MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 3564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012924	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012924	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012924	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012924	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012924	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012924	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012924	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012924	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012924	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012924	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012924	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012924	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012924	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012924	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012924	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012924	GAT	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012924	AGA	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012924	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012924	GGC	2	6	17007	17012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012924	GCA	2	6	17326	17331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012924	CGC	2	6	17373	17378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012924	TGT	2	6	17412	17417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012924	AGA	2	6	17421	17426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012924	AGA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012924	CAG	2	6	17495	17500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012924	GGA	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012924	GAA	2	6	17949	17954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012924	GGT	2	6	18023	18028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012924	GTC	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012924	CAT	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012924	TAA	2	6	18140	18145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012924	GGA	2	6	18149	18154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012924	ATC	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012924	CGC	2	6	18339	18344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012924	CAC	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012924	GAT	2	6	18455	18460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012924	CCT	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_012924	TCT	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012924	AGG	2	6	18612	18617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012924	AAC	2	6	18647	18652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012924	GTT	2	6	18657	18662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012924	ATC	2	6	18850	18855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012924	AGT	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012924	ACG	2	6	18988	18993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012924	TAG	2	6	19159	19164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012924	AGG	2	6	19181	19186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012924	GAG	2	6	19194	19199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012924	CTC	2	6	19204	19209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012924	AGA	2	6	19246	19251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012924	TCG	2	6	19349	19354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012924	GGA	2	6	19362	19367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012924	ACA	2	6	19480	19485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012924	ATG	2	6	19547	19552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012924	TAT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012924	GGA	2	6	19680	19685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012924	ACC	2	6	19946	19951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012924	AAT	2	6	19966	19971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012924	AGC	2	6	20026	20031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012924	AAG	2	6	20163	20168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012924	GAG	2	6	20178	20183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012924	ACA	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012924	GAT	2	6	20738	20743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012924	AGG	2	6	20783	20788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012924	CGG	2	6	20829	20834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012924	TAC	2	6	21099	21104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012924	CCT	2	6	21187	21192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_012924	GGT	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012924	TCG	2	6	21438	21443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012924	CGT	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012924	AGT	2	6	21909	21914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012924	CAG	2	6	21960	21965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012924	AGT	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012924	ACC	2	6	22509	22514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012924	CGT	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012924	CGC	2	6	22939	22944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012924	GGA	2	6	23043	23048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012924	TCC	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_012924	CTA	2	6	23136	23141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012924	AGC	2	6	23153	23158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012924	TCG	2	6	23167	23172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012924	CGG	2	6	23279	23284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012924	TAT	2	6	23327	23332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012924	GGT	2	6	23385	23390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012924	TAA	2	6	24916	24921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012924	GAG	2	6	24977	24982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012924	AGG	2	6	26343	26348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012924	CTT	2	6	27345	27350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012924	TAT	2	6	27373	27378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012924	AAC	2	6	30632	30637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012924	TGT	2	6	30646	30651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012924	TTA	2	6	42788	42793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012924	ATA	2	6	43738	43743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012924	ATT	2	6	43775	43780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012924	ACA	2	6	43792	43797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012924	ATA	2	6	43827	43832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012924	AGA	2	6	43868	43873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012924	CAG	2	6	44023	44028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012924	TTA	2	6	44053	44058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012924	TAA	2	6	44072	44077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012924	GAA	2	6	44091	44096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012924	CTA	2	6	44180	44185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012924	GGA	2	6	44195	44200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012924	TAA	2	6	44207	44212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012924	AGA	2	6	44257	44262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012924	TAG	2	6	44426	44431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012924	AAT	2	6	44441	44446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012924	TGA	2	6	44480	44485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012924	AGA	2	6	44615	44620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012924	GAT	2	6	44646	44651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012924	AAT	2	6	44748	44753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012924	TTA	2	6	44773	44778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012924	AGA	2	6	44807	44812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012924	GAA	2	6	46635	46640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012924	AAG	2	6	46649	46654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012924	ATT	2	6	46694	46699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012924	CGT	2	6	46712	46717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012924	GTC	2	6	46719	46724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012924	AGG	2	6	46767	46772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012924	TAT	2	6	46828	46833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012924	TCG	2	6	46846	46851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012924	GTC	2	6	46854	46859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012924	ATT	2	6	46888	46893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012924	ATT	2	6	46931	46936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012924	AAG	2	6	46938	46943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012924	ATC	2	6	46971	46976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012924	CGC	2	6	46989	46994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012924	GTC	2	6	46996	47001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012924	TAA	3	9	52258	52266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012924	TGA	2	6	52277	52282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012924	GGA	2	6	52345	52350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012924	GAA	2	6	52384	52389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012924	GAA	2	6	52440	52445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012924	GAG	2	6	52480	52485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012924	TAA	2	6	55313	55318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012924	AAG	2	6	55342	55347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012924	GAA	2	6	56334	56339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012924	GTC	2	6	56415	56420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012924	GAA	2	6	56447	56452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012924	ATT	2	6	56457	56462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012924	ATG	2	6	56487	56492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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