925	AGCAA	2	10	563350	563359	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012925	TCACC	2	10	567032	567041	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_012925	GAAGT	2	10	570021	570030	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012925	GAAAA	2	10	576426	576435	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012925	TTGAG	2	10	579526	579535	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012925	AGAAA	2	10	581346	581355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012925	TAAAA	2	10	617326	617335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012925	AAATA	2	10	617426	617435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012925	CAGAA	2	10	617446	617455	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012925	TTTAA	2	10	633492	633501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012925	AAGTG	2	10	643046	643055	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012925	AGCTA	2	10	646014	646023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012925	AAAAT	2	10	655377	655386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012925	TTTCT	2	10	655521	655530	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012925	GCAAA	2	10	659287	659296	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012925	GAGCA	33	165	659966	660130	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012925	GAAAA	2	10	667682	667691	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012925	AAAAG	2	10	683656	683665	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012925	TAGAA	2	10	684182	684191	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012925	ATGAT	2	10	687615	687624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012925	TAGAA	2	10	700730	700739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012925	TCCTT	2	10	706149	706158	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_012925	AGCAG	2	10	706430	706439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012925	ATTTA	2	10	721685	721694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012925	AATTA	2	10	732682	732691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012925	CAATG	2	10	748016	748025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_012925	CTCTT	2	10	753655	753664	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_012925	TTTCC	2	10	755768	755777	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_012925	TTATA	2	10	755883	755892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012925	GAGTA	2	10	761839	761848	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012925	CTTAT	2	10	768124	768133	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012925	GATTT	2	10	768189	768198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012925	CTTAT	2	10	769563	769572	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012925	GATTT	2	10	769628	769637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012925	AAAGA	2	10	774812	774821	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012925	CATTC	2	10	782294	782303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_012925	CTTTT	2	10	795443	795452	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_012925	CTATA	2	10	796356	796365	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_012925	TATTT	2	10	797893	797902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012925	TTGGT	2	10	798664	798673	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012925	TAAAA	2	10	798902	798911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012925	AAATG	2	10	821974	821983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012925	GAGAA	2	10	854060	854069	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012925	TGAAA	2	10	872205	872214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012925	CACTG	2	10	874497	874506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_012925	TTTTA	2	10	893163	893172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012925	GAAAA	2	10	896089	896098	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012925	TGCTA	2	10	897328	897337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_012925	ATTGA	2	10	898088	898097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012925	TTCAA	2	10	910833	910842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_012925	AATAA	2	10	922094	922103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012925	TTAAT	2	10	923595	923604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012925	AAGTG	2	10	926161	926170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012925	ATTGA	2	10	928333	928342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012925	GCAAT	2	10	931003	931012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_012925	ATAGA	2	10	947787	947796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012925	TAGAA	2	10	950580	950589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012925	TTTCT	2	10	957259	957268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_012925	CAATC	2	10	957645	957654	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
173	NC_012925	ACAAA	2	10	969326	969335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_012925	ATAGT	2	10	972288	972297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012925	CTTTC	2	10	984972	984981	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_012925	CTGCT	2	10	985446	985455	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_012925	TCTAT	2	10	1001882	1001891	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_012925	AAGTG	2	10	1011363	1011372	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_012925	TTTAG	2	10	1041212	1041221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012925	ATAGT	2	10	1064060	1064069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012925	GCGAT	2	10	1072191	1072200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
184	NC_012925	AGGTC	2	10	1074424	1074433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
185	NC_012925	TTTCC	2	10	1075351	1075360	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_012925	TTGTA	2	10	1079529	1079538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012925	ATTGT	2	10	1082998	1083007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_012925	CTTTT	2	10	1142326	1142335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_012925	TCGCT	2	10	1151897	1151906	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_012925	ATCCT	2	10	1154791	1154800	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
196	NC_012925	CAATT	2	10	1158102	1158111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_012925	CAGTG	2	10	1159012	1159021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_012925	GTTTT	2	10	1191501	1191510	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_012925	TTTAG	2	10	1736309	1736318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_012925	GAAGT	2	10	1824614	1824623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_012925	TATTT	2	10	1872177	1872186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_012925	AAACC	2	10	1885011	1885020	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_012925	CTGCT	2	10	1904963	1904972	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
290	NC_012925	ACTTG	2	10	1905080	1905089	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_012925	TTCAC	2	10	1916347	1916356	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
292	NC_012925	AGTTT	2	10	1916493	1916502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012925	TTATT	2	10	1917278	1917287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012925	AATTA	2	10	1921632	1921641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_012925	TATAA	2	10	1924581	1924590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_012925	AAACA	2	10	1924902	1924911	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
297	NC_012925	CTTTT	2	10	1927567	1927576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_012925	TTCCT	2	10	1931784	1931793	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
299	NC_012925	CAAAA	2	10	1936117	1936126	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_012925	TATCA	2	10	1963613	1963622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_012925	CTTTT	2	10	1967409	1967418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
302	NC_012925	TAAAA	2	10	1973889	1973898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_012925	CTTTT	2	10	2000911	2000920	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
304	NC_012925	TAAAA	2	10	2003819	2003828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.