MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus suis BM407 plasmid pBM407

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012923	TTTGA	2	10	367	376	20 %	60 %	20 %	0 %	253750613
2	NC_012923	AGAAT	2	10	891	900	60 %	20 %	20 %	0 %	253750613
3	NC_012923	AAATG	2	10	1214	1223	60 %	20 %	20 %	0 %	253750615
4	NC_012923	CTGCT	2	10	4019	4028	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012923	ATTAT	2	10	4982	4991	40 %	60 %	0 %	0 %	253750619
6	NC_012923	CCTTT	2	10	5160	5169	0 %	60 %	0 %	40 %	253750619
7	NC_012923	TAATG	2	10	5693	5702	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012923	TCATT	2	10	7328	7337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012923	TGATA	2	10	7530	7539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012923	TTGTT	2	10	8521	8530	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012923	AAAAG	2	10	8781	8790	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012923	ATCCT	2	10	9215	9224	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012923	TTGTT	2	10	9762	9771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012923	CATAC	2	10	11328	11337	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_012923	TTGTT	2	10	11699	11708	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012923	TTTAT	2	10	12410	12419	20 %	80 %	0 %	0 %	253750622
17	NC_012923	TCTAT	2	10	12791	12800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012923	CTTTC	2	10	13318	13327	0 %	60 %	0 %	40 %	253750623
19	NC_012923	CCATA	2	10	13764	13773	40 %	20 %	0 %	40 %	253750623
20	NC_012923	TGGGC	2	10	16938	16947	0 %	20 %	60 %	20 %	253750625
21	NC_012923	CTTTT	2	10	20223	20232	0 %	80 %	0 %	20 %	253750626
22	NC_012923	TCTGC	2	10	20515	20524	0 %	40 %	20 %	40 %	253750626

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.