MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 27450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012924	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750924
2	NC_012924	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750924
3	NC_012924	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
4	NC_012924	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750924
5	NC_012924	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750924
6	NC_012924	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750924
7	NC_012924	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750924
8	NC_012924	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750924
9	NC_012924	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750924
10	NC_012924	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750924
11	NC_012924	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750924
12	NC_012924	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
13	NC_012924	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
14	NC_012924	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750924
15	NC_012924	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750924
16	NC_012924	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750924
17	NC_012924	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012924	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012924	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012924	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
21	NC_012924	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750925
22	NC_012924	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750925
23	NC_012924	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750925
24	NC_012924	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750925
25	NC_012924	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750925
26	NC_012924	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750925
27	NC_012924	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
28	NC_012924	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
29	NC_012924	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750925
30	NC_012924	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750925
31	NC_012924	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
32	NC_012924	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
33	NC_012924	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750925
34	NC_012924	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
35	NC_012924	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
36	NC_012924	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012924	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750926
38	NC_012924	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750926
39	NC_012924	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
40	NC_012924	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
41	NC_012924	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750926
42	NC_012924	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750926
43	NC_012924	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
44	NC_012924	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750926
45	NC_012924	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
46	NC_012924	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750926
47	NC_012924	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750927
48	NC_012924	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750927
49	NC_012924	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750927
50	NC_012924	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012924	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012924	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750928
53	NC_012924	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750928
54	NC_012924	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750928
55	NC_012924	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750928
56	NC_012924	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750928
57	NC_012924	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750928
58	NC_012924	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
59	NC_012924	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750929
60	NC_012924	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750929
61	NC_012924	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750929
62	NC_012924	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
63	NC_012924	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
64	NC_012924	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750929
65	NC_012924	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
66	NC_012924	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750929
67	NC_012924	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
68	NC_012924	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
69	NC_012924	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
70	NC_012924	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750929
71	NC_012924	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750929
72	NC_012924	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750929
73	NC_012924	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
74	NC_012924	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
75	NC_012924	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750929
76	NC_012924	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012924	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012924	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012924	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750930
80	NC_012924	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750930
81	NC_012924	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750930
82	NC_012924	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750930
83	NC_012924	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750930
84	NC_012924	GAA	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750930
85	NC_012924	GAT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750930
86	NC_012924	TTA	3	9	6319	6327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750931
87	NC_012924	ATG	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
88	NC_012924	ATT	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750931
89	NC_012924	GAT	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
90	NC_012924	AGA	2	6	6936	6941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750931
91	NC_012924	TAG	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
92	NC_012924	TTG	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750931
93	NC_012924	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
94	NC_012924	TTG	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750931
95	NC_012924	GAT	2	6	7207	7212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
96	NC_012924	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750931
97	NC_012924	CCA	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253750931
98	NC_012924	GTT	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750931
99	NC_012924	GCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750931
100	NC_012924	TAG	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
101	NC_012924	TCA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750931
102	NC_012924	TGT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750931
103	NC_012924	ATT	2	6	7796	7801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750931
104	NC_012924	TCT	2	6	7857	7862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750931
105	NC_012924	TAA	2	6	7902	7907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750931
106	NC_012924	GGA	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750931
107	NC_012924	GAT	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
108	NC_012924	TGA	3	9	8031	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
109	NC_012924	ACT	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750931
110	NC_012924	TGA	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
111	NC_012924	TAG	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
112	NC_012924	ATG	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
113	NC_012924	TGT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750931
114	NC_012924	CTA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750931
115	NC_012924	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750931
116	NC_012924	GTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750931
117	NC_012924	TGC	2	6	9156	9161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750931
118	NC_012924	AGA	2	6	9257	9262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750931
119	NC_012924	AAG	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750931
120	NC_012924	GTA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
121	NC_012924	GAC	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750931
122	NC_012924	TGT	2	6	9633	9638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750931
123	NC_012924	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012924	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750932
125	NC_012924	ACT	2	6	9946	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750932
126	NC_012924	GAA	2	6	10046	10051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750932
127	NC_012924	AAT	2	6	10071	10076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750933
128	NC_012924	CAA	2	6	10128	10133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750933
129	NC_012924	TTG	2	6	10201	10206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750933
130	NC_012924	CAG	3	9	10224	10232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750933
131	NC_012924	GAA	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750933
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243	NC_012924	AGA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
244	NC_012924	CAG	2	6	17495	17500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_012924	ATC	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_012924	AAC	2	6	18647	18652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_012924	GTT	2	6	18657	18662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_012924	ACG	2	6	18988	18993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_012924	CAG	2	6	21960	21965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_012924	AGT	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012924	ACC	2	6	22509	22514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_012924	CGT	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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381	NC_012924	TAT	2	6	27373	27378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_012924	TAA	2	6	27429	27434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750944
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500	NC_012924	ATT	2	6	36415	36420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750950

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