MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis P1/7

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012925	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752823
2	NC_012925	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752823
3	NC_012925	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752823
4	NC_012925	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752823
5	NC_012925	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752823
6	NC_012925	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752823
7	NC_012925	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752823
8	NC_012925	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752823
9	NC_012925	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752823
10	NC_012925	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752823
11	NC_012925	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752823
12	NC_012925	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752823
13	NC_012925	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752823
14	NC_012925	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752823
15	NC_012925	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752823
16	NC_012925	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752823
17	NC_012925	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752824
18	NC_012925	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752824
19	NC_012925	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752824
20	NC_012925	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752824
21	NC_012925	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752824
22	NC_012925	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752824
23	NC_012925	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752824
24	NC_012925	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752824
25	NC_012925	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752824
26	NC_012925	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752824
27	NC_012925	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752824
28	NC_012925	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752824
29	NC_012925	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752824
30	NC_012925	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752824
31	NC_012925	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752824
32	NC_012925	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752824
33	NC_012925	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752825
34	NC_012925	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752825
35	NC_012925	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752825
36	NC_012925	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752825
37	NC_012925	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752825
38	NC_012925	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752825
39	NC_012925	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752825
40	NC_012925	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752825
41	NC_012925	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752825
42	NC_012925	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752825
43	NC_012925	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752826
44	NC_012925	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752826
45	NC_012925	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752826
46	NC_012925	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752827
47	NC_012925	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752827
48	NC_012925	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752827
49	NC_012925	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752827
50	NC_012925	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752827
51	NC_012925	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752827
52	NC_012925	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752828
53	NC_012925	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752828
54	NC_012925	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752828
55	NC_012925	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752828
56	NC_012925	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752828
57	NC_012925	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752828
58	NC_012925	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752828
59	NC_012925	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752828
60	NC_012925	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752828
61	NC_012925	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752828
62	NC_012925	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752828
63	NC_012925	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752828
64	NC_012925	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752828
65	NC_012925	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752828
66	NC_012925	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752828
67	NC_012925	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752828
68	NC_012925	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752828
69	NC_012925	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752828
70	NC_012925	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752829
71	NC_012925	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752829
72	NC_012925	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752829
73	NC_012925	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752829
74	NC_012925	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752829
75	NC_012925	GAA	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752829
76	NC_012925	GAT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752829
77	NC_012925	TTA	3	9	6319	6327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752830
78	NC_012925	ATG	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
79	NC_012925	ATT	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752830
80	NC_012925	GAT	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
81	NC_012925	AGA	2	6	6936	6941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752830
82	NC_012925	TAG	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
83	NC_012925	TTG	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752830
84	NC_012925	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
85	NC_012925	TTG	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752830
86	NC_012925	GAT	2	6	7207	7212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
87	NC_012925	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752830
88	NC_012925	CCA	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752830
89	NC_012925	GTT	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752830
90	NC_012925	GCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752830
91	NC_012925	TAG	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
92	NC_012925	TCA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752830
93	NC_012925	TGT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752830
94	NC_012925	ATT	2	6	7796	7801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752830
95	NC_012925	TCT	2	6	7857	7862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752830
96	NC_012925	TAA	2	6	7902	7907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752830
97	NC_012925	GGA	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752830
98	NC_012925	GAT	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
99	NC_012925	TGA	3	9	8031	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
100	NC_012925	ACT	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752830
101	NC_012925	TGA	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
102	NC_012925	TAG	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
103	NC_012925	ATG	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
104	NC_012925	TGT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752830
105	NC_012925	CTA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752830
106	NC_012925	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752830
107	NC_012925	GTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752830
108	NC_012925	TGC	2	6	9156	9161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752830
109	NC_012925	AGA	2	6	9257	9262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752830
110	NC_012925	AAG	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752830
111	NC_012925	GTA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752830
112	NC_012925	GAC	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752830
113	NC_012925	TGT	2	6	9633	9638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752830
114	NC_012925	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752831
115	NC_012925	ACT	2	6	9946	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752831
116	NC_012925	GAA	2	6	10046	10051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752831
117	NC_012925	AAT	2	6	10071	10076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752832
118	NC_012925	CAA	2	6	10128	10133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752832
119	NC_012925	TTG	2	6	10201	10206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752832
120	NC_012925	CAG	3	9	10224	10232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752832
121	NC_012925	GAA	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752832
122	NC_012925	GCA	2	6	10332	10337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752832
123	NC_012925	AAG	2	6	10369	10374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752832
124	NC_012925	TGA	2	6	10456	10461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752833
125	NC_012925	AGA	2	6	10468	10473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752833
126	NC_012925	AGA	2	6	10504	10509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752833
127	NC_012925	GGT	2	6	10585	10590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752834
128	NC_012925	AAG	2	6	10626	10631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752834
129	NC_012925	GAA	2	6	10724	10729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752834
130	NC_012925	CTA	2	6	10856	10861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752834
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