MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis P1/7

Total Repeats: 920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012925	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012925	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012925	GTGA	2	8	17379	17386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012925	AGCG	2	8	17550	17557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012925	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012925	GTAA	2	8	19011	19018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012925	TCAC	2	8	19068	19075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012925	GCGA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012925	ATTC	2	8	20033	20040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012925	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012925	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012925	AATC	2	8	22191	22198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012925	GCGT	2	8	23102	23109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012925	TTTG	2	8	26290	26297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012925	ATTT	2	8	27357	27364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012925	AATA	2	8	43615	43622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012925	AATA	2	8	46215	46222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012925	CTCC	2	8	46241	46248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_012925	TTCG	2	8	46342	46349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012925	AAGC	2	8	46464	46471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012925	AAAC	2	8	46666	46673	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012925	ATCA	2	8	46736	46743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012925	GACC	2	8	52236	52243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012925	ATAG	2	8	52304	52311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012925	AAAC	2	8	52324	52331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012925	GAAT	2	8	52544	52551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012925	ACTC	2	8	56617	56624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012925	AGGG	2	8	57927	57934	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012925	AAGG	2	8	58394	58401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012925	GTTA	2	8	59427	59434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012925	AATA	2	8	60737	60744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012925	GAGC	2	8	66418	66425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012925	GAAT	2	8	70757	70764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012925	AAGT	2	8	71382	71389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012925	GTTT	2	8	71461	71468	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012925	TAGG	2	8	71483	71490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012925	GACT	2	8	74924	74931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012925	TTGA	2	8	74948	74955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012925	AAAC	2	8	77799	77806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012925	CAAC	2	8	78968	78975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012925	ATCT	2	8	79018	79025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012925	TACA	2	8	81900	81907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012925	GTGA	2	8	88176	88183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012925	AGCG	2	8	88347	88354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012925	AGCC	2	8	89229	89236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012925	GTAA	2	8	89808	89815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012925	TCAC	2	8	89865	89872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012925	GCGA	2	8	89964	89971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012925	ATTC	2	8	90830	90837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012925	CTAA	2	8	91186	91193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012925	TAGG	2	8	91842	91849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012925	GCGT	2	8	93230	93237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012925	TAGT	2	8	95314	95321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012925	TATT	2	8	99046	99053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012925	TAAA	2	8	99091	99098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012925	TGCT	2	8	100888	100895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012925	CTTT	2	8	100951	100958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012925	GCTG	2	8	101148	101155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012925	TTTA	2	8	101366	101373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012925	TACT	2	8	101477	101484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012925	TTAA	2	8	101549	101556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012925	TCTT	2	8	105081	105088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012925	TCTT	2	8	110806	110813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012925	ATGG	2	8	114521	114528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012925	ATCC	2	8	114658	114665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012925	GAAA	2	8	118389	118396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012925	CAGT	2	8	119213	119220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012925	GGTA	2	8	119313	119320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012925	CGAC	2	8	119608	119615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012925	AACT	2	8	125815	125822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012925	TTGC	2	8	126001	126008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012925	TTTG	2	8	129433	129440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012925	TCTA	2	8	129806	129813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012925	CAAT	2	8	137210	137217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012925	TCTA	2	8	139670	139677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012925	ACCT	2	8	139679	139686	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012925	AAAC	2	8	140095	140102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012925	AAAT	2	8	140426	140433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012925	TTTG	2	8	140456	140463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012925	ATAG	2	8	140492	140499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012925	AAAG	2	8	140637	140644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012925	TTTG	2	8	146114	146121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012925	CTTT	2	8	150773	150780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012925	GTCT	2	8	150818	150825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012925	AAAG	2	8	151349	151356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012925	TAGT	2	8	162294	162301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012925	ATAA	2	8	162521	162528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012925	CTTA	2	8	163258	163265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012925	GTTG	2	8	163496	163503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012925	ATCT	2	8	163633	163640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012925	CTTA	2	8	164061	164068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012925	CCTT	2	8	164251	164258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012925	AAGA	2	8	164667	164674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012925	GACA	2	8	164786	164793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012925	AGTC	2	8	165477	165484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012925	GCAG	2	8	165832	165839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012925	GGTA	2	8	166432	166439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012925	TAGA	2	8	169140	169147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012925	TGTA	2	8	170559	170566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012925	GAAA	2	8	170632	170639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012925	GTAG	2	8	170640	170647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012925	TTCA	2	8	178600	178607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012925	CAGT	2	8	188018	188025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012925	AAAT	2	8	191288	191295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012925	AAAT	2	8	191350	191357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012925	TAAA	2	8	193230	193237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012925	TAAA	2	8	193972	193979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012925	GTTG	2	8	195865	195872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012925	AAAT	3	12	197169	197180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012925	TAAA	2	8	197203	197210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012925	ATTT	2	8	200528	200535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012925	ATAG	2	8	200559	200566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012925	ATTT	2	8	200575	200582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012925	ATTT	2	8	200596	200603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012925	CATC	2	8	209003	209010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012925	ACCA	2	8	209549	209556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012925	TCAA	2	8	209912	209919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012925	CTTG	2	8	210091	210098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012925	TGCC	2	8	210162	210169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012925	GACA	2	8	210336	210343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012925	GCCA	2	8	210472	210479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012925	ATCT	2	8	210535	210542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012925	AGCC	2	8	210642	210649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012925	CCAA	2	8	210842	210849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012925	TTGT	2	8	213846	213853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012925	GAGT	2	8	216482	216489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012925	ATTG	2	8	216667	216674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012925	TTTA	2	8	216713	216720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012925	CATC	2	8	216853	216860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012925	GAAT	2	8	217899	217906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012925	ATAG	2	8	222928	222935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012925	ACTT	2	8	227541	227548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012925	TTTA	2	8	230366	230373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012925	AACG	2	8	231350	231357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012925	ACTG	2	8	236267	236274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012925	CAAA	2	8	238753	238760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012925	GTTT	2	8	241090	241097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012925	AAGA	2	8	241112	241119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012925	AAAT	2	8	252548	252555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012925	ATAA	2	8	252577	252584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012925	GGAA	2	8	257317	257324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012925	TAGT	2	8	257397	257404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012925	GCTG	2	8	260928	260935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012925	CAAA	2	8	261051	261058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012925	GGAA	2	8	261806	261813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012925	CTGC	2	8	262180	262187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012925	ATCT	2	8	263385	263392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012925	ATTT	2	8	263462	263469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012925	AGAA	2	8	266791	266798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012925	CAAA	2	8	266839	266846	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012925	TAGG	2	8	269824	269831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012925	TTGT	2	8	269929	269936	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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