MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012924	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012924	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012924	GTGA	2	8	17379	17386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012924	AGCG	2	8	17550	17557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012924	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012924	GTAA	2	8	19011	19018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012924	TCAC	2	8	19068	19075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012924	GCGA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012924	ATTC	2	8	20033	20040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012924	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012924	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012924	AATC	2	8	22191	22198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012924	GCGT	2	8	23102	23109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012924	TTTG	2	8	26290	26297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012924	ATTT	2	8	27357	27364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012924	AATA	2	8	43615	43622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012924	TAAA	2	8	43648	43655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012924	TTAT	2	8	44338	44345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012924	GAAG	2	8	44594	44601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012924	GAAG	2	8	44762	44769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012924	AATA	2	8	46215	46222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012924	CTCC	2	8	46241	46248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_012924	TTCG	2	8	46342	46349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012924	AAGC	2	8	46464	46471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012924	AAAC	2	8	46666	46673	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012924	ATCA	2	8	46736	46743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012924	GACC	2	8	52230	52237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012924	ATAG	2	8	52298	52305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012924	AAAC	2	8	52318	52325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012924	GAAT	2	8	52538	52545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012924	ACTC	2	8	56611	56618	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012924	AGGG	2	8	57921	57928	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012924	AAGG	2	8	58388	58395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012924	GTTA	2	8	59421	59428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012924	AATA	2	8	60731	60738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012924	GAGC	2	8	66412	66419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012924	GAAT	2	8	70751	70758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012924	AAGT	2	8	71376	71383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012924	GTTT	2	8	71455	71462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012924	TAGG	2	8	71477	71484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012924	GACT	2	8	74918	74925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012924	TTGA	2	8	74942	74949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012924	AAAC	2	8	77793	77800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012924	CAAC	2	8	78962	78969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012924	ATCT	2	8	79012	79019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012924	TACA	2	8	81894	81901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012924	GTGA	2	8	88170	88177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012924	AGCG	2	8	88341	88348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012924	AGCC	2	8	89223	89230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012924	GTAA	2	8	89802	89809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012924	TCAC	2	8	89859	89866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012924	GCGA	2	8	89958	89965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012924	ATTC	2	8	90824	90831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012924	CTAA	2	8	91180	91187	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012924	TAGG	2	8	91836	91843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012924	GCGT	2	8	93224	93231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012924	TAGT	2	8	95308	95315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012924	ATGT	2	8	96921	96928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012924	ATGT	2	8	96955	96962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012924	TATT	2	8	99040	99047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012924	TAAA	2	8	99085	99092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012924	TGCT	2	8	100882	100889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012924	CTTT	2	8	100945	100952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012924	GCTG	2	8	101142	101149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012924	TTTA	2	8	101360	101367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012924	TACT	2	8	101471	101478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012924	TTAA	2	8	101543	101550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012924	TCTT	2	8	105075	105082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012924	TCTT	2	8	110611	110618	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012924	ATGG	2	8	114326	114333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012924	ATCC	2	8	114463	114470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012924	GAAA	2	8	118194	118201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012924	CAGT	2	8	119018	119025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012924	GGTA	2	8	119118	119125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012924	CGAC	2	8	119413	119420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012924	AACT	2	8	125620	125627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012924	TTGC	2	8	125806	125813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012924	TTTG	2	8	129238	129245	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012924	TCTA	2	8	129611	129618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012924	CAAT	2	8	137015	137022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012924	TCTA	2	8	139475	139482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012924	ACCT	2	8	139484	139491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012924	AAAC	2	8	139900	139907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012924	AAAT	2	8	140231	140238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012924	TTTG	2	8	140261	140268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012924	ATAG	2	8	140297	140304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012924	AAAG	2	8	140442	140449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012924	TTTG	2	8	145919	145926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012924	CTTT	2	8	150578	150585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012924	GTCT	2	8	150623	150630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012924	AAAG	2	8	151154	151161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012924	TAGT	2	8	162099	162106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012924	ATAA	2	8	162326	162333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012924	CTTA	2	8	163063	163070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012924	GTTG	2	8	163301	163308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012924	ATCT	2	8	163438	163445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012924	CTTA	2	8	163866	163873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012924	CCTT	2	8	164056	164063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012924	AAGA	2	8	164472	164479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012924	GACA	2	8	164591	164598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012924	AGTC	2	8	165282	165289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012924	GCAG	2	8	165637	165644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012924	GGTA	2	8	166237	166244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012924	TAGA	2	8	168945	168952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012924	TGTA	2	8	170364	170371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012924	GAAA	2	8	170437	170444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012924	GTAG	2	8	170445	170452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012924	TTCA	2	8	178405	178412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012924	CAGT	2	8	187823	187830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012924	AAAT	2	8	191093	191100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012924	AAAT	2	8	191155	191162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012924	TAAA	2	8	193035	193042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012924	TAAA	2	8	193777	193784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012924	GTTG	2	8	195670	195677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012924	AAAT	3	12	196974	196985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012924	TAAA	2	8	197008	197015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012924	ATTT	2	8	200333	200340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012924	ATAG	2	8	200364	200371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012924	ATTT	2	8	200380	200387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012924	ATTT	2	8	200401	200408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012924	CATC	2	8	208808	208815	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012924	ACCA	2	8	209354	209361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012924	TCAA	2	8	209717	209724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012924	CTTG	2	8	209896	209903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012924	TGCC	2	8	209967	209974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012924	GACA	2	8	210141	210148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012924	GCCA	2	8	210277	210284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012924	ATCT	2	8	210340	210347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012924	AGCC	2	8	210447	210454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012924	CCAA	2	8	210647	210654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012924	TTGT	2	8	213651	213658	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012924	GAGT	2	8	216287	216294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012924	ATTG	2	8	216472	216479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012924	TTTA	2	8	216518	216525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012924	CATC	2	8	216658	216665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012924	GAAT	2	8	217704	217711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012924	ATAG	2	8	222733	222740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012924	ACTT	2	8	227349	227356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012924	TTTA	2	8	230174	230181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012924	AACG	2	8	231158	231165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012924	ACTG	2	8	236075	236082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012924	CAAA	2	8	238561	238568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012924	GTTT	2	8	240898	240905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012924	AAGA	2	8	240920	240927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012924	AAAT	2	8	252356	252363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012924	ATAA	2	8	252385	252392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012924	GGAA	2	8	257125	257132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012924	TAGT	2	8	257205	257212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012924	GCTG	2	8	260493	260500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012924	CAAA	2	8	260616	260623	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012924	GGAA	2	8	261371	261378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012924	CTGC	2	8	261745	261752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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