MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 1292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012924	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	253750924
2	NC_012924	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	253750924
3	NC_012924	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	253750926
4	NC_012924	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	253750930
5	NC_012924	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	253750930
6	NC_012924	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	253750931
7	NC_012924	TGAAA	2	10	9967	9976	60 %	20 %	20 %	0 %	253750932
8	NC_012924	CTATT	2	10	11204	11213	20 %	60 %	0 %	20 %	253750935
9	NC_012924	CTTTG	2	10	13433	13442	0 %	60 %	20 %	20 %	253750937
10	NC_012924	AACAG	2	10	13877	13886	60 %	0 %	20 %	20 %	253750938
11	NC_012924	CTTGT	2	10	15033	15042	0 %	60 %	20 %	20 %	253750938
12	NC_012924	TTTAT	2	10	24440	24449	20 %	80 %	0 %	0 %	253750941
13	NC_012924	AATGC	2	10	25406	25415	40 %	20 %	20 %	20 %	253750942
14	NC_012924	CTACG	2	10	30760	30769	20 %	20 %	20 %	40 %	253750948
15	NC_012924	GAACG	2	10	33046	33055	40 %	0 %	40 %	20 %	253750949
16	NC_012924	AAACC	2	10	33182	33191	60 %	0 %	0 %	40 %	253750949
17	NC_012924	ATTCT	2	10	34529	34538	20 %	60 %	0 %	20 %	253750949
18	NC_012924	GCCAT	2	10	35004	35013	20 %	20 %	20 %	40 %	253750949
19	NC_012924	AAATG	2	10	36090	36099	60 %	20 %	20 %	0 %	253750950
20	NC_012924	AGCAG	2	10	38721	38730	40 %	0 %	40 %	20 %	253750953
21	NC_012924	CTATT	2	10	38946	38955	20 %	60 %	0 %	20 %	253750953
22	NC_012924	CTATT	2	10	41508	41517	20 %	60 %	0 %	20 %	253750955
23	NC_012924	GAAGC	2	10	42686	42695	40 %	0 %	40 %	20 %	253750956
24	NC_012924	AGCGG	2	10	45792	45801	20 %	0 %	60 %	20 %	253750958
25	NC_012924	TTAGT	2	10	47408	47417	20 %	60 %	20 %	0 %	253750959
26	NC_012924	GAAGT	2	10	48055	48064	40 %	20 %	40 %	0 %	253750960
27	NC_012924	TTATC	2	10	48186	48195	20 %	60 %	0 %	20 %	253750960
28	NC_012924	TAATC	2	10	48294	48303	40 %	40 %	0 %	20 %	253750960
29	NC_012924	TCAAT	2	10	48553	48562	40 %	40 %	0 %	20 %	253750961
30	NC_012924	TTATT	2	10	48806	48815	20 %	80 %	0 %	0 %	253750961
31	NC_012924	GCAGA	2	10	53787	53796	40 %	0 %	40 %	20 %	253750966
32	NC_012924	GGGCT	2	10	54258	54267	0 %	20 %	60 %	20 %	253750966
33	NC_012924	TGAAT	2	10	55881	55890	40 %	40 %	20 %	0 %	253750968
34	NC_012924	AGCAG	2	10	60021	60030	40 %	0 %	40 %	20 %	253750972
35	NC_012924	GCCCT	2	10	62843	62852	0 %	20 %	20 %	60 %	253750975
36	NC_012924	GTTTT	2	10	65346	65355	0 %	80 %	20 %	0 %	253750977
37	NC_012924	TTGCT	2	10	65942	65951	0 %	60 %	20 %	20 %	253750978
38	NC_012924	GTATC	2	10	69229	69238	20 %	40 %	20 %	20 %	253750981
39	NC_012924	TGGAT	2	10	71223	71232	20 %	40 %	40 %	0 %	253750985
40	NC_012924	AAATT	2	10	72325	72334	60 %	40 %	0 %	0 %	253750986
41	NC_012924	TGGCG	2	10	73332	73341	0 %	20 %	60 %	20 %	253750988
42	NC_012924	AAAAC	2	10	73892	73901	80 %	0 %	0 %	20 %	253750989
43	NC_012924	TACAC	2	10	74306	74315	40 %	20 %	0 %	40 %	253750990
44	NC_012924	GAAAA	2	10	75185	75194	80 %	0 %	20 %	0 %	253750991
45	NC_012924	GTCTT	2	10	75473	75482	0 %	60 %	20 %	20 %	253750992
46	NC_012924	TTTGG	2	10	75604	75613	0 %	60 %	40 %	0 %	253750992
47	NC_012924	TAAGA	2	10	78937	78946	60 %	20 %	20 %	0 %	253751000
48	NC_012924	AGAAT	2	10	83725	83734	60 %	20 %	20 %	0 %	253751009
49	NC_012924	GAAAA	2	10	86051	86060	80 %	0 %	20 %	0 %	253751015
50	NC_012924	TGACT	2	10	86446	86455	20 %	40 %	20 %	20 %	253751015
51	NC_012924	TGTGA	2	10	94387	94396	20 %	40 %	40 %	0 %	253751017
52	NC_012924	TGCTT	2	10	95949	95958	0 %	60 %	20 %	20 %	253751019
53	NC_012924	TTGTT	2	10	97154	97163	0 %	80 %	20 %	0 %	253751021
54	NC_012924	AATAT	2	10	98596	98605	60 %	40 %	0 %	0 %	253751022
55	NC_012924	TTTCA	2	10	99412	99421	20 %	60 %	0 %	20 %	253751024
56	NC_012924	CTTCG	2	10	99655	99664	0 %	40 %	20 %	40 %	253751024
57	NC_012924	TTTTC	2	10	100576	100585	0 %	80 %	0 %	20 %	253751025
58	NC_012924	TTTGG	2	10	102872	102881	0 %	60 %	40 %	0 %	253751028
59	NC_012924	ATTGC	2	10	103337	103346	20 %	40 %	20 %	20 %	253751028
60	NC_012924	GCTTT	2	10	103568	103577	0 %	60 %	20 %	20 %	253751029
61	NC_012924	AGAAA	2	10	104026	104035	80 %	0 %	20 %	0 %	253751029
62	NC_012924	GACTT	2	10	105605	105614	20 %	40 %	20 %	20 %	253751030
63	NC_012924	CTGGG	2	10	109825	109834	0 %	20 %	60 %	20 %	253751035
64	NC_012924	CCGTT	2	10	115520	115529	0 %	40 %	20 %	40 %	253751037
65	NC_012924	GCTTG	2	10	121008	121017	0 %	40 %	40 %	20 %	253751040
66	NC_012924	TGGTT	2	10	121136	121145	0 %	60 %	40 %	0 %	253751040
67	NC_012924	GGTCA	2	10	121435	121444	20 %	20 %	40 %	20 %	253751040
68	NC_012924	AAGGA	2	10	122525	122534	60 %	0 %	40 %	0 %	253751043
69	NC_012924	GGCAA	2	10	123083	123092	40 %	0 %	40 %	20 %	253751045
70	NC_012924	TTGGT	2	10	125471	125480	0 %	60 %	40 %	0 %	253751047
71	NC_012924	GAAAA	2	10	125933	125942	80 %	0 %	20 %	0 %	253751048
72	NC_012924	CCTTG	2	10	125986	125995	0 %	40 %	20 %	40 %	253751048
73	NC_012924	CTGGA	2	10	126874	126883	20 %	20 %	40 %	20 %	253751049
74	NC_012924	AGCAG	2	10	127230	127239	40 %	0 %	40 %	20 %	253751049
75	NC_012924	GCTCA	2	10	127338	127347	20 %	20 %	20 %	40 %	253751049
76	NC_012924	AATCA	2	10	127852	127861	60 %	20 %	0 %	20 %	253751050
77	NC_012924	AGGTG	2	10	128540	128549	20 %	20 %	60 %	0 %	253751050
78	NC_012924	ACTTT	2	10	132246	132255	20 %	60 %	0 %	20 %	253751055
79	NC_012924	TAGCG	2	10	135344	135353	20 %	20 %	40 %	20 %	253751059
80	NC_012924	ATCAA	2	10	136505	136514	60 %	20 %	0 %	20 %	253751061
81	NC_012924	CGTAT	2	10	137777	137786	20 %	40 %	20 %	20 %	253751062
82	NC_012924	ATCCA	2	10	137868	137877	40 %	20 %	0 %	40 %	253751062
83	NC_012924	CAAGA	2	10	138644	138653	60 %	0 %	20 %	20 %	253751062
84	NC_012924	AAGCT	2	10	139074	139083	40 %	20 %	20 %	20 %	253751062
85	NC_012924	AAGAA	2	10	141334	141343	80 %	0 %	20 %	0 %	253751063
86	NC_012924	GCAGT	2	10	141624	141633	20 %	20 %	40 %	20 %	253751063
87	NC_012924	ATCCA	2	10	141735	141744	40 %	20 %	0 %	40 %	253751063
88	NC_012924	TACGA	2	10	142236	142245	40 %	20 %	20 %	20 %	253751063
89	NC_012924	GTTTA	2	10	146233	146242	20 %	60 %	20 %	0 %	253751066
90	NC_012924	GCATG	2	10	147755	147764	20 %	20 %	40 %	20 %	253751068
91	NC_012924	AAAAT	2	10	148168	148177	80 %	20 %	0 %	0 %	253751068
92	NC_012924	GGGTC	2	10	152792	152801	0 %	20 %	60 %	20 %	253751073
93	NC_012924	TTTCA	2	10	153762	153771	20 %	60 %	0 %	20 %	253751074
94	NC_012924	TGGTC	2	10	156948	156957	0 %	40 %	40 %	20 %	253751077
95	NC_012924	GTCTT	2	10	157903	157912	0 %	60 %	20 %	20 %	253751078
96	NC_012924	TTGGA	2	10	160419	160428	20 %	40 %	40 %	0 %	253751079
97	NC_012924	TCATC	2	10	161292	161301	20 %	40 %	0 %	40 %	253751081
98	NC_012924	CTTGG	2	10	161461	161470	0 %	40 %	40 %	20 %	253751081
99	NC_012924	AGACT	2	10	167829	167838	40 %	20 %	20 %	20 %	253751082
100	NC_012924	ATACA	2	10	172948	172957	60 %	20 %	0 %	20 %	253751087
101	NC_012924	GGTTT	2	10	175106	175115	0 %	60 %	40 %	0 %	253751088
102	NC_012924	TTATC	2	10	175982	175991	20 %	60 %	0 %	20 %	253751089
103	NC_012924	TCTGG	2	10	179417	179426	0 %	40 %	40 %	20 %	253751092
104	NC_012924	TTCAA	2	10	179957	179966	40 %	40 %	0 %	20 %	253751092
105	NC_012924	TGATT	2	10	184588	184597	20 %	60 %	20 %	0 %	253751096
106	NC_012924	GAAGC	2	10	186705	186714	40 %	0 %	40 %	20 %	253751097
107	NC_012924	GGAAA	2	10	192074	192083	60 %	0 %	40 %	0 %	253751099
108	NC_012924	CTGGT	2	10	192570	192579	0 %	40 %	40 %	20 %	253751100
109	NC_012924	CCAGA	2	10	192623	192632	40 %	0 %	20 %	40 %	253751100
110	NC_012924	AGCAG	2	10	194671	194680	40 %	0 %	40 %	20 %	253751102
111	NC_012924	TTTTG	2	10	196203	196212	0 %	80 %	20 %	0 %	253751105
112	NC_012924	GAACA	2	10	196238	196247	60 %	0 %	20 %	20 %	253751105
113	NC_012924	TTTTA	2	10	197427	197436	20 %	80 %	0 %	0 %	253751106
114	NC_012924	TGAAA	2	10	198592	198601	60 %	20 %	20 %	0 %	253751107
115	NC_012924	AAGGA	2	10	199244	199253	60 %	0 %	40 %	0 %	253751107
116	NC_012924	AGTAA	2	10	199715	199724	60 %	20 %	20 %	0 %	253751107
117	NC_012924	CAAGT	2	10	201473	201482	40 %	20 %	20 %	20 %	253751108
118	NC_012924	ATGGA	2	10	202143	202152	40 %	20 %	40 %	0 %	253751108
119	NC_012924	TTTGG	2	10	205260	205269	0 %	60 %	40 %	0 %	253751110
120	NC_012924	TCTAC	2	10	206040	206049	20 %	40 %	0 %	40 %	253751111
121	NC_012924	AATGT	2	10	206187	206196	40 %	40 %	20 %	0 %	253751111
122	NC_012924	GACCA	2	10	213156	213165	40 %	0 %	20 %	40 %	253751114
123	NC_012924	GTTTT	2	10	214265	214274	0 %	80 %	20 %	0 %	253751115
124	NC_012924	CCATA	2	10	214367	214376	40 %	20 %	0 %	40 %	253751116
125	NC_012924	ATGAC	2	10	215755	215764	40 %	20 %	20 %	20 %	253751117
126	NC_012924	AGCTC	2	10	217437	217446	20 %	20 %	20 %	40 %	253751118
127	NC_012924	TCCAA	2	10	219974	219983	40 %	20 %	0 %	40 %	253751120
128	NC_012924	AAAGA	2	10	222879	222888	80 %	0 %	20 %	0 %	253751122
129	NC_012924	AGGGC	2	10	226407	226416	20 %	0 %	60 %	20 %	253751125
130	NC_012924	AGCAG	2	10	226440	226449	40 %	0 %	40 %	20 %	253751125
131	NC_012924	ATCAA	2	10	227263	227272	60 %	20 %	0 %	20 %	253751126
132	NC_012924	CCTTG	2	10	228830	228839	0 %	40 %	20 %	40 %	253751127
133	NC_012924	ACCAA	2	10	229839	229848	60 %	0 %	0 %	40 %	253751128
134	NC_012924	TAATG	2	10	232325	232334	40 %	40 %	20 %	0 %	253751130
135	NC_012924	ATTTT	2	10	233588	233597	20 %	80 %	0 %	0 %	253751131
136	NC_012924	TTGGA	2	10	236829	236838	20 %	40 %	40 %	0 %	253751133
137	NC_012924	CTACT	2	10	237930	237939	20 %	40 %	0 %	40 %	253751134
138	NC_012924	TGGGC	2	10	238025	238034	0 %	20 %	60 %	20 %	253751134
139	NC_012924	GTTAA	2	10	238110	238119	40 %	40 %	20 %	0 %	253751134
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141	NC_012924	TGAAC	2	10	240472	240481	40 %	20 %	20 %	20 %	253751137
142	NC_012924	GGCTT	2	10	241177	241186	0 %	40 %	40 %	20 %	253751138
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147	NC_012924	TCCAA	2	10	246552	246561	40 %	20 %	0 %	40 %	253751143
148	NC_012924	ATCAT	2	10	246875	246884	40 %	40 %	0 %	20 %	253751143
149	NC_012924	ACTCT	2	10	248659	248668	20 %	40 %	0 %	40 %	253751145
150	NC_012924	TGGCA	2	10	248915	248924	20 %	20 %	40 %	20 %	253751145
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153	NC_012924	AGTTG	2	10	251702	251711	20 %	40 %	40 %	0 %	253751147
154	NC_012924	AGTTG	2	10	255855	255864	20 %	40 %	40 %	0 %	253751153
155	NC_012924	ATTGA	2	10	256420	256429	40 %	40 %	20 %	0 %	253751153
156	NC_012924	TTTCC	2	10	257381	257390	0 %	60 %	0 %	40 %	253751154
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161	NC_012924	AGAAA	2	10	271293	271302	80 %	0 %	20 %	0 %	253751163
162	NC_012924	GGGCT	2	10	271540	271549	0 %	20 %	60 %	20 %	253751163
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165	NC_012924	TTTGC	2	10	273105	273114	0 %	60 %	20 %	20 %	253751164
166	NC_012924	TCTTG	2	10	274315	274324	0 %	60 %	20 %	20 %	253751164
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169	NC_012924	TATCG	2	10	279017	279026	20 %	40 %	20 %	20 %	253751169
170	NC_012924	CCTAG	2	10	279533	279542	20 %	20 %	20 %	40 %	253751169
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172	NC_012924	CCTTT	2	10	282018	282027	0 %	60 %	0 %	40 %	253751172
173	NC_012924	TGGTC	2	10	283808	283817	0 %	40 %	40 %	20 %	253751173
174	NC_012924	CCAAA	2	10	283967	283976	60 %	0 %	0 %	40 %	253751173
175	NC_012924	CAGGG	2	10	284019	284028	20 %	0 %	60 %	20 %	253751173
176	NC_012924	CCTCT	2	10	284112	284121	0 %	40 %	0 %	60 %	253751173
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199	NC_012924	ACAGA	2	10	318805	318814	60 %	0 %	20 %	20 %	253751208
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202	NC_012924	GTTTT	2	10	323764	323773	0 %	80 %	20 %	0 %	253751210
203	NC_012924	AAACC	2	10	325898	325907	60 %	0 %	0 %	40 %	253751212
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245	NC_012924	CAGGT	2	10	411091	411100	20 %	20 %	40 %	20 %	253751276
246	NC_012924	GGTTT	2	10	412252	412261	0 %	60 %	40 %	0 %	253751277
247	NC_012924	AGCCT	2	10	412769	412778	20 %	20 %	20 %	40 %	253751278
248	NC_012924	AAAGA	2	10	416006	416015	80 %	0 %	20 %	0 %	253751281
249	NC_012924	TCCTG	2	10	416497	416506	0 %	40 %	20 %	40 %	253751282
250	NC_012924	TGGAT	2	10	416526	416535	20 %	40 %	40 %	0 %	253751282
251	NC_012924	AGCAG	2	10	417533	417542	40 %	0 %	40 %	20 %	253751283
252	NC_012924	TGTAT	2	10	420269	420278	20 %	60 %	20 %	0 %	253751286
253	NC_012924	TTAAT	2	10	427779	427788	40 %	60 %	0 %	0 %	253751287
254	NC_012924	CTTGA	2	10	428020	428029	20 %	40 %	20 %	20 %	253751287
255	NC_012924	ATAGT	2	10	428105	428114	40 %	40 %	20 %	0 %	253751287
256	NC_012924	GGAAA	2	10	428603	428612	60 %	0 %	40 %	0 %	253751288
257	NC_012924	ATTTT	2	10	429756	429765	20 %	80 %	0 %	0 %	253751289
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260	NC_012924	TGCTC	2	10	433004	433013	0 %	40 %	20 %	40 %	253751293
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262	NC_012924	TGGTA	2	10	436185	436194	20 %	40 %	40 %	0 %	253751296
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