MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012924	TGGAAG	2	12	21765	21776	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012924	AGTCTA	2	12	52238	52249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012924	TGGAAG	2	12	92556	92567	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012924	TTCGGG	2	12	93493	93504	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012924	TAAGAT	2	12	136948	136959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012924	ATACTC	2	12	139542	139553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012924	ACTAAG	2	12	150823	150834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012924	GTTATA	2	12	154310	154321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012924	AAACAG	2	12	163414	163425	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012924	ACTGAT	2	12	163761	163772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012924	AGATGC	2	12	165118	165129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012924	ATTTTT	2	12	172703	172714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012924	TGATTT	2	12	184090	184101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012924	ATTGCC	2	12	209146	209157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012924	CATTGC	2	12	210474	210485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012924	ATCTGC	2	12	216393	216404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012924	AAAATT	2	12	218004	218015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012924	TTTTTC	2	12	255475	255486	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012924	AACCAA	2	12	261716	261727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012924	TAGAAA	2	12	286599	286610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012924	TAGCCG	2	12	286638	286649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012924	TAAAAA	2	12	324143	324154	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012924	TGGAAG	2	12	331408	331419	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012924	ATCTGC	2	12	354317	354328	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012924	AGGAAA	2	12	357177	357188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012924	TCTTTT	2	12	382820	382831	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012924	TAGCAG	2	12	388911	388922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012924	TGTGAT	2	12	389237	389248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012924	AAACTA	2	12	411782	411793	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012924	TGGAAG	2	12	425449	425460	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012924	CAAAAT	2	12	426948	426959	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012924	ATTGTA	2	12	429316	429327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012924	TAAAAA	2	12	445473	445484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012924	TGTATT	2	12	449294	449305	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012924	AAATAC	2	12	460060	460071	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012924	AAGCAG	2	12	461228	461239	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012924	AAAATC	2	12	485265	485276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012924	ATCTGC	2	12	485313	485324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012924	TACGAT	2	12	487483	487494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012924	ACCTAT	2	12	494165	494176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012924	AATATA	2	12	529832	529843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012924	TAGAAA	2	12	541258	541269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012924	TTTTCC	2	12	549113	549124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012924	GACTGA	2	12	574598	574609	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012924	TGGAGT	2	12	578107	578118	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012924	TTGAAG	2	12	581030	581041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012924	AAGGAA	2	12	592380	592391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012924	GTTTTT	2	12	603223	603234	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012924	ATTTTT	2	12	619747	619758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012924	CCAGTC	2	12	705608	705619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012924	CTTGCA	2	12	753193	753204	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012924	TTCGGG	2	12	753581	753592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012924	CTCATT	2	12	788964	788975	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012924	GAATAT	2	12	790446	790457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012924	GGAGCT	2	12	797618	797629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012924	CTCATT	2	12	798365	798376	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012924	TCCCAC	2	12	830737	830748	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012924	TGACAA	2	12	837439	837450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012924	TGACAA	2	12	837513	837524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012924	AAAATC	2	12	852541	852552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012924	TGATTT	2	12	852612	852623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012924	TTTATT	2	12	852888	852899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012924	TATCAT	2	12	874332	874343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012924	AAATTA	2	12	887419	887430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012924	TAATCC	2	12	887744	887755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012924	CTACAT	2	12	1019299	1019310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012924	AATCAA	2	12	1028158	1028169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012924	CCACAT	2	12	1074403	1074414	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012924	ATAAAG	2	12	1082297	1082308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012924	TGATTT	2	12	1139541	1139552	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012924	GTCGTT	2	12	1161338	1161349	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012924	CGAACA	2	12	1163150	1163161	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012924	AACATT	2	12	1171771	1171782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012924	GCAGAT	2	12	1194784	1194795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012924	TGATTT	2	12	1194831	1194842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012924	TGATTT	2	12	1199259	1199270	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012924	AAATAT	2	12	1201761	1201772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012924	GCAGAT	2	12	1208624	1208635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012924	TGATTT	2	12	1208671	1208682	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012924	TTACAT	2	12	1214853	1214864	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012924	TACCTG	2	12	1233962	1233973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012924	CGAATC	2	12	1263298	1263309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012924	TGATTT	2	12	1273959	1273970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012924	AAAATC	2	12	1331780	1331791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012924	TCCTTC	2	12	1366877	1366888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012924	CTTTAA	2	12	1368872	1368883	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012924	ACTTTT	2	12	1370207	1370218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012924	CATCCC	2	12	1395895	1395906	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012924	ATCAGA	2	12	1414969	1414980	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012924	GCAGAT	2	12	1414990	1415001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012924	CCATCG	2	12	1426625	1426636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012924	TATCAA	2	12	1438675	1438686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012924	AAATAA	2	12	1441669	1441680	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012924	TAAAAA	2	12	1446161	1446172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012924	AAAATC	2	12	1499781	1499792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012924	ATCTGC	2	12	1499829	1499840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012924	ATAAAA	2	12	1513119	1513130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012924	CGTTTG	2	12	1531373	1531384	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012924	ATTGAC	2	12	1531939	1531950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012924	AACACT	2	12	1548680	1548691	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012924	ATTTAT	2	12	1575195	1575206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012924	AGGAAC	2	12	1576405	1576416	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012924	TGATTT	2	12	1581623	1581634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012924	AAAATC	2	12	1591594	1591605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012924	CAAAAT	2	12	1592240	1592251	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012924	ATAAAA	2	12	1597555	1597566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012924	TGATTT	2	12	1599323	1599334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012924	TCCCAG	2	12	1615642	1615653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012924	AGCCTG	2	12	1633170	1633181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012924	TGATTT	2	12	1660629	1660640	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012924	AAAATC	2	12	1697439	1697450	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_012924	CTCAAT	2	12	1760261	1760272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012924	AATAGA	2	12	1798014	1798025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012924	AAGAAA	2	12	1847930	1847941	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012924	CTCCAC	2	12	1874103	1874114	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012924	GAAAGC	2	12	1881866	1881877	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012924	TAGAAA	2	12	1885493	1885504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012924	TGATTT	2	12	1904216	1904227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012924	TTTATT	2	12	1933066	1933077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012924	TAGTGT	2	12	1973366	1973377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012924	TAAGAT	2	12	1989275	1989286	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012924	TTTTAT	2	12	1990676	1990687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012924	CAGTTT	2	12	1992969	1992980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012924	GCAGAT	2	12	1999864	1999875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012924	TTGGAT	2	12	2004359	2004370	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012924	ATTTAT	2	12	2016245	2016256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012924	ATTTTT	2	12	2019293	2019304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012924	TCATTT	2	12	2022218	2022229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012924	CTTTCT	2	12	2027376	2027387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012924	AAAATC	2	12	2052151	2052162	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012924	GTATTA	2	12	2061045	2061056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.